seq1 = pF1KE2600.tfa, 891 bp
seq2 = pF1KE2600/gi568815591r_45814823.tfa (gi568815591r:45814823_46021140), 206318 bp

>pF1KE2600 891
>gi568815591r:45814823_46021140 (Chr7)

(complement)

1-421  (100001-100421)   99% ->
422-648  (103702-103928)   100% ->
649-768  (104474-104593)   100% ->
769-891  (106196-106318)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCAGCGGGCGCGACCCACGCTCTGGGCCGCTGCGCTGACTCTGCTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCAGCGGGCGCGACCCACGCTCTGGGCCGCTGCGCTGACTCTGCTGGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCTGCTCCGCGGGCCGCCGGTGGCGCGGGCTGGCGCGAGCTCGGGGGGCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
 100051 GCTGCTCCGCGGGCCGCCGGTGGCGCGGGCTGGCGCGAGCTCGGCGGGCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGGGTCCCGTGGTGCGCTGCGAGCCGTGCGACGCGCGTGCACTGGCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGGGTCCCGTGGTGCGCTGCGAGCCGTGCGACGCGCGTGCACTGGCCCAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TGCGCGCCTCCGCCCGCCGTGTGCGCGGAGCTGGTGCGCGAGCCGGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TGCGCGCCTCCGCCCGCCGTGTGCGCGGAGCTGGTGCGCGAGCCGGGCTG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CGGCTGCTGCCTGACGTGCGCACTGAGCGAGGGCCAGCCGTGCGGCATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CGGCTGCTGCCTGACGTGCGCACTGAGCGAGGGCCAGCCGTGCGGCATCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ACACCGAGCGCTGTGGCTCCGGCCTTCGCTGCCAGCCGTCGCCCGACGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ACACCGAGCGCTGTGGCTCCGGCCTTCGCTGCCAGCCGTCGCCCGACGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GCGCGACCGCTGCAGGCGCTGCTGGACGGCCGCGGGCTCTGCGTCAACGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GCGCGACCGCTGCAGGCGCTGCTGGACGGCCGCGGGCTCTGCGTCAACGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TAGTGCCGTCAGCCGCCTGCGCGCCTACCTGCTGCCAGCGCCGCCAGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TAGTGCCGTCAGCCGCCTGCGCGCCTACCTGCTGCCAGCGCCGCCAGCTC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CAGGTGAGCCGCCCGCGCCAG         GAAATGCTAGTGAGTCGGAG
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 100401 CAGGTGAGCCGCCCGCGCCAGGTG...AAGGAAATGCTAGTGAGTCGGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 GAAGACCGCAGCGCCGGCAGTGTGGAGAGCCCGTCCGTCTCCAGCACGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103722 GAAGACCGCAGCGCCGGCAGTGTGGAGAGCCCGTCCGTCTCCAGCACGCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 CCGGGTGTCTGATCCCAAGTTCCACCCCCTCCATTCAAAGATAATCATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103772 CCGGGTGTCTGATCCCAAGTTCCACCCCCTCCATTCAAAGATAATCATCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 TCAAGAAAGGGCATGCTAAAGACAGCCAGCGCTACAAAGTTGACTACGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103822 TCAAGAAAGGGCATGCTAAAGACAGCCAGCGCTACAAAGTTGACTACGAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 TCTCAGAGCACAGATACCCAGAACTTCTCCTCCGAGTCCAAGCGGGAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103872 TCTCAGAGCACAGATACCCAGAACTTCTCCTCCGAGTCCAAGCGGGAGAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 AGAATAT         GGTCCCTGCCGTAGAGAAATGGAAGACACACTGA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103922 AGAATATGTG...CAGGGTCCCTGCCGTAGAGAAATGGAAGACACACTGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 ATCACCTGAAGTTCCTCAATGTGCTGAGTCCCAGGGGTGTACACATTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104508 ATCACCTGAAGTTCCTCAATGTGCTGAGTCCCAGGGGTGTACACATTCCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 AACTGTGACAAGAAGGGATTTTATAAGAAAAAGCAG         TGTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 104558 AACTGTGACAAGAAGGGATTTTATAAGAAAAAGCAGGTG...CAGTGTCG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 CCCTTCCAAAGGCAGGAAGCGGGGCTTCTGCTGGTGTGTGGATAAGTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106201 CCCTTCCAAAGGCAGGAAGCGGGGCTTCTGCTGGTGTGTGGATAAGTATG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 GGCAGCCTCTCCCAGGCTACACCACCAAGGGGAAGGAGGACGTGCACTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106251 GGCAGCCTCTCCCAGGCTACACCACCAAGGGGAAGGAGGACGTGCACTGC

    900     .    :    .
    874 TACAGCATGCAGAGCAAG
        ||||||||||||||||||
 106301 TACAGCATGCAGAGCAAG