seq1 = pF1KE2490.tfa, 1284 bp
seq2 = pF1KE2490/gi568815584r_73866931.tfa (gi568815584r:73866931_74088102), 221172 bp

>pF1KE2490 1284
>gi568815584r:73866931_74088102 (Chr14)

(complement)

1-217  (100001-100217)   100% ->
218-297  (101210-101289)   100% ->
298-441  (104942-105085)   100% ->
442-517  (110729-110804)   100% ->
518-553  (111044-111079)   100% ->
554-642  (111691-111779)   100% ->
643-722  (112088-112167)   100% ->
723-784  (113118-113179)   100% ->
785-886  (114125-114226)   100% ->
887-1027  (115079-115219)   100% ->
1028-1084  (116195-116251)   100% ->
1085-1200  (117978-118093)   100% ->
1201-1284  (121089-121172)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCACTTCTTGGGGCACAGTCTTTTTCATGCTGGTGGTATCCTGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCACTTCTTGGGGCACAGTCTTTTTCATGCTGGTGGTATCCTGTGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TTGCAGCGCTGTCTCCCACAGGAACCAGCAGACTTGGTTTGAGGGTATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TTGCAGCGCTGTCTCCCACAGGAACCAGCAGACTTGGTTTGAGGGTATCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCCTGTCTTCCATGTGCCCCATCAATGTCAGCGCCAGCACCTTGTATGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCCTGTCTTCCATGTGCCCCATCAATGTCAGCGCCAGCACCTTGTATGGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ATTATGTTTGATGCAGGGAGCACTGGAACTCGAATTCATGTTTACACCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ATTATGTTTGATGCAGGGAGCACTGGAACTCGAATTCATGTTTACACCTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TGTGCAGAAAATGCCAG         GACAGCTTCCAATTCTAGAAGGGG
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 100201 TGTGCAGAAAATGCCAGGTA...TAGGACAGCTTCCAATTCTAGAAGGGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AAGTTTTTGATTCTGTGAAGCCAGGACTTTCTGCTTTTGTAGATCAACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101234 AAGTTTTTGATTCTGTGAAGCCAGGACTTTCTGCTTTTGTAGATCAACCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 AAGCAG         GGTGCTGAGACCGTTCAAGGGCTCTTAGAGGTGGC
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101284 AAGCAGGTG...AAGGGTGCTGAGACCGTTCAAGGGCTCTTAGAGGTGGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CAAAGACTCAATCCCCCGAAGTCACTGGAAAAAGACCCCAGTGGTCCTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104977 CAAAGACTCAATCCCCCGAAGTCACTGGAAAAAGACCCCAGTGGTCCTAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 AGGCAACAGCAGGACTACGCTTACTGCCAGAACACAAAGCCAAGGCTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105027 AGGCAACAGCAGGACTACGCTTACTGCCAGAACACAAAGCCAAGGCTCTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CTCTTTGAG         GTAAAGGAGATCTTCAGGAAGTCACCTTTCCT
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 105077 CTCTTTGAGGTA...TAGGTAAAGGAGATCTTCAGGAAGTCACCTTTCCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GGTACCAAAGGGCAGTGTTAGCATCATGGATGGATCCGACGAAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 110761 GGTACCAAAGGGCAGTGTTAGCATCATGGATGGATCCGACGAAGGTG...

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    518    GCATATTAGCTTGGGTTACTGTGAATTTTCTGACAG         GT
        >>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 111041 TAGGCATATTAGCTTGGGTTACTGTGAATTTTCTGACAGGTA...CAGGT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 CAGCTGCATGGCCACAGACAGGAGACTGTGGGGACCTTGGACCTAGGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111693 CAGCTGCATGGCCACAGACAGGAGACTGTGGGGACCTTGGACCTAGGGGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 AGCCTCCACCCAAATCACGTTCCTGCCCCAGTTTGAG         AAAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 111743 AGCCTCCACCCAAATCACGTTCCTGCCCCAGTTTGAGGTG...CAGAAAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 CTCTGGAACAAACTCCTAGGGGCTACCTCACTTCCTTTGAGATGTTTAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112092 CTCTGGAACAAACTCCTAGGGGCTACCTCACTTCCTTTGAGATGTTTAAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 AGCACTTATAAGCTCTATACACATAG         TTACCTGGGATTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 112142 AGCACTTATAAGCTCTATACACATAGGTG...CAGTTACCTGGGATTTGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 ATTGAAAGCTGCAAGACTAGCAACCCTGGