seq1 = pF1KE2613.tfa, 1230 bp
seq2 = pF1KE2613/gi568815596r_219072589.tfa (gi568815596r:219072589_219276828), 204240 bp

>pF1KE2613 1230
>gi568815596r:219072589_219276828 (Chr2)

(complement)

1-69  (100001-100069)   100% ->
70-178  (100498-100606)   100% ->
179-260  (101157-101238)   98% ->
261-381  (101721-101841)   100% ->
382-510  (101923-102051)   100% ->
511-572  (102622-102683)   100% ->
573-690  (103362-103479)   100% ->
691-1230  (103701-104240)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGACCTGACCGGGCTCCTGCTGGACGAAGAAGGCACCTTCTCCCTCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGACCTGACCGGGCTCCTGCTGGACGAAGAAGGCACCTTCTCCCTCGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGGCTTCCAGGACTTCACG         TTCCTCCCAGGACACCAGAAGC
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 100051 CGGCTTCCAGGACTTCACGGTG...CAGTTCCTCCCAGGACACCAGAAGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TGAGTGCCCGGATCCGAAGGAGGCTCTACTATGGCTGGGACTGGGAAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100520 TGAGTGCCCGGATCCGAAGGAGGCTCTACTATGGCTGGGACTGGGAAGCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GACTGTAGCCTGGAGGAGCTCTCCAGCCCGGTGGCAG         ACAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 100570 GACTGTAGCCTGGAGGAGCTCTCCAGCCCGGTGGCAGGTT...CAGACAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TGCTGTCGAACTGCTCCAGAAGGCAGCCCCCAGCCCTATTCGCCGACTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101161 TGCTGTCGAACTGCTCCAGAAGGCAGCCCCCAGCCCTATTCGCCGACTCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AGAAGAAATACGTAGCTCATGTGTCCCG         GGAGGCATGCATC
        |||||||||| |||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 101211 AGAAGAAATATGTAGCTCATGTGTCCCGGTG...CAGGGAGGCATGCATC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 TCCCCATGTGCTATGATGCTGGCTCTGGTGTACATTGAACGGCTCCGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101734 TCCCCATGTGCTATGATGCTGGCTCTGGTGTACATTGAACGGCTCCGGCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CCGAAACCCAGACTACTTGCAGCATGTGTCATCCTCTGACTTGTTCCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101784 CCGAAACCCAGACTACTTGCAGCATGTGTCATCCTCTGACTTGTTCCTGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TCTCCATG         ATGGTGGCCAGTAAGTACCTCTATGATGAAGGG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 101834 TCTCCATGGTA...CAGATGGTGGCCAGTAAGTACCTCTATGATGAAGGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 GAGGAGGAGGAGGTCTTCAACGACGAATGGGGAGCTGCTGGGGGTGTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101956 GAGGAGGAGGAGGTCTTCAACGACGAATGGGGAGCTGCTGGGGGTGTGGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 CGTGCCCACTCTCAATGCCTTGGAGAGGGGCTTCCTGAGTGCCATG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 102006 CGTGCCCACTCTCAATGCCTTGGAGAGGGGCTTCCTGAGTGCCATGGTG.

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    511      GATTGGCATCTCTACACTGACCCTCGGGAGATCTTTGAGGTGCTG
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102056 ..CAGGATTGGCATCTCTACACTGACCCTCGGGAGATCTTTGAGGTGCTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 AGCTGGTTGGAGAGCTG         TGTGGCTGAGCAGCAGGGACGGTG
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 102667 AGCTGGTTGGAGAGCTGGTA...CAGTGTGGCTGAGCAGCAGGGACGGTG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 GCGAGGCTGGTACACCTACACAGACCTGTGTGTGCTGCTGGAGCAGCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103386 GCGAGGCTGGTACACCTACACAGACCTGTGTGTGCTGCTGGAGCAGCCGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 CCTGGCAGTTGGCCCTGGGCTCCCTCTGCCAGCGGCTGGTAAAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 103436 CCTGGCAGTTGGCCCTGGGCTCCCTCTGCCAGCGGCTGGTAAAGGTG...

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    691    CTGTCTTGCCTGTTAGCTGTGGCATATGTGAGCAGTGTGGCCCTGGC
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103698 CAGCTGTCTTGCCTGTTAGCTGTGGCATATGTGAGCAGTGTGGCCCTGGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 TGTGGCATCGGTGGCCGTAATACATCAGTCTTTGGGGCTGTCCTGCACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
 103748 TGTGGCATCGGTGGCCGTAATACATCAGTCTTTGGGGCTGTCCTGCATCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 CTACACCTGGGCCGCCTGACCTTGGACTGACCTCCCGTTGCCTCCTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103798 CTACACCTGGGCCGCCTGACCTTGGACTGACCTCCCGTTGCCTCCTGGAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 CCCTGCATACCTTCTGTGCCACAATGCCTGCCGTCTCCCGCTAATGTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
 103848 CCCTGCATACCTTCTGTGCCACAATGCCTGCCGTCTCTCGCTAATGTCTC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 CAGCTGCCTGGAAGGCAGCATGGGGCTGCGGTCACTCTGGGGCAGTCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103898 CAGCTGCCTGGAAGGCAGCATGGGGCTGCGGTCACTCTGGGGCAGTCTTC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 TGGCCTCACTGACTCCTCCACCATTGCCTCCCCCAGACCCCCCTGCTCCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
 103948 TGGCCTCACTGACTCCTCCACCATTGCCTCCCCCAGACCCCCCTGCCCCT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 CCCACTCTTCTTCATAACTGCCACCTTTGCCAGAAGCTCCAGAGAGACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103998 CCCACTCTTCTTCATAACTGCCACCTTTGCCAGAAGCTCCAGAGAGACTC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 CCCAACCTGCCATGCCTGCCTCCACCCCAACCGTACAGTCCCCACTGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104048 CCCAACCTGCCATGCCTGCCTCCACCCCAACCGTACAGTCCCCACTGCGC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 TGTCCAGCCCCTGGTACCATACCTATGGCCTGGCTCCCCCCTGGCCTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104098 TGTCCAGCCCCTGGTACCATACCTATGGCCTGGCTCCCCCCTGGCCTTGG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 AGCCCGGTGCCCCTTTCACTTCCTCAGCCTCAGCAATGTTCCCTTTTCAG
        |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104148 AGCCCGGTGCTCCTTTCACTTCCTCAGCCTCAGCAATGTTCCCTTTTCAG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 TGTCATGGAGCTGGCTCGCCTCAAGTCTTTCGTTTTCCCAGGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104198 TGTCATGGAGCTGGCTCGCCTCAAGTCTTTCGTTTTCCCAGGC