seq1 = pF1KE2625.tfa, 1338 bp
seq2 = pF1KE2625/gi568815581r_68321776.tfa (gi568815581r:68321776_68557421), 235646 bp

>pF1KE2625 1338
>gi568815581r:68321776_68557421 (Chr17)

(complement)

1-80  (100001-100080)   100% ->
81-163  (104430-104512)   98% ->
164-333  (106525-106694)   100% ->
334-430  (112833-112929)   100% ->
431-528  (120943-121040)   100% ->
529-621  (121710-121802)   100% ->
622-692  (122796-122866)   100% ->
693-800  (123847-123954)   100% ->
801-965  (127262-127426)   100% ->
966-1073  (128486-128593)   100% ->
1074-1192  (130169-130287)   100% ->
1193-1293  (131247-131347)   100% ->
1294-1338  (135602-135646)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGGCCGAGGCCGCGGACGCTCCCCCGGGCGGGGTTGAGTCGGCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGGCCGAGGCCGCGGACGCTCCCCCGGGCGGGGTTGAGTCGGCGCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAGCTGCTTCTCTTTCAACCAGGACTGCAC         ATCCCTAGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 100051 CAGCTGCTTCTCTTTCAACCAGGACTGCACGTA...CAGATCCCTAGCAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TTGGAACTAAAGCCGGGTATAAGCTGTTTTCTCTGAGTTCTGTGGAGCAG
         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104441 CTGGAACTAAAGCCGGGTATAAGCTGTTTTCTCTGAGTTCTGTGGAGCAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CTGGATCAAGTCCACGGAAGCA         ATGAAATCCCGGACGTCTA
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 104491 CTGGATCAAGTCCACGGAAGCAGTA...CAGATGAAATCCCGGACGTCTA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CATCGTGGAGCGCCTCTTCTCCAGCAGCCTGGTGGTGGTAGTCAGTCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106544 CATCGTGGAGCGCCTCTTCTCCAGCAGCCTGGTGGTGGTAGTCAGTCACA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CAAAACCACGGCAGATGAACGTGTATCACTTCAAGAAAGGCACAGAGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106594 CAAAACCACGGCAGATGAACGTGTATCACTTCAAGAAAGGCACAGAGATC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TGTAATTACAGCTACTCCAGCAACATCTTGTCCATAAGGCTGAACCGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106644 TGTAATTACAGCTACTCCAGCAACATCTTGTCCATAAGGCTGAACCGGCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 A         AGGCTGCTGGTTTGCCTAGAAGAGTCCATTTATATTCACA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106694 AGTA...CAGAGGCTGCTGGTTTGCCTAGAAGAGTCCATTTATATTCACA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 ACATTAAAGACATGAAGCTGTTGAAGACCCTCCTGGATATTCCTGCAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112873 ACATTAAAGACATGAAGCTGTTGAAGACCCTCCTGGATATTCCTGCAAAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CCAACAG         GTCTATGTGCTCTCTCTATCAACCATTCCAATTC
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112923 CCAACAGGTG...CAGGTCTATGTGCTCTCTCTATCAACCATTCCAATTC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 TTACCTGGCCTATCCTGGAAGCCTGACTTCAGGGGAGATTGTGCTTTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120977 TTACCTGGCCTATCCTGGAAGCCTGACTTCAGGGGAGATTGTGCTTTATG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 ATGGAAACTCCCTG         AAAACAGTCTGCACTATTGCTGCCCAT
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 121027 ATGGAAACTCCCTGGTA...CAGAAAACAGTCTGCACTATTGCTGCCCAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 GAGGGAACACTAGCTGCCATCACCTTCAATGCCTCAGGCTCCAAACTAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121737 GAGGGAACACTAGCTGCCATCACCTTCAATGCCTCAGGCTCCAAACTAGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 AAGTGCGTCTGAAAAA         GGCACAGTCATCCGGGTGTTCTCTG
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 121787 AAGTGCGTCTGAAAAAGTG...CAGGGCACAGTCATCCGGGTGTTCTCTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 TCCCTGATGGGCAAAAGCTCTATGAGTTCCGGAGAGGGATGAAAAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 122821 TCCCTGATGGGCAAAAGCTCTATGAGTTCCGGAGAGGGATGAAAAGGTC.

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    693      GTATGTGACAATCAGCTCTCTAGTGTTCAGTATGGATTCACAATT
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122871 ..TAGGTATGTGACAATCAGCTCTCTAGTGTTCAGTATGGATTCACAATT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 CCTCTGCGCCTCCAGTAACACCGAGACGGTACACATCTTCAAGCTGGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123892 CCTCTGCGCCTCCAGTAACACCGAGACGGTACACATCTTCAAGCTGGAAC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 AGGTCACCAACAG         TCGACCAGAAGAGCCTTCGACCTGGAGT
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 123942 AGGTCACCAACAGGCA...TAGTCGACCAGAAGAGCCTTCGACCTGGAGT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    829 GGCTACATGGGAAAGATGTTTATGGCTGCTACCAACTACCTCCCTACCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127290 GGCTACATGGGAAAGATGTTTATGGCTGCTACCAACTACCTCCCTACCCA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 GGTGTCAGACATGATGCATCAGGACAGGGCTTTTGCCACTGCACGCTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127340 GGTGTCAGACATGATGCATCAGGACAGGGCTTTTGCCACTGCACGCTTGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 ACTTCTCCGGACAGAGGAACATCTGTACCCTCTCAAC         GATC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 127390 ACTTCTCCGGACAGAGGAACATCTGTACCCTCTCAACGTA...TAGGATC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    970 CAGAAGTTGCCACGGCTGCTAGTTGCGTCATCCAGTGGACACCTTTATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128490 CAGAAGTTGCCACGGCTGCTAGTTGCGTCATCCAGTGGACACCTTTATAT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 GTACAATTTGGATCCTCAGGATGGAGGAGAGTGTGTCTTAATCAAAACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128540 GTACAATTTGGATCCTCAGGATGGAGGAGAGTGTGTCTTAATCAAAACCC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 ACAG         CTTGCTTGGCTCAGGAACAACAGAAGAGAATAAAGAA
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128590 ACAGGTG...TAGCTTGCTTGGCTCAGGAACAACAGAAGAGAATAAAGAA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1111 AATGACCTCAGACCTTCCTTACCTCAGTCTTATGCAGCGACCGTAGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130206 AATGACCTCAGACCTTCCTTACCTCAGTCTTATGCAGCGACCGTAGCCAG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1161 ACCAAGTGCATCTTCAGCCTCCACGGTGCCAG         GTTATTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 130256 ACCAAGTGCATCTTCAGCCTCCACGGTGCCAGGTG...CAGGTTATTCTG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1202 AGGACGGCGGGGCGCTGCGAGGAGAAGTTATTCCTGAACATGAGTTTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131256 AGGACGGCGGGGCGCTGCGAGGAGAAGTTATTCCTGAACATGAGTTTGCG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1252 ACGGGACCAGTGTGTCTTGATGATGAGAATGAGTTTCCTCCT        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 131306 ACGGGACCAGTGTGTCTTGATGATGAGAATGAGTTTCCTCCTGTG...TA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1294  ATAATCTTGTGCCGTGGAAATCAGAAGGGCAAAACGAAGCAGTCA
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135601 GATAATCTTGTGCCGTGGAAATCAGAAGGGCAAAACGAAGCAGTCA