seq1 = pF1KE2630.tfa, 2457 bp
seq2 = pF1KE2630/gi568815586r_57697885.tfa (gi568815586r:57697885_57916040), 218156 bp

>pF1KE2630 2457
>gi568815586r:57697885_57916040 (Chr12)

(complement)

1-66  (100001-100066)   100% ->
67-141  (101815-101889)   100% ->
142-338  (102618-102814)   100% ->
339-447  (104914-105022)   100% ->
448-558  (105115-105225)   100% ->
559-761  (105490-105692)   100% ->
762-840  (106151-106229)   100% ->
841-939  (106346-106444)   100% ->
940-1093  (107493-107646)   100% ->
1094-1194  (107747-107847)   100% ->
1195-1332  (108314-108451)   100% ->
1333-1491  (108552-108710)   100% ->
1492-1671  (109502-109681)   100% ->
1672-1817  (112372-112517)   100% ->
1818-1962  (112650-112794)   100% ->
1963-2151  (113693-113881)   100% ->
2152-2220  (114829-114897)   100% ->
2221-2346  (116121-116246)   100% ->
2347-2457  (118046-118156)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCTCTGACCAGTGCCTTCAGGGCTGTGGACAACGACCCTGGGATCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCTCTGACCAGTGCCTTCAGGGCTGTGGACAACGACCCTGGGATCAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGTCTGGAGAATAGAG         AAAATGGAGCTGGCGCTGGTGCCTG
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 100051 TGTCTGGAGAATAGAGGTG...CAGAAAATGGAGCTGGCGCTGGTGCCTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TGAGCGCCCACGGCAACTTCTATGAGGGGGACTGCTACGTCATCCTCTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101840 TGAGCGCCCACGGCAACTTCTATGAGGGGGACTGCTACGTCATCCTCTCG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142          ACCCGGAGAGTGGCCAGTCTCCTATCCCAGGACATCCACTT
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101890 GTG...CAGACCCGGAGAGTGGCCAGTCTCCTATCCCAGGACATCCACTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CTGGATCGGGAAGGACTCCTCCCAGGATGAGCAAAGCTGCGCAGCCATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102659 CTGGATCGGGAAGGACTCCTCCCAGGATGAGCAAAGCTGCGCAGCCATAT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ATACCACACAGCTGGACGACTACCTGGGAGGCAGCCCTGTGCAGCACCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102709 ATACCACACAGCTGGACGACTACCTGGGAGGCAGCCCTGTGCAGCACCGA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GAGGTCCAGTACCATGAGTCAGACACTTTCCGTGGCTACTTCAAGCAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102759 GAGGTCCAGTACCATGAGTCAGACACTTTCCGTGGCTACTTCAAGCAGGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CATCAT         CTACAAGCAGGGGGGTGTCGCCTCTGGGATGAAGC
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102809 CATCATGTG...TAGCTACAAGCAGGGGGGTGTCGCCTCTGGGATGAAGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 ACGTGGAGACCAATACCTACGACGTGAAGCGGCTGCTACATGTGAAAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104949 ACGTGGAGACCAATACCTACGACGTGAAGCGGCTGCTACATGTGAAAGGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 AAAAGAAACATCAGGGCTACCGAG         GTGGAAATGAGCTGGGA
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 104999 AAAAGAAACATCAGGGCTACCGAGGTT...CAGGTGGAAATGAGCTGGGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 CAGTTTCAACCGAGGTGATGTCTTCTTGCTGGACCTTGGGAAAGTCATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105132 CAGTTTCAACCGAGGTGATGTCTTCTTGCTGGACCTTGGGAAAGTCATCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TCCAATGGAATGGCCCAGAGAGCAACAGTGGGGAGCGCCTGAAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 105182 TCCAATGGAATGGCCCAGAGAGCAACAGTGGGGAGCGCCTGAAGGTA...

