seq1 = pF1KE2676.tfa, 4386 bp
seq2 = pF1KE2676/gi568815575f_24599425.tfa (gi568815575f:24599425_25095947), 496523 bp

>pF1KE2676 4386
>gi568815575f:24599425_25095947 (ChrX)

1-25  (94538-94562)   100% ->
26-150  (100001-100125)   99% ->
151-247  (103827-103923)   100% ->
248-328  (104965-105045)   100% ->
329-444  (115130-115245)   100% ->
445-507  (115717-115779)   100% ->
508-600  (116938-117030)   100% ->
601-688  (117460-117547)   100% ->
689-890  (117866-118067)   100% ->
891-1069  (118156-118334)   100% ->
1070-1182  (123731-123843)   100% ->
1183-1299  (124911-125027)   100% ->
1300-1374  (126557-126631)   100% ->
1375-1513  (127509-127647)   100% ->
1514-1668  (128358-128512)   100% ->
1669-1753  (132946-133030)   100% ->
1754-1815  (134331-134392)   100% ->
1816-1905  (135975-136064)   100% ->
1906-2022  (138201-138317)   100% ->
2023-2198  (139951-140126)   100% ->
2199-2328  (141951-142080)   100% ->
2329-2448  (142578-142697)   100% ->
2449-2548  (143806-143905)   100% ->
2549-2673  (145994-146118)   100% ->
2674-2823  (148887-149036)   100% ->
2824-2946  (149446-149568)   100% ->
2947-2979  (210474-210506)   100% ->
2980-3072  (211284-211376)   100% ->
3073-3278  (213234-213439)   100% ->
3279-3411  (215555-215687)   100% ->
3412-3543  (222028-222159)   100% ->
3544-3718  (227003-227177)   99% ->
3719-3897  (242228-242406)   100% ->
3898-4029  (244122-244253)   100% ->
4030-4146  (288582-288698)   100% ->
4147-4243  (331029-331125)   100% ->
4244-4386  (396381-396523)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCACCTGTGCACGGCGACGACT         CTCTGTCAGATTCAGG
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
  94538 ATGGCACCTGTGCACGGCGACGACTGTG...CAGCTCTGTCAGATTCAGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 GAGTTTTGTATCTTCTCGAGCCCGGCGAGAAAAAAAATCAAAGAAGGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100017 GAGTTTTGTATCTTCTCGAGCCCGGCGAGAAAAAAAATCAAAGAAGGGGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GCCAAGAAGCCCTAGAAAGACTGAAAAAGGCTAAAGCTGGTGAAAAGTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
 100067 GCCAAGAAGCCCTAGAAAGACTGAAAAAGGCTAAAGCTGGTGAGAAGTAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AAATATGAA         GTCGAGGACTTCACAGGTGTTTATGAAGAAGT
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 100117 AAATATGAAGTA...TAGGTCGAGGACTTCACAGGTGTTTATGAAGAAGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TGATGAAGAACAGTATTCGAAGCTGGTTCAGGCACGCCAGGATGATGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103859 TGATGAAGAACAGTATTCGAAGCTGGTTCAGGCACGCCAGGATGATGACT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GGATTGTGGATGATG         ATGGTATTGGCTATGTGGAAGATGGC
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 103909 GGATTGTGGATGATGGTA...CAGATGGTATTGGCTATGTGGAAGATGGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 CGAGAGATTTTTGATGATGACCTTGAAGATGATGCCCTTGATGCTGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104991 CGAGAGATTTTTGATGATGACCTTGAAGATGATGCCCTTGATGCTGATGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GAAAG         GAAAAGATGGTAAAGCACGCAATAAAGACAAGAGGA
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105041 GAAAGGTA...TAGGAAAAGATGGTAAAGCACGCAATAAAGACAAGAGGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 ATGTAAAGAAGCTCGCAGTGACAAAACCGAACAACATTAAGTCAATGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115166 ATGTAAAGAAGCTCGCAGTGACAAAACCGAACAACATTAAGTCAATGTTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 ATTGCTTGTGCTGGAAAGAAAACTGCAGAT         AAAGCTGTAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 115216 ATTGCTTGTGCTGGAAAGAAAACTGCAGATGTG...CAGAAAGCTGTAGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 CTTGTCCAAGGATGGTCTGCTAGGTGACATTCTACAGGATCTTAACACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115728 CTTGTCCAAGGATGGTCTGCTAGGTGACATTCTACAGGATCTTAACACTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 AG         ACACCTCAAATAACTCCACCACCTGTAATGATACTGAAG
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115778 AGGTA...TAGACACCTCAAATAACTCCACCACCTGTAATGATACTGAAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    547 AAGAAAAGATCCATTGGAGCTTCACCGAATCCTTTCTCTGTGCACACCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116977 AAGAAAAGATCCATTGGAGCTTCACCGAATCCTTTCTCTGTGCACACCGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 CACG         GCAGTTCCTTCAGGAAAAATTGCTTCCCCTGTCTCCA
