seq1 = pF1KE2680.tfa, 1281 bp
seq2 = pF1KE2680/gi568815579r_14309037.tfa (gi568815579r:14309037_14513220), 204184 bp

>pF1KE2680 1281
>gi568815579r:14309037_14513220 (Chr19)

(complement)

1-208  (100001-100208)   100% ->
209-336  (100543-100670)   100% ->
337-429  (101623-101715)   100% ->
430-613  (102049-102232)   100% ->
614-732  (102887-103005)   100% ->
733-864  (103348-103479)   100% ->
865-974  (103576-103685)   100% ->
975-1119  (103774-103918)   100% ->
1120-1267  (104037-104184)   100% ->
1268-1281  (104269-104282)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCAGAACAGGATGTGGAAAACGATCTTTTGGATTACGATGAAGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCAGAACAGGATGTGGAAAACGATCTTTTGGATTACGATGAAGAGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGAGCCCCAGGCTCCTCAAGAGAGCACACCAGCTCCCCCTAAGAAAGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AGAGCCCCAGGCTCCTCAAGAGAGCACACCAGCTCCCCCTAAGAAAGACA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCAAGGGATCCTACGTTTCCATCCACAGCTCTGGCTTCCGGGACTTTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCAAGGGATCCTACGTTTCCATCCACAGCTCTGGCTTCCGGGACTTTCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTGAAGCCGGAGCTCCTGCGGGCCATCGTGGACTGTGGCTTTGAGCATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CTGAAGCCGGAGCTCCTGCGGGCCATCGTGGACTGTGGCTTTGAGCATCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TTCTGAGG         TCCAGCATGAGTGCATTCCCCAGGCCATCCTGG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TTCTGAGGGTA...CAGTCCAGCATGAGTGCATTCCCCAGGCCATCCTGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GCATGGACGTCCTGTGCCAGGCCAAGTCCGGGATGGGCAAGACAGCGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100576 GCATGGACGTCCTGTGCCAGGCCAAGTCCGGGATGGGCAAGACAGCGGTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TTCGTGCTGGCCACCCTACAGCAGATTGAGCCTGTCAACGGACAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 100626 TTCGTGCTGGCCACCCTACAGCAGATTGAGCCTGTCAACGGACAGGTG..

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    337     GTGACGGTCCTGGTCATGTGCCACACGAGGGAGCTGGCCTTCCAGA
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100676 .CAGGTGACGGTCCTGGTCATGTGCCACACGAGGGAGCTGGCCTTCCAGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TCAGCAAGGAATATGAGCGCTTTTCCAAGTACATGCCCAGCGTCAAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 101669 TCAGCAAGGAATATGAGCGCTTTTCCAAGTACATGCCCAGCGTCAAGGTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    430       GTGTCTGTGTTCTTCGGTGGTCTCTCCATCAAGAAGGATGAAGA
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101719 ...TAGGTGTCTGTGTTCTTCGGTGGTCTCTCCATCAAGAAGGATGAAGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 AGTGTTGAAGAAGAACTGTCCCCATGTCGTGGTGGGGACCCCGGGCCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102093 AGTGTTGAAGAAGAACTGTCCCCATGTCGTGGTGGGGACCCCGGGCCGCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TCCTGGCGCTCGTGCGGAATAGGAGCTTCAGCCTAAAGAATGTGAAGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102143 TCCTGGCGCTCGTGCGGAATAGGAGCTTCAGCCTAAAGAATGTGAAGCAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 TTTGTGCTGGACGAGTGTGACAAGATGCTGGAGCAGCTGG         A
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 102193 TTTGTGCTGGACGAGTGTGACAAGATGCTGGAGCAGCTGGGTG...TAGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 CATGCGGCGGGATGTGCAGGAGATCTTCCGCCTGACACCACACGAGAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102888 CATGCGGCGGGATGTGCAGGAGATCTTCCGCCTGACACCACACGAGAAGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 AGTGCATGATGTTCAGCGCCACCCTGAGCAAGGACATCCGGCCTGTGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102938 AGTGCATGATGTTCAGCGCCACCCTGAGCAAGGACATCCGGCCTGTGTGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 AGGAAGTTCATGCAGGAT         CCCATGGAGGTGTTTGTGGACGA
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 102988 AGGAAGTTCATGCAGGATGTG...CAGCCCATGGAGGTGTTTGTGGACGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 CGAGACCAAGCTCACGCTGCACGGCCTGCAGCAGTACTACGTCAAACTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103371 CGAGACCAAGCTCACGCTGCACGGCCTGCAGCAGTACTACGTCAAACTCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 AAGACAGTGAGAAGAACCGCAAGCTCTTTGATCTCTTGGATGTGCTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103421 AAGACAGTGAGAAGAACCGCAAGCTCTTTGATCTCTTGGATGTGCTGGAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 TTTAACCAG         GTGATAATCTTCGTCAAGTCAGTGCAGCGCTG
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 103471 TTTAACCAGGTG...CAGGTGATAATCTTCGTCAAGTCAGTGCAGCGCTG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 CATGGCCCTGGCCCAGCTCCTCGTGGAGCAGAACTTCCCGGCCATCGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103608 CATGGCCCTGGCCCAGCTCCTCGTGGAGCAGAACTTCCCGGCCATCGCCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 TCCACCGGGGCATGGCCCAGGAGGAGCG         CCTGTCACGCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 103658 TCCACCGGGGCATGGCCCAGGAGGAGCGGTG...CAGCCTGTCACGCTAT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 CAGCAGTTCAAGGATTTCCAGCGGCGGATCCTGGTGGCCACCAATCTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103787 CAGCAGTTCAAGGATTTCCAGCGGCGGATCCTGGTGGCCACCAATCTGTT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 TGGCCGGGGGATGGACATCGAGCGAGTCAACATCGTCTTTAACTACGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103837 TGGCCGGGGGATGGACATCGAGCGAGTCAACATCGTCTTTAACTACGACA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 TGCCTGAGGACTCGGACACCTACCTGCACCGG         GTGGCCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 103887 TGCCTGAGGACTCGGACACCTACCTGCACCGGGTG...CAGGTGGCCCGG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 GCGGGTCGCTTTGGCACCAAAGGCCTAGCCATCACTTTTGTGTCTGACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104046 GCGGGTCGCTTTGGCACCAAAGGCCTAGCCATCACTTTTGTGTCTGACGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 GAATGATGCCAAAATCCTCAATGACGTCCAGGACCGGTTTGAAGTTAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104096 GAATGATGCCAAAATCCTCAATGACGTCCAGGACCGGTTTGAAGTTAATG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 TGGCAGAACTTCCAGAGGAAATCGACATCTCCACATACA         TC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 104146 TGGCAGAACTTCCAGAGGAAATCGACATCTCCACATACAGTA...CAGTC

   1350     .    :
   1270 GAGCAGAGCCGG
        ||||||||||||
 104271 GAGCAGAGCCGG