seq1 = pF1KE2663.tfa, 1473 bp
seq2 = pF1KE2663/gi568815592f_130340423.tfa (gi568815592f:130340423_130541895), 201473 bp

>pF1KE2663 1473
>gi568815592f:130340423_130541895 (Chr6)

1-1473  (100001-101473)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGATAGCAACTGGTGGAGTGATAACTGGCCTGGCCGCCTTGAAAAGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGATAGCAACTGGTGGAGTGATAACTGGCCTGGCCGCCTTGAAAAGGCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGACTCTGCCAGATCACAGCAGCATGTCAACCTCAGCCCGTCTCCTGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AGACTCTGCCAGATCACAGCAGCATGTCAACCTCAGCCCGTCTCCTGCTA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCCAAGAGAAGAAGCCCATCAGGCGCCGGCCCCGGGCAGATGTTGTGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCCAAGAGAAGAAGCCCATCAGGCGCCGGCCCCGGGCAGATGTTGTGGTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GTTCGTGGCAAAATCCGGCTTTATTCCCCATCTGGTTTTTTTCTTATTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GTTCGTGGCAAAATCCGGCTTTATTCCCCATCTGGTTTTTTTCTTATTTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 AGGAGTGCTCATCTCCATTATAGGAATTGCTATGGCCGTTCTTGGATATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 AGGAGTGCTCATCTCCATTATAGGAATTGCTATGGCCGTTCTTGGATATT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GGCCCCAAAAAGAACATTTTATTGATGCTGAAACAACACTGTCAACAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GGCCCCAAAAAGAACATTTTATTGATGCTGAAACAACACTGTCAACAAAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GAAACTCAGGTCATTCGGAATGAAGGCGGTGTGGTGGTTCGCTTCTTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GAAACTCAGGTCATTCGGAATGAAGGCGGTGTGGTGGTTCGCTTCTTTGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GCAGCATTTGCATTCTGATAAGATGAAAATGCTTGGCCCATTCACCATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GCAGCATTTGCATTCTGATAAGATGAAAATGCTTGGCCCATTCACCATGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GGATTGGCATTTTCATTTTCATTTGTGCTAATGCCATTCTTCATGAAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GGATTGGCATTTTCATTTTCATTTGTGCTAATGCCATTCTTCATGAAAAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CGTGACAAAGAGACCAAAATCATACACATGAGGGATATCTATTCCACAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CGTGACAAAGAGACCAAAATCATACACATGAGGGATATCTATTCCACAGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CATTGACATTCACACGCTAAGAATCAAGGAGCAAAGGCAAATGAACGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CATTGACATTCACACGCTAAGAATCAAGGAGCAAAGGCAAATGAACGGCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TGTACACTGGTTTGATGGGAGAAACAGAAGTAAAACAGAATGGGAGCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TGTACACTGGTTTGATGGGAGAAACAGAAGTAAAACAGAATGGGAGCTCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 TGTGCCTCGAGATTGGCAGCAAATACGATCGCCTCTTTCTCGGGTTTTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 TGTGCCTCGAGATTGGCAGCAAATACGATCGCCTCTTTCTCGGGTTTTCG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GAGCAGTTTTCGAATGGACAGCTCCGTGGAGGAGGATGAACTTATGTTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GAGCAGTTTTCGAATGGACAGCTCCGTGGAGGAGGATGAACTTATGTTAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 ATGAAGGTAAGAGTTCTGGGCATCTTATGCCCCCTTTGCTCTCTGACAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 ATGAAGGTAAGAGTTCTGGGCATCTTATGCCCCCTTTGCTCTCTGACAGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TCTGTGTCTGTCTTTGGCCTCTATCCACCTCCTTCCAAGACAACTGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TCTGTGTCTGTCTTTGGCCTCTATCCACCTCCTTCCAAGACAACTGATGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TAAGACCAGCGGCTCTAAGAAATGTGAAACCAAGTCAATTGTGTCATCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TAAGACCAGCGGCTCTAAGAAATGTGAAACCAAGTCAATTGTGTCATCGT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 CCATCAGTGCTTTTACATTGCCTGTGATCAAACTTAATAACTGTGTTATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 CCATCAGTGCTTTTACATTGCCTGTGATCAAACTTAATAACTGTGTTATT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 GATGAGCCCAGTATAGATAACATCACTGAAGATGCTGACAACCTCAAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 GATGAGCCCAGTATAGATAACATCACTGAAGATGCTGACAACCTCAAAAG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 TAGGTCAAGGAATTTGTCAATGGATTCCCTTGTGGTTCCTTTGCCCAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 TAGGTCAAGGAATTTGTCAATGGATTCCCTTGTGGTTCCTTTGCCCAACA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 CCAGTGAATCCTTCCAGCCCGTCAGCACAGTGCTACCAAGGAATAATTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 CCAGTGAATCCTTCCAGCCCGTCAGCACAGTGCTACCAAGGAATAATTCC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 ATTGGGGAGTCGTTGTCGAGTCAGTACAAGTCATCTATGGCTCTCGGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 ATTGGGGAGTCGTTGTCGAGTCAGTACAAGTCATCTATGGCTCTCGGACC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 TGGGGCTGGACAGCTCTTGTCTCCTGGGGCTGCCAGAAGACAGTTTGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 TGGGGCTGGACAGCTCTTGTCTCCTGGGGCTGCCAGAAGACAGTTTGGGT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 CCAATACATCCTTGCATTTGCTCTCGTCACACTCAAAGTCCTTGGACTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 CCAATACATCCTTGCATTTGCTCTCGTCACACTCAAAGTCCTTGGACTTA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 GACCGGGGTCCCTCCACTCTAACTGTTCAGGCAGAACAACGGAAACATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 GACCGGGGTCCCTCCACTCTAACTGTTCAGGCAGAACAACGGAAACATCC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 AAGTTGGCCTAGGTTGGATCGGAACAACAGCAAGGGATATATGAAACTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 AAGTTGGCCTAGGTTGGATCGGAACAACAGCAAGGGATATATGAAACTAG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 AGAACAAAGAAGACCCGATGGATAGGTTGCTTGTGCCCCAAGTTGCCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 AGAACAAAGAAGACCCGATGGATAGGTTGCTTGTGCCCCAAGTTGCCATC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 AAAAAGGACTTTACCAATAAGGAGAAGCTTCTTATGATTTCAAGATCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 AAAAAGGACTTTACCAATAAGGAGAAGCTTCTTATGATTTCAAGATCTCA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 CAATAATTTGAGTTTTGAACATGATGAGTTTTTGAGTAACAACCTAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101401 CAATAATTTGAGTTTTGAACATGATGAGTTTTTGAGTAACAACCTAAAGA

   1450     .    :    .    :
   1451 GGGGAACTTCTGAAACAAGGTTT
        |||||||||||||||||||||||
 101451 GGGGAACTTCTGAAACAAGGTTT