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117027 CACGGTA...CAGGCAGTTCCTTCAGGAAAAATTGCTTCCCCTGTCTCCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    638 GAAAGGAGCCTCCATTAACTCCTGTTCCTCTTAAACGTGCTGAATTTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117497 GAAAGGAGCCTCCATTAACTCCTGTTCCTCTTAAACGTGCTGAATTTGCT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    688 G         GCGATGATGTACAGGTCGAGAGTACAGAAGAAGAGCAGGA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117547 GGTA...CAGGCGATGATGTACAGGTCGAGAGTACAGAAGAAGAGCAGGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    729 GTCAGGGGCAATGGAGTTTGAAGATGGTGACTTTGATGAGCCCATGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117906 GTCAGGGGCAATGGAGTTTGAAGATGGTGACTTTGATGAGCCCATGGAAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    779 TTGAAGAGGTGGACCTGGAGCCTATGGCTGCCAAGGCTTGGGACAAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117956 TTGAAGAGGTGGACCTGGAGCCTATGGCTGCCAAGGCTTGGGACAAAGAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    829 AGTGAGCCAGCAGAGGAAGTGAAACAAGAGGCGGATTCTGGGAAAGGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118006 AGTGAGCCAGCAGAGGAAGTGAAACAAGAGGCGGATTCTGGGAAAGGGAC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 CGTGTCCTACTT         AGGAAGTTTTCTCCCGGATGTCTCTTGTT
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 118056 CGTGTCCTACTTGTA...CAGAGGAAGTTTTCTCCCGGATGTCTCTTGTT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    920 GGGACATTGATCAAGAAGGTGATAGCAGTTTCTCAGTGCAAGAAGTTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118185 GGGACATTGATCAAGAAGGTGATAGCAGTTTCTCAGTGCAAGAAGTTCAA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    970 GTGGATTCCAGTCACCTCCCATTGGTAAAAGGGGCAGATGAGGAACAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118235 GTGGATTCCAGTCACCTCCCATTGGTAAAAGGGGCAGATGAGGAACAAGT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 ATTCCACTTTTATTGGTTGGATGCTTATGAGGATCAGTACAACCAACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118285 ATTCCACTTTTATTGGTTGGATGCTTATGAGGATCAGTACAACCAACCAG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070          GTGTGGTATTTCTGTTTGGGAAAGTTTGGATTGAATCAGCC
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118335 GTA...CAGGTGTGGTATTTCTGTTTGGGAAAGTTTGGATTGAATCAGCC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1111 GAGACCCATGTGAGCTGTTGTGTCATGGTGAAAAATATCGAGCGAACGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123772 GAGACCCATGTGAGCTGTTGTGTCATGGTGAAAAATATCGAGCGAACGCT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1161 TTACTTCCTTCCCCGTGAAATG         AAAATTGATCTAAATACGG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 123822 TTACTTCCTTCCCCGTGAAATGGTA...CAGAAAATTGATCTAAATACGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1202 GGAAAGAAACAGGAACTCCAATTTCAATGAAGGATGTTTATGAGGAATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124930 GGAAAGAAACAGGAACTCCAATTTCAATGAAGGATGTTTATGAGGAATTT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1252 GATGAGAAAATAGCAACAAAATATAAAATTATGAAGTTCAAGTCTAAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 124980 GATGAGAAAATAGCAACAAAATATAAAATTATGAAGTTCAAGTCTAAGGT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1300        CCAGTGGAAAAGAACTATGCTTTTGAGATACCTGATGTTCCAG
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125030 T...CAGCCAGTGGAAAAGAACTATGCTTTTGAGATACCTGATGTTCCAG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1343 AAAAATCTGAGTACTTGGAAGTTAAATACTCG         GCTGAAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 126600 AAAAATCTGAGTACTTGGAAGTTAAATACTCGGTA...CAGGCTGAAATG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1384 CCACAGCTTCCTCAAGATTTGAAAGGAGAAACTTTTTCTCATGTATTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127518 CCACAGCTTCCTCAAGATTTGAAAGGAGAAACTTTTTCTCATGTATTTGG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1434 GACCAACACATCTAGCCTGGAACTGTTCTTGATGAACAGAAAGATCAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127568 GACCAACACATCTAGCCTGGAACTGTTCTTGATGAACAGAAAGATCAAAG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1484 GACCTTGTTGGCTTGAAGTAAAAAGTCCAC         AGCTCTTGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 127618 GACCTTGTTGGCTTGAAGTAAAAAGTCCACGTA...CAGAGCTCTTGAAT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1525 CAGCCAGTCAGTTGGTGTAAAGTTGAGGCAATGGCTTTGAAACCAGACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128369 CAGCCAGTCAGTTGGTGTAAAGTTGAGGCAATGGCTTTGAAACCAGACCT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1575 GGTGAATGTAATTAAGGATGTCAGTCCACCACCGCTTGTCGTGATGGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128419 GGTGAATGTAATTAAGGATGTCAGTCCACCACCGCTTGTCGTGATGGCTT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1625 TCAGCATGAAGACAATGCAGAATGCAAAGAACCATCAAAATGAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 128469 TCAGCATGAAGACAATGCAGAATGCAAAGAACCATCAAAATGAGGTT...

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1669    ATTATTGCTATGGCAGCTTTGGTCCATCACAGTTTTGCATTGGATAA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132943 CAGATTATTGCTATGGCAGCTTTGGTCCATCACAGTTTTGCATTGGATAA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1716 AGCAGCCCCAAAGCCTCCCTTTCAGTCACACTTCTGTG         TTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 132993 AGCAGCCCCAAAGCCTCCCTTTCAGTCACACTTCTGTGGTA...CAGTTG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1757 TGTCTAAACCAAAGGACTGTATTTTTCCATATGCTTTCAAAGAAGTCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134334 TGTCTAAACCAAAGGACTGTATTTTTCCATATGCTTTCAAAGAAGTCATT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1807 GAGAAAAAG         AATGTGAAGGTTGAGGTTGCTGCAACAGAAAG
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 134384 GAGAAAAAGGTA...CAGAATGTGAAGGTTGAGGTTGCTGCAACAGAAAG

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1848 AACACTGCTAGGTTTTTTCCTTGCAAAAGTTCACAAAATTGATCCTGATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136007 AACACTGCTAGGTTTTTTCCTTGCAAAAGTTCACAAAATTGATCCTGATA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1898 TCATTGTG         GGTCATAATATTTATGGGTTTGAACTGGAAGTA
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 136057 TCATTGTGGTG...TAGGGTCATAATATTTATGGGTTTGAACTGGAAGTA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1939 CTACTGCAGAGAATTAATGTGTGCAAAGCTCCTCACTGGTCCAAGATAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138234 CTACTGCAGAGAATTAATGTGTGCAAAGCTCCTCACTGGTCCAAGATAGG

