Result of SIM4 for
pF1KE2522
seq1 = pF1KE2522.tfa, 2772 bp
seq2 = pF1KE2522/gi568815591r_150915899.tfa (gi568815591r:150915899_151124423), 208525 bp
>pF1KE2522 2772
>gi568815591r:150915899_151124423 (Chr7)
(complement)
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551-596 (100694-100739) 100% ->
597-659 (100917-100979) 100% ->
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964-1718 (105050-105804) 99% ->
1719-1872 (105977-106130) 100% ->
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2290-2423 (107603-107736) 100% ->
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2521-2647 (108189-108315) 100% ->
2648-2772 (108401-108525) 100%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGGTGAGCCGAATGGGCTGGGGGGGGAGAAGAAGGCGGCTGGGGCGGTG
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100001 ATGGTGAGCCGAATGGGCTGGGGGGGGAGAAGAAGGCGGCTGGGGCGGTG
50 . : . : . : . : . :
51 GGGAGATCTGGGGCCCGGATCGGTGCCCCTCCTCCCCATGCCACTGCCAC
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100051 GGGAGATCTGGGGCCCGGATCGGTGCCCCTCCTCCCCATGCCACTGCCAC
100 . : . : . : . : . :
101 CTCCTCCTCCTCCTTCATGCCGGGGACCTGGGGGAGGGAGGATCTCCATC
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100101 CTCCTCCTCCTCCTTCATGCCGGGGACCTGGGGGAGGGAGGATCTCCATC
150 . : . : . : . : . :
151 TTCTCTCTGTCCCCTGCCCCTCATACAAGAAGCTCCCCCTCCTCATTTTC
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100151 TTCTCTCTGTCCCCTGCCCCTCATACAAGAAGCTCCCCCTCCTCATTTTC
200 . : . : . : . : . :
201 CCCTCCCACCGCAGGGCCCCCTTGCTCAGTGCTACAGGGGACAGGGGCTT
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100201 CCCTCCCACCGCAGGGCCCCCTTGCTCAGTGCTACAGGGGACAGGGGCTT
250 . : . : . : . : . :
251 CTCAGTCTTGCCACAGTGCTCTCCCTATCCCAGCCACCCCCCCAACACAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100251 CTCAGTCTTGCCACAGTGCTCTCCCTATCCCAGCCACCCCCCCAACACAG
300 . : . : . : . : . :
301 GCTCAACCTGCAATGACACCTGCCTCTGCATCTCCCTCCTGGGGATCCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100301 GCTCAACCTGCAATGACACCTGCCTCTGCATCTCCCTCCTGGGGATCCCA
350 . : . : . : . : . :
351 CTCCACCCCACCCCTGGCCCCGGCAACCCCCACTCCCTCACAGCAGTGCC
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100351 CTCCACCCCACCCCTGGCCCCGGCAACCCCCACTCCCTCACAGCAGTGCC
400 . : . : . : . : . :
401 CCCAGGACTCTCCTGGGCTGCGGGTAGGCCCTTTGATCCCTGAACAGGAT
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100401 CCCAGGACTCTCCTGGGCTGCGGGTAGGCCCTTTGATCCCTGAACAGGAT
450 . : . : . : . : . :
451 TATGAGCGGCTGGAGGACTGTGACCCTGAGGGGTCCCAAGACTCACCCAT
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100451 TATGAGCGGCTGGAGGACTGTGACCCTGAGGGGTCCCAAGACTCACCCAT
500 . : . : . : . : . :
501 CCACGGGGAGGAGCAGCAACCCCTGCTTCATGTCCCTGAAGGGCTCCGAG
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100501 CCACGGGGAGGAGCAGCAACCCCTGCTTCATGTCCCTGAAGGGCTCCGAG
550 . : . : . : . : . :
551 GCTCCTGGCATCACATCCAGAACCTGGACAGTTTCTTCACC
>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100551 GTA...CAGGCTCCTGGCATCACATCCAGAACCTGGACAGTTTCTTCACC
600 . : . : . : . : . :
592 AAGAT CTACAGCTACCACCAGCGGAATGGCTTTGCCTGCAT
|||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100735 AAGATATC...CATCTACAGCTACCACCAGCGGAATGGCTTTGCCTGCAT
650 . : . : . : . : . :
633 CTTGCTGGAGGATGTCTTCCAGCTGGG ACAATTTATTTTCA
|||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
100953 CTTGCTGGAGGATGTCTTCCAGCTGGGGTG...CAGACAATTTATTTTCA
700 . : . : . : . : . :
674 TTGTCACCTTCACAACCTTCCTCCTTCGATGCGTGGATTACAATGTTCTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101232 TTGTCACCTTCACAACCTTCCTCCTTCGATGCGTGGATTACAATGTTCTC
750 . : . : . : . : . :
724 TTTGCCAACCAACCAAGTAACCATACCAGACCTGGGCCGTTCCACAGCAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101282 TTTGCCAACCAACCAAGTAACCATACCAGACCTGGGCCGTTCCACAGCAA
800 . : . : . : . : . :
774 AGTGACCCTGTCAGATGCCATCCTACCCTCAGCCCAGTGTGCTGAGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
101332 AGTGACCCTGTCAGATGCCATCCTACCCTCAGCCCAGTGTGCTGAGAGGT
850 . : . : . : . : . :
822 GATCCGCTCCAGCCCGCTGCTGGTCCTCCTCCTGGTCCTGGCT
>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101382 T...CAGGATCCGCTCCAGCCCGCTGCTGGTCCTCCTCCTGGTCCTGGCT
900 . : . : . : . : . :
865 GCCGGCTTCTGGCTGGTCCAACTGCTTCGCTCAGTCTGCAACCTCTTCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103138 GCCGGCTTCTGGCTGGTCCAACTGCTTCGCTCAGTCTGCAACCTCTTCAG
950 . : . : . : . : . :
915 CTACTGGGACATCCAGGTGTTTTACAGGGAGGCCCTGCACATCCCCCCG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
103188 CTACTGGGACATCCAGGTGTTTTACAGGGAGGCCCTGCACATCCCCCCGG
1000 . : . : . : . : . :
964 GAGGAGCTGAGCTCGGTTCCCTGGGCAGAGGTGCAGTCCCGC
>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103238 TG...CAGGAGGAGCTGAGCTCGGTTCCCTGGGCAGAGGTGCAGTCCCGC
1050 . : . : . : . : . :
1006 CTCTTGGCACTGCAGCGGAGCGGGGGCCTGTGCGTGCAGCCGCGGCCCCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105092 CTCTTGGCACTGCAGCGGAGCGGGGGCCTGTGCGTGCAGCCGCGGCCCCT
1100 . : . : . : . : . :
1056 GACGGAGCTGGACATCCACCACCGCATCCTGCGCTACACCAACTACCAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105142 GACGGAGCTGGACATCCACCACCGCATCCTGCGCTACACCAACTACCAGG
1150 . : . : . : . : . :
1106 TGGCGCTGGCCAACAAAGGCCTGCTGCCGGCCCGCTGCCCGCTGCCCTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105192 TGGCGCTGGCCAACAAAGGCCTGCTGCCGGCCCGCTGCCCGCTGCCCTGG
1200 . : . : . : . : . :
1156 GGAGGCAGTGCGGCTTTCCTCAGCCGCGGCCTGGCGCTCAATGTCGACCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105242 GGAGGCAGTGCGGCTTTCCTCAGCCGCGGCCTGGCGCTCAATGTCGACCT
1250 . : . : . : . : . :
1206 GCTGCTCTTCCGCGGTCCCTTCTCGCTCTTCCGCGGGGGCTGGGAGCTGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105292 GCTGCTCTTCCGCGGTCCCTTCTCGCTCTTCCGCGGGGGCTGGGAGCTGC
1300 . : . : . : . : . :
1256 CGCACGCCTACAAGCGCAGCGACCAGCGGGGCGCCCTAGCAGCGCGCTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105342 CGCACGCCTACAAGCGCAGCGACCAGCGGGGCGCCCTAGCAGCGCGCTGG
1350 . : . : . : . : . :
1306 GGGCGCACAGTGCTGCTGCTGGCCGCCCTGAACCTGGCGCTGAGCCCGCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105392 GGGCGCACAGTGCTGCTGCTGGCCGCCCTGAACCTGGCGCTGAGCCCGCT
1400 . : . : . : . : . :
1356 GGTGCTGGCCTGGCAGGTTCTGCACGTCTTCTATAGCCACGTGGAGCTGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105442 GGTGCTGGCCTGGCAGGTTCTGCACGTCTTCTATAGCCACGTGGAGCTGC
1450 . : . : . : . : . :
1406 TGCGGCGCGAGCCTGGCGCGCTGGGGGCGCGCGGCTGGTCCCGCCTGGCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105492 TGCGGCGCGAGCCTGGCGCGCTGGGGGCGCGCGGCTGGTCCCGCCTGGCG
1500 . : . : . : . : . :
1456 CGCTTGCAGCTGCGCCACTTCAACGAGCTGCCGCACGAGCTGCGCGCGCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105542 CGCTTGCAGCTGCGCCACTTCAACGAGCTGCCGCACGAGCTGCGCGCGCG
1550 . : . : . : . : . :
1506 CCTGGCCCGCGCCTACCGCCCCGCCGCCGCCTTCCTGCGCACCGCTGCGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105592 CCTGGCCCGCGCCTACCGCCCCGCCGCCGCCTTCCTGCGCACCGCTGCGC
1600 . : . : . : . : . :
1556 CCCCCGCGCCCCTGCGCACGCTGCTGGCCCGCCAGCTCGTTTTCTTCGCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105642 CCCCCGCGCCCCTGCGCACGCTGCTGGCCCGCCAGCTCGTTTTCTTCGCG
1650 . : . : . : . : . :
1606 GGCGCACTCTTCGCCGCGCTGCTTGTGCTCACCGTCTACGACGAGGACGT
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105692 GGTGCACTCTTCGCCGCGCTGCTTGTGCTCACCGTCTACGACGAGGACGT
1700 . : . : . : . : . :
1656 GCTAGCCGTGGAGCACGTGCTCACCGCCATGACCGCGCTCGGGGTCACCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105742 GCTAGCCGTGGAGCACGTGCTCACCGCCATGACCGCGCTCGGGGTCACCG
1750 . : . : . : . : . :
1706 CCACCGTCGCCAG GTCTTTCATTCCGGAAGAGCAGTGCCAG
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105792 CCACCGTCGCCAGGTG...CAGGTCTTTCATTCCGGAAGAGCAGTGCCAG
1800 . : . : . : . : . :
1747 GGTCGTGCGCCGCAGCTCCTGCTGCAGACAGCCCTGGCCCACATGCACTA
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106005 GGTCGTGCGCCGCAGCTCCTGCTGCAGACAGCCCTGGCCCACATGCACTA
1850 . : . : . : . : . :
1797 CCTCCCGGAGGAGCCCGGCCCCGGCGGCAGGGACCGCGCCTACCGGCAGA
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106055 CCTCCCGGAGGAGCCCGGCCCCGGCGGCAGGGACCGCGCCTACCGGCAGA
1900 . : . : . : . : . :
1847 TGGCGCAGCTGCTGCAGTACCGAGCG GTCTCCCTCCTGGAG
||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
106105 TGGCGCAGCTGCTGCAGTACCGAGCGGTG...CAGGTCTCCCTCCTGGAG
1950 . : . : . : . : . :
1888 GAGCTCCTGTCCCCGCTCCTCACCCCGCTGTTTCTGCTTTTCTGGTTCCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106389 GAGCTCCTGTCCCCGCTCCTCACCCCGCTGTTTCTGCTTTTCTGGTTCCG
2000 . : . : . : . : . :
1938 CCCTCGTGCCCTGGAGATTATCGACTTTTTTCATCACTTCACTGTGGATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106439 CCCTCGTGCCCTGGAGATTATCGACTTTTTTCATCACTTCACTGTGGATG
2050 . : . : . : . : . :
1988 TGGCTGGGGTTGGGGACATCTGTTCCTTTGCCCTTATGGATGTGAAGCGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106489 TGGCTGGGGTTGGGGACATCTGTTCCTTTGCCCTTATGGATGTGAAGCGC
2100 . : . : . : . : . :
2038 CACGGACACCCTCAG TGGCTCTCGGCGGGACAGACTGAGGC
|||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
106539 CACGGACACCCTCAGGTC...CAGTGGCTCTCGGCGGGACAGACTGAGGC
2150 . : . : . : . : . :
2079 CTCGCTGTCTCAGCGTGCGGAGGACGGCAAGACTGAGCTTTCTTTGATGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107178 CTCGCTGTCTCAGCGTGCGGAGGACGGCAAGACTGAGCTTTCTTTGATGC
2200 . : . : . : . : . :
2129 GGTTCTCCCTGGCGCATCCACTCTGGCGCCCCCCAGGGCACAGCTCTAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107228 GGTTCTCCCTGGCGCATCCACTCTGGCGCCCCCCAGGGCACAGCTCTAAG
2250 . : . : . : . : . :
2179 TTTCTTGGGCACCTCTGGGGCCGAGTACAACAAGATGCAGCTGCCTGGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107278 TTTCTTGGGCACCTCTGGGGCCGAGTACAACAAGATGCAGCTGCCTGGGG
2300 . : . : . : . : . :
2229 TGCCACCTCGGCTCGCGGCCCCTCCACCCCGGGGGTGCTCAGCAACTGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107328 TGCCACCTCGGCTCGCGGCCCCTCCACCCCGGGGGTGCTCAGCAACTGCA
2350 . : . : . : . : . :
2279 CCTCGCCCCTG CCTGAGGCCTTCCTGGCCAACCTCTTCGTG
|||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
107378 CCTCGCCCCTGGTG...CAGCCTGAGGCCTTCCTGGCCAACCTCTTCGTG
2400 . : . : . : . : . :
2320 CACCCTCTCCTGCCTCCGAGAGATCTGAGCCCGACAGCCCCCTGTCCAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107633 CACCCTCTCCTGCCTCCGAGAGATCTGAGCCCGACAGCCCCCTGTCCAGC
2450 . : . : . : . : . :
2370 TGCGGCCACAGCCAGCCTCCTTGCCTCCATTTCCCGAATTGCCCAGGACC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107683 TGCGGCCACAGCCAGCCTCCTTGCCTCCATTTCCCGAATTGCCCAGGACC
2500 . : . : . : . : . :
2420 CCAG CTCTGTGTCCCCAGGAGGCACTGGGGGCCAGAAGCTG
||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107733 CCAGGTG...CAGCTCTGTGTCCCCAGGAGGCACTGGGGGCCAGAAGCTG
2550 . : . : . : . : . :
2461 GCCCAGCTCCCAGAACTTGCTTCTGCCGAGATGAGTCTCCATGTCATCTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107934 GCCCAGCTCCCAGAACTTGCTTCTGCCGAGATGAGTCTCCATGTCATCTA
2600 . : . : . : . : . :
2511 CCTGCACCAG CTTCACCAGCAGCAGCAGCAGCAGGAGCCGT
||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
107984 CCTGCACCAGGTG...CAGCTTCACCAGCAGCAGCAGCAGCAGGAGCCGT
2650 . : . : . : . : . :
2552 GGGGTGAGGCTGCAGCCTCCATCCTGTCCAGGCCCTGCTCCAGCCCCTCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
108220 GGGGTGAGGCTGCAGCCTCCATCCTGTCCAGGCCCTGCTCCAGCCCCTCA
2700 . : . : . : . : . :
2602 CAGCCACCCTCGCCTGATGAGGAGAAGCCATCCTGGTCAAGTGACG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
108270 CAGCCACCCTCGCCTGATGAGGAGAAGCCATCCTGGTCAAGTGACGGTG.
2750 . : . : . : . : . :
2648 GCTCCAGTCCTGCCTCTAGCCCCAGACAACAGTGGGGAACCCAGA
..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
108320 ..CAGGCTCCAGTCCTGCCTCTAGCCCCAGACAACAGTGGGGAACCCAGA
2800 . : . : . : . : . :
2693 AGGCCCGGAATCTGTTCCCCGGAGGGTTTCAGGTGACCACAGACACCCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
108446 AGGCCCGGAATCTGTTCCCCGGAGGGTTTCAGGTGACCACAGACACCCAG
2850 . : . : . :
2743 AAGGAGCCTGACCGGGCCTCTTGCACTGAC
||||||||||||||||||||||||||||||
108496 AAGGAGCCTGACCGGGCCTCTTGCACTGAC