seq1 = pF1KE2526.tfa, 576 bp
seq2 = pF1KE2526/gi568815589r_34535635.tfa (gi568815589r:34535635_34737697), 202063 bp

>pF1KE2526 576
>gi568815589r:34535635_34737697 (Chr9)

(complement)

1-151  (100001-100151)   100% ->
152-352  (100278-100478)   100% ->
353-576  (101840-102063)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCAGTGGGCCGTGGGCCGGCGGTGGGCGTGGGCCGCGCTGCTCCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCAGTGGGCCGTGGGCCGGCGGTGGGCGTGGGCCGCGCTGCTCCTGGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGTCGCAGCGGTGCTGACCCAGGTCGTCTGGCTCTGGCTGGGTACGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGTCGCAGCGGTGCTGACCCAGGTCGTCTGGCTCTGGCTGGGTACGCAGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCTTCGTCTTCCAGCGCGAAGAGATAGCGCAGTTGGCGCGGCAGTACGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCTTCGTCTTCCAGCGCGAAGAGATAGCGCAGTTGGCGCGGCAGTACGCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 G         GGCTGGACCACGAGCTGGCCTTCTCTCGTCTGATCGTGGA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GGTG...CAGGGCTGGACCACGAGCTGGCCTTCTCTCGTCTGATCGTGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GCTGCGGCGGCTGCACCCAGGCCACGTGCTGCCCGACGAGGAGCTGCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100318 GCTGCGGCGGCTGCACCCAGGCCACGTGCTGCCCGACGAGGAGCTGCAGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GGGTGTTCGTGAATGCGGGTGGCTGGATGGGCGCCATGTGCCTTCTGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100368 GGGTGTTCGTGAATGCGGGTGGCTGGATGGGCGCCATGTGCCTTCTGCAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GCCTCGCTGTCCGAGTATGTGCTGCTCTTCGGCACCGCCTTGGGCTCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100418 GCCTCGCTGTCCGAGTATGTGCTGCTCTTCGGCACCGCCTTGGGCTCCCG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CGGCCACTCGG         GGGAGACGGTAGTACACGGGCCTGGTGAGG
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 100468 CGGCCACTCGGGTC...CAGGGGAGACGGTAGTACACGGGCCTGGTGAGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CAACAGCTGTGGAGTGGGGGCCAAACACATGGATGGTGGAGTACGGCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101870 CAACAGCTGTGGAGTGGGGGCCAAACACATGGATGGTGGAGTACGGCCGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GGCGTCATCCCATCCACCCTGGCCTTCGCGCTGGCCGACACTGTCTTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101920 GGCGTCATCCCATCCACCCTGGCCTTCGCGCTGGCCGACACTGTCTTCAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CACCCAGGACTTCCTCACCCTCTTCTATACTCTTCGCTCCTATGCTCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101970 CACCCAGGACTTCCTCACCCTCTTCTATACTCTTCGCTCCTATGCTCGGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :
    533 GCCTCCGGCTTGAGCTCACCACCTACCTCTTTGGCCAGGACCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102020 GCCTCCGGCTTGAGCTCACCACCTACCTCTTTGGCCAGGACCCT