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1989 TCGACTGAAGCGATCCAACATGCCAAAGCTTGGG         GGCCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 138284 TCGACTGAAGCGATCCAACATGCCAAAGCTTGGGGTA...TAGGGCCGGA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2030 GTGGATTTGGTGAAAGAAATGCTACCTGTGGTCGAATGATCTGTGATGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139958 GTGGATTTGGTGAAAGAAATGCTACCTGTGGTCGAATGATCTGTGATGTG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2080 GAAATTTCAGCAAAGGAATTGATTCGTTGTAAAAGCTACCATCTGTCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140008 GAAATTTCAGCAAAGGAATTGATTCGTTGTAAAAGCTACCATCTGTCTGA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2130 ACTTGTTCAGCAGATTCTAAAAACTGAAAGGGTTGTAATCCCAATGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140058 ACTTGTTCAGCAGATTCTAAAAACTGAAAGGGTTGTAATCCCAATGGAAA

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2180 ATATACAAAATATGTACAG         TGAATCTTCTCAACTGTTATAC
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 140108 ATATACAAAATATGTACAGGTA...CAGTGAATCTTCTCAACTGTTATAC

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2221 CTGTTGGAACACACCTGGAAAGATGCCAAGTTCATTTTGCAGATCATGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141973 CTGTTGGAACACACCTGGAAAGATGCCAAGTTCATTTTGCAGATCATGTG

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2271 TGAGCTAAATGTTCTTCCATTAGCATTGCAGATCACTAACATCGCTGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142023 TGAGCTAAATGTTCTTCCATTAGCATTGCAGATCACTAACATCGCTGGGA

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2321 ACATTATG         TCCAGGACGCTGATGGGTGGACGATCCGAGCGT
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 142073 ACATTATGGTA...TAGTCCAGGACGCTGATGGGTGGACGATCCGAGCGT

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2362 AACGAGTTCTTGTTGCTTCATGCATTTTACGAAAACAACTATATTGTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142611 AACGAGTTCTTGTTGCTTCATGCATTTTACGAAAACAACTATATTGTGCC

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2412 TGACAAGCAGATTTTCAGAAAGCCTCAGCAAAAACTG         GGAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 142661 TGACAAGCAGATTTTCAGAAAGCCTCAGCAAAAACTGGTG...TAGGGAG

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2453 ATGAAGATGAAGAAATTGATGGAGATACCAATAAATACAAGAAAGGACGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143810 ATGAAGATGAAGAAATTGATGGAGATACCAATAAATACAAGAAAGGACGT

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2503 AAGAAAGCAGCTTATGCTGGAGGCTTGGTTTTGGACCCCAAAGTTG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 143860 AAGAAAGCAGCTTATGCTGGAGGCTTGGTTTTGGACCCCAAAGTTGGTA.

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2549      GTTTTTATGATAAGTTCATTTTGCTTCTGGACTTCAACAGTCTAT
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143910 ..CAGGTTTTTATGATAAGTTCATTTTGCTTCTGGACTTCAACAGTCTAT

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2594 ATCCTTCCATCATTCAGGAATTTAACATTTGTTTTACAACAGTACAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146039 ATCCTTCCATCATTCAGGAATTTAACATTTGTTTTACAACAGTACAAAGA

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2644 GTTGCTTCAGAGGCACAGAAAGTTACAGAG         GATGGAGAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 146089 GTTGCTTCAGAGGCACAGAAAGTTACAGAGGTT...CAGGATGGAGAACA

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2685 AGAACAGATCCCTGAGTTGCCAGATCCAAGCTTAGAAATGGGCATTTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148898 AGAACAGATCCCTGAGTTGCCAGATCCAAGCTTAGAAATGGGCATTTTGC

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2735 CCAGAGAGATCCGGAAACTGGTAGAACGGAGAAAACAAGTCAAACAGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148948 CCAGAGAGATCCGGAAACTGGTAGAACGGAGAAAACAAGTCAAACAGCTA

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2785 ATGAAACAGCAAGACTTAAATCCAGACCTTATTCTTCAG         TA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 148998 ATGAAACAGCAAGACTTAAATCCAGACCTTATTCTTCAGGTA...CAGTA

