seq1 = pF1KE2551.tfa, 1890 bp
seq2 = pF1KE2551/gi568815581r_30098459.tfa (gi568815581r:30098459_30321958), 223500 bp

>pF1KE2551 1890
>gi568815581r:30098459_30321958 (Chr17)

(complement)

1-343  (100001-100343)   100% ->
344-478  (103028-103162)   100% ->
479-698  (103622-103841)   100% ->
699-837  (104655-104793)   100% ->
838-972  (105743-105877)   100% ->
973-1076  (106245-106348)   100% ->
1077-1204  (109092-109219)   100% ->
1205-1317  (110535-110647)   100% ->
1318-1449  (111313-111444)   100% ->
1450-1549  (112717-112816)   100% ->
1550-1650  (114127-114227)   100% ->
1651-1818  (118620-118787)   100% ->
1819-1890  (123429-123500)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGACGACGCCCTTGAATTCTCAGAAGCAGCTATCAGCGTGTGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGACGACGCCCTTGAATTCTCAGAAGCAGCTATCAGCGTGTGAAGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGGAGAAGATTGTCAGGAAAACGGAGTTCTACAGAAGGTTGTTCCCACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGGAGAAGATTGTCAGGAAAACGGAGTTCTACAGAAGGTTGTTCCCACCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CAGGGGACAAAGTGGAGTCCGGGCAAATATCCAATGGGTACTCAGCAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CAGGGGACAAAGTGGAGTCCGGGCAAATATCCAATGGGTACTCAGCAGTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CCAAGTCCTGGTGCGGGAGATGACACACGGCACTCTATCCCAGCGACCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CCAAGTCCTGGTGCGGGAGATGACACACGGCACTCTATCCCAGCGACCAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CACCACCCTAGTGGCTGAGCTTCATCAAGGGGAACGGGAGACCTGGGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CACCACCCTAGTGGCTGAGCTTCATCAAGGGGAACGGGAGACCTGGGGCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGAAGGTGGATTTCCTTCTCTCAGTGATTGGCTATGCTGTGGACCTGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 AGAAGGTGGATTTCCTTCTCTCAGTGATTGGCTATGCTGTGGACCTGGGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AATGTCTGGCGCTTCCCCTACATATGTTACCAGAATGGAGGGG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 100301 AATGTCTGGCGCTTCCCCTACATATGTTACCAGAATGGAGGGGGTC...C

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    344   GGGCATTCCTCCTCCCCTACACCATCATGGCCATTTTTGGGGGAATCC
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103026 AGGGGCATTCCTCCTCCCCTACACCATCATGGCCATTTTTGGGGGAATCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 CGCTCTTTTACATGGAGCTCGCACTGGGACAGTACCACCGAAATGGATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103076 CGCTCTTTTACATGGAGCTCGCACTGGGACAGTACCACCGAAATGGATGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 ATTTCAATATGGAGGAAAATCTGCCCGATTTTCAAAG         GGAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 103126 ATTTCAATATGGAGGAAAATCTGCCCGATTTTCAAAGGTA...CAGGGAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 TGGTTATGCCATCTGCATCATTGCCTTTTACATTGCTTCCTACTACAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103626 TGGTTATGCCATCTGCATCATTGCCTTTTACATTGCTTCCTACTACAACA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 CCATCATGGCCTGGGCGCTATACTACCTCATCTCCTCCTTCACGGACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103676 CCATCATGGCCTGGGCGCTATACTACCTCATCTCCTCCTTCACGGACCAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 CTGCCCTGGACCAGCTGCAAGAACTCCTGGAACACTGGCAACTGCACCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103726 CTGCCCTGGACCAGCTGCAAGAACTCCTGGAACACTGGCAACTGCACCAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 TTACTTCTCCGAGGACAACATCACCTGGACCCTCCATTCCACGTCCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103776 TTACTTCTCCGAGGACAACATCACCTGGACCCTCCATTCCACGTCCCCTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 CTGAAGAATTTTACAC         GCGCCACGTCCTGCAGATCCACCGG
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 103826 CTGAAGAATTTTACACGTA...CAGGCGCCACGTCCTGCAGATCCACCGG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 TCTAAGGGGCTCCAGGACCTGGGGGGCATCAGCTGGCAGCTGGCCCTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104680 TCTAAGGGGCTCCAGGACCTGGGGGGCATCAGCTGGCAGCTGGCCCTCTG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 CATCATGCTGATCTTCACTGTTATCTACTTCAGCATCTGGAAAGGCGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104730 CATCATGCTGATCTTCACTGTTATCTACTTCAGCATCTGGAAAGGCGTCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 AGACCTCTGGCAAG         GTGGTGTGGGTGACAGCCACCTTCCCT
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 104780 AGACCTCTGGCAAGGTG...CAGGTGGTGTGGGTGACAGCCACCTTCCCT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 TATATCATCCTTTCTGTCCTGCTGGTGAGGGGTGCCACCCTCCCTGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105770 TATATCATCCTTTCTGTCCTGCTGGTGAGGGGTGCCACCCTCCCTGGAGC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 CTGGAGGGGTGTTCTCTTCTACTTGAAACCCAATTGGCAGAAACTCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105820 CTGGAGGGGTGTTCTCTTCTACTTGAAACCCAATTGGCAGAAACTCCTGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 AGACAGGG         GTGTGGATAGATGCAGCCGCTCAGATCTTCTTC
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 105870 AGACAGGGGTA...CAGGTGTGGATAGATGCAGCCGCTCAGATCTTCTTC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 TCTCTTGGTCCGGGCTTTGGGGTCCTGCTGGCTTTTGCTAGCTACAACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106278 TCTCTTGGTCCGGGCTTTGGGGTCCTGCTGGCTTTTGCTAGCTACAACAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 GTTCAACAACAACTGCTACCA         AGATGCCCTGGTGACCAGCG
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 106328 GTTCAACAACAACTGCTACCAGTG...CAGAGATGCCCTGGTGACCAGCG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 TGGTGAACTGCATGACGAGCTTCGTTTCGGGATTTGTCATCTTCACAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109112 TGGTGAACTGCATGACGAGCTTCGTTTCGGGATTTGTCATCTTCACAGTG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 CTCGGTTACATGGCTGAGATGAGGAATGAAGATGTGTCTGAGGTGGCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109162 CTCGGTTACATGGCTGAGATGAGGAATGAAGATGTGTCTGAGGTGGCCAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1197 AGACGCAG         GTCCCAGCCTCCTCTTCATCACGTATGCAGAAG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 109212 AGACGCAGGTA...CAGGTCCCAGCCTCCTCTTCATCACGTATGCAGAAG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1238 CGATAGCCAACATGCCAGCGTCCACTTTCTTTGCCATCATCTTCTTTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110568 CGATAGCCAACATGCCAGCGTCCACTTTCTTTGCCATCATCTTCTTTCTG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1288 ATGTTAATCACGCTGGGCTTGGACAGCACG         TTTGCAGGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 110618 ATGTTAATCACGCTGGGCTTGGACAGCACGGTG...CAGTTTGCAGGCTT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1329 GGAGGGGGTGATCACGGCTGTGCTGGATGAGTTCCCACACGTCTGGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111324 GGAGGGGGTGATCACGGCTGTGCTGGATGAGTTCCCACACGTCTGGGCCA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1379 AGCGCCGGGAGCGGTTCGTGCTCGCCGTGGTCATCACCTGCTTCTTTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111374 AGCGCCGGGAGCGGTTCGTGCTCGCCGTGGTCATCACCTGCTTCTTTGGA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1429 TCCCTGGTCACCCTGACTTTT         GGAGGGGCCTACGTGGTGAA
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 111424 TCCCTGGTCACCCTGACTTTTGTG...CAGGGAGGGGCCTACGTGGTGAA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1470 GCTGCTGGAGGAGTATGCCACGGGGCCCGCAGTGCTCACTGTCGCGCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112737 GCTGCTGGAGGAGTATGCCACGGGGCCCGCAGTGCTCACTGTCGCGCTGA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1520 TCGAAGCAGTCGCTGTGTCTTGGTTCTATG         GCATCACTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 112787 TCGAAGCAGTCGCTGTGTCTTGGTTCTATGGTA...CAGGCATCACTCAG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1561 TTCTGCAGGGACGTGAAGGAAATGCTCGGCTTCAGCCCGGGGTGGTTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114138 TTCTGCAGGGACGTGAAGGAAATGCTCGGCTTCAGCCCGGGGTGGTTCTG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1611 GAGGATCTGCTGGGTGGCCATCAGCCCTCTGTTTCTCCTG         T
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 114188 GAGGATCTGCTGGGTGGCCATCAGCCCTCTGTTTCTCCTGGTG...TAGT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1652 TCATCATTTGCAGTTTTCTGATGAGCCCGCCACAACTACGACTTTTCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118621 TCATCATTTGCAGTTTTCTGATGAGCCCGCCACAACTACGACTTTTCCAA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1702 TATAATTATCCTTACTGGAGTATCATCTTGGGTTACTGCATAGGAACCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118671 TATAATTATCCTTACTGGAGTATCATCTTGGGTTACTGCATAGGAACCTC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1752 ATCTTTCATTTGCATCCCCACATATATAGCTTATCGGTTGATCATCACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118721 ATCTTTCATTTGCATCCCCACATATATAGCTTATCGGTTGATCATCACTC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1802 CAGGGACATTTAAAGAG         CGTATTATTAAAAGTATTACCCCA
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 118771 CAGGGACATTTAAAGAGGTA...TAGCGTATTATTAAAAGTATTACCCCA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1843 GAAACACCAACAGAAATTCCTTGTGGGGACATCCGCTTGAATGCTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123453 GAAACACCAACAGAAATTCCTTGTGGGGACATCCGCTTGAATGCTGTG