seq1 = pF1KE2620.tfa, 1644 bp
seq2 = pF1KE2620/gi568815582f_531254.tfa (gi568815582f:531254_734054), 202801 bp

>pF1KE2620 1644
>gi568815582f:531254_734054 (Chr16)

1-171  (100001-100171)   99% ->
172-1644  (101329-102801)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCCGCCCTACGTCCACTCCTGCCTCTCCTGCTCCTCCTCCGGCTGAC
        |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCCGCCCTACGTCCACTCCTGCCGCTCCTGCTCCTCCTCCGGCTGAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTCGGGGGCTGGCTTGCTGCCAGGGCTGGGGAGCCACCCGGGCGTGTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTCGGGGGCTGGCTTGCTGCCAGGGCTGGGGAGCCACCCGGGCGTGTGCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCAACCAGCTCAGCCCCAACCTGTGGGTGGACGCCCAGAGCACCTGTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCAACCAGCTCAGCCCCAACCTGTGGGTGGACGCCCAGAGCACCTGTGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CGCGAGTGTAGCAGGGACCAG         GACTGTGCGGCTGCTGAGAA
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 100151 CGCGAGTGTAGCAGGGACCAGGTG...CAGGACTGTGCGGCTGCTGAGAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GTGCTGCATCAACGTGTGTGGACTGCACAGCTGCGTGGCAGCACGCTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101349 GTGCTGCATCAACGTGTGTGGACTGCACAGCTGCGTGGCAGCACGCTTCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CCGGCAGCCCAGCTGCGCCGACGACAGCGGCCTCCTGCGAGGGCTTTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101399 CCGGCAGCCCAGCTGCGCCGACGACAGCGGCCTCCTGCGAGGGCTTTGTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TGCCCACAGCAGGGCTCGGACTGCGACATCTGGGACGGGCAGCCCGTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101449 TGCCCACAGCAGGGCTCGGACTGCGACATCTGGGACGGGCAGCCCGTGTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CCGCTGCCGCGACCGCTGTGAGAAGGAGCCCAGCTTCACCTGCGCCTCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101499 CCGCTGCCGCGACCGCTGTGAGAAGGAGCCCAGCTTCACCTGCGCCTCGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 ACGGCCTCACCTACTACAACCGCTGCTATATGGACGCCGAGGCCTGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101549 ACGGCCTCACCTACTACAACCGCTGCTATATGGACGCCGAGGCCTGCCTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 CGGGGCCTGCACCTCCACATCGTGCCCTGCAAGCACGTGCTCAGCTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101599 CGGGGCCTGCACCTCCACATCGTGCCCTGCAAGCACGTGCTCAGCTGGCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 GCCCAGCAGCCCGGGGCCGCCGGAGACCACTGCCCGCCCCACACCTGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101649 GCCCAGCAGCCCGGGGCCGCCGGAGACCACTGCCCGCCCCACACCTGGGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 CCGCGCCCGTGCCTCCTGCCCTGTACAGCAGCCCCTCCCCACAGGCGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101699 CCGCGCCCGTGCCTCCTGCCCTGTACAGCAGCCCCTCCCCACAGGCGGTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 CAGGTTGGGGGTACGGCCAGCCTCCACTGCGACGTCAGCGGCCGCCCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101749 CAGGTTGGGGGTACGGCCAGCCTCCACTGCGACGTCAGCGGCCGCCCGCC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 GCCTGCTGTGACCTGGGAGAAGCAGAGTCACCAGCGAGAGAACCTGATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101799 GCCTGCTGTGACCTGGGAGAAGCAGAGTCACCAGCGAGAGAACCTGATCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 TGCGCCCTGATCAGATGTATGGCAACGTGGTGGTCACCAGCATCGGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101849 TGCGCCCTGATCAGATGTATGGCAACGTGGTGGTCACCAGCATCGGGCAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 CTGGTGCTCTACAACGCGCGGCCCGAAGACGCCGGCCTGTACACCTGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101899 CTGGTGCTCTACAACGCGCGGCCCGAAGACGCCGGCCTGTACACCTGCAC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 