seq1 = pF1KE2567.tfa, 2229 bp
seq2 = pF1KE2567/gi568815579r_2897851.tfa (gi568815579r:2897851_3128804), 230954 bp

>pF1KE2567 2229
>gi568815579r:2897851_3128804 (Chr19)

(complement)

1-24  (99901-99924)   100% ->
25-122  (100002-100099)   100% ->
123-186  (100423-100486)   100% ->
187-231  (100932-100976)   100% ->
232-294  (103723-103785)   100% ->
295-369  (109032-109106)   100% ->
370-550  (109342-109522)   100% ->
551-570  (110946-110965)   100% ->
571-678  (113045-113152)   100% ->
679-723  (114191-114235)   100% ->
724-873  (114987-115136)   100% ->
874-1012  (117645-117783)   100% ->
1013-1173  (119103-119263)   100% ->
1174-1250  (119860-119936)   100% ->
1251-1500  (122136-122385)   100% ->
1501-1748  (122837-123084)   100% ->
1749-1896  (123221-123368)   100% ->
1897-2047  (126302-126452)   100% ->
2048-2124  (128082-128158)   100% ->
2125-2229  (130850-130954)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTACCCCCAGGGAAGGCACCCG         ACCCCGCTCCAGTCCGG
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
  99901 ATGTACCCCCAGGGAAGGCACCCGGTG...CAGACCCCGCTCCAGTCCGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 CCAGCCCTTCAAGTTCTCGATCTTGGAGATCTGCGACCGCATCAAAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100019 CCAGCCCTTCAAGTTCTCGATCTTGGAGATCTGCGACCGCATCAAAGAAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AATTCCAGTTTCTTCAGGCTCAATACCACAG         CCTCAAGCTA
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 100069 AATTCCAGTTTCTTCAGGCTCAATACCACAGGTG...CAGCCTCAAGCTA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 GAATGTGAGAAGCTGGCCAGCGAGAAGACGGAAATGCAGCGACATTATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100433 GAATGTGAGAAGCTGGCCAGCGAGAAGACGGAAATGCAGCGACATTATGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CATG         TATTATGAGATGTCGTACGGGCTCAACATTGAAATGC
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100483 CATGGTG...CAGTATTATGAGATGTCGTACGGGCTCAACATTGAAATGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 ATAAGCAG         GCGGAGATTGTGAAGCGTCTGAGCGGTATCTGC
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 100969 ATAAGCAGGTA...CAGGCGGAGATTGTGAAGCGTCTGAGCGGTATCTGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    265 GCTCAGATTATCCCCTTCCTGACCCAGGAG         CATCAGCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 103756 GCTCAGATTATCCCCTTCCTGACCCAGGAGGTG...CAGCATCAGCAGCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    306 GGTGCTCCAGGCCGTAGAACGCGCCAAGCAGGTCACCGTGGGGGAGCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109043 GGTGCTCCAGGCCGTAGAACGCGCCAAGCAGGTCACCGTGGGGGAGCTGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    356 ACAGCCTCATCGGG         CAGCAGCTCCAGCCGCTGTCCCACCAC
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 109093 ACAGCCTCATCGGGGTG...CAGCAGCAGCTCCAGCCGCTGTCCCACCAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    397 GCACCCCCTGTGCCCCTCACCCCCCGCCCAGCCGGGCTGGTGGGCGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109369 GCACCCCCTGTGCCCCTCACCCCCCGCCCAGCCGGGCTGGTGGGCGGCAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    447 TGCTACGGGGCTGCTTGCTCTGTCTGGAGCCCTGGCTGCCCAGGCTCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109419 TGCTACGGGGCTGCTTGCTCTGTCTGGAGCCCTGGCTGCCCAGGCTCAGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    497 TGGCGGCGGCTGTCAAGGAGGACCGTGCGGGCGTGGAGGCCGAGGGGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109469 TGGCGGCGGCTGTCAAGGAGGACCGTGCGGGCGTGGAGGCCGAGGGGTCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    547 AGAG         TGGAGAGAGCCCCGAGCAGG         AGTGCATC
        ||||>>>...>>>||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 109519 AGAGGTG...CAGTGGAGAGAGCCCCGAGCAGGGTA...CAGAGTGCATC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    579 TCCCTCGCCCCCTGAGAGTCTCGTGGAGGAGGAGCGACCGAGTGGCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113053 TCCCTCGCCCCCTGAGAGTCTCGTGGAGGAGGAGCGACCGAGTGGCCCTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    629 GTGGTGGCGGGAAGCAGAGAGCAGATGAGAAGGAGCCATCAGGACCTTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113103 GTGGTGGCGGGAAGCAGAGAGCAGATGAGAAGGAGCCATCAGGACCTTAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    679          GAAAGCGACGAAGACAAGAGTGATTACAATCTGGTGGTGGA
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113153 GTG...CAGGAAAGCGACGAAGACAAGAGTGATTACAATCTGGTGGTGGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    720 CGAG         GACCAACCCTCAGAGCCCCCCAGCCCGGCTACCACCC
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114232 CGAGGTG...CAGGACCAACCCTCAGAGCCCCCCAGCCCGGCTACCACCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    761 CCTGCGGAAAGGTACCCATCTGCATTCCTGCCCGTCGGGACCTGGTGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115024 CCTGCGGAAAGGTACCCATCTGCATTCCTGCCCGTCGGGACCTGGTGGAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    811 AGTCCAGCCTCCTTGGCCTCTAGCCTTGGCTCACCGCTGCCTAGAGCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115074 AGTCCAGCCTCCTTGGCCTCTAGCCTTGGCTCACCGCTGCCTAGAGCCAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    861 GGAGCTCATCCTG         AATGACCTTCCCGCCAGCACTCCTGCCT
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 115124 GGAGCTCATCCTGGTA...CAGAATGACCTTCCCGCCAGCACTCCTGCCT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    902 CCAAATCCTGTGACTCCTCCCCGCCCCAGGACGCTTCCACCCCCGGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117673 CCAAATCCTGTGACTCCTCCCCGCCCCAGGACGCTTCCACCCCCGGGCCC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    952 AGCTCGGCCAGTCACCTCTGCCAGCTTGCTGCCAAGCCAGCACCTTCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117723 AGCTCGGCCAGTCACCTCTGCCAGCTTGCTGCCAAGCCAGCACCTTCCAC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1002 GGACAGCGTCG         CCCTGAGGAGCCCCCTGACTCTGTCCAGTC
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 117773 GGACAGCGTCGGTG...CAGCCCTGAGGAGCCCCCTGACTCTGTCCAGTC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1043 CCTTCACCACGTCCTTCAGCCTGGGCTCCCACAGCACTCTCAACGGAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119133 CCTTCACCACGTCCTTCAGCCTGGGCTCCCACAGCACTCTCAACGGAGAC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1093 CTCTCCGTGCCCAGCTCCTACGTCAGCCTCCACCTGTCCCCCCAGGTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119183 CTCTCCGTGCCCAGCTCCTACGTCAGCCTCCACCTGTCCCCCCAGGTCAG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1143 CAGCTCTGTGGTGTACGGACGCTCCCCCGTG         ATGGCATTTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 119233 CAGCTCTGTGGTGTACGGACGCTCCCCCGTGGTG...CAGATGGCATTTG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1184 AGTCTCATCCCCATCTCCGAGGGTCATCCGTCTCTTCCTCCCTACCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119870 AGTCTCATCCCCATCTCCGAGGGTCATCCGTCTCTTCCTCCCTACCCAGC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1234 ATCCCTGGGGGAAAGCC         GGCCTACTCCTTCCACGTGTCTGC
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 119920 ATCCCTGGGGGAAAGCCGTG...CAGGGCCTACTCCTTCCACGTGTCTGC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1275 GGACGGGCAGATGCAGCCGGTTCCCTTCCCCTCGGATGCACTGGTAGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122160 GGACGGGCAGATGCAGCCGGTTCCCTTCCCCTCGGATGCACTGGTAGGCG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1325 CGGGCATCCCGCGGCACGCCCGGCAGCTGCACACGCTGGCCCATGGCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122210 CGGGCATCCCGCGGCACGCCCGGCAGCTGCACACGCTGGCCCATGGCGAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1375 GTGGTCTGCGCGGTCACCATCAGCGGCTCCACACAGCATGTGTACACGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122260 GTGGTCTGCGCGGTCACCATCAGCGGCTCCACACAGCATGTGTACACGGG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1425 CGGCAAGGGCTGTGTGAAGGTGTGGGACGTGGGCCAGCCTGGGGCCAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122310 CGGCAAGGGCTGTGTGAAGGTGTGGGACGTGGGCCAGCCTGGGGCCAAGA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1475 CGCCCGTGGCCCAGCTCGACTGCCTG         AACCGAGACAACTAC
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 122360 CGCCCGTGGCCCAGCTCGACTGCCTGGTG...CAGAACCGAGACAACTAC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1516 ATTCGTTCCTGCAAGTTGCTGCCGGATGGCCGGAGTCTGATCGTGGGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122852 ATTCGTTCCTGCAAGTTGCTGCCGGATGGCCGGAGTCTGATCGTGGGCGG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1566 TGAGGCCAGCACCTTGTCCATTTGGGACCTGGCGGCGCCCACCCCCCGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122902 TGAGGCCAGCACCTTGTCCATTTGGGACCTGGCGGCGCCCACCCCCCGTA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1616 TCAAGGCCGAGCTGACTTCCTCAGCCCCAGCCTGCTACGCCCTGGCCGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122952 TCAAGGCCGAGCTGACTTCCTCAGCCCCAGCCTGCTACGCCCTGGCCGTC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1666 AGCCCCGACGCCAAGGTTTGCTTCTCCTGCTGCAGCGATGGCAACATTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123002 AGCCCCGACGCCAAGGTTTGCTTCTCCTGCTGCAGCGATGGCAACATTGT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1716 GGTCTGGGACCTGCAGAATCAGACTATGGTCAG         GCAGTTCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 123052 GGTCTGGGACCTGCAGAATCAGACTATGGTCAGGTG...CAGGCAGTTCC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1757 AGGGCCACACGGACGGCGCCAGCTGCATTGATATTTCCGATTACGGCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123229 AGGGCCACACGGACGGCGCCAGCTGCATTGATATTTCCGATTACGGCACT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1807 CGGCTCTGGACAGGGGGCCTGGACAACACGGTGCGCTGCTGGGACCTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123279 CGGCTCTGGACAGGGGGCCTGGACAACACGGTGCGCTGCTGGGACCTGCG

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1857 GGAGGGCCGCCAGCTGCAGCAGCATGACTTCAGCTCCCAG         A
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 123329 GGAGGGCCGCCAGCTGCAGCAGCATGACTTCAGCTCCCAGGTG...CAGA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1898 TTTTCTCCCTGGGCCACTGCCCTAACCAGGACTGGCTGGCGGTCGGAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126303 TTTTCTCCCTGGGCCACTGCCCTAACCAGGACTGGCTGGCGGTCGGAATG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1948 GAGAGTAGCAACGTGGAGATCCTGCACGTCCGCAAGCCGGAGAAATACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126353 GAGAGTAGCAACGTGGAGATCCTGCACGTCCGCAAGCCGGAGAAATACCA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1998 GCTGCACCTCCACGAGAGCTGCGTGCTGTCCCTGAAGTTTGCCTCCTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126403 GCTGCACCTCCACGAGAGCTGCGTGCTGTCCCTGAAGTTTGCCTCCTGCG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2048          GACGGTGGTTTGTGAGCACCGGGAAGGACAACCTGCTCAAC
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126453 GTG...AAGGACGGTGGTTTGTGAGCACCGGGAAGGACAACCTGCTCAAC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2089 GCCTGGAGGACGCCGTACGGGGCCAGCATTTTCCAG         TCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 128123 GCCTGGAGGACGCCGTACGGGGCCAGCATTTTCCAGGTA...CAGTCCAA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2130 GGAGTCGTCCTCAGTCCTGAGTTGTGACATCTCCAGAAATAACAAATACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130855 GGAGTCGTCCTCAGTCCTGAGTTGTGACATCTCCAGAAATAACAAATACA

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2180 TCGTGACAGGCTCGGGGGACAAGAAGGCCACCGTGTATGAGGTGGTCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130905 TCGTGACAGGCTCGGGGGACAAGAAGGCCACCGTGTATGAGGTGGTCTAC