seq1 = pF1KE2569.tfa, 3273 bp
seq2 = pF1KE2569/gi568815593f_7296297.tfa (gi568815593f:7296297_7926868), 630572 bp

>pF1KE2569 3273
>gi568815593f:7296297_7926868 (Chr5)

1-210  (100001-100210)   100% ->
211-408  (118277-118474)   100% ->
409-570  (224442-224603)   99% ->
571-720  (329871-330020)   100% ->
721-869  (394395-394543)   100% ->
870-981  (399456-399567)   100% ->
982-1109  (401951-402078)   100% ->
1110-1268  (410448-410606)   100% ->
1269-1401  (411410-411542)   100% ->
1402-1578  (412915-413091)   100% ->
1579-1622  (416560-416603)   100% ->
1623-1703  (420861-420941)   100% ->
1704-1773  (428249-428318)   100% ->
1774-1871  (430868-430965)   100% ->
1872-1956  (447372-447456)   98% ->
1957-2094  (461153-461290)   100% ->
2095-2214  (470391-470510)   100% ->
2215-2384  (476636-476805)   100% ->
2385-2469  (488069-488153)   100% ->
2470-2628  (493346-493504)   100% ->
2629-2775  (505922-506068)   99% ->
2776-2883  (508289-508396)   100% ->
2884-2998  (520570-520684)   100% ->
2999-3123  (524269-524393)   100% ->
3124-3273  (530423-530572)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTGGCAGGAGGCGATGCGGCGCCGCCGCTACCTGCGGGACCGCTCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTGGCAGGAGGCGATGCGGCGCCGCCGCTACCTGCGGGACCGCTCCGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGAGGCGGCGGGCGGCGGAGACGGGCTGCCGCGGTCCCGGGACTGGCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGAGGCGGCGGGCGGCGGAGACGGGCTGCCGCGGTCCCGGGACTGGCTCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACGAGTCCTACTACTGCATGAGCCAGCAGCACCCGCTCATCGTCTTCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACGAGTCCTACTACTGCATGAGCCAGCAGCACCCGCTCATCGTCTTCCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTGCTCATCGTCATGGGCTCCTGCCTCGCCCTGCTCGCCGTCTTCTTCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CTGCTCATCGTCATGGGCTCCTGCCTCGCCCTGCTCGCCGTCTTCTTCGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GCTCGGGCTG         GAAGTTGAAGACCATGTGGCGTTTCTAATAA
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GCTCGGGCTGGTG...CAGGAAGTTGAAGACCATGTGGCGTTTCTAATAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CAGTTCCAACTGCCCTGGCGATTTTCTTTGCGATATTTATCCTGGTCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118308 CAGTTCCAACTGCCCTGGCGATTTTCTTTGCGATATTTATCCTGGTCTGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 ATCGAGTCTGTGTTTAAGAAGCTGCTGCGCCTCTTCTCGTTGGTGATATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118358 ATCGAGTCTGTGTTTAAGAAGCTGCTGCGCCTCTTCTCGTTGGTGATATG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GATATGCCTTGTTGCCATGGGATACCTGTTCATGTGTTTTGGAGGCACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118408 GATATGCCTTGTTGCCATGGGATACCTGTTCATGTGTTTTGGAGGCACCG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 TCTCTCCCTGGGACCAG         GTATCGTTCTTCCTCTTCATCATC
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 118458 TCTCTCCCTGGGACCAGGTA...TAGGTATCGTTCTTCCTCTTCATCATC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 TTCGTGTTGTACACCATGCTGCCCTTCAACATGCGAGACGCCATCATTGC
        |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 224466 TTCGTGGTGTACACCATGCTGCCCTTCAACATGCGAGACGCCATCATTGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CAGCGTCCTCACCTCCTCCTCCCACACCATCGTGCTTAGCGTCTGCCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 224516 CAGCGTCCTCACCTCCTCCTCCCACACCATCGTGCTTAGCGTCTGCCTGT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 CTGCAACACCGGGAGGCAAGGAGCACCTGGTCTGGCAG         ATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 224566 CTGCAACACCGGGAGGCAAGGAGCACCTGGTCTGGCAGGTG...TAGATC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 CTGGCCAATGTGATCATTTTCATCTGTGGGAACCTGGCGGGAGCCTACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 329874 CTGGCCAATGTGATCATTTTCATCTGTGGGAACCTGGCGGGAGCCTACCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 TAAGCACCTCATGGAACTCGCTCTTCAGCAAACATATCAGGACACCTGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 329924 TAAGCACCTCATGGAACTCGCTCTTCAGCAAACATATCAGGACACCTGTA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 ATTGCATCAAGTCGCGGATCAAGTTGGAATTTGAAAAACGTCAACAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 329974 ATTGCATCAAGTCGCGGATCAAGTTGGAATTTGAAAAACGTCAACAGGTA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    721       GAGCGGCTTCTGCTCTCCCTGCTGCCGGCCCACATCGCCATGGA
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 330024 ...CAGGAGCGGCTTCTGCTCTCCCTGCTGCCGGCCCACATCGCCATGGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 GATGAAAGCGGAGATCATCCAGAGGCTGCAGGGCCCCAAGGCGGGCCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 394439 GATGAAAGCGGAGATCATCCAGAGGCTGCAGGGCCCCAAGGCGGGCCAGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 TGGAGAACACAAATAACTTCCACAACCTGTATGTGAAGCGGCATACAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 394489 TGGAGAACACAAATAACTTCCACAACCTGTATGTGAAGCGGCATACAAAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 GTGAG         CATCTTATACGCTGACATCGTTGGCTTTACCCGGCT
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 394539 GTGAGGTA...CAGCATCTTATACGCTGACATCGTTGGCTTTACCCGGCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 GGCAAGTGACTGCTCCCCGGGAGAACTAGTCCACATGCTGAATGAGCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 399492 GGCAAGTGACTGCTCCCCGGGAGAACTAGTCCACATGCTGAATGAGCTCT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 TTGGAAAGTTTGATCAAATTGCAAAG         GAGAATGAATGCATG
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 399542 TTGGAAAGTTTGATCAAATTGCAAAGGTG...CAGGAGAATGAATGCATG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 AGAATTAAAATTTTAGGAGACTGCTACTACTGTGTATCTGGACTCCCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 401966 AGAATTAAAATTTTAGGAGACTGCTACTACTGTGTATCTGGACTCCCTAT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 ATCTCTCCCTAACCATGCCAAGAACTGTGTGAAAATGGGGCTGGACATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 402016 ATCTCTCCCTAACCATGCCAAGAACTGTGTGAAAATGGGGCTGGACATGT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 GTGAAGCCATAAA         GAAAGTGAGGGATGCTACTGGAGTTGAT
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 402066 GTGAAGCCATAAAGTA...TAGGAAAGTGAGGGATGCTACTGGAGTTGAT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 ATCAACATGCGCGTGGGCGTGCATTCTGGGAATGTCCTGTGTGGCGTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 410476 ATCAACATGCGCGTGGGCGTGCATTCTGGGAATGTCCTGTGTGGCGTGAT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 TGGTCTGCAGAAGTGGCAATATGATGTGTGGTCACATGATGTGACCTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 410526 TGGTCTGCAGAAGTGGCAATATGATGTGTGGTCACATGATGTGACCTTGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1238 CCAACCACATGGAAGCTGGAGGGGTCCCTGG         ACGTGTTCAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 410576 CCAACCACATGGAAGCTGGAGGGGTCCCTGGGTA...CAGACGTGTTCAC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 ATTTCTTCTGTCACCCTGGAGCACTTGAATGGCGCTTATAAAGTGGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 411420 ATTTCTTCTGTCACCCTGGAGCACTTGAATGGCGCTTATAAAGTGGAGGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1329 GGGAGATGGTGACATTAGGGACCCATATTTAAAACAGCACCTGGTGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 411470 GGGAGATGGTGACATTAGGGACCCATATTTAAAACAGCACCTGGTGAAAA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1379 CCTACTTTGTGATCAACCCCAAG         GGAGAACGACGGAGCCCC
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 411520 CCTACTTTGTGATCAACCCCAAGGTC...AAGGGAGAACGACGGAGCCCC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1420 CAGCATCTCTTCAGACCTCGCCACACCCTTGATGGAGCCAAAATGAGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 412933 CAGCATCTCTTCAGACCTCGCCACACCCTTGATGGAGCCAAAATGAGGGC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1470 CTCGGTCCGCATGACCCGGTACTTGGAGTCCTGGGGGGCAGCCAAGCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 412983 CTCGGTCCGCATGACCCGGTACTTGGAGTCCTGGGGGGCAGCCAAGCCCT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1520 TTGCACACCTACATCACAGGGACAGCATGACCACAGAGAACGGCAAGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 413033 TTGCACACCTACATCACAGGGACAGCATGACCACAGAGAACGGCAAGATC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1570 AGCACCACG         GATGTACCCATGGGTCAGCATAATTTTCAAAA
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 413083 AGCACCACGGTA...TAGGATGTACCCATGGGTCAGCATAATTTTCAAAA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1611 TCGCACCTTAAG         AACCAAGTCACAAAAGAAGAGATTTGAAG
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 416592 TCGCACCTTAAGGTA...TAGAACCAAGTCACAAAAGAAGAGATTTGAAG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1652 AAGAATTGAATGAAAGGATGATTCAAGCAATTGATGGGATTAATGCACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 420890 AAGAATTGAATGAAAGGATGATTCAAGCAATTGATGGGATTAATGCACAG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1702 AA         GCAATGGCTCAAGTCTGAAGACATTCAGAGAATCTCACT
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 420940 AAGTG...CAGGCAATGGCTCAAGTCTGAAGACATTCAGAGAATCTCACT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1743 GCTTTTCTATAACAAAGTACTAGAAAAAGAG         TACCGGGCCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 428288 GCTTTTCTATAACAAAGTACTAGAAAAAGAGGTA...CAGTACCGGGCCA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1784 CGGCACTGCCAGCGTTCAAGTATTATGTGACTTGTGCCTGTCTCATATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 430878 CGGCACTGCCAGCGTTCAAGTATTATGTGACTTGTGCCTGTCTCATATTC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1834 TTCTGCATCTTCATTGTGCAGATTCTCGTGCTGCCAAA         AAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 430928 TTCTGCATCTTCATTGTGCAGATTCTCGTGCTGCCAAAGTA...TAGAAC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1875 GTCTGTCCTGGGCATCTCCTTTGGGGCTGCGTTTCTCTTGCTGGCCTTCA
        ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 447375 GTCCGTCCTGGGCATCTCCTTTGGGGCTGCGTTTCTCTTGCTGGCCTTCA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1925 TCCTCTTCGTCTGCTTTGCTGGACAGCTTCTG         CAATGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 447425 TCCTCTTCGTCTGCTTTGCTGGACAGCTTCTGGTA...TAGCAATGCAGC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1966 AAAAAAGCCTCTCCCCTGCTCATGTGGCTTTTGAAGTCCTCGGGCATCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 461162 AAAAAAGCCTCTCCCCTGCTCATGTGGCTTTTGAAGTCCTCGGGCATCAT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2016 TGCCAACCGCCCCTGGCCACGGATCTCTCTCACGATCATCACCACAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 461212 TGCCAACCGCCCCTGGCCACGGATCTCTCTCACGATCATCACCACAGCCA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2066 TCATATTAATGATGGCCGTGTTCAACATG         TTTTTCCTGAGT
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 461262 TCATATTAATGATGGCCGTGTTCAACATGGTA...CAGTTTTTCCTGAGT

