seq1 = pF1KE2503.tfa, 1893 bp
seq2 = pF1KE2503/gi568815583r_34427635.tfa (gi568815583r:34427635_34633260), 205626 bp

>pF1KE2503 1893
>gi568815583r:34427635_34633260 (Chr15)

(complement)

1-80  (100001-100080)   100% ->
81-369  (100126-100415)   99% ->
370-408  (101262-101300)   100% ->
409-456  (101566-101613)   100% ->
457-541  (101702-101786)   100% ->
542-651  (101883-101992)   100% ->
652-738  (102993-103079)   100% ->
739-846  (103187-103294)   100% ->
847-934  (103512-103599)   100% ->
935-1191  (103987-104243)   100% ->
1192-1335  (104511-104654)   100% ->
1336-1436  (104789-104889)   100% ->
1437-1537  (104972-105072)   99% ->
1538-1693  (105184-105339)   98% ->
1694-1893  (105427-105626)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTTGCCAGTTGATGGGGAAGAAAGGAAGTCGGAGGGCTCAGACACTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTTGCCAGTTGATGGGGAAGAAAGGAAGTCGGAGGGCTCAGACACTGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGGGGACAGAACATCTCCATGTGCAGTCTC          ATCTGCTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>-||||||||||
 100051 GGGGGACAGAACATCTCCATGTGCAGTCTCATC...CATCATCTGCTACC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     91 CTGAAGGATCTGGAGGTAGGAGGCTCTGGGCGGAGGTGCAGTGACCCCGC
        |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
 100137 CTGAAGGATCTGGAGGTAGGAGGCTCTGGGTGGAGGTGCAGTGACCCCGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    141 AGGCCAGCCCTCCAACCTCCTCCCGCAGCGGGGACTGGGTGCCCCTCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100187 AGGCCAGCCCTCCAACCTCCTCCCGCAGCGGGGACTGGGTGCCCCTCTGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    191 CAGCTGAGACAGCCCACACACAACCCAGCCCTAATGATCGTTCTCTCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100237 CAGCTGAGACAGCCCACACACAACCCAGCCCTAATGATCGTTCTCTCTAC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    241 CTCTCCCCCAAGTCCTCCTCCGCCTCCTCCTCTCTGCATGCGCGTCAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100287 CTCTCCCCCAAGTCCTCCTCCGCCTCCTCCTCTCTGCATGCGCGTCAGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    291 CCCGTGCCAAGAACAAGCAGCAGTCCTGAACTCGAGGTCCATAAAAATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100337 CCCGTGCCAAGAACAAGCAGCAGTCCTGAACTCGAGGTCCATAAAAATCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    341 GTCGACTGAATGACACCATCAAATCTTTG         AAACAACAGAAG
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 100387 GTCGACTGAATGACACCATCAAATCTTTGGTA...CAGAAACAACAGAAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    382 AAACAAGTGGAACATCAGCTGGAAGAA         GAAAAGAAAGCAAA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 101274 AAACAAGTGGAACATCAGCTGGAAGAAGTA...TAGGAAAAGAAAGCAAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    423 CAATGAGAAACAGAAAGCTGAAAGGGAGCTAGAG         GGTCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 101580 CAATGAGAAACAGAAAGCTGAAAGGGAGCTAGAGGTG...AAGGGTCAAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    464 TCCAGAGATTGAACACAGAGAAAAAGAAACTAAATACGGACCTGTATCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101709 TCCAGAGATTGAACACAGAGAAAAAGAAACTAAATACGGACCTGTATCAC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    514 ATGAAACATTCTCTCAGATACTTTGAAG         AAGAGTCCAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 101759 ATGAAACATTCTCTCAGATACTTTGAAGGTG...CAGAAGAGTCCAAGGA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    555 TCTGGCCGGCCGCCTGCAACGTTCATCGCAGCGTATAGGAGAGTTAGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101896 TCTGGCCGGCCGCCTGCAACGTTCATCGCAGCGTATAGGAGAGTTAGAGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    605 GGTCTCTCTGTGCTGTCGCCGCCACACAGAAGAAGAAGCCGGATGGG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 101946 GGTCTCTCTGTGCTGTCGCCGCCACACAGAAGAAGAAGCCGGATGGGGTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    652       TTCTCGAGCCGCAGTAAAGCACTTCTCAAGCGGCAGTTAGAGCA
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101996 ...CAGTTCTCGAGCCGCAGTAAAGCACTTCTCAAGCGGCAGTTAGAGCA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    696 GTCCATACGGGAGCAGATACTGCTGAAAGGACACGTGACACAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 103037 GTCCATACGGGAGCAGATACTGCTGAAAGGACACGTGACACAGGTG...C

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    739   TTGAAGGAGTCGCTTAAAGAAGTCCAGCTGGAGAGAGATCAATATGCT
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103185 AGTTGAAGGAGTCGCTTAAAGAAGTCCAGCTGGAGAGAGATCAATATGCT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    787 GAACAAATAAAAGGAGAGAGGGCCCAGTGGCAGCAGAGGATGAGGAAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103235 GAACAAATAAAAGGAGAGAGGGCCCAGTGGCAGCAGAGGATGAGGAAAAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    837 GTCGCAGGAG         GTTTGCACATTGAAGGAGGAGAAGAAGCATG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 103285 GTCGCAGGAGGTG...CAGGTTTGCACATTGAAGGAGGAGAAGAAGCATG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    878 ATACGCATCGGGTAGAGGAGCTGGAGAGGAGCTTGTCCAGACTCAAAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103543 ATACGCATCGGGTAGAGGAGCTGGAGAGGAGCTTGTCCAGACTCAAAAAC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    928 CAGATGG         CTGAGCCACTGCCCCCGGATGCCCCAGCAGTGTC
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103593 CAGATGGGTA...CAGCTGAGCCACTGCCCCCGGATGCCCCAGCAGTGTC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    969 CTCTGAGGTGGAGCTGCAAGACCTGAGGAAGGAGCTGGAGAGAGTGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104021 CTCTGAGGTGGAGCTGCAAGACCTGAGGAAGGAGCTGGAGAGAGTGGCAG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1019 GAGAGCTCCAGGCTCAGGTGGAAAACAATCAGTGCATCAGTCTCCTGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104071 GAGAGCTCCAGGCTCAGGTGGAAAACAATCAGTGCATCAGTCTCCTGAAC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1069 CGTGGGCAAAAGGAGAGGCTTCGCGAGCAGGAGGAGAGGCTTCAGGAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104121 CGTGGGCAAAAGGAGAGGCTTCGCGAGCAGGAGGAGAGGCTTCAGGAGCA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1119 GCAGGAGAGGCTTCGGGAACGGGAGAAGAGGCTTCAGCAGCTGGCCGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104171 GCAGGAGAGGCTTCGGGAACGGGAGAAGAGGCTTCAGCAGCTGGCCGAGC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1169 CACAGAGCGACTTGGAGGAGCTG         AAGCACGAGAACAAGAGC
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 104221 CACAGAGCGACTTGGAGGAGCTGGTG...CAGAAGCACGAGAACAAGAGC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1210 GCACTGCAGTTGGAGCAGCAAGTAAAGGAGCTGCAGGAGAAGCTGGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104529 GCACTGCAGTTGGAGCAGCAAGTAAAGGAGCTGCAGGAGAAGCTGGGCCA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1260 GGTGATGGAGACGCTCACCTCGGCCGAGAAGGAGCCAGAGGCAGCAGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104579 GGTGATGGAGACGCTCACCTCGGCCGAGAAGGAGCCAGAGGCAGCAGTCC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1310 CAGCCTCAGGGACTGGGGGCGAGTCT         AGCGGCCTTATGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 104629 CAGCCTCAGGGACTGGGGGCGAGTCTGTG...CAGAGCGGCCTTATGGAC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 CTCCTGGAGGAGAAGGCGGACCTGAGGGAGCATGTGGAGAAACTGGAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104804 CTCCTGGAGGAGAAGGCGGACCTGAGGGAGCATGTGGAGAAACTGGAACT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 TGGATTCATCCAGTACCGGAGAGAGAGATGCCATCA         GAACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||| |
 104854 TGGATTCATCCAGTACCGGAGAGAGAGATGCCATCAGTG...CAGGAAAG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1442 TACATCGCCTTCTAACAGAGCCAGGGGACAGTGCCAAAGATGCGTCACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104977 TACATCGCCTTCTAACAGAGCCAGGGGACAGTGCCAAAGATGCGTCACCG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1492 GGAGGAGGCCATCATCAGGCTGGCCCAGGACAAGGAGGAGAGGAAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 105027 GGAGGAGGCCATCATCAGGCTGGCCCAGGACAAGGAGGAGAGGAAGGTA.

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1538      GTGAAGCTGCTGGAGCTGCAGGAGATGGTGTTGCGGCTTGTGGCA
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105077 ..CAGGTGAAGCTGCTGGAGCTGCAGGAGATGGTGTTGCGGCTTGTGGCA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1583 GCTACAACGAGGGGCACGGCAAATTCCTGGCCGCTGCCCAGAACCCTGCT
        |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
 105229 GCTACAGCGAGGGGCACGGCAAATTCCTGGCCGCTGCCCGGAACCCTGCT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1633 GCTGAACCCAGTCCAGGAGCCCCAGCCCCCCAGGAGCTCGGGGCTGCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105279 GCTGAACCCAGTCCAGGAGCCCCAGCCCCCCAGGAGCTCGGGGCTGCCGA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1683 CAAGCATGGTG         ATCTTTGTGAGGCGAGCCTCACCAACAGCG
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 105329 CAAGCATGGTGGTG...AAGATCTTTGTGAGGCGAGCCTCACCAACAGCG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1724 TGGAGCCTGCACAAGGAGAAGCCAGGGAGGGTTCTTCCCAGGACAACCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105457 TGGAGCCTGCACAAGGAGAAGCCAGGGAGGGTTCTTCCCAGGACAACCCT

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1774 ACTGCACAGCCAATCGTGCAGCTCCTTGGTGAGATGCAGGACCACCAGGA
        |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105507 ACTGCACAGCCAGTCCTGCAGCTCCTTGGTGAGATGCAGGACCACCAGGA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1824 GCACCCAGGCTTGGGCAGCAACTGCTGTGTGCCATGCTTTTGCTGGGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105557 GCACCCAGGCTTGGGCAGCAACTGCTGTGTGCCATGCTTTTGCTGGGCTT

   2000     .    :    .    :
   1874 GGCTGCCGAGAAGAAGGAGA
        ||||||||||||||||||||
 105607 GGCTGCCGAGAAGAAGGAGA