Result of SIM4 for
pF1KE2607
seq1 = pF1KE2607.tfa, 3312 bp
seq2 = pF1KE2607/gi568815596f_233826538.tfa (gi568815596f:233826538_234114609), 288072 bp
>pF1KE2607 3312
>gi568815596f:233826538_234114609 (Chr2)
1-117 (100001-100117) 100% ->
118-191 (104131-104204) 100% ->
192-348 (110816-110972) 100% ->
349-526 (112461-112638) 100% ->
527-699 (116039-116211) 100% ->
700-874 (119319-119493) 100% ->
875-942 (120551-120618) 100% ->
943-1140 (123412-123609) 100% ->
1141-1243 (127380-127482) 100% ->
1244-1362 (128595-128713) 100% ->
1363-1653 (134239-134529) 100% ->
1654-1749 (136745-136840) 100% ->
1750-1879 (138091-138220) 100% ->
1880-2025 (140073-140218) 100% ->
2026-2138 (143158-143270) 100% ->
2139-2355 (143673-143889) 100% ->
2356-2447 (153651-153742) 100% ->
2448-2589 (155237-155378) 100% ->
2590-2761 (156516-156687) 100% ->
2762-2939 (159151-159328) 100% ->
2940-3130 (169789-169979) 100% ->
3131-3230 (180316-180415) 100% ->
3231-3264 (181533-181566) 100% ->
3265-3312 (188025-188072) 100%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGTCCTTTCGGGCAGCCAGGCTCAGCATGAGGAACAGAAGGAATGACAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100001 ATGTCCTTTCGGGCAGCCAGGCTCAGCATGAGGAACAGAAGGAATGACAC
50 . : . : . : . : . :
51 TCTGGACAGCACCCGGACCCTGTACTCCAGCGCGTCTCGGAGCACAGACT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100051 TCTGGACAGCACCCGGACCCTGTACTCCAGCGCGTCTCGGAGCACAGACT
100 . : . : . : . : . :
101 TGTCTTACAGTGAAAGC GACTTGGTGAATTTTATTCAAGCA
|||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
100101 TGTCTTACAGTGAAAGCGTA...AAGGACTTGGTGAATTTTATTCAAGCA
150 . : . : . : . : . :
142 AATTTTAAGAAACGAGAATGTGTCTTCTTTACCAAAGATTCCAAGGCCAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104155 AATTTTAAGAAACGAGAATGTGTCTTCTTTACCAAAGATTCCAAGGCCAC
200 . : . : . : . : . :
192 GGAGAATGTGTGCAAGTGTGGCTATGCCCAGAGCCAGCACA
>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104205 GTA...CAGGGAGAATGTGTGCAAGTGTGGCTATGCCCAGAGCCAGCACA
250 . : . : . : . : . :
233 TGGAAGGCACCCAGATCAACCAAAGTGAGAAATGGAACTACAAGAAACAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
110857 TGGAAGGCACCCAGATCAACCAAAGTGAGAAATGGAACTACAAGAAACAC
300 . : . : . : . : . :
283 ACCAAGGAATTTCCTACCGACGCCTTTGGGGATATTCAGTTTGAGACACT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
110907 ACCAAGGAATTTCCTACCGACGCCTTTGGGGATATTCAGTTTGAGACACT
350 . : . : . : . : . :
333 GGGGAAGAAAGGGAAG TATATACGTCTGTCCTGCGACACGG
||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
110957 GGGGAAGAAAGGGAAGGTA...TAGTATATACGTCTGTCCTGCGACACGG
400 . : . : . : . : . :
374 ACGCGGAAATCCTTTACGAGCTGCTGACCCAGCACTGGCACCTGAAAACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
112486 ACGCGGAAATCCTTTACGAGCTGCTGACCCAGCACTGGCACCTGAAAACA
450 . : . : . : . : . :
424 CCCAACCTGGTCATTTCTGTGACCGGGGGCGCCAAGAACTTCGCCCTGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
112536 CCCAACCTGGTCATTTCTGTGACCGGGGGCGCCAAGAACTTCGCCCTGAA
500 . : . : . : . : . :
474 GCCGCGCATGCGCAAGATCTTCAGCCGGCTCATCTACATCGCGCAGTCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
112586 GCCGCGCATGCGCAAGATCTTCAGCCGGCTCATCTACATCGCGCAGTCCA
550 . : . : . : . : . :
524 AAG GTGCTTGGATTCTCACGGGAGGCACCCATTATGGCCTG
|||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
112636 AAGGTG...CAGGTGCTTGGATTCTCACGGGAGGCACCCATTATGGCCTG
600 . : . : . : . : . :
565 ATGAAGTACATCGGGGAGGTGGTGAGAGATAACACCATCAGCAGGAGTTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
116077 ATGAAGTACATCGGGGAGGTGGTGAGAGATAACACCATCAGCAGGAGTTC
650 . : . : . : . : . :
615 AGAGGAGAATATTGTGGCCATTGGCATAGCAGCTTGGGGCATGGTCTCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
116127 AGAGGAGAATATTGTGGCCATTGGCATAGCAGCTTGGGGCATGGTCTCCA
700 . : . : . : . : . :
665 ACCGGGACACCCTCATCAGGAATTGCGATGCTGAG GGCTAT
|||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
116177 ACCGGGACACCCTCATCAGGAATTGCGATGCTGAGGTA...CAGGGCTAT
750 . : . : . : . : . :
706 TTTTTAGCCCAGTACCTTATGGATGACTTCACAAGAGATCCACTGTATAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
119325 TTTTTAGCCCAGTACCTTATGGATGACTTCACAAGAGATCCACTGTATAT
800 . : . : . : . : . :
756 CCTGGACAACAACCACACACATTTGCTGCTCGTGGACAATGGCTGTCATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
119375 CCTGGACAACAACCACACACATTTGCTGCTCGTGGACAATGGCTGTCATG
850 . : . : . : . : . :
806 GACATCCCACTGTCGAAGCAAAGCTCCGGAATCAGCTAGAGAAGTATATC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
119425 GACATCCCACTGTCGAAGCAAAGCTCCGGAATCAGCTAGAGAAGTATATC
900 . : . : . : . : . :
856 TCTGAGCGCACTATTCAAG ATTCCAACTATGGTGGCAAGAT
|||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
119475 TCTGAGCGCACTATTCAAGGTC...CAGATTCCAACTATGGTGGCAAGAT
950 . : . : . : . : . :
897 CCCCATTGTGTGTTTTGCCCAAGGAGGTGGAAAAGAGACTTTGAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
120573 CCCCATTGTGTGTTTTGCCCAAGGAGGTGGAAAAGAGACTTTGAAAGTG.
1000 . : . : . : . : . :
943 GCCATCAATACCTCCATCAAAAATAAAATTCCTTGTGTGGTGGTG
..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
120623 ..CAGGCCATCAATACCTCCATCAAAAATAAAATTCCTTGTGTGGTGGTG
1050 . : . : . : . : . :
988 GAAGGCTCGGGCCAGATCGCTGATGTGATCGCTAGCCTGGTGGAGGTGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
123457 GAAGGCTCGGGCCAGATCGCTGATGTGATCGCTAGCCTGGTGGAGGTGGA
1100 . : . : . : . : . :
1038 GGATGCCCTGACATCTTCTGCCGTCAAGGAGAAGCTGGTGCGCTTTTTAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
123507 GGATGCCCTGACATCTTCTGCCGTCAAGGAGAAGCTGGTGCGCTTTTTAC
1150 . : . : . : . : . :
1088 CCCGCACGGTGTCCCGGCTGCCTGAGGAGGAGACTGAGAGTTGGATCAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
123557 CCCGCACGGTGTCCCGGCTGCCTGAGGAGGAGACTGAGAGTTGGATCAAA
1200 . : . : . : . : . :
1138 TGG CTCAAAGAAATTCTCGAATGTTCTCACCTATTAACAGT
|||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
123607 TGGGTA...CAGCTCAAAGAAATTCTCGAATGTTCTCACCTATTAACAGT
1250 . : . : . : . : . :
1179 TATTAAAATGGAAGAAGCTGGGGATGAAATTGTGAGCAATGCCATCTCCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
127418 TATTAAAATGGAAGAAGCTGGGGATGAAATTGTGAGCAATGCCATCTCCT
1300 . : . : . : . : . :
1229 ACGCTCTATACAAAG CCTTCAGCACCAGTGAGCAAGACAAG
|||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
127468 ACGCTCTATACAAAGGTG...CAGCCTTCAGCACCAGTGAGCAAGACAAG
1350 . : . : . : . : . :
1270 GATAACTGGAATGGGCAGCTGAAGCTTCTGCTGGAGTGGAACCAGCTGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
128621 GATAACTGGAATGGGCAGCTGAAGCTTCTGCTGGAGTGGAACCAGCTGGA
1400 . : . : . : . : . :
1320 CTTAGCCAATGATGAGATTTTCACCAATGACCGCCGATGGGAG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
128671 CTTAGCCAATGATGAGATTTTCACCAATGACCGCCGATGGGAGGTA...T
1450 . : . : . : . : . :
1363 TCTGCTGACCTTCAAGAAGTCATGTTTACGGCTCTCATAAAGGACAGA
>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
134237 AGTCTGCTGACCTTCAAGAAGTCATGTTTACGGCTCTCATAAAGGACAGA
1500 . : . : . : . : . :
1411 CCCAAGTTTGTCCGCCTCTTTCTGGAGAATGGCTTGAACCTACGGAAGTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
134287 CCCAAGTTTGTCCGCCTCTTTCTGGAGAATGGCTTGAACCTACGGAAGTT
1550 . : . : . : . : . :
1461 TCTCACCCATGATGTCCTCACTGAACTCTTCTCCAACCACTTCAGCACGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
134337 TCTCACCCATGATGTCCTCACTGAACTCTTCTCCAACCACTTCAGCACGC
1600 . : . : . : . : . :
1511 TTGTGTACCGGAATCTGCAGATCGCCAAGAATTCCTATAATGATGCCCTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
134387 TTGTGTACCGGAATCTGCAGATCGCCAAGAATTCCTATAATGATGCCCTC
1650 . : . : . : . : . :
1561 CTCACGTTTGTCTGGAAACTGGTTGCGAACTTCCGAAGAGGCTTCCGGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
134437 CTCACGTTTGTCTGGAAACTGGTTGCGAACTTCCGAAGAGGCTTCCGGAA
1700 . : . : . : . : . :
1611 GGAAGACAGAAATGGCCGGGACGAGATGGACATAGAACTCCAC
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
134487 GGAAGACAGAAATGGCCGGGACGAGATGGACATAGAACTCCACGTA...C
1750 . : . : . : . : . :
1654 GACGTGTCTCCTATTACTCGGCACCCCCTGCAAGCTCTCTTCATCTGG
>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
136743 AGGACGTGTCTCCTATTACTCGGCACCCCCTGCAAGCTCTCTTCATCTGG
1800 . : . : . : . : . :
1702 GCCATTCTTCAGAATAAGAAGGAACTCTCCAAAGTCATTTGGGAGCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
136793 GCCATTCTTCAGAATAAGAAGGAACTCTCCAAAGTCATTTGGGAGCAGGT
1850 . : . : . : . : . :
1750 ACCAGGGGCTGCACTCTGGCAGCCCTGGGAGCCAGCAAGCTTC
>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
136843 A...AAGACCAGGGGCTGCACTCTGGCAGCCCTGGGAGCCAGCAAGCTTC
1900 . : . : . : . : . :
1793 TGAAGACTCTGGCCAAAGTGAAGAACGACATCAATGCTGCTGGGGAGTCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
138134 TGAAGACTCTGGCCAAAGTGAAGAACGACATCAATGCTGCTGGGGAGTCC
1950 . : . : . : . : . :
1843 GAGGAGCTGGCTAATGAGTACGAGACCCGGGCTGTTG AGCT
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
138184 GAGGAGCTGGCTAATGAGTACGAGACCCGGGCTGTTGGTG...TAGAGCT
2000 . : . : . : . : . :
1884 GTTCACTGAGTGTTACAGCAGCGATGAAGACTTGGCAGAACAGCTGCTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
140077 GTTCACTGAGTGTTACAGCAGCGATGAAGACTTGGCAGAACAGCTGCTGG
2050 . : . : . : . : . :
1934 TCTATTCCTGTGAAGCTTGGGGTGGAAGCAACTGTCTGGAGCTGGCGGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
140127 TCTATTCCTGTGAAGCTTGGGGTGGAAGCAACTGTCTGGAGCTGGCGGTG
2100 . : . : . : . : . :
1984 GAGGCCACAGACCAGCATTTCATCGCCCAGCCTGGGGTCCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
140177 GAGGCCACAGACCAGCATTTCATCGCCCAGCCTGGGGTCCAGGTA...TA
2150 . : . : . : . : . :
2026 AATTTTCTTTCTAAGCAATGGTATGGAGAGATTTCCCGAGACACCAAGA
>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
143157 GAATTTTCTTTCTAAGCAATGGTATGGAGAGATTTCCCGAGACACCAAGA
2200 . : . : . : . : . :
2075 ACTGGAAGATTATCCTGTGTCTGTTTATTATACCCTTGGTGGGCTGTGGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
143207 ACTGGAAGATTATCCTGTGTCTGTTTATTATACCCTTGGTGGGCTGTGGC
2250 . : . : . : . : . :
2125 TTTGTATCATTTAG GAAGAAACCTGTCGACAAGCACAAGAA
||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
143257 TTTGTATCATTTAGGTA...CAGGAAGAAACCTGTCGACAAGCACAAGAA
2300 . : . : . : . : . :
2166 GCTGCTTTGGTACTATGTGGCGTTCTTCACCTCCCCCTTCGTGGTCTTCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
143700 GCTGCTTTGGTACTATGTGGCGTTCTTCACCTCCCCCTTCGTGGTCTTCT
2350 . : . : . : . : . :
2216 CCTGGAATGTGGTCTTCTACATCGCCTTCCTCCTGCTGTTTGCCTACGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
143750 CCTGGAATGTGGTCTTCTACATCGCCTTCCTCCTGCTGTTTGCCTACGTG
2400 . : . : . : . : . :
2266 CTGCTCATGGATTTCCATTCGGTGCCACACCCCCCCGAGCTGGTCCTGTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
143800 CTGCTCATGGATTTCCATTCGGTGCCACACCCCCCCGAGCTGGTCCTGTA
2450 . : . : . : . : . :
2316 CTCGCTGGTCTTTGTCCTCTTCTGTGATGAAGTGAGACAG T
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
143850 CTCGCTGGTCTTTGTCCTCTTCTGTGATGAAGTGAGACAGGTA...CAGT
2500 . : . : . : . : . :
2357 GGTACGTAAATGGGGTGAATTATTTTACTGACCTGTGGAATGTGATGGAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
153652 GGTACGTAAATGGGGTGAATTATTTTACTGACCTGTGGAATGTGATGGAC
2550 . : . : . : . : . :
2407 ACGCTGGGGCTTTTTTACTTCATAGCAGGAATTGTATTTCG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
153702 ACGCTGGGGCTTTTTTACTTCATAGCAGGAATTGTATTTCGGTA...TAG
2600 . : . : . : . : . :
2448 GCTCCACTCTTCTAATAAAAGCTCTTTGTATTCTGGACGAGTCATTTTCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
155237 GCTCCACTCTTCTAATAAAAGCTCTTTGTATTCTGGACGAGTCATTTTCT
2650 . : . : . : . : . :
2498 GTCTGGACTACATTATTTTCACTCTAAGATTGATCCACATTTTTACTGTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
155287 GTCTGGACTACATTATTTTCACTCTAAGATTGATCCACATTTTTACTGTA
2700 . : . : . : . : . :
2548 AGCAGAAACTTAGGACCCAAGATTATAATGCTGCAGAGGATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
155337 AGCAGAAACTTAGGACCCAAGATTATAATGCTGCAGAGGATGGTA...CA
2750 . : . : . : . : . :
2590 CTGATCGATGTGTTCTTCTTCCTGTTCCTCTTTGCGGTGTGGATGGTGG
>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
156515 GCTGATCGATGTGTTCTTCTTCCTGTTCCTCTTTGCGGTGTGGATGGTGG
2800 . : . : . : . : . :
2639 CCTTTGGCGTGGCCAGGCAAGGGATCCTTAGGCAGAATGAGCAGCGCTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
156565 CCTTTGGCGTGGCCAGGCAAGGGATCCTTAGGCAGAATGAGCAGCGCTGG
2850 . : . : . : . : . :
2689 AGGTGGATATTCCGTTCGGTCATCTACGAGCCCTACCTGGCCATGTTCGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
156615 AGGTGGATATTCCGTTCGGTCATCTACGAGCCCTACCTGGCCATGTTCGG
2900 . : . : . : . : . :
2739 CCAGGTGCCCAGTGACGTGGATG GTACCACGTATGACTTTG
|||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
156665 CCAGGTGCCCAGTGACGTGGATGGTA...CAGGTACCACGTATGACTTTG
2950 . : . : . : . : . :
2780 CCCACTGCACCTTCACTGGGAATGAGTCCAAGCCACTGTGTGTGGAGCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
159169 CCCACTGCACCTTCACTGGGAATGAGTCCAAGCCACTGTGTGTGGAGCTG
3000 . : . : . : . : . :
2830 GATGAGCACAACCTGCCCCGGTTCCCCGAGTGGATCACCATCCCCCTGGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
159219 GATGAGCACAACCTGCCCCGGTTCCCCGAGTGGATCACCATCCCCCTGGT
3050 . : . : . : . : . :
2880 GTGCATCTACATGTTATCCACCAACATCCTGCTGGTCAACCTGCTGGTCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
159269 GTGCATCTACATGTTATCCACCAACATCCTGCTGGTCAACCTGCTGGTCG
3100 . : . : . : . : . :
2930 CCATGTTTGG CTACACGGTGGGCACCGTCCAGGAGAACAAT
||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
159319 CCATGTTTGGGTA...CAGCTACACGGTGGGCACCGTCCAGGAGAACAAT
3150 . : . : . : . : . :
2971 GACCAGGTCTGGAAGTTCCAGAGGTACTTCCTGGTGCAGGAGTACTGCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
169820 GACCAGGTCTGGAAGTTCCAGAGGTACTTCCTGGTGCAGGAGTACTGCAG
3200 . : . : . : . : . :
3021 CCGCCTCAATATCCCCTTCCCCTTCATCGTCTTCGCTTACTTCTACATGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
169870 CCGCCTCAATATCCCCTTCCCCTTCATCGTCTTCGCTTACTTCTACATGG
3250 . : . : . : . : . :
3071 TGGTGAAGAAGTGCTTCAAGTGTTGCTGCAAGGAGAAAAACATGGAGTCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
169920 TGGTGAAGAAGTGCTTCAAGTGTTGCTGCAAGGAGAAAAACATGGAGTCT
3300 . : . : . : . : . :
3121 TCTGTCTGCT GTTTCAAAAATGAAGACAATGAGACTCTGGC
||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
169970 TCTGTCTGCTGTG...AAGGTTTCAAAAATGAAGACAATGAGACTCTGGC
3350 . : . : . : . : . :
3162 ATGGGAGGGTGTCATGAAGGAAAACTACCTTGTCAAGATCAACACAAAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
180347 ATGGGAGGGTGTCATGAAGGAAAACTACCTTGTCAAGATCAACACAAAAG
3400 . : . : . : . : . :
3212 CCAACGACACCTCAGAGGA AATGAGGCATCGATTTAGACAA
|||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
180397 CCAACGACACCTCAGAGGAGTA...CAGAATGAGGCATCGATTTAGACAA
3450 . : . : . : . : . :
3253 CTGGATACAAAG CTTAATGATCTCAAGGGTCTTCTGAAAGA
||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
181555 CTGGATACAAAGGTA...AAGCTTAATGATCTCAAGGGTCTTCTGAAAGA
3500 . : .
3294 GATTGCTAATAAAATCAAA
|||||||||||||||||||
188054 GATTGCTAATAAAATCAAA