seq1 = pF1KE2591.tfa, 1623 bp
seq2 = pF1KE2591/gi568815585r_78515929.tfa (gi568815585r:78515929_78742190), 226262 bp

>pF1KE2591 1623
>gi568815585r:78515929_78742190 (Chr13)

(complement)

1-69  (100001-100069)   100% ->
70-318  (103120-103368)   100% ->
319-407  (106993-107081)   100% ->
408-1623  (125069-126283)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCTAAGCCATACGGTCAGGAAGCATCTTCGGAAAACTAGACTTGAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCTAAGCCATACGGTCAGGAAGCATCTTCGGAAAACTAGACTTGAATT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ACTACACAAAGAATATGAG         GACGAAATAGATTGTTTACAGA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 100051 ACTACACAAAGAATATGAGGTA...CAGGACGAAATAGATTGTTTACAGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AAGAAGTAGAAGAGCTTAAGAGTAAAAATCTCAGCTTGGAGTCACAGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103142 AAGAAGTAGAAGAGCTTAAGAGTAAAAATCTCAGCTTGGAGTCACAGATC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AAAACTATTCTGGATCCTTTAACCTTGGTGCAGGGCAACCAAAATGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103192 AAAACTATTCTGGATCCTTTAACCTTGGTGCAGGGCAACCAAAATGAAGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CAAACATCTAGTCACAGATAATCCAAGTAAAATTAACCCAGAAACTGTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103242 CAAACATCTAGTCACAGATAATCCAAGTAAAATTAACCCAGAAACTGTAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CAGAGTGGAAGAAAAAACTCAGAACAGCTAATGAAATCTATGAAAAAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103292 CAGAGTGGAAGAAAAAACTCAGAACAGCTAATGAAATCTATGAAAAAGTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 AAAGATGATGTGGATAAGCTAAAGGAG         GCAAATAAAAAATT
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 103342 AAAGATGATGTGGATAAGCTAAAGGAGGTA...TAGGCAAATAAAAAATT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GAAATTGGAAAATGGTGGTCTGGTGAGGGAGAATTTACGACTGAAGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107007 GAAATTGGAAAATGGTGGTCTGGTGAGGGAGAATTTACGACTGAAGGCTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 AAGTTGATAACAGATCACCTCAAAA         GTTTGGAAGGTTTGCA
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 107057 AAGTTGATAACAGATCACCTCAAAAGTA...TAGGTTTGGAAGGTTTGCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GTTGCTGCTCTTCAGTCCAAAGTAGAACAGTATGAGCGTGAAACCAATCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125085 GTTGCTGCTCTTCAGTCCAAAGTAGAACAGTATGAGCGTGAAACCAATCG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CCTCAAGAAAGCCCTGGAACGAAGTGATAAGTATATAGAGGAACTAGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125135 CCTCAAGAAAGCCCTGGAACGAAGTGATAAGTATATAGAGGAACTAGAAT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 CTCAAGTTGCACAGCTAAAAAATTCAAGTGAAGAGAAAGAAGCTATGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125185 CTCAAGTTGCACAGCTAAAAAATTCAAGTGAAGAGAAAGAAGCTATGAAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 TCCATTTGCCAGACAGCACTTTCTGCAGATGGCAAAGGGAGCAAAGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125235 TCCATTTGCCAGACAGCACTTTCTGCAGATGGCAAAGGGAGCAAAGGCAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 TGAGGAGGATGTGGTGTCAAAGAATCAAGGCGATAGTGCCAGAAAGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125285 TGAGGAGGATGTGGTGTCAAAGAATCAAGGCGATAGTGCCAGAAAGCAGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 CTGGCTCATCCACCTCCAGTTCTTCTCACCTAGCGAAGCCTTCCAGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125335 CTGGCTCATCCACCTCCAGTTCTTCTCACCTAGCGAAGCCTTCCAGCAGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 AGACTGTGTGACACCAGTTCTGCAAGGCAGGAAAGTACCAGCAAAGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125385 