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2107 GACTCAGAGGAAACAATCCCTCCAACTGCCAACACAACAAACACAAGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 470403 GACTCAGAGGAAACAATCCCTCCAACTGCCAACACAACAAACACAAGCTT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2157 TTCAGCCTCAAATAATCAGGTGGCGATTCTGCGTGCGCAGAATTTATTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 470453 TTCAGCCTCAAATAATCAGGTGGCGATTCTGCGTGCGCAGAATTTATTTT

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2207 TCCTCCCG         TACTTTATCTACAGCTGCATTCTGGGACTGATA
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 470503 TCCTCCCGGTA...CAGTACTTTATCTACAGCTGCATTCTGGGACTGATA

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2248 TCCTGTTCCGTGTTCCTGCGGGTAAACTATGAGCTGAAGATGTTGATCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 476669 TCCTGTTCCGTGTTCCTGCGGGTAAACTATGAGCTGAAGATGTTGATCAT

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2298 GATGGTGGCCTTGGTGGGCTACAACACCATCCTACTCCACACCCACGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 476719 GATGGTGGCCTTGGTGGGCTACAACACCATCCTACTCCACACCCACGCCC

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2348 ACGTCCTGGGCGACTACAGCCAGGTCTTATTTGAGAG         ACCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 476769 ACGTCCTGGGCGACTACAGCCAGGTCTTATTTGAGAGGTG...TAGACCA