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2826 TGACATTCGACAGAAGGCTTTGAAGCTCACAGCGAACAGTATGTATGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149448 TGACATTCGACAGAAGGCTTTGAAGCTCACAGCGAACAGTATGTATGGTT

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2876 GCCTGGGATTTTCCTATAGCAGATTTTACGCCAAACCACTGGCTGCCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149498 GCCTGGGATTTTCCTATAGCAGATTTTACGCCAAACCACTGGCTGCCTTG

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2926 GTGACATACAAAGGAAGGGAG         ATTTTGATGCATACGAAAGA
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 149548 GTGACATACAAAGGAAGGGAGGTA...TAGATTTTGATGCATACGAAAGA

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2967 GATGGTACAAAAG         ATGAATCTTGAAGTTATTTATGGAGATA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 210494 GATGGTACAAAAGGTA...CAGATGAATCTTGAAGTTATTTATGGAGATA

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3008 CAGATTCAATTATGATAAACACCAATAGCACCAATCTGGAAGAAGTATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 211312 CAGATTCAATTATGATAAACACCAATAGCACCAATCTGGAAGAAGTATTT

   3300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3058 AAGTTGGGAAACAAG         GTAAAAAGTGAAGTGAATAAGTTGTA
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 211362 AAGTTGGGAAACAAGGTG...CAGGTAAAAAGTGAAGTGAATAAGTTGTA

   3350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3099 CAAACTGCTTGAAATAGACATTGATGGGGTTTTCAAGTCTCTGCTACTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 213260 CAAACTGCTTGAAATAGACATTGATGGGGTTTTCAAGTCTCTGCTACTGC

   3400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3149 TGAAAAAAAAGAAGTACGCTGCTCTGGTTGTTGAGCCAACGTCGGATGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 213310 TGAAAAAAAAGAAGTACGCTGCTCTGGTTGTTGAGCCAACGTCGGATGGG

   3450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3199 AATTATGTCACCAAACAGGAGCTCAAAGGATTAGATATAGTTAGAAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 213360 AATTATGTCACCAAACAGGAGCTCAAAGGATTAGATATAGTTAGAAGAGA

   3500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3249 TTGGTGTGATCTTGCTAAAGACACTGGAAA         CTTTGTGATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 213410 TTGGTGTGATCTTGCTAAAGACACTGGAAAGTG...CAGCTTTGTGATTG

   3550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3290 GCCAGATTCTTTCTGATCAAAGCCGGGACACTATAGTGGAAAACATTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 215566 GCCAGATTCTTTCTGATCAAAGCCGGGACACTATAGTGGAAAACATTCAG

   3600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3340 AAGAGGCTGATAGAAATTGGAGAAAATGTGCTAAATGGCAGTGTCCCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 215616 AAGAGGCTGATAGAAATTGGAGAAAATGTGCTAAATGGCAGTGTCCCAGT

   3650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3390 GAGCCAGTTTGAAATTAACAAG         GCATTGACAAAGGATCCCC
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 215666 GAGCCAGTTTGAAATTAACAAGGTA...TAGGCATTGACAAAGGATCCCC

   3700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3431 AGGATTACCCTGATAAAAAAAGCCTACCTCATGTACATGTTGCCCTCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 222047 AGGATTACCCTGATAAAAAAAGCCTACCTCATGTACATGTTGCCCTCTGG

   3750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3481 ATAAATTCTCAAGGAGGCAGAAAGGTGAAAGCTGGAGATACTGTGTCATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 222097 ATAAATTCTCAAGGAGGCAGAAAGGTGAAAGCTGGAGATACTGTGTCATA

   3800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3531 TGTCATCTGTCAG         GATGGATCAAACCTCACTGCAAGTCAGA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 222147 TGTCATCTGTCAGGTA...TAGGATGGATCAAACCTCACTGCAAGTCAGA

   3850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3572 GGGCCTATGCGCCTGAGCAGCTGCAGAAACAGGATAATCTAACCATTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 227031 GGGCCTATGCGCCTGAGCAGCTGCAGAAACAGGATAATCTAACCATTGAC

