seq1 = pF1KE2592.tfa, 672 bp
seq2 = pF1KE2592/gi568815593r_115516212.tfa (gi568815593r:115516212_115725792), 209581 bp

>pF1KE2592 672
>gi568815593r:115516212_115725792 (Chr5)

(complement)

1-192  (100001-100192)   100% ->
193-438  (105113-105358)   100% ->
439-672  (109348-109581)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCGCGGCCGGGGTCCGCGCAGCGCTGGGCGGCCGTCGCGGGCCGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCGCGGCCGGGGTCCGCGCAGCGCTGGGCGGCCGTCGCGGGCCGTTG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGGGTGCAGGCTGCTCGCACTGCTGCTACTGGTGCCTGGACCCGGCGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGGGTGCAGGCTGCTCGCACTGCTGCTACTGGTGCCTGGACCCGGCGGCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCTCTGAGATCACCTTCGAGCTTCCTGACAACGCCAAGCAGTGCTTCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCTCTGAGATCACCTTCGAGCTTCCTGACAACGCCAAGCAGTGCTTCTAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GAGGACATCGCTCAGGGCACCAAGTGCACCCTGGAGTTCCAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 100151 GAGGACATCGCTCAGGGCACCAAGTGCACCCTGGAGTTCCAGGTA...CA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    193  GTGATTACTGGTGGTCACTATGATGTAGATTGTCGATTAGAAGATCCTG
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105112 GGTGATTACTGGTGGTCACTATGATGTAGATTGTCGATTAGAAGATCCTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 ATGGTAAAGTGTTATACAAAGAGATGAAGAAACAGTATGATAGTTTTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105162 ATGGTAAAGTGTTATACAAAGAGATGAAGAAACAGTATGATAGTTTTACC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TTCACAGCCTCCAAAAATGGGACATACAAATTTTGCTTCAGCAATGAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105212 TTCACAGCCTCCAAAAATGGGACATACAAATTTTGCTTCAGCAATGAATT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 TTCTACTTTCACACATAAAACTGTATATTTTGATTTTCAAGTTGGAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105262 TTCTACTTTCACACATAAAACTGTATATTTTGATTTTCAAGTTGGAGAAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 ACCCACCTTTGTTTCCTAGTGAGAACCGAGTCAGTGCTCTTACCCAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 105312 ACCCACCTTTGTTTCCTAGTGAGAACCGAGTCAGTGCTCTTACCCAGGTA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    439       ATGGAATCTGCCTGTGTTTCAATTCACGAAGCTCTGAAGTCTGT
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105362 ...CAGATGGAATCTGCCTGTGTTTCAATTCACGAAGCTCTGAAGTCTGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CATCGATTATCAGACTCATTTCCGTTTAAGAGAAGCTCAAGGCCGAAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109392 CATCGATTATCAGACTCATTTCCGTTTAAGAGAAGCTCAAGGCCGAAGCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 GAGCAGAGGATCTAAATACAAGAGTGGCCTATTGGTCAGTAGGAGAAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109442 GAGCAGAGGATCTAAATACAAGAGTGGCCTATTGGTCAGTAGGAGAAGCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 CTCATTCTTCTGGTGGTTAGCATAGGGCAGGTATTTCTTTTGAAAAGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109492 CTCATTCTTCTGGTGGTTAGCATAGGGCAGGTATTTCTTTTGAAAAGCTT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :
    633 TTTCTCAGATAAAAGAACCACCACAACTCGTGTTGGATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109542 TTTCTCAGATAAAAGAACCACCACAACTCGTGTTGGATCA