seq1 = pF1KE2559.tfa, 441 bp
seq2 = pF1KE2559/gi568815597r_241896166.tfa (gi568815597r:241896166_242099008), 202843 bp

>pF1KE2559 441
>gi568815597r:241896166_242099008 (Chr1)

(complement)

1-58  (100001-100058)   100% ->
59-114  (100178-100233)   100% ->
115-221  (100389-100495)   100% ->
222-441  (102624-102843)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCGCCTCCACAGAAAATCCCAAGCGTCAGACCCTTCAAGCAGAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCGCCTCCACAGAAAATCCCAAGCGTCAGACCCTTCAAGCAGAGGAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AAGCTTGG         CAATCAGACAAGAGGAAGTTGCTGGAATCCGGG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AAGCTTGGGTA...CAGCAATCAGACAAGAGGAAGTTGCTGGAATCCGGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CAAAGTTCCCCAACAAAATCCCG         GTGGTAGTGGAGCGCTAC
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 100211 CAAAGTTCCCCAACAAAATCCCGGTA...CAGGTGGTAGTGGAGCGCTAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 CCCAGGGAGACGTTCCTGCCCCCGCTGGACAAAACCAAGTTCCTGGTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100407 CCCAGGGAGACGTTCCTGCCCCCGCTGGACAAAACCAAGTTCCTGGTCCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GCAGGAGCTGACCATGACCCAGTTCCTCAGCATCATCCG         GA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 100457 GCAGGAGCTGACCATGACCCAGTTCCTCAGCATCATCCGGTA...CAGGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 GCCGCATGGTCCTGAGAGCCACGGAAGCCTTTTACTTGCTGGTGAACAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102626 GCCGCATGGTCCTGAGAGCCACGGAAGCCTTTTACTTGCTGGTGAACAAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 AAGAGCCTGGTCAGCATGAGCGCAACCATGGCAGAGATCTACAGAGACTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102676 AAGAGCCTGGTCAGCATGAGCGCAACCATGGCAGAGATCTACAGAGACTA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CAAGGATGAGGATGGCTTCGTGTACATGACCTACGCCTCCCAGGAGACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102726 CAAGGATGAGGATGGCTTCGTGTACATGACCTACGCCTCCCAGGAGACAT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TTGGCTGCCTGGAGTCAGCAGCCCCCAGGGATGGGAGCAGCCTTGAGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102776 TTGGCTGCCTGGAGTCAGCAGCCCCCAGGGATGGGAGCAGCCTTGAGGAC

    450     .    :    .
    424 AGACCCTGCAATCCTCTC
        ||||||||||||||||||
 102826 AGACCCTGCAATCCTCTC