seq1 = pF1KE2574.tfa, 1323 bp
seq2 = pF1KE2574/gi568815584r_50137599.tfa (gi568815584r:50137599_50412150), 274552 bp

>pF1KE2574 1323
>gi568815584r:50137599_50412150 (Chr14)

(complement)

1-140  (100001-100140)   99% ->
141-256  (109134-109249)   99% ->
257-408  (109983-110134)   100% ->
409-540  (117905-118036)   100% ->
541-703  (128118-128280)   100% ->
704-738  (133597-133631)   100% ->
739-906  (142821-142988)   100% ->
907-1064  (144241-144398)   100% ->
1065-1196  (146662-146793)   100% ->
1197-1323  (174426-174552)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGTGCCAGCGCTGCGTTATTTGGTTGGTGCCTGCGGACGGGCCCGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGTGCCAGCGCTGCGTTATTTGGTTGGTGCCTGCGGACGGGCCCGCGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCGTTTCGCCGGTGGCTCCCCTGGGGCGTGCGGGTTCGCGTCTGGGAGGC
        || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCTTTTCGCCGGTGGCTCCCCTGGGGCGTGCGGGTTCGCGTCTGGGAGGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CAAGACCGCTGTGTGGAGGTAGCCGCAGCGCCAGCACCAG         C
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 100101 CAAGACCGCTGTGTGGAGGTAGCCGCAGCGCCAGCACCAGGTG...AAGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TCATTTGATATAGTCATTGTTGGTGGCGGAATTGTGGGGCTTGCCTCTGC
        ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
 109135 TCATTTGATATAGTCATCGTTGGTGGCGGAATTGTGGGGCTTGCCTCTGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CAGAGCACTCATCCTGCGACATCCATCACTTTCTATTGGTGTTCTGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109185 CAGAGCACTCATCCTGCGACATCCATCACTTTCTATTGGTGTTCTGGAAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AGGAGAAAGATTTAG         CTGTTCACCAGACTGGACATAACAGT
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 109235 AGGAGAAAGATTTAGGTA...TAGCTGTTCACCAGACTGGACATAACAGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GGTGTCATACATAGTGGAATTTATTATAAACCTGAGTCTCTGAAAGCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110009 GGTGTCATACATAGTGGAATTTATTATAAACCTGAGTCTCTGAAAGCCAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 ATTATGTGTACAAGGTGCAGCCCTCCTCTATGAGTACTGTCAGCAAAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110059 ATTATGTGTACAAGGTGCAGCCCTCCTCTATGAGTACTGTCAGCAAAAGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GAATTTCCTACAAGCAGTGTGGCAAG         CTTATAGTAGCTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 110109 GAATTTCCTACAAGCAGTGTGGCAAGGTA...AAGCTTATAGTAGCTGTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GAACAAGAAGAAATTCCCAGACTTCAGGCCCTATATGAGAAAGGCCTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117920 GAACAAGAAGAAATTCCCAGACTTCAGGCCCTATATGAGAAAGGCCTCCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GAATGGTGTCCCGGGCCTGAGGCTGATCCAGCAGGAGGATATAAAAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117970 GAATGGTGTCCCGGGCCTGAGGCTGATCCAGCAGGAGGATATAAAAAAGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 AGGAGCCATATTGTAGG         GGTCTAATGGCTATTGATTGTCCA
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 118020 AGGAGCCATATTGTAGGGTA...CAGGGTCTAATGGCTATTGATTGTCCA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 CATACTGGCATTGTGGACTATCGGCAGGTGGCTTTGTCATTTGCCCAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128142 CATACTGGCATTGTGGACTATCGGCAGGTGGCTTTGTCATTTGCCCAGGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 TTTCCAAGAAGCAGGTGGCTCTGTCTTGACCAATTTTGAAGTAAAAGGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128192 TTTCCAAGAAGCAGGTGGCTCTGTCTTGACCAATTTTGAAGTAAAAGGTA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 TTGAAATGGCTAAAGAAAGTCCTTCAAGAAGTATAGATG         GA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 128242 TTGAAATGGCTAAAGAAAGTCCTTCAAGAAGTATAGATGGTA...CAGGA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 ATGCAATATCCAATTGTTATAAAGAATACAAAG         GGAGAGGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 133599 ATGCAATATCCAATTGTTATAAAGAATACAAAGGTA...TAGGGAGAGGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 AATTCGATGTCAGTATGTTGTGACATGTGCAGGACTTTACTCAGACCGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142829 AATTCGATGTCAGTATGTTGTGACATGTGCAGGACTTTACTCAGACCGTA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 TTTCAGAGTTGAGTGGCTGCACTCCTGATCCTCGAATTGTACCATTCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142879 TTTCAGAGTTGAGTGGCTGCACTCCTGATCCTCGAATTGTACCATTCCGG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 GGAGATTACCTGCTTTTGAAGCCAGAAAAATGTTATCTTGTAAAAGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142929 GGAGATTACCTGCTTTTGAAGCCAGAAAAATGTTATCTTGTAAAAGGAAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 TATTTATCCG         GTCCCAGATAGCCGGTTTCCTTTCCTAGGAG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 142979 TATTTATCCGGTA...TAGGTCCCAGATAGCCGGTTTCCTTTCCTAGGAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 TTCACTTCACACCAAGGATGGATGGCAGTATTTGGCTAGGGCCTAATGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144272 TTCACTTCACACCAAGGATGGATGGCAGTATTTGGCTAGGGCCTAATGCA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 GTTCTTGCCTTTAAACGAGAGGGTTACAGACCCTTTGACTTCAGTGCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144322 GTTCTTGCCTTTAAACGAGAGGGTTACAGACCCTTTGACTTCAGTGCCAC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 AGATGTTATGGATATAATTATCAATAG         TGGCTTGATTAAAC
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 144372 AGATGTTATGGATATAATTATCAATAGGTA...CAGTGGCTTGATTAAAC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 TGGCATCCCAGAATTTTTCCTATGGAGTTACTGAAATGTATAAAGCATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146676 TGGCATCCCAGAATTTTTCCTATGGAGTTACTGAAATGTATAAAGCATGT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 TTTCTTGGTGCAACAGTGAAGTATCTTCAAAAATTCATCCCTGAAATTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146726 TTTCTTGGTGCAACAGTGAAGTATCTTCAAAAATTCATCCCTGAAATTAC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 TATCAGTGATATACTTAG         GCAGGTGGCTGTGAGAGGACCGA
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 146776 TATCAGTGATATACTTAGGTA...CAGGCAGGTGGCTGTGAGAGGACCGA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 GCTGGCTATGGCAGCAACCCATGAAAGTGAGTGATAACAACATTTATTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 174449 GCTGGCTATGGCAGCAACCCATGAAAGTGAGTGATAACAACATTTATTGT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 TTCCTGTGGCGTTGCTTTGCTTTGCTATTGACTGGTAGCACTTGTAGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
 174499 TTCCTGTGGCGTTGCTTTGCTTTGCTATTGACTGGTAGCGCTTGTAGCTT

   1400 
   1320 TAAA
        ||||
 174549 TAAA