seq1 = pF1KE2509.tfa, 2262 bp
seq2 = pF1KE2509/gi568815582f_67226863.tfa (gi568815582f:67226863_67485086), 258224 bp

>pF1KE2509 2262
>gi568815582f:67226863_67485086 (Chr16)

1-70  (100001-100070)   100% ->
71-198  (115095-115222)   100% ->
199-391  (119394-119586)   100% ->
392-488  (120633-120729)   100% ->
489-577  (123340-123428)   100% ->
578-702  (136728-136852)   100% ->
703-754  (138442-138493)   100% ->
755-1195  (140155-140595)   100% ->
1196-1494  (144082-144380)   100% ->
1495-1660  (148385-148550)   100% ->
1661-1806  (149865-150010)   100% ->
1807-1930  (151727-151850)   100% ->
1931-2045  (155271-155385)   100% ->
2046-2262  (158008-158224)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGAGCAATGGGAGCTGGACGAGGAAGGCATTCGCCGCCTGGGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGAGCAATGGGAGCTGGACGAGGAAGGCATTCGCCGCCTGGGGGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCTGACGCTGGAGCAGCCGG         AACTGGTGGAGTCTCTTTCAT
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 100051 GCTGACGCTGGAGCAGCCGGGTA...CAGAACTGGTGGAGTCTCTTTCAT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TGCAGGGATCTTATGCTGGCAAAATCCATTCCATTGGTGATGCCTTCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115116 TGCAGGGATCTTATGCTGGCAAAATCCATTCCATTGGTGATGCCTTCAGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AATTTTAAAAATCTCCGATCCTTAGATTTATCAAGGAATTTGATCACTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115166 AATTTTAAAAATCTCCGATCCTTAGATTTATCAAGGAATTTGATCACTAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CCTTAAG         GGAATCCAGTATTTATGTTCACTCCAAGACCTGA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115216 CCTTAAGGTA...TAGGGAATCCAGTATTTATGTTCACTCCAAGACCTGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ATTTATATTATAACAACATTCCTTCATTAGTGGAAGTGTCCCGTCTACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119428 ATTTATATTATAACAACATTCCTTCATTAGTGGAAGTGTCCCGTCTACAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CCGTTACCCTTCCTCAAAGAACTGGATTTGAGACTTAATCCTGTTGTAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119478 CCGTTACCCTTCCTCAAAGAACTGGATTTGAGACTTAATCCTGTTGTAAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GAAAGATACAGATTATAGGCTCTTTGCTGTATATACACTACAAACTCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119528 GAAAGATACAGATTATAGGCTCTTTGCTGTATATACACTACAAACTCTGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 AGAAATTAG         ATGACCGAACTGTACGTGAAGGTGAGAGAAAA
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 119578 AGAAATTAGGTA...CAGATGACCGAACTGTACGTGAAGGTGAGAGAAAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GCTGCCAAGCTGCATTTTAGTCAGTTGGGCAACAGTGAAAATTTTCTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120665 GCTGCCAAGCTGCATTTTAGTCAGTTGGGCAACAGTGAAAATTTTCTTTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 AGAGGTGGAAAAAAG         CTCTAGGGAGAAGACAATGAAAAACT
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 120715 AGAGGTGGAAAAAAGGTA...CAGCTCTAGGGAGAAGACAATGAAAAACT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 GTGTAACAGGTGAGAGCTCTGCATCAAAAGTCAGTGCTAATGTTGACAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123366 GTGTAACAGGTGAGAGCTCTGCATCAAAAGTCAGTGCTAATGTTGACAGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 AGGATTGAAATGG         ACTCAAACAAAGGACTTTTTATTCCCTT
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 123416 AGGATTGAAATGGGTA...CAGACTCAAACAAAGGACTTTTTATTCCCTT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 CCCCAACCGGGAAATAAAGGATTCCCTAAGTACTTCTGCAACTCAGGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136756 CCCCAACCGGGAAATAAAGGATTCCCTAAGTACTTCTGCAACTCAGGGCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 ATGGTACACGTGATCAGAAATTAGACACCTTCCCACTGGGGACACAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 136806 ATGGTACACGTGATCAGAAATTAGACACCTTCCCACTGGGGACACAGGTA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    703       ACACAGGAAGTAGCAAGAAGGGAGATGCCAAGTGACAATCACCA
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136856 ...TAGACACAGGAAGTAGCAAGAAGGGAGATGCCAAGTGACAATCACCA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 GGAAGATG         AGTTCAGACACTACTCGCCTCGTCAGTCCACAG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 138486 GGAAGATGGTA...TAGAGTTCAGACACTACTCGCCTCGTCAGTCCACAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 TCCGATCCCCAGAGAAGATGACTAGAGAAGGGTACCAAGTATCTTTTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140188 TCCGATCCCCAGAGAAGATGACTAGAGAAGGGTACCAAGTATCTTTTTTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 GACAATAAGTCTTCAGGTTCTTCTCCAGAAAAGGAATTGATACCAAAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140238 GACAATAAGTCTTCAGGTTCTTCTCCAGAAAAGGAATTGATACCAAAACC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 TGATACTTTTCATCTTACCCATGATGCCTCATTGAGTAAATGCCTGGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140288 TGATACTTTTCATCTTACCCATGATGCCTCATTGAGTAAATGCCTGGATG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 TGGGTGATTCTAGCCAGATCCATCCCTATCAGTTACCTTCAGATGTTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140338 TGGGTGATTCTAGCCAGATCCATCCCTATCAGTTACCTTCAGATGTTGGT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 CTGGAAAATTATGACAGTTGTTATTCTCAAACTCTATCCCTGCATGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140388 CTGGAAAATTATGACAGTTGTTATTCTCAAACTCTATCCCTGCATGGAAG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 TCTTGGTAAAAGGCCTCAGAGAAGCAAGAACTATCAAGAGTATAGCATAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140438 TCTTGGTAAAAGGCCTCAGAGAAGCAAGAACTATCAAGAGTATAGCATAA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 AGCCTTCAAATGACATAAAGACCACCGCTTCACATTCCTGTGGAGACTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140488 AGCCTTCAAATGACATAAAGACCACCGCTTCACATTCCTGTGGAGACTTA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 TTAACTTCTCTGTCAAACCCTGACTCCAGCACTGGAAGGCTTTTGAAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140538 TTAACTTCTCTGTCAAACCCTGACTCCAGCACTGGAAGGCTTTTGAAGCT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 TAGTTCAG         ATCTGTATGCCACAACCCATTTCAACAGTGACC
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 140588 TAGTTCAGGTA...CAGATCTGTATGCCACAACCCATTTCAACAGTGACC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 CTGCTGTACTTGTCAATGTAGAGCAACAATTATCTACCAGCCTGGATGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144115 CTGCTGTACTTGTCAATGTAGAGCAACAATTATCTACCAGCCTGGATGAT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 TTAACACCAGCACATGGTTCTGTCCCAAACAACGCTGTCCTGGGAAACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144165 TTAACACCAGCACATGGTTCTGTCCCAAACAACGCTGTCCTGGGAAACAG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1329 GACAACTCCTCTGCGGACACTGCTGTTGTCTCCTGGGACTTCAGAACACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144215 GACAACTCCTCTGCGGACACTGCTGTTGTCTCCTGGGACTTCAGAACACA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1379 GAAAGATTTTTACCAAGAGGTCACTAAGCCCATCGAAGAGAGGATTCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144265 GAAAGATTTTTACCAAGAGGTCACTAAGCCCATCGAAGAGAGGATTCAAA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1429 TGGAAGGACAATATCCTTGCCAACCTGAATCTAAAGCATGGTTTCCAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144315 TGGAAGGACAATATCCTTGCCAACCTGAATCTAAAGCATGGTTTCCAAGA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1479 TGCTACAGGCAGCGAG         CCTCTCTCTAGTGACCTGGGTAGTT
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 144365 TGCTACAGGCAGCGAGGCA...GAGCCTCTCTCTAGTGACCTGGGTAGTT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1520 TGCACGGTTTGGCTGGAAACCACAGTCCCCCCATCTCTGCCAGAACCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148410 TGCACGGTTTGGCTGGAAACCACAGTCCCCCCATCTCTGCCAGAACCCCC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1570 CATGTGGCCACTGTCCTCAGACAGCTCCTGGAGCTTGTGGATAAGCACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148460 CATGTGGCCACTGTCCTCAGACAGCTCCTGGAGCTTGTGGATAAGCACTG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1620 GAATGGCTCCGGCTCCCTCCTCCTCAACAAGAAGTTTCTCG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 148510 GAATGGCTCCGGCTCCCTCCTCCTCAACAAGAAGTTTCTCGGTG...CAG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1661 GTCCTGCCCGAGATTTGCTTCTGTCTTTGGTAGTCCCGGCTCCTTCTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149865 GTCCTGCCCGAGATTTGCTTCTGTCTTTGGTAGTCCCGGCTCCTTCTCAG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1711 CCGAGGTGTTGCTCACATCCTGAAGACACGATGAAAGCATTCTGCAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149915 CCGAGGTGTTGCTCACATCCTGAAGACACGATGAAAGCATTCTGCAGGAG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1761 GGAGCTTGAACTGAAGGAGGCTGCGCAGCTGGTCCCTAATGACATG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 149965 GGAGCTTGAACTGAAGGAGGCTGCGCAGCTGGTCCCTAATGACATGGTA.

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1807      GAAAGTTTGAAGCAAAAACTGGTCAGAGTGCTGGAGGAAAACCTC
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150015 ..AAGGAAAGTTTGAAGCAAAAACTGGTCAGAGTGCTGGAGGAAAACCTC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1852 ATTTTGTCAGAAAAAATTCAACAGTTGGAGGAAGGTGCTGCCATCTCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151772 ATTTTGTCAGAAAAAATTCAACAGTTGGAGGAAGGTGCTGCCATCTCAAT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1902 TGTGAGTGGGCAACAGTCACATACTTATG         ATGATCTTCTGC
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 151822 TGTGAGTGGGCAACAGTCACATACTTATGGTA...TAGATGATCTTCTGC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1943 ACAAAAACCAACAGCTGACCATGCAGGTGGCTTGCCTGAACCAGGAGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155283 ACAAAAACCAACAGCTGACCATGCAGGTGGCTTGCCTGAACCAGGAGCTT

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1993 GCCCAGCTGAAAAAGCTGGAGAAGACAGTTGCCATTCTCCATGAAAGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155333 GCCCAGCTGAAAAAGCTGGAGAAGACAGTTGCCATTCTCCATGAAAGTCA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2043 GAG         ATCCCTGGTGGTAACTAATGAGTATCTGCTGCAGCAGC
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155383 GAGGTA...CAGATCCCTGGTGGTAACTAATGAGTATCTGCTGCAGCAGC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2084 TGAATAAGGAGCCAAAAGGTTATTCCGGGAAAGCGCTCCTGCCTCCTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158046 TGAATAAGGAGCCAAAAGGTTATTCCGGGAAAGCGCTCCTGCCTCCTGAG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2134 AAGGGTCATCATCTGGGGAGATCATCGCCCTTTGGGAAAAGCACGTTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158096 AAGGGTCATCATCTGGGGAGATCATCGCCCTTTGGGAAAAGCACGTTGTC

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2184 TTCCTCCTCACCAGTGGCACATGAGACTGGTCAGTATCTAATACAGAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158146 TTCCTCCTCACCAGTGGCACATGAGACTGGTCAGTATCTAATACAGAGCG

   2350     .    :    .    :    .
   2234 TCTTGGATGCTGCCCCAGAGCCTGGCTTA
        |||||||||||||||||||||||||||||
 158196 TCTTGGATGCTGCCCCAGAGCCTGGCTTA