seq1 = pF1KE2623.tfa, 681 bp
seq2 = pF1KE2623/gi568815591r_132696442.tfa (gi568815591r:132696442_133181937), 485496 bp

>pF1KE2623 681
>gi568815591r:132696442_133181937 (Chr7)

(complement)

1-81  (100001-100081)   100% ->
82-169  (111709-111796)   100% ->
170-251  (157311-157392)   100% ->
252-378  (206652-206774)   96% ==
525-660  (385361-385496)   100% ->
661-681  (396278-396298)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGTGGGACCACCAGCACCCGCCGGGTCACCTTCGAGGCGGACGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGTGGGACCACCAGCACCCGCCGGGTCACCTTCGAGGCGGACGAGAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGAGAACATCACCGTGGTGAAGGGCATCCGG         CTTTCGGAAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 100051 TGAGAACATCACCGTGGTGAAGGGCATCCGGGTG...CAGCTTTCGGAAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ATGTGATTGATCGAATGAAGGAATCCTCTCCATCTGGTTCGAAGTCTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111719 ATGTGATTGATCGAATGAAGGAATCCTCTCCATCTGGTTCGAAGTCTCAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CGGTATTCTGGTGCTTATGGTGCCTCAG         TTTCTGATGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 111769 CGGTATTCTGGTGCTTATGGTGCCTCAGGTA...TAGTTTCTGATGAAGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 ATTGAAAAGAAGAGTAGCTGAGGAGCTGGCATTGGAGCAAGCCAAGAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157324 ATTGAAAAGAAGAGTAGCTGAGGAGCTGGCATTGGAGCAAGCCAAGAAAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AATCCGAAGATCAGAAACG         ACTAAAGCAAGCCAAAGAGCTG
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 157374 AATCCGAAGATCAGAAACGGTG...TAGACTAAAGCAAGCCAAAGAGCTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 GACCGAGAGAGGGCTGCTGCCAATGAGCAGTTAACCAGAGCCATCCTTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 206674 GACCGAGAGAGGGCTGCTGCCAATGAGCAGTTAACCAGAGCCATCCTTCG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GGAGAGGATATGTAGCGAGGAGGAACGCGCTAAGGCAAAGCACCTGGCTA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|-
 206724 GGAGAGGATATGTAGCGAGGAGGAACGCGCTAAGGCAAAGCACCTGG T 

    400     .
    374 GGCAG
        |--||
 206772 G  AG

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    525 GCGATATGAGTCTCATCCAGTCTGTGCTGATCTGCAGGCCAAAATTCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 385361 GCGATATGAGTCTCATCCAGTCTGTGCTGATCTGCAGGCCAAAATTCTTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    575 AGTGTTACCGTGAGAACACCCACCAGACCCTCAAATGCTCCGCTCTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 385411 AGTGTTACCGTGAGAACACCCACCAGACCCTCAAATGCTCCGCTCTGGCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    625 ACCCAGTATATGCACTGTGTCAATCATGCCAAACAG         AGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 385461 ACCCAGTATATGCACTGTGTCAATCATGCCAAACAGGTA...CAGAGCAT

    150     .    :    .
    666 GCTTGAGAAGGGAGGA
        ||||||||||||||||
 396283 GCTTGAGAAGGGAGGA