Result of SIM4 for
pF1KE2563
seq1 = pF1KE2563.tfa, 2985 bp
seq2 = pF1KE2563/gi568815585r_33005596.tfa (gi568815585r:33005596_33230291), 224696 bp
>pF1KE2563 2985
>gi568815585r:33005596_33230291 (Chr13)
(complement)
1-33 (87950-87982) 100% ->
34-1394 (100003-101363) 100% ->
1395-1568 (102746-102919) 100% ->
1569-1728 (104052-104211) 100% ->
1729-1927 (112029-112227) 100% ->
1928-2138 (117361-117571) 100% ->
2139-2253 (118400-118514) 100% ->
2254-2475 (119385-119606) 100% ->
2476-2693 (120202-120419) 100% ->
2694-2870 (123358-123534) 100% ->
2871-2985 (124582-124696) 100%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGAAACTTGATGTGAACTTCCAAAGGAAAAAG GGTGACGA
|||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
87950 ATGAAACTTGATGTGAACTTCCAAAGGAAAAAGGTA...CAGGGTGACGA
50 . : . : . : . : . :
42 CTCCGATGAGGAAGATCTTTGTATCAGCAACAAATGGACTTTCCAAAGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100011 CTCCGATGAGGAAGATCTTTGTATCAGCAACAAATGGACTTTCCAAAGAA
100 . : . : . : . : . :
92 CCAGTCGCAGGTGGTCTCGTGTGGACGACCTCTACACGCTGCTCCCTCGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100061 CCAGTCGCAGGTGGTCTCGTGTGGACGACCTCTACACGCTGCTCCCTCGA
150 . : . : . : . : . :
142 GGAGACAGAAATGGGTCACCGGGAGGCACGGGGATGAGGAACACGACCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100111 GGAGACAGAAATGGGTCACCGGGAGGCACGGGGATGAGGAACACGACCAG
200 . : . : . : . : . :
192 CAGTGAGAGCGTCCTCACAGACCTGAGCGAGCCTGAGGTCTGCTCCATTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100161 CAGTGAGAGCGTCCTCACAGACCTGAGCGAGCCTGAGGTCTGCTCCATTC
250 . : . : . : . : . :
242 ACAGCGAAAGCAGTGGAGGCAGCGACAGTCGCAGCCAGCCGGGCCAGTGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100211 ACAGCGAAAGCAGTGGAGGCAGCGACAGTCGCAGCCAGCCGGGCCAGTGC
300 . : . : . : . : . :
292 TGTACAGACAACCCGGTCATGCTGGATGCCCCACTCGTCAGCAGCAGCCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100261 TGTACAGACAACCCGGTCATGCTGGATGCCCCACTCGTCAGCAGCAGCCT
350 . : . : . : . : . :
342 CCCACAGCCCCCCAGAGATGTCCTCAACCACCCCTTCCACCCCAAGAATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100311 CCCACAGCCCCCCAGAGATGTCCTCAACCACCCCTTCCACCCCAAGAATG
400 . : . : . : . : . :
392 AGAAGCCCACGAGGGCTAGGGCCAAATCATTTTTGAAACGCATGGAAACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100361 AGAAGCCCACGAGGGCTAGGGCCAAATCATTTTTGAAACGCATGGAAACA
450 . : . : . : . : . :
442 CTCCGAGGGAAGGGAGCCCACGGGAGGCATAAGGGGTCTGGGCGGACAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100411 CTCCGAGGGAAGGGAGCCCACGGGAGGCATAAGGGGTCTGGGCGGACAGG
500 . : . : . : . : . :
492 TGGCCTGGTGATCAGTGGGCCCATGTTGCAGCAGGAGCCAGAGTCCTTTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100461 TGGCCTGGTGATCAGTGGGCCCATGTTGCAGCAGGAGCCAGAGTCCTTTA
550 . : . : . : . : . :
542 AGGCTATGCAGTGCATCCAAATACCAAATGGAGATCTCCAGAATTCGCCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100511 AGGCTATGCAGTGCATCCAAATACCAAATGGAGATCTCCAGAATTCGCCG
600 . : . : . : . : . :
592 CCACCTGCCTGCAGAAAAGGGCTCCCATGCTCTGGCAAGTCGAGTGGCGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100561 CCACCTGCCTGCAGAAAAGGGCTCCCATGCTCTGGCAAGTCGAGTGGCGA
650 . : . : . : . : . :
642 GAGCAGCCCGTCGGAGCACAGCAGCAGCGGGGTGAGCACGCCCTGCCTGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100611 GAGCAGCCCGTCGGAGCACAGCAGCAGCGGGGTGAGCACGCCCTGCCTGA
700 . : . : . : . : . :
692 AGGAACGCAAGTGCCACGAGGCCAACAAGCGCGGGGGCATGTACTTGGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100661 AGGAACGCAAGTGCCACGAGGCCAACAAGCGCGGGGGCATGTACTTGGAG
750 . : . : . : . : . :
742 GACCTAGATGTGCTGGCGGGGACAGCACTGCCGGATGCAGGGGACCAAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100711 GACCTAGATGTGCTGGCGGGGACAGCACTGCCGGATGCAGGGGACCAAAG
800 . : . : . : . : . :
792 CCGTATGCATGAATTTCACTCCCAAGAGAATTTGGTGGTGCATATTCCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100761 CCGTATGCATGAATTTCACTCCCAAGAGAATTTGGTGGTGCATATTCCCA
850 . : . : . : . : . :
842 AGGATCACAAACCAGGAACATTCCCCAAGGCACTTTCTATTGAAAGCCTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100811 AGGATCACAAACCAGGAACATTCCCCAAGGCACTTTCTATTGAAAGCCTC
900 . : . : . : . : . :
892 TCTCCCACAGATAGTAGCAATGGGGTTAATTGGAGGACCGGTAGCATCTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100861 TCTCCCACAGATAGTAGCAATGGGGTTAATTGGAGGACCGGTAGCATCTC
950 . : . : . : . : . :
942 CCTGGGCAGAGAGCAGGTCCCTGGTGCCAGGGAGCCCCGGCTCATGGCGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100911 CCTGGGCAGAGAGCAGGTCCCTGGTGCCAGGGAGCCCCGGCTCATGGCGT
1000 . : . : . : . : . :
992 CCTGCCACAGAGCCAGCCGAGTCAGTATCTATGACAATGTCCCTGGCTCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100961 CCTGCCACAGAGCCAGCCGAGTCAGTATCTATGACAATGTCCCTGGCTCC
1050 . : . : . : . : . :
1042 CATCTGTATGCCAGCACAGGAGATCTTTTGGACTTGGAGAAAGATGACCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101011 CATCTGTATGCCAGCACAGGAGATCTTTTGGACTTGGAGAAAGATGACCT
1100 . : . : . : . : . :
1092 TTTCCCTCACTTGGATGACATTCTGCAGCATGTCAATGGGCTCCAAGAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101061 TTTCCCTCACTTGGATGACATTCTGCAGCATGTCAATGGGCTCCAAGAGG
1150 . : . : . : . : . :
1142 TAGTCGATGACTGGTCCAAAGATGTCTTGCCTGAACTGCAAACTCATGAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101111 TAGTCGATGACTGGTCCAAAGATGTCTTGCCTGAACTGCAAACTCATGAT
1200 . : . : . : . : . :
1192 ACATTGGTTGGGGAACCTGGCTTATCCACCTTTCCATCTCCTAATCAGAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101161 ACATTGGTTGGGGAACCTGGCTTATCCACCTTTCCATCTCCTAATCAGAT
1250 . : . : . : . : . :
1242 CACCTTAGATTTTGAAGGTAACTCTGTCTCAGAAGGTCGGACGACACCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101211 CACCTTAGATTTTGAAGGTAACTCTGTCTCAGAAGGTCGGACGACACCCA
1300 . : . : . : . : . :
1292 GTGATGTGGAAAGAGATGTAACATCTCTTAATGAATCTGAGCCTCCTGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101261 GTGATGTGGAAAGAGATGTAACATCTCTTAATGAATCTGAGCCTCCTGGG
1350 . : . : . : . : . :
1342 GTCAGAGACAGGAGGGATTCTGGTGTAGGGGCCTCTCTGACCAGGCCAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101311 GTCAGAGACAGGAGGGATTCTGGTGTAGGGGCCTCTCTGACCAGGCCAAA
1400 . : . : . : . : . :
1392 CAG GCGACTCCGATGGAACAGTTTCCAGCTGTCGCACCAGC
|||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101361 CAGGTA...AAGGCGACTCCGATGGAACAGTTTCCAGCTGTCGCACCAGC
1450 . : . : . : . : . :
