Result of SIM4 for
pF1KE2540
seq1 = pF1KE2540.tfa, 2922 bp
seq2 = pF1KE2540/gi568815588f_58413144.tfa (gi568815588f:58413144_58928888), 515745 bp
>pF1KE2540 2922
>gi568815588f:58413144_58928888 (Chr10)
1-190 (100001-100190) 100% ==
306-387 (371856-371937) 100% ->
388-546 (373780-373938) 100% ->
547-600 (375227-375280) 100% ->
601-795 (376119-376313) 100% ->
796-1047 (376539-376790) 100% ->
1048-1179 (380341-380472) 100% ->
1180-1366 (383197-383383) 100% ->
1367-1528 (385256-385417) 100% ->
1529-1725 (385913-386109) 100% ->
1726-1858 (387051-387183) 100% ->
1859-2015 (387747-387903) 100% ->
2016-2181 (389934-390099) 100% ->
2182-2221 (393441-393480) 100% ->
2222-2376 (393861-394015) 100% ->
2377-2533 (400687-400843) 100% ->
2534-2694 (404419-404579) 100% ->
2695-2794 (407226-407325) 100% ->
2795-2922 (415618-415745) 100%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGGCCGCCCAGGGAGAGCCCGGCTACCTGGCGGCGCAGTCGGACCCCGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100001 ATGGCCGCCCAGGGAGAGCCCGGCTACCTGGCGGCGCAGTCGGACCCCGG
50 . : . : . : . : . :
51 CTCCAACAGCGAGCGCAGCACCGACTCCCCAGTGCCCGGCTCCGAGGACG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100051 CTCCAACAGCGAGCGCAGCACCGACTCCCCAGTGCCCGGCTCCGAGGACG
100 . : . : . : . : . :
101 ACTTGGTCGCCGGGGCGACCCTGCACAGCCCGGAGTGGAGCGAGGAGCGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100101 ACTTGGTCGCCGGGGCGACCCTGCACAGCCCGGAGTGGAGCGAGGAGCGC
150 . : . : . : . :
151 TTCCGCGTGGACAGGAAGAAACTTGAGGCCATGTTACAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100151 TTCCGCGTGGACAGGAAGAAACTTGAGGCCATGTTACAAG
0 . : . : . : . : . :
306 AGATCCCCATATTAAGGTTTCTGGAAAGAAAGAAGATGTTAAAGAAGCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
371856 AGATCCCCATATTAAGGTTTCTGGAAAGAAAGAAGATGTTAAAGAAGCCA
50 . : . : . : . : . :
356 AGGAAATGATCATGTCTGTCTTAGACACAAAA AGCAATCGA
||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
371906 AGGAAATGATCATGTCTGTCTTAGACACAAAAGTA...TAGAGCAATCGA
100 . : . : . : . : . :
397 GTCACACTGAAGATGGATGTTTCACATACAGAACATTCACATGTAATCGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
373789 GTCACACTGAAGATGGATGTTTCACATACAGAACATTCACATGTAATCGG
150 . : . : . : . : . :
447 CAAAGGTGGCAACAATATTAAAAAAGTGATGGAAGAAACCGGATGCCATA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
373839 CAAAGGTGGCAACAATATTAAAAAAGTGATGGAAGAAACCGGATGCCATA
200 . : . : . : . : . :
497 TCCACTTTCCAGATTCCAACAGGAATAACCAAGCAGAAAAAAGCAACCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
373889 TCCACTTTCCAGATTCCAACAGGAATAACCAAGCAGAAAAAAGCAACCAG
250 . : . : . : . : . :
547 GTATCTATAGCGGGACAACCAGCAGGAGTAGAATCTGCCCG
>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
373939 GTG...TAGGTATCTATAGCGGGACAACCAGCAGGAGTAGAATCTGCCCG
300 . : . : . : . : . :
588 AGTTAGAATTCGG GAGCTGCTTCCTTTGGTGCTGATGTTTG
|||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
375268 AGTTAGAATTCGGGTA...TAGGAGCTGCTTCCTTTGGTGCTGATGTTTG
350 . : . : . : . : . :
629 AGCTACCAATTGCTGGAATTCTTCAACCGGTTCCTGATCCTAATTCCCCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
376147 AGCTACCAATTGCTGGAATTCTTCAACCGGTTCCTGATCCTAATTCCCCC
400 . : . : . : . : . :
679 TCTATTCAGCATATATCACAAACGTACAATATTTCAGTATCATTTAAACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
376197 TCTATTCAGCATATATCACAAACGTACAATATTTCAGTATCATTTAAACA
450 . : . : . : . : . :
729 GCGTTCCCGAATGTATGGTGCTACTGTCATAGTACGAGGGTCTCAGAATA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
376247 GCGTTCCCGAATGTATGGTGCTACTGTCATAGTACGAGGGTCTCAGAATA
500 . : . : . : . : . :
779 ACACTAGTGCTGTGAAG GAAGGAACTGCCATGCTGTTAGAA
|||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
376297 ACACTAGTGCTGTGAAGGTA...TAGGAAGGAACTGCCATGCTGTTAGAA
550 . : . : . : . : . :
820 CATCTTGCTGGGAGCTTAGCATCAGCTATTCCTGTGAGCACACAACTAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
376563 CATCTTGCTGGGAGCTTAGCATCAGCTATTCCTGTGAGCACACAACTAGA
600 . : . : . : . : . :
870 TATTGCAGCTCAACATCATCTCTTTATGATGGGTCGAAATGGGAGCAACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
376613 TATTGCAGCTCAACATCATCTCTTTATGATGGGTCGAAATGGGAGCAACA
650 . : . : . : . : . :
920 TCAAACATATCATGCAGAGAACAGGTGCTCAGATCCACTTTCCTGATCCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
376663 TCAAACATATCATGCAGAGAACAGGTGCTCAGATCCACTTTCCTGATCCC
700 . : . : . : . : . :
970 AGTAATCCACAAAAGAAATCTACCGTCTACCTCCAGGGCACCATTGAGTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
376713 AGTAATCCACAAAAGAAATCTACCGTCTACCTCCAGGGCACCATTGAGTC
750 . : . : . : . : . :
1020 TGTCTGTCTTGCAAGGCAATATCTCATG GGTTGTCTTCCTC
||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
376763 TGTCTGTCTTGCAAGGCAATATCTCATGGTA...TAGGGTTGTCTTCCTC
800 . : . : . : . : . :
1061 TTGTGTTGATGTTTGATATGAAGGAAGAAATTGAAGTAGATCCACAATTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
380354 TTGTGTTGATGTTTGATATGAAGGAAGAAATTGAAGTAGATCCACAATTC
850 . : . : . : . : . :
1111 ATTGCGCAGTTGATGGAACAGCTTGATGTCTTCATCAGTATTAAACCAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
380404 ATTGCGCAGTTGATGGAACAGCTTGATGTCTTCATCAGTATTAAACCAAA
900 . : . : . : . : . :
1161 GCCCAAACAGCCAAGCAAG TCTGTGATTGTGAAAAGTGTTG
|||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
380454 GCCCAAACAGCCAAGCAAGGTT...TAGTCTGTGATTGTGAAAAGTGTTG
950 . : . : . : . : . :
1202 AGCGAAATGCCTTAAATATGTATGAAGCAAGGAAATGTCTCCTCGGACTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
383219 AGCGAAATGCCTTAAATATGTATGAAGCAAGGAAATGTCTCCTCGGACTT
1000 . : . : . : . : . :
1252 GAAAGCAGTGGGGTTACCATAGCAACCAGTCCATCCCCAGCATCCTGCCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
383269 GAAAGCAGTGGGGTTACCATAGCAACCAGTCCATCCCCAGCATCCTGCCC
1050 . : . : . : . : . :
1302 TGCCGGCCTGGCATGTCCCAGCCTGGATATCTTAGCTTCAGCAGGCCTTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
383319 TGCCGGCCTGGCATGTCCCAGCCTGGATATCTTAGCTTCAGCAGGCCTTG
1100 . : . : . : . : . :
1352 GACTCACTGGACTAG GTCTTTTGGGACCCACCACCTTATCT
|||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
383369 GACTCACTGGACTAGGTA...CAGGTCTTTTGGGACCCACCACCTTATCT
1150 . : . : . : . : . :
1393 CTGAACACTTCAACAACCCCAAACTCACTCTTGAATGCTCTTAATAGCTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
385282 CTGAACACTTCAACAACCCCAAACTCACTCTTGAATGCTCTTAATAGCTC
1200 . : . : . : . : . :
1443 AGTCAGTCCTTTGCAAAGTCCAAGTTCTGGTACACCCAGCCCCACATTAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
385332 AGTCAGTCCTTTGCAAAGTCCAAGTTCTGGTACACCCAGCCCCACATTAT
1250 . : . : . : . : . :
1493 GGGCACCCCCACTTGCTAATACTTCAAGTGCCACAG GTTTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
385382 GGGCACCCCCACTTGCTAATACTTCAAGTGCCACAGGTC...TAGGTTTT
1300 . : . : . : . : . :
1534 TCTGCTATACCACACCTTATGATTCCATCTACTGCCCAAGCCACATTAAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
385918 TCTGCTATACCACACCTTATGATTCCATCTACTGCCCAAGCCACATTAAC
1350 . : . : . : . : . :
1584 TAATATTTTGTTGTCTGGAGTGCCCACCTATGGGCACACAGCTCCATCTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
385968 TAATATTTTGTTGTCTGGAGTGCCCACCTATGGGCACACAGCTCCATCTC
1400 . : . : . : . : . :
1634 CCCCTCCTGGCTTGACTCCTGTTGATGTCCATATCAACAGTATGCAGACC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
386018 CCCCTCCTGGCTTGACTCCTGTTGATGTCCATATCAACAGTATGCAGACC
1450 . : . : . : . : . :
1684 GAAGGCAAAAAAATCTCTGCTGCTTTAAATGGACATGCACAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
386068 GAAGGCAAAAAAATCTCTGCTGCTTTAAATGGACATGCACAGGTA...TA
1500 . : . : . : . : . :
1726 TCTCCAGATATAAAATATGGTGCAATATCCACTTCATCACTTGGAGAAA
>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
387050 GTCTCCAGATATAAAATATGGTGCAATATCCACTTCATCACTTGGAGAAA
1550 . : . : . : . : . :
1775 AAGTGCTGAGTGCAAATCACGGGGATCCGTCCATCCAGACAAGTGGGTCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
387100 AAGTGCTGAGTGCAAATCACGGGGATCCGTCCATCCAGACAAGTGGGTCT
1600 . : . : . : . : . :
1825 GAGCAGACATCTCCCAAATCAAGCCCCACTGAAG GTTGTAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
387150 GAGCAGACATCTCCCAAATCAAGCCCCACTGAAGGTC...CAGGTTGTAA
1650 . : . : . : . : . :
1866 TGATGCTTTTGTTGAAGTAGGCATGCCTCGAAGTCCTTCCCATTCTGGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
387754 TGATGCTTTTGTTGAAGTAGGCATGCCTCGAAGTCCTTCCCATTCTGGGA
1700 . : . : . : . : . :
1916 ATGCTGGTGACTTGAAACAGATGATGTGTCCCTCCAAGGTTTCCTGTGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
387804 ATGCTGGTGACTTGAAACAGATGATGTGTCCCTCCAAGGTTTCCTGTGCC
1750 . : . : . : . : . :
1966 AAAAGGCAGACAGTGGAACTATTGCAAGGCACGAAAAACTCACACTTACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
387854 AAAAGGCAGACAGTGGAACTATTGCAAGGCACGAAAAACTCACACTTACA
1800 . : . : . : . : . :
2016 CAGCACTGACAGGTTGCTCTCAGACCCTGAACTGAGTGCTA
>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
387904 GTA...CAGCAGCACTGACAGGTTGCTCTCAGACCCTGAACTGAGTGCTA
1850 . : . : . : . : . :
2057 CCGAAAGCCCTTTGGCTGACAAGAAGGCTCCAGGGAGTGAGCGCGCTGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
389975 CCGAAAGCCCTTTGGCTGACAAGAAGGCTCCAGGGAGTGAGCGCGCTGCA
1900 . : . : . : . : . :
2107 GAGAGGGCAGCAGCTGCCCAGCAAAACTCCGAAAGGGCCCACCTTGCTCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
390025 GAGAGGGCAGCAGCTGCCCAGCAAAACTCCGAAAGGGCCCACCTTGCTCC
1950 . : . : . : . : . :
2157 ACGGTCATCATATGTCAACATGCAG GCATTTGACTATGAAC
|||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
390075 ACGGTCATCATATGTCAACATGCAGGTA...CAGGCATTTGACTATGAAC
2000 . : . : . : . : . :
2198 AGAAGAAGCTATTAGCCACCAAAG CTATGTTAAAGAAACCA
||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
393457 AGAAGAAGCTATTAGCCACCAAAGGTA...AAGCTATGTTAAAGAAACCA
2050 . : . : . : . : . :
2239 GTGGTGACGGAGGTCAGAACGCCCACAAATACCTGGAGTGGCCTGGGTTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
393878 GTGGTGACGGAGGTCAGAACGCCCACAAATACCTGGAGTGGCCTGGGTTT
2100 . : . : . : . : . :
2289 TTCTAAATCCATGCCAGCTGAAACTATCAAGGAGTTGAGAAGGGCCAATC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
393928 TTCTAAATCCATGCCAGCTGAAACTATCAAGGAGTTGAGAAGGGCCAATC
2150 . : . : . : . : . :
2339 ATGTGTCCTATAAGCCCACAATGACAACCACTTATGAG GGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
393978 ATGTGTCCTATAAGCCCACAATGACAACCACTTATGAGGTT...CAGGGC
2200 . : . : . : . : . :
2380 TCATCCATGTCCCTTTCACGGTCCAACAGTCGTGAGCACTTGGGAGGTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
400690 TCATCCATGTCCCTTTCACGGTCCAACAGTCGTGAGCACTTGGGAGGTGG
2250 . : . : . : . : . :
2430 AAGCGAATCTGATAACTGGAGAGACCGAAATGGAATTGGACCTGGAAGTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
400740 AAGCGAATCTGATAACTGGAGAGACCGAAATGGAATTGGACCTGGAAGTC
2300 . : . : . : . : . :
2480 ATAGTGAATTTGCAGCTTCTATTGGCAGCCCTAAGCGTAAACAAAACAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
400790 ATAGTGAATTTGCAGCTTCTATTGGCAGCCCTAAGCGTAAACAAAACAAA
2350 . : . : . : . : . :
2530 TCAA CGGAACACTATCTCAGCAGTAGCAATTACATGGACTG
||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
400840 TCAAGTG...CAGCGGAACACTATCTCAGCAGTAGCAATTACATGGACTG
2400 . : . : . : . : . :
2571 CATTTCCTCGCTGACAGGAAGCAATGGCTGTAACTTAAATAGCTCTTTCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
404456 CATTTCCTCGCTGACAGGAAGCAATGGCTGTAACTTAAATAGCTCTTTCA
2450 . : . : . : . : . :
2621 AAGGTTCTGACCTCCCTGAGCTCTTCAGCAAACTGGGCCTGGGCAAATAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
404506 AAGGTTCTGACCTCCCTGAGCTCTTCAGCAAACTGGGCCTGGGCAAATAC
2500 . : . : . : . : . :
2671 ACAGATGTTTTCCAGCAACAAGAG ATCGATCTTCAGACATT
||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
404556 ACAGATGTTTTCCAGCAACAAGAGGTC...CAGATCGATCTTCAGACATT
2550 . : . : . : . : . :
2712 CCTCACTCTCACAGATCAGGATCTGAAGGAGCTGGGAATAACTACTTTTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
407243 CCTCACTCTCACAGATCAGGATCTGAAGGAGCTGGGAATAACTACTTTTG
2600 . : . : . : . : . :
2762 GTGCCAGGAGGAAAATGCTGCTTGCAATTTCAG AACTAAAT
|||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
407293 GTGCCAGGAGGAAAATGCTGCTTGCAATTTCAGGTG...TAGAACTAAAT
2650 . : . : . : . : . :
2803 AAAAACCGAAGAAAGCTTTTTGAATCGCCAAATGCACGCACCTCTTTCCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
415626 AAAAACCGAAGAAAGCTTTTTGAATCGCCAAATGCACGCACCTCTTTCCT
2700 . : . : . : . : . :
2853 GGAAGGTGGAGCGAGTGGAAGGCTACCCCGTCAGTATCACTCAGACATTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
415676 GGAAGGTGGAGCGAGTGGAAGGCTACCCCGTCAGTATCACTCAGACATTG
2750 . : . :
2903 CTAGTGTCAGTGGCCGCTGG
||||||||||||||||||||
415726 CTAGTGTCAGTGGCCGCTGG