   3900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3622 ACCCAGTACTACCTGGCCCAGCAGATCCACCCAGTCGTGGCTCGGATCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 227081 ACCCAGTACTACCTGGCCCAGCAGATCCACCCAGTCGTGGCTCGGATCTG

   3950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3672 TGAACCAATAGACGGAATTGATGCTGTACTCATTGCAACGTGGTTGG   
        ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||>>>
 227131 TGAACCAATAGACGGAATTGATGCTGTCCTCATTGCAACGTGGTTGGGTA

   4000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3719       GACTTGACCCCACCCAATTTAGAGTTCATCATTATCATAAAGAT
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 227181 ...TAGGACTTGACCCCACCCAATTTAGAGTTCATCATTATCATAAAGAT

   4050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3763 GAAGAGAATGATGCTCTACTTGGTGGCCCAGCACAGCTCACTGATGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 242272 GAAGAGAATGATGCTCTACTTGGTGGCCCAGCACAGCTCACTGATGAAGA

   4100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3813 GAAATACAGGGACTGTGAAAGATTCAAATGTCCATGCCCTACATGTGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 242322 GAAATACAGGGACTGTGAAAGATTCAAATGTCCATGCCCTACATGTGGAA

   4150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3863 CTGAGAATATTTATGATAATGTCTTTGATGGTTCG         GGAACA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 242372 CTGAGAATATTTATGATAATGTCTTTGATGGTTCGGTT...TAGGGAACA

   4200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3904 GATATGGAGCCCAGCTTGTATCGTTGCAGTAACATCGATTGTAAGGCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 244128 GATATGGAGCCCAGCTTGTATCGTTGCAGTAACATCGATTGTAAGGCTTC

   4250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3954 ACCTCTGACCTTTACAGTACAACTGAGCAACAAATTGATCATGGACATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 244178 ACCTCTGACCTTTACAGTACAACTGAGCAACAAATTGATCATGGACATTA

   4300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   4004 GACGTTTCATTAAAAAGTACTATGAT         GGCTGGTTGATATGT
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 244228 GACGTTTCATTAAAAAGTACTATGATGTA...CAGGGCTGGTTGATATGT

   4350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   4045 GAAGAGCCAACCTGTCGCAATCGAACTCGTCACCTTCCCCTTCAATTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 288597 GAAGAGCCAACCTGTCGCAATCGAACTCGTCACCTTCCCCTTCAATTCTC

   4400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   4095 CCGAACTGGGCCTCTTTGCCCAGCCTGCATGAAAGCTACACTTCAACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 288647 CCGAACTGGGCCTCTTTGCCCAGCCTGCATGAAAGCTACACTTCAACCAG

   4450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   4145 AG         TATTCTGACAAGTCCCTGTACACCCAGCTGTGCTTTTAC
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 288697 AGGTA...CAGTATTCTGACAAGTCCCTGTACACCCAGCTGTGCTTTTAC

   4500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   4186 CGGTACATTTTTGATGCGGAGTGTGCACTGGAGAAACTTACTACCGATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 331068 CGGTACATTTTTGATGCGGAGTGTGCACTGGAGAAACTTACTACCGATCA

   4550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   4236 TGAGAAAG         ATAAATTGAAGAAGCAATTTTTTACCCCCAAAG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 331118 TGAGAAAGGTA...TAGATAAATTGAAGAAGCAATTTTTTACCCCCAAAG

   4600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   4277 TTCTGCAGGACTACAGAAAACTCAAGAACACAGCAGAGCAATTCTTGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 396414 TTCTGCAGGACTACAGAAAACTCAAGAACACAGCAGAGCAATTCTTGTCC

   4650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   4327 CGAAGTGGCTACTCCGAAGTGAATCTGAGCAAACTCTTCGCTGGTTGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 396464 CGAAGTGGCTACTCCGAAGTGAATCTGAGCAAACTCTTCGCTGGTTGTGC

   4700     .    :
   4377 CGTGAAATCC
        ||||||||||
 396514 CGTGAAATCC