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2389 GGCATTTGGAAAGACCTGAAGACCATGGGCTCTGTGTCTCTCTCTATATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 488073 GGCATTTGGAAAGACCTGAAGACCATGGGCTCTGTGTCTCTCTCTATATT

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2439 CTTCATCACACTGCTTGTTCTGGGTAGACAG         AATGAATATT
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 488123 CTTCATCACACTGCTTGTTCTGGGTAGACAGGTA...CAGAATGAATATT

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2480 ACTGTAGGTTAGACTTCTTATGGAAGAACAAATTCAAAAAAGAGCGGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 493356 ACTGTAGGTTAGACTTCTTATGGAAGAACAAATTCAAAAAAGAGCGGGAG

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2530 GAGATAGAGACCATGGAGAACCTGAACCGCGTGCTGCTGGAGAACGTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 493406 GAGATAGAGACCATGGAGAACCTGAACCGCGTGCTGCTGGAGAACGTGCT

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2580 TCCCGCGCACGTGGCTGAGCACTTCCTGGCCAGGAGCCTGAAGAATGAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 493456 TCCCGCGCACGTGGCTGAGCACTTCCTGGCCAGGAGCCTGAAGAATGAGG

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2629         GAGCTATACCACCAGTCCTATGACTGCGTCTGTGTCATGTTT
        >>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
 493506 TC...CAGGAGCTATACCACCAGTCCTATGACTGCGTCTGCGTCATGTTT

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2671 GCCTCCATTCCGGATTTCAAAGAATTTTATACAGAATCCGACGTGAACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 505964 GCCTCCATTCCGGATTTCAAAGAATTTTATACAGAATCCGACGTGAACAA

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2721 GGAGGGCTTGGAATGCCTTCGGCTCCTGAACGAGATCATCGCTGACTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 506014 GGAGGGCTTGGAATGCCTTCGGCTCCTGAACGAGATCATCGCTGACTTTG

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2771 ATGAT         CTTCTTTCCAAGCCAAAATTCAGTGGAGTTGAAAAG
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 506064 ATGATGTA...CAGCTTCTTTCCAAGCCAAAATTCAGTGGAGTTGAAAAG

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2812 ATTAAGACCATTGGCAGCACATACATGGCAGCAACAGGTCTGAGCGCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 508325 ATTAAGACCATTGGCAGCACATACATGGCAGCAACAGGTCTGAGCGCTGT

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2862 GCCCAGCCAGGAGCACTCCCAG         GAGCCCGAGCGGCAGTACA
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 508375 GCCCAGCCAGGAGCACTCCCAGGTA...CAGGAGCCCGAGCGGCAGTACA

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2903 TGCACATTGGCACCATGGTGGAGTTTGCTTTTGCCCTGGTAGGGAAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 520589 TGCACATTGGCACCATGGTGGAGTTTGCTTTTGCCCTGGTAGGGAAGCTG

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2953 GATGCCATCAACAAGCACTCCTTCAACGACTTCAAATTGCGAGTGG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 520639 GATGCCATCAACAAGCACTCCTTCAACGACTTCAAATTGCGAGTGGGTA.

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2999      GTATTAACCATGGACCTGTGATAGCTGGTGTGATTGGAGCTCAGA
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 520689 ..CAGGTATTAACCATGGACCTGTGATAGCTGGTGTGATTGGAGCTCAGA

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3044 AGCCACAATATGATATCTGGGGCAACACTGTCAATGTGGCCAGTAGGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 524314 AGCCACAATATGATATCTGGGGCAACACTGTCAATGTGGCCAGTAGGATG

   3300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3094 GACAGCACCGGAGTCCTGGACAAAATACAG         GTTACCGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 524364 GACAGCACCGGAGTCCTGGACAAAATACAGGTA...TAGGTTACCGAGGA

   3350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3135 GACGAGCCTCGTCCTGCAGACCCTCGGATACACGTGCACCTGTCGAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 530434 GACGAGCCTCGTCCTGCAGACCCTCGGATACACGTGCACCTGTCGAGGAA

   3400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3185 TAATCAACGTGAAAGGAAAGGGGGACCTGAAGACGTACTTTGTAAACACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 530484 TAATCAACGTGAAAGGAAAGGGGGACCTGAAGACGTACTTTGTAAACACA

   3450     .    :    .    :    .    :    .
   3235 GAAATGTCAAGGTCCCTTTCCCAGAGCAACGTGGCATCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 530534 GAAATGTCAAGGTCCCTTTCCCAGAGCAACGTGGCATCC