AGACTGTGTGACACCAGTTCTGCAAGGCAGGAAAGTACCAGCAAAGCAGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 CCTTAACTGTTCTAAGAACAAAGACCTATATCAAGAACAGGTAGAAGTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125435 CCTTAACTGTTCTAAGAACAAAGACCTATATCAAGAACAGGTAGAAGTAA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 TGTTAGATGTGACAGATACAAGTATGGATACTTATTTGGAAAGAGAATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125485 TGTTAGATGTGACAGATACAAGTATGGATACTTATTTGGAAAGAGAATGG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 GGGAATAAACCAAGTGACTGTGTACCCTACAAAGATGAAGAACTTTATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125535 GGGAATAAACCAAGTGACTGTGTACCCTACAAAGATGAAGAACTTTATGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    924 TCTTCCAGCTCCTTGTACTCCTTTGTCCCTTAGTTGCCTTCAGCTCAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125585 TCTTCCAGCTCCTTGTACTCCTTTGTCCCTTAGTTGCCTTCAGCTCAGTA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    974 CTCCAGAAAATAGAGAGAGCTCTGTGGTCCAAGCAGGAGGTTCCAAAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125635 CTCCAGAAAATAGAGAGAGCTCTGTGGTCCAAGCAGGAGGTTCCAAAAAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1024 CACTCAAACCATCTCAGAAAATTGGTGTTTGATGATTTTTGTGATTCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125685 CACTCAAACCATCTCAGAAAATTGGTGTTTGATGATTTTTGTGATTCTTC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1074 AAATGTTTCTAATAAAGATTCTTCAGAAGATGATATAAGTAGAAGTGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125735 AAATGTTTCTAATAAAGATTCTTCAGAAGATGATATAAGTAGAAGTGAAA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1124 ATGAAAAGAAATCAGAATGTTTTTCTTCCCCAAAGACAGGATTTTGGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125785 ATGAAAAGAAATCAGAATGTTTTTCTTCCCCAAAGACAGGATTTTGGGAC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1174 TGTTGTTCCACAAGCTATGCCCAAAACTTAGATTTTGAAAGTTCAGAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125835 TGTTGTTCCACAAGCTATGCCCAAAACTTAGATTTTGAAAGTTCAGAGGG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1224 GAACACGATAGCAAATTCTGTTGGAGAAATATCTTCAAAATTGAGTGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125885 GAACACGATAGCAAATTCTGTTGGAGAAATATCTTCAAAATTGAGTGAGA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1274 AATCAGGCTTATGTTTATCCAAAAGGTTGAATTCTATTCGCTCTTTTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125935 AATCAGGCTTATGTTTATCCAAAAGGTTGAATTCTATTCGCTCTTTTGAA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1324 ATGAACCGGACAAGAACATCCAGTGAAGCATCGATGGATGCTGCTTACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125985 ATGAACCGGACAAGAACATCCAGTGAAGCATCGATGGATGCTGCTTACCT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1374 TGACAAAATCTCTGAGTTGGATTCAATGATGTCAGAGTCAGACAACAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126035 TGACAAAATCTCTGAGTTGGATTCAATGATGTCAGAGTCAGACAACAGCA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1424 AGAGCCCTTGTAATAACGGTTTTAAGTCACTGGATTTGGATGGGTTATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126085 AGAGCCCTTGTAATAACGGTTTTAAGTCACTGGATTTGGATGGGTTATCA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1474 AAGTCATCTCAAGGCAGTGAATTTCTTGAGGAACCTGATAAGTTGGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126135 AAGTCATCTCAAGGCAGTGAATTTCTTGAGGAACCTGATAAGTTGGAAGA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1524 AAAAACTGAGCTAAACCTTTCCAAAGGTTCTCTAACTAATGATCAGTTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126185 AAAAACTGAGCTAAACCTTTCCAAAGGTTCTCTAACTAATGATCAGTTAG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1574 AAAATGGAAGTGAATGGAAACCCACTTCTTTTTTTTCTCCTCTCTCCATC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||||||||||||
 126235 AAAATGGAAGTGAATGGAAACCCACTTCTTTTTTT CTCCTCTCTCCATC