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    559    GCTATGCTTCTGGCAAAGGATATTCGAGACAGGGAGCGAGGGGGCCG
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105487 CAGGCTATGCTTCTGGCAAAGGATATTCGAGACAGGGAGCGAGGGGGCCG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 TGCTAAAATAGGAGTGATCGAGGGAGACAAGGAGGCAGCCAGCCCAGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105537 TGCTAAAATAGGAGTGATCGAGGGAGACAAGGAGGCAGCCAGCCCAGAGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 TGATGAAGGTCCTTCAGGACACCCTTGGCCGACGCTCCATTATCAAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105587 TGATGAAGGTCCTTCAGGACACCCTTGGCCGACGCTCCATTATCAAGCCT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 ACAGTCCCTGATGAGATCATAGATCAGAAGCAGAAATCAACTATCATGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105637 ACAGTCCCTGATGAGATCATAGATCAGAAGCAGAAATCAACTATCATGTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 GTATCA         TATCTCAGATTCAGCTGGGCAGCTGGCAGTCACAG
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105687 GTATCAGTG...CAGTATCTCAGATTCAGCTGGGCAGCTGGCAGTCACAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 AGGTAGCAACAAGGCCTCTGGTCCAGGACTTACTGAACCATGAT      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 106186 AGGTAGCAACAAGGCCTCTGGTCCAGGACTTACTGAACCATGATGTA...

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    841    GACTGCTACATCCTGGACCAAAGTGGAACCAAAATCTACGTGTGGAA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106343 TAGGACTGCTACATCCTGGACCAAAGTGGAACCAAAATCTACGTGTGGAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 AGGAAAAGGAGCCACAAAGGCTGAAAAACAGGCAGCCATGTCTAAAGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106393 AGGAAAAGGAGCCACAAAGGCTGAAAAACAGGCAGCCATGTCTAAAGCGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 TG         GGCTTCATCAAGATGAAGAGCTACCCCAGCAGCACCAAT
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106443 TGGTA...CAGGGCTTCATCAAGATGAAGAGCTACCCCAGCAGCACCAAT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 GTGGAGACCGTCAACGATGGTGCTGAGTCGGCCATGTTCAAGCAGCTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107532 GTGGAGACCGTCAACGATGGTGCTGAGTCGGCCATGTTCAAGCAGCTGTT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 CCAGAAGTGGTCAGTAAAGGACCAGACCATGGGCCTGGGGAAAACGTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107582 CCAGAAGTGGTCAGTAAAGGACCAGACCATGGGCCTGGGGAAAACGTTCA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 GCATTGGTAAAATTG         CTAAAGTTTTCCAGGATAAATTTGAT
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 107632 GCATTGGTAAAATTGGTG...CAGCTAAAGTTTTCCAGGATAAATTTGAT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 GTGACTCTGCTACACACCAAGCCAGAGGTAGCTGCCCAGGAAAGAATGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107773 GTGACTCTGCTACACACCAAGCCAGAGGTAGCTGCCCAGGAAAGAATGGT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 CGATGATGGCAACGGAAAAGTTGAG         GTCTGGAGAATTGAGA
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 107823 CGATGATGGCAACGGAAAAGTTGAGGTA...CAGGTCTGGAGAATTGAGA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1211 ACCTGGAGCTGGTCCCTGTGGAGTATCAATGGTATGGCTTCTTTTATGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108330 ACCTGGAGCTGGTCCCTGTGGAGTATCAATGGTATGGCTTCTTTTATGGG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1261 GGAGACTGTTATCTGGTCCTCTACACATACGAGGTAAATGGGAAGCCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108380 GGAGACTGTTATCTGGTCCTCTACACATACGAGGTAAATGGGAAGCCACA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 TCACATCTTGTACATCTGGCAG         GGCCGCCACGCCTCACAGG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 108430 TCACATCTTGTACATCTGGCAGGTA...CAGGGCCGCCACGCCTCACAGG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1352 ATGAGCTGGCAGCCTCAGCATACCAGGCAGTGGAGGTGGATCGGCAGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108571 ATGAGCTGGCAGCCTCAGCATACCAGGCAGTGGAGGTGGATCGGCAGTTT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1402 GATGGGGCTGCTGTGCAGGTTCGAGTCAGGATGGGAACGGAGCCACGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108621 GATGGGGCTGCTGTGCAGGTTCGAGTCAGGATGGGAACGGAGCCACGCCA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1452 CTTCATGGCCATCTTCAAAGGGAAGCTAGTTATCTTTGAG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 108671 CTTCATGGCCATCTTCAAAGGGAAGCTAGTTATCTTTGAGGTG...TAGG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1493 GTGGGACTTCCAGGAAGGGAAATGCCGAGCCTGACCCTCCAGTAAGACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109503 GTGGGACTTCCAGGAAGGGAAATGCCGAGCCTGACCCTCCAGTAAGACTC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1543 TTCCAAATTCATGGAAATGACAAATCTAACACCAAAGCAGTGGAAGTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109553 TTCCAAATTCATGGAAATGACAAATCTAACACCAAAGCAGTGGAAGTTCC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1593 AGCCTTTGCCTCCTCCCTAAACTCCAATGATGTCTTTCTGCTGCGAACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109603 AGCCTTTGCCTCCTCCCTAAACTCCAATGATGTCTTTCTGCTGCGAACTC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1643 AGGCAGAGCACTACCTGTGGTATGGCAAG         GGGTCTAGTGGG
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 109653 AGGCAGAGCACTACCTGTGGTATGGCAAGGTA...CAGGGGTCTAGTGGG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1684 GATGAGCGGGCAATGGCTAAGGAGCTGGCCAGCCTTCTCTGTGATGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112384 GATGAGCGGGCAATGGCTAAGGAGCTGGCCAGCCTTCTCTGTGATGGCAG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1734 CGAGAACACTGTGGCCGAGGGCCAGGAGCCAGCCGAGTTCTGGGACCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112434 CGAGAACACTGTGGCCGAGGGCCAGGAGCCAGCCGAGTTCTGGGACCTAC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1784 TGGGAGGGAAAACTCCCTATGCCAATGATAAAAG         ACTTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 112484 TGGGAGGGAAAACTCCCTATGCCAATGATAAAAGGTA...CAGACTTCAG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1825 CAGGAAATCCTAGATGTCCAGTCTCGTCTCTTTGAATGTTCCAATAAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112657 CAGGAAATCCTAGATGTCCAGTCTCGTCTCTTTGAATGTTCCAATAAGAC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1875 CGGCCAATTCGTTGTCACTGAGATCACAGACTTCACCCAGGATGACCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112707 CGGCCAATTCGTTGTCACTGAGATCACAGACTTCACCCAGGATGACCTGA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1925 ACCCTACTGACGTGATGCTCCTAGATACCTGGGACCAG         GTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 112757 ACCCTACTGACGTGATGCTCCTAGATACCTGGGACCAGGTA...CAGGTG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1966 TTCTTGTGGATTGGGGCTGAGGCCAATGCCACGGAGAAGGAGAGTGCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113696 TTCTTGTGGATTGGGGCTGAGGCCAATGCCACGGAGAAGGAGAGTGCCCT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2016 TGCCACAGCACAGCAGTACCTGCACACTCACCCCAGCGGCCGAGATCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113746 TGCCACAGCACAGCAGTACCTGCACACTCACCCCAGCGGCCGAGATCCCG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2066 ACACACCAATCCTGATCATTAAGCAGGGGTTTGAGCCTCCCATCTTCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113796 ACACACCAATCCTGATCATTAAGCAGGGGTTTGAGCCTCCCATCTTCACA

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2116 GGCTGGTTCCTAGCCTGGGACCCTAACATTTGGAGT         GCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 113846 GGCTGGTTCCTAGCCTGGGACCCTAACATTTGGAGTGTA...CAGGCAGG

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2157 AAAAACATATGAACAATTAAAAGAAGAGCTGGGAGATGCTGCTGCTATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114834 AAAAACATATGAACAATTAAAAGAAGAGCTGGGAGATGCTGCTGCTATCA

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2207 TGCGAATCACTGCT         GACATGAAGAATGCAACCCTCTCCCTG
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 114884 TGCGAATCACTGCTGTG...TAGGACATGAAGAATGCAACCCTCTCCCTG

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2248 AATTCTAATGACAGTGAGCCAAAATATTACCCTATAGCAGTTCTGTTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116148 AATTCTAATGACAGTGAGCCAAAATATTACCCTATAGCAGTTCTGTTGAA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2298 AAACCAGAATCAGGAGCTGCCTGAGGATGTAAACCCTGCCAAAAAGGAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 116198 AAACCAGAATCAGGAGCTGCCTGAGGATGTAAACCCTGCCAAAAAGGAGG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2347         AATTACCTCTCTGAACAGGACTTTGTGTCTGTGTTTGGCATC
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116248 TG...TAGAATTACCTCTCTGAACAGGACTTTGTGTCTGTGTTTGGCATC

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2389 ACAAGAGGGCAATTTGCAGCTCTGCCTGGCTGGAAACAGCTCCAAATGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118088 ACAAGAGGGCAATTTGCAGCTCTGCCTGGCTGGAAACAGCTCCAAATGAA

   2600     .    :    .
   2439 GAAAGAAAAGGGGCTTTTC
        |||||||||||||||||||
 118138 GAAAGAAAAGGGGCTTTTC