Result of SIM4 for
pF1KE2565
seq1 = pF1KE2565.tfa, 3456 bp
seq2 = pF1KE2565/gi568815595r_47753162.tfa (gi568815595r:47753162_48098860), 345699 bp
>pF1KE2565 3456
>gi568815595r:47753162_48098860 (Chr3)
(complement)
1-223 (100001-100223) 100% ->
224-292 (120928-120996) 100% ->
293-415 (170511-170633) 100% ->
416-529 (176983-177096) 100% ->
530-652 (180020-180142) 100% ->
653-1876 (181687-182910) 100% ->
1877-1999 (183922-184044) 100% ->
2000-2106 (221338-221444) 100% ->
2107-2322 (222961-223176) 100% ->
2323-2506 (226761-226944) 100% ->
2507-2566 (227575-227634) 100% ->
2567-2859 (227756-228048) 100% ->
2860-2973 (229534-229647) 100% ->
2974-3066 (231523-231615) 100% ->
3067-3148 (241349-241430) 100% ->
3149-3261 (243501-243613) 100% ->
3262-3456 (245509-245700) 98%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGGCTGACCTCAGTCTTGCAGATGCATTAACAGAACCATCTCCAGACAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100001 ATGGCTGACCTCAGTCTTGCAGATGCATTAACAGAACCATCTCCAGACAT
50 . : . : . : . : . :
51 TGAGGGAGAGATAAAGCGGGACTTCATTGCCACACTAGAGGCAGAGGCCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100051 TGAGGGAGAGATAAAGCGGGACTTCATTGCCACACTAGAGGCAGAGGCCT
100 . : . : . : . : . :
101 TTGATGATGTTGTGGGAGAAACTGTTGGAAAAACAGACTATATTCCTCTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100101 TTGATGATGTTGTGGGAGAAACTGTTGGAAAAACAGACTATATTCCTCTC
150 . : . : . : . : . :
151 CTGGATGTTGATGAGAAAACCGGGAACTCAGAGTCAAAGAAGAAACCGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100151 CTGGATGTTGATGAGAAAACCGGGAACTCAGAGTCAAAGAAGAAACCGTG
200 . : . : . : . : . :
201 CTCAGAAACTAGCCAGATTGAAG ATACTCCATCTTCTAAAC
|||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
100201 CTCAGAAACTAGCCAGATTGAAGGTA...CAGATACTCCATCTTCTAAAC
250 . : . : . : . : . :
242 CAACACTCCTAGCCAATGGTGGTCATGGAGTAGAAGGGAGCGATACTACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
120946 CAACACTCCTAGCCAATGGTGGTCATGGAGTAGAAGGGAGCGATACTACA
300 . : . : . : . : . :
292 G GGTCTCCAACTGAATTCCTTGAAGAGAAAATGGCCTACCA
|>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
120996 GGTA...AAGGGTCTCCAACTGAATTCCTTGAAGAGAAAATGGCCTACCA
350 . : . : . : . : . :
333 GGAATACCCAAATAGCCAGAACTGGCCAGAAGATACCAACTTTTGTTTCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
170551 GGAATACCCAAATAGCCAGAACTGGCCAGAAGATACCAACTTTTGTTTCC
400 . : . : . : . : . :
383 AACCTGAGCAAGTGGTCGATCCTATCCAGACTG ATCCCTTT
|||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
170601 AACCTGAGCAAGTGGTCGATCCTATCCAGACTGGTA...CAGATCCCTTT
450 . : . : . : . : . :
424 AAGATGTACCATGATGATGACCTGGCAGATTTGGTCTTTCCCTCCAGTGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
176991 AAGATGTACCATGATGATGACCTGGCAGATTTGGTCTTTCCCTCCAGTGC
500 . : . : . : . : . :
474 GACAGCTGATACTTCAATATTTGCAGGACAAAATGATCCCTTGAAAGACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
177041 GACAGCTGATACTTCAATATTTGCAGGACAAAATGATCCCTTGAAAGACA
550 . : . : . : . : . :
524 GTTACG GTATGTCTCCCTGCAACACAGCTGTTGTACCTCAG
||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
177091 GTTACGGTA...TAGGTATGTCTCCCTGCAACACAGCTGTTGTACCTCAG
600 . : . : . : . : . :
565 GGGTGGTCTGTGGAAGCCTTAAACTCTCCACACTCAGAGTCCTTTGTTTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
180055 GGGTGGTCTGTGGAAGCCTTAAACTCTCCACACTCAGAGTCCTTTGTTTC
650 . : . : . : . : . :
615 CCCAGAGGCTGTTGCAGAACCTCCTCAGCCAACGGCAG TTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
180105 CCCAGAGGCTGTTGCAGAACCTCCTCAGCCAACGGCAGGTA...TAGTTC
700 . : . : . : . : . :
656 CCTTAGAGCTAGCCAAGGAGATAGAAATGGCATCAGAAGAGAGGCCACCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
181690 CCTTAGAGCTAGCCAAGGAGATAGAAATGGCATCAGAAGAGAGGCCACCA
750 . : . : . : . : . :
706 GCACAAGCATTGGAAATAATGATGGGACTGAAGACTACTGACATGGCACC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
181740 GCACAAGCATTGGAAATAATGATGGGACTGAAGACTACTGACATGGCACC
800 . : . : . : . : . :
756 ATCTAAAGAAACAGAGATGGCCCTCGCCAAGGACATGGCACTAGCTACAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
181790 ATCTAAAGAAACAGAGATGGCCCTCGCCAAGGACATGGCACTAGCTACAA
850 . : . : . : . : . :
806 AAACCGAGGTGGCATTGGCTAAAGATATGGAATCACCCACCAAATTAGAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
181840 AAACCGAGGTGGCATTGGCTAAAGATATGGAATCACCCACCAAATTAGAT
900 . : . : . : . : . :
856 GTGACACTGGCCAAGGACATGCAGCCATCCATGGAATCAGATATGGCCCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
181890 GTGACACTGGCCAAGGACATGCAGCCATCCATGGAATCAGATATGGCCCT
950 . : . : . : . : . :
906 AGTCAAGGACATGGAACTACCCACAGAAAAAGAAGTGGCCCTGGTTAAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
181940 AGTCAAGGACATGGAACTACCCACAGAAAAAGAAGTGGCCCTGGTTAAGG
1000 . : . : . : . : . :
956 ATGTCAGATGGCCCACAGAAACAGATGTATCTTCAGCCAAGAATGTGGTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
181990 ATGTCAGATGGCCCACAGAAACAGATGTATCTTCAGCCAAGAATGTGGTA
1050 . : . : . : . : . :
1006 CTGCCCACAGAAACAGAGGTAGCCCCAGCCAAGGATGTGACACTGTTGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
182040 CTGCCCACAGAAACAGAGGTAGCCCCAGCCAAGGATGTGACACTGTTGAA
1100 . : . : . : . : . :
1056 AGAAACAGAGAGGGCATCTCCTATAAAAATGGACTTAGCCCCTTCCAAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
182090 AGAAACAGAGAGGGCATCTCCTATAAAAATGGACTTAGCCCCTTCCAAGG
1150 . : . : . : . : . :
1106 ACATGGGACCACCCAAAGAAAACAAGAAAGAAACAGAGAGGGCATCTCCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
182140 ACATGGGACCACCCAAAGAAAACAAGAAAGAAACAGAGAGGGCATCTCCT
1200 . : . : . : . : . :
1156 ATAAAAATGGACTTGGCTCCTTCCAAGGACATGGGACCACCCAAAGAAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
182190 ATAAAAATGGACTTGGCTCCTTCCAAGGACATGGGACCACCCAAAGAAAA
1250 . : . : . : . : . :
1206 CAAGATAGTCCCAGCCAAGGATTTGGTATTACTCTCAGAAATAGAGGTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
182240 CAAGATAGTCCCAGCCAAGGATTTGGTATTACTCTCAGAAATAGAGGTGG
1300 . : . : . : . : . :
1256 CACAGGCTAATGACATTATATCATCCACAGAAATATCCTCTGCTGAGAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
182290 CACAGGCTAATGACATTATATCATCCACAGAAATATCCTCTGCTGAGAAG
1350 . : . : . : . : . :
1306 GTGGCTTTGTCCTCAGAAACAGAGGTAGCCCTGGCCAGGGACATGACACT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
182340 GTGGCTTTGTCCTCAGAAACAGAGGTAGCCCTGGCCAGGGACATGACACT
1400 . : . : . : . : . :
1356 GCCCCCGGAAACCAACGTGATCTTGACCAAGGATAAAGCACTACCTTTAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
182390 GCCCCCGGAAACCAACGTGATCTTGACCAAGGATAAAGCACTACCTTTAG
1450 . : . : . : . : . :
1406 AAGCAGAGGTGGCCCCAGTCAAGGACATGGCTCAACTCCCAGAAACAGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
182440 AAGCAGAGGTGGCCCCAGTCAAGGACATGGCTCAACTCCCAGAAACAGAA
1500 . : . : . : . : . :
1456 ATAGCCCCGGCCAAGGATGTGGCTCCGTCCACAGTAAAAGAAGTGGGCTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
182490 ATAGCCCCGGCCAAGGATGTGGCTCCGTCCACAGTAAAAGAAGTGGGCTT
1550 . : . : . : . : . :
1506 GTTGAAGGACATGTCTCCACTATCAGAAACAGAAATGGCTCTGGGCAAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
182540 GTTGAAGGACATGTCTCCACTATCAGAAACAGAAATGGCTCTGGGCAAGG
1600 . : . : . : . : . :
1556 ATGTGACTCCACCTCCAGAAACAGAAGTAGTTCTCATCAAGAACGTATGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
182590 ATGTGACTCCACCTCCAGAAACAGAAGTAGTTCTCATCAAGAACGTATGT
1650 . : . : . : . : . :
1606 CTGCCTCCAGAAATGGAGGTGGCCCTGACTGAGGATCAGGTCCCAGCCCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
182640 CTGCCTCCAGAAATGGAGGTGGCCCTGACTGAGGATCAGGTCCCAGCCCT
1700 . : . : . : . : . :
1656 CAAAACAGAAGCACCCCTGGCTAAGGATGGGGTTCTGACCCTGGCCAACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
182690 CAAAACAGAAGCACCCCTGGCTAAGGATGGGGTTCTGACCCTGGCCAACA
1750 . : . : . : . : . :
1706 ATGTGACTCCAGCCAAAGATGTTCCACCACTCTCAGAAACAGAGGCAACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
182740 ATGTGACTCCAGCCAAAGATGTTCCACCACTCTCAGAAACAGAGGCAACA
1800 . : . : . : . : . :
1756 CCAGTTCCAATTAAAGACATGGAAATTGCACAAACACAAAAAGGAATAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
182790 CCAGTTCCAATTAAAGACATGGAAATTGCACAAACACAAAAAGGAATAAG
1850 . : . : . : . : . :
1806 TGAGGATTCCCATTTAGAATCTCTGCAGGATGTGGGGCAGTCAGCTGCAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
182840 TGAGGATTCCCATTTAGAATCTCTGCAGGATGTGGGGCAGTCAGCTGCAC
1900 . : . : . : . : . :
1856 CTACTTTCATGATTTCACCAG AAACCGTCACAGGAACGGGG
|||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
182890 CTACTTTCATGATTTCACCAGGTA...TAGAAACCGTCACAGGAACGGGG
1950 . : . : . : . : . :
1897 AAAAAGTGCAGCTTGCCGGCCGAGGAGGATTCTGTGTTAGAAAAACTAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
183942 AAAAAGTGCAGCTTGCCGGCCGAGGAGGATTCTGTGTTAGAAAAACTAGG
2000 . : . : . : . : . :
1947 GGAAAGGAAACCATGCAACAGTCAACCTTCTGAGCTTTCTTCAGAGACCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
183992 GGAAAGGAAACCATGCAACAGTCAACCTTCTGAGCTTTCTTCAGAGACCT
2050 . : . : . : . : . :
1997 CAG GAATAGCCAGGCCAGAAGAAGGAAGGCCTGTGGTGAGT
|||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
184042 CAGGTA...TAGGAATAGCCAGGCCAGAAGAAGGAAGGCCTGTGGTGAGT
2100 . : . : . : . : . :
2038 GGGACAGGAAATGACATCACCACCCCACCGAACAAGGAGCTCCCACCAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
221376 GGGACAGGAAATGACATCACCACCCCACCGAACAAGGAGCTCCCACCAAG
2150 . : . : . : . : . :
2088 CCCAGAGAAGAAAACAAAG CCTTTGGCCACCACTCAACCTG
|||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
221426 CCCAGAGAAGAAAACAAAGGTA...AAGCCTTTGGCCACCACTCAACCTG
2200 . : . : . : . : . :
2129 CAAAGACTTCAACATCGAAAGCCAAAACACAGCCCACTTCTCTCCCTAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
222983 CAAAGACTTCAACATCGAAAGCCAAAACACAGCCCACTTCTCTCCCTAAG
2250 . : . : . : . : . :
2179 CAGCCAGCTCCCACCACCATTGGTGGGTTGAATAAAAAACCCATGAGCCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
223033 CAGCCAGCTCCCACCACCATTGGTGGGTTGAATAAAAAACCCATGAGCCT
2300 . : . : . : . : . :
2229 TGCTTCAGGCTTAGTGCCAGCTGCCCCACCCAAACGCCCTGCCGTCGCCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
223083 TGCTTCAGGCTTAGTGCCAGCTGCCCCACCCAAACGCCCTGCCGTCGCCT
2350 . : . : . : . : . :
2279 CTGCCAGGCCTTCCATCTTACCTTCAAAAGACGTGAAGCCAAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
223133 CTGCCAGGCCTTCCATCTTACCTTCAAAAGACGTGAAGCCAAAGGTA...
2400 . : . : . : . : . :
2323 CCCATTGCAGATGCAAAGGCTCCTGAGAAGCGGGCCTCACCATCCAA
>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
226758 CAGCCCATTGCAGATGCAAAGGCTCCTGAGAAGCGGGCCTCACCATCCAA
2450 . : . : . : . : . :
2370 GCCAGCTTCTGCCCCAGCCTCCAGATCTGGGTCCAAGAGCACTCAGACTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
226808 GCCAGCTTCTGCCCCAGCCTCCAGATCTGGGTCCAAGAGCACTCAGACTG
2500 . : . : . : . : . :
2420 TTGCAAAAACCACAACAGCTGCTGCTGTTGCCTCAACTGGCCCAAGCAGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
226858 TTGCAAAAACCACAACAGCTGCTGCTGTTGCCTCAACTGGCCCAAGCAGT
2550 . : . : . : . : . :
2470 AGGAGCCCCTCCACGCTCCTGCCCAAGAAGCCCACTG CCAT
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
226908 AGGAGCCCCTCCACGCTCCTGCCCAAGAAGCCCACTGGTG...CAGCCAT
2600 . : . : . : . : . :
2511 TAAGACTGAGGGAAAACCTGCAGAAGTCAAGAAGATGACTGCAAAGTCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
227579 TAAGACTGAGGGAAAACCTGCAGAAGTCAAGAAGATGACTGCAAAGTCTG
2650 . : . : . : . : . :
2561 TACCAG CTGACTTGAGTCGCCCAAAGAGCACCTCCACCAGT
||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
227629 TACCAGGTA...CAGCTGACTTGAGTCGCCCAAAGAGCACCTCCACCAGT
2700 . : . : . : . : . :
2602 TCCATGAAGAAAACCACCACTCTCAGTGGGACAGCCCCCGCTGCAGGGGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
227791 TCCATGAAGAAAACCACCACTCTCAGTGGGACAGCCCCCGCTGCAGGGGT
2750 . : . : . : . : . :
2652 GGTTCCCAGCCGAGTCAAGGCCACACCCATGCCCTCCCGGCCCTCCACAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
227841 GGTTCCCAGCCGAGTCAAGGCCACACCCATGCCCTCCCGGCCCTCCACAA
2800 . : . : . : . : . :
2702 CTCCTTTCATAGACAAGAAGCCCACCTCGGCCAAACCCAGCTCCACCACC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
227891 CTCCTTTCATAGACAAGAAGCCCACCTCGGCCAAACCCAGCTCCACCACC
2850 . : . : . : . : . :
2752 CCCCGGCTCAGCCGCCTGGCCACCAATACTTCTGCTCCTGATCTGAAGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
227941 CCCCGGCTCAGCCGCCTGGCCACCAATACTTCTGCTCCTGATCTGAAGAA
2900 . : . : . : . : . :
2802 TGTCCGCTCCAAGGTTGGCTCCACGGAAAACATCAAGCATCAGCCTGGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
227991 TGTCCGCTCCAAGGTTGGCTCCACGGAAAACATCAAGCATCAGCCTGGAG
2950 . : . : . : . : . :
2852 GAGGCCGG GCCAAAGTAGAGAAAAAAACAGAGGCAGCTGCT
||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
228041 GAGGCCGGGTG...CAGGCCAAAGTAGAGAAAAAAACAGAGGCAGCTGCT
3000 . : . : . : . : . :
2893 ACAACCCGAAAGCCTGAATCTAATGCAGTCACTAAAACAGCCGGCCCAAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
229567 ACAACCCGAAAGCCTGAATCTAATGCAGTCACTAAAACAGCCGGCCCAAT
3050 . : . : . : . : . :
2943 TGCAAGTGCACAGAAACAACCTGCGGGGAAA GTCCAGATAG
|||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
229617 TGCAAGTGCACAGAAACAACCTGCGGGGAAAGTG...CAGGTCCAGATAG
3100 . : . : . : . : . :
2984 TCTCCAAAAAAGTGAGCTACAGCCATATTCAGTCCAAGTGTGGTTCCAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
231533 TCTCCAAAAAAGTGAGCTACAGCCATATTCAGTCCAAGTGTGGTTCCAAG
3150 . : . : . : . : . :
3034 GACAATATTAAGCATGTCCCTGGAGGTGGTAAT GTTCAGAT
|||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
231583 GACAATATTAAGCATGTCCCTGGAGGTGGTAATGTA...CAGGTTCAGAT
3200 . : . : . : . : . :
3075 TCAGAACAAGAAAGTGGACATCTCTAAGGTCTCCTCCAAGTGTGGGTCTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
241357 TCAGAACAAGAAAGTGGACATCTCTAAGGTCTCCTCCAAGTGTGGGTCTA
3250 . : . : . : . : . :
3125 AGGCTAACATCAAGCACAAGCCTG GTGGAGGAGATGTCAAG
||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
241407 AGGCTAACATCAAGCACAAGCCTGGTG...CAGGTGGAGGAGATGTCAAG
3300 . : . : . : . : . :
3166 ATTGAAAGTCAGAAGTTGAACTTCAAGGAGAAGGCCCAGGCCAAGGTGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
243518 ATTGAAAGTCAGAAGTTGAACTTCAAGGAGAAGGCCCAGGCCAAGGTGGG
3350 . : . : . : . : . :
3216 ATCCCTCGATAATGTGGGCCACCTACCTGCAGGAGGTGCTGTGAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
243568 ATCCCTCGATAATGTGGGCCACCTACCTGCAGGAGGTGCTGTGAAGGTA.
3400 . : . : . : . : . :
3262 ACTGAGGGCGGTGGCAGCGAGGCTCCTCTGTGTCCGGGTCCCCCT
..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
243618 ..TAGACTGAGGGCGGTGGCAGCGAGGCTCCTCTGTGTCCGGGTCCCCCT
3450 . : . : . : . : . :
3307 GCTGGGGAGGAGCCGGCCATCTCTGAGGCAGCGCCTGAAGCTGGCGCCCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
245554 GCTGGGGAGGAGCCGGCCATCTCTGAGGCAGCGCCTGAAGCTGGCGCCCC
3500 . : . : . : . : . :
3357 CACTTCAGCCAGTGGCCTCAATGGCCACCCCACCCTGTCAGGGGGTGGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
245604 CACTTCAGCCAGTGGCCTCAATGGCCACCCCACCCTGTCAGGGGGTGGTG
3550 . : . : . : . : . :
3407 ACCAAAGGGAGGCCCAGACCTTGGACAGCCAGATCCAGGAGACAAGCATC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--|-
245654 ACCAAAGGGAGGCCCAGACCTTGGACAGCCAGATCCAGGAGACAAG T