1433 CCCGGCCGGCCCCAGCATCGCCCCACATCAGCAGCCAGACGGCCAGCCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102784 CCCGGCCGGCCCCAGCATCGCCCCACATCAGCAGCCAGACGGCCAGCCAG
1500 . : . : . : . : . :
1483 CTGAGCCTGCTCCAGCGCTTCTCACTGCTCCGCCTCACGGCCATCATGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102834 CTGAGCCTGCTCCAGCGCTTCTCACTGCTCCGCCTCACGGCCATCATGGA
1550 . : . : . : . : . :
1533 GAAGCACTCCATGTCCAACAAGCACGGCTGGACATG GTCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
102884 GAAGCACTCCATGTCCAACAAGCACGGCTGGACATGGTG...TAGGTCAG
1600 . : . : . : . : . :
1574 TTCCAAAGTTCATGAAGAGGATGAAAGTTCCCGACTACAAAGACAAGGCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104057 TTCCAAAGTTCATGAAGAGGATGAAAGTTCCCGACTACAAAGACAAGGCT
1650 . : . : . : . : . :
1624 GTCTTTGGCGTTCCTCTCATAGTCCACGTCCAAAGAACGGGACAGCCCCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104107 GTCTTTGGCGTTCCTCTCATAGTCCACGTCCAAAGAACGGGACAGCCCCT
1700 . : . : . : . : . :
1674 GCCTCAAAGTATTCAGCAAGCACTGAGATATCTACGCAGCAACTGCCTCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104157 GCCTCAAAGTATTCAGCAAGCACTGAGATATCTACGCAGCAACTGCCTCG
1750 . : . : . : . : . :
1724 ATCAG GTGGGTCTTTTTCGCAAATCAGGAGTGAAGTCTCGA
|||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104207 ATCAGGTA...CAGGTGGGTCTTTTTCGCAAATCAGGAGTGAAGTCTCGA
1800 . : . : . : . : . :
1765 ATCCATGCCCTTCGCCAAATGAATGAAAACTTCCCTGAGAACGTCAACTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
112065 ATCCATGCCCTTCGCCAAATGAATGAAAACTTCCCTGAGAACGTCAACTA
1850 . : . : . : . : . :
1815 TGAAGACCAGTCTGCTTATGATGTGGCGGATATGGTGAAACAGTTCTTCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
112115 TGAAGACCAGTCTGCTTATGATGTGGCGGATATGGTGAAACAGTTCTTCC
1900 . : . : . : . : . :
1865 GGGACCTCCCTGAGCCTCTTTTCACCAACAAGCTCAGTGAGACCTTTCTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
112165 GGGACCTCCCTGAGCCTCTTTTCACCAACAAGCTCAGTGAGACCTTTCTC
1950 . : . : . : . : . :
1915 CATATCTATCAGT ATGTCTCCAAAGAGCAGCGGCTGCAGGC
|||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
112215 CATATCTATCAGTGTA...CAGATGTCTCCAAAGAGCAGCGGCTGCAGGC
2000 . : . : . : . : . :
1956 CGTGCAGGCTGCCATCCTGCTACTGGCCGATGAGAACAGGGAGGTCCTGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
117389 CGTGCAGGCTGCCATCCTGCTACTGGCCGATGAGAACAGGGAGGTCCTGC
2050 . : . : . : . : . :
2006 AGACGCTCTTGTGTTTCCTGAACGACGTCGTCAACTTGGTGGAAGAGAAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
117439 AGACGCTCTTGTGTTTCCTGAACGACGTCGTCAACTTGGTGGAAGAGAAT
2100 . : . : . : . : . :
2056 CAGATGACGCCCATGAACCTGGCAGTGTGTCTGGCCCCCTCCCTCTTTCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
117489 CAGATGACGCCCATGAACCTGGCAGTGTGTCTGGCCCCCTCCCTCTTTCA
2150 . : . : . : . : . :
2106 TCTTAATTTATTGAAGAAAGAAAGCTCTCCACG AGTCATAC
|||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
117539 TCTTAATTTATTGAAGAAAGAAAGCTCTCCACGGTG...CAGAGTCATAC
2200 . : . : . : . : . :
2147 AGAAGAAATATGCCACTGGGAAGCCAGATCAAAAGGACCTCAACGAGAAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
118408 AGAAGAAATATGCCACTGGGAAGCCAGATCAAAAGGACCTCAACGAGAAT
2250 . : . : . : . : . :
2197 CTGGCAGCAGCTCAGGGGCTAGCGCACATGATCATGGAATGCGACAGACT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
118458 CTGGCAGCAGCTCAGGGGCTAGCGCACATGATCATGGAATGCGACAGACT
2300 . : . : . : . : . :
2247 TTTTGAG GTTCCACACGAGTTGGTGGCCCAGTCTCGTAACT
|||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
118508 TTTTGAGGTG...TAGGTTCCACACGAGTTGGTGGCCCAGTCTCGTAACT
2350 . : . : . : . : . :
2288 CGTATGTGGAGGCTGAGATCCACGTGCCAACCCTGGAAGAATTGGGGACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
119419 CGTATGTGGAGGCTGAGATCCACGTGCCAACCCTGGAAGAATTGGGGACA
2400 . : . : . : . : . :
2338 CAGCTGGAGGAGAGTGGGGCAACTTTCCACACTTACCTGAACCATCTCAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
119469 CAGCTGGAGGAGAGTGGGGCAACTTTCCACACTTACCTGAACCATCTCAT
2450 . : . : . : . : . :
2388 CCAGGGCCTCCAGAAAGAAGCCAAGGAGAAGTTCAAAGGATGGGTCACGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
119519 CCAGGGCCTCCAGAAAGAAGCCAAGGAGAAGTTCAAAGGATGGGTCACGT
2500 . : . : . : . : . :
2438 GCTCCAGCACGGACAATACAGATCTTGCTTTCAAAAAG GTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
119569 GCTCCAGCACGGACAATACAGATCTTGCTTTCAAAAAGGTA...AAGGTG
2550 . : . : . : . : . :
2479 GGCGACGGGAACCCGCTGAAGCTGTGGAAGGCTTCTGTGGAGGTGGAAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
120205 GGCGACGGGAACCCGCTGAAGCTGTGGAAGGCTTCTGTGGAGGTGGAAGC
2600 . : . : . : . : . :
2529 ACCCCCCTCAGTGGTCCTGAACCGCGTGCTGAGAGAGCGCCACCTGTGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
120255 ACCCCCCTCAGTGGTCCTGAACCGCGTGCTGAGAGAGCGCCACCTGTGGG
2650 . : . : . : . : . :
2579 ACGAGGACTTTGTGCAGTGGAAGGTTGTGGAAACTCTAGACAGGCAAACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
120305 ACGAGGACTTTGTGCAGTGGAAGGTTGTGGAAACTCTAGACAGGCAAACA
2700 . : . : . : . : . :
2629 GAGATCTACCAGTATGTGCTGAACAGCATGGCTCCCCATCCTTCCAGAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
120355 GAGATCTACCAGTATGTGCTGAACAGCATGGCTCCCCATCCTTCCAGAGA
2750 . : . : . : . : . :
2679 CTTTGTGGTTCTCAG GACCTGGAAAACTGATTTGCCCAAAG
|||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
120405 CTTTGTGGTTCTCAGGTG...CAGGACCTGGAAAACTGATTTGCCCAAAG
2800 . : . : . : . : . :
2720 GAATGTGTACCCTGGTGTCCCTCTCCGTGGAGCATGAGGAAGCCCAGCTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
123384 GAATGTGTACCCTGGTGTCCCTCTCCGTGGAGCATGAGGAAGCCCAGCTC
2850 . : . : . : . : . :
2770 CTGGGTGGTGTGCGAGCAGTGGTGATGGACTCGCAGTACTTGATAGAACC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
123434 CTGGGTGGTGTGCGAGCAGTGGTGATGGACTCGCAGTACTTGATAGAACC
2900 . : . : . : . : . :
2820 GTGTGGCTCTGGCAAGTCAAGACTGACTCACATCTGCAGGATAGACCTGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
123484 GTGTGGCTCTGGCAAGTCAAGACTGACTCACATCTGCAGGATAGACCTGA
2950 . : . : . : . : . :
2870 A AGGTCACTCCCCAGAATGGTACAGCAAAGGCTTTGGACAT
|>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
123534 AGTA...CAGAGGTCACTCCCCAGAATGGTACAGCAAAGGCTTTGGACAT
3000 . : . : . : . : . :
2911 CTGTGTGCAGCAGAAGTTGCCAGGATTAGAAACTCTTTCCAGCCCCTCAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
124622 CTGTGTGCAGCAGAAGTTGCCAGGATTAGAAACTCTTTCCAGCCCCTCAT
3050 . : . : .
2961 TGCTGAGGGCCCAGAAACTAAAATC
|||||||||||||||||||||||||
124672 TGCTGAGGGCCCAGAAACTAAAATC