CGCGCGCAACGCTGCTGGGCTGCTGCGGGCTGACTTCCCACTCTCTGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101949 CGCGCGCAACGCTGCTGGGCTGCTGCGGGCTGACTTCCCACTCTCTGTGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 TCCAGCGAGAGCCGGCCAGGGACGCAGCCCCCAGCATCCCAGCCCCGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101999 TCCAGCGAGAGCCGGCCAGGGACGCAGCCCCCAGCATCCCAGCCCCGGCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 GAGTGCCTGCCGGATGTGCAGGCCTGCACGGGCCCCACTTCCCCACACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102049 GAGTGCCTGCCGGATGTGCAGGCCTGCACGGGCCCCACTTCCCCACACCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 TGTCCTCTGGCACTACGACCCGCAGCGGGGCGGCTGCATGACCTTCCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102099 TGTCCTCTGGCACTACGACCCGCAGCGGGGCGGCTGCATGACCTTCCCGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 CCCGTGGCTGTGATGGGGCGGCCCGCGGCTTTGAGACCTACGAGGCATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102149 CCCGTGGCTGTGATGGGGCGGCCCGCGGCTTTGAGACCTACGAGGCATGC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1042 CAGCAGGCCTGTGCCCGCGGCCCCGGCGACGCCTGCGTGCTGCCTGCCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102199 CAGCAGGCCTGTGCCCGCGGCCCCGGCGACGCCTGCGTGCTGCCTGCCGT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1092 GCAGGGCCCCTGCCGGGGCTGGGAGCCGCGCTGGGCCTACAGCCCGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102249 GCAGGGCCCCTGCCGGGGCTGGGAGCCGCGCTGGGCCTACAGCCCGCTGC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1142 TGCAGCAGTGCCATCCCTTCGTGTACGGTGGCTGCGAGGGCAACGGCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102299 TGCAGCAGTGCCATCCCTTCGTGTACGGTGGCTGCGAGGGCAACGGCAAC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1192 AACTTCCACAGCCGCGAGAGCTGCGAGGATGCCTGCCCCGTGCCGCGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102349 AACTTCCACAGCCGCGAGAGCTGCGAGGATGCCTGCCCCGTGCCGCGCAC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1242 ACCGCCCTGCCGCGCCTGCCGCCTCCGGAGCAAGCTGGCGCTGAGCCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102399 ACCGCCCTGCCGCGCCTGCCGCCTCCGGAGCAAGCTGGCGCTGAGCCTGT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1292 GCCGCAGCGACTTCGCCATCGTGGGGCGGCTCACGGAGGTGCTGGAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102449 GCCGCAGCGACTTCGCCATCGTGGGGCGGCTCACGGAGGTGCTGGAGGAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1342 CCCGAGGCCGCCGGCGGCATCGCCCGCGTGGCGCTCGAGGACGTGCTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102499 CCCGAGGCCGCCGGCGGCATCGCCCGCGTGGCGCTCGAGGACGTGCTCAA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1392 GGATGACAAGATGGGACTCAAGTTCTTGGGCACCAAGTACCTGGAGGTGA
        ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102549 GGATGACAAGATGGGCCTCAAGTTCTTGGGCACCAAGTACCTGGAGGTGA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1442 CGCTGAGTGGCATGGACTGGGCCTGCCCCTGCCCCAACATGACGGCGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102599 CGCTGAGTGGCATGGACTGGGCCTGCCCCTGCCCCAACATGACGGCGGGC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1492 GACGGGCCGCTGGTCATCATGGGTGAGGTGCGCGATGGCGTGGCCGTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102649 GACGGGCCGCTGGTCATCATGGGTGAGGTGCGCGATGGCGTGGCCGTGCT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1542 GGACGCCGGCAGCTACGTCCGCGCCGCCAGCGAGAAGCGCGTCAAGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102699 GGACGCCGGCAGCTACGTCCGCGCCGCCAGCGAGAAGCGCGTCAAGAAGA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1592 TCTTGGAGCTGCTGGAGAAGCAGGCCTGCGAGCTGCTCAACCGCTTCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102749 TCTTGGAGCTGCTGGAGAAGCAGGCCTGCGAGCTGCTCAACCGCTTCCAG

   1650 
   1642 GAC
        |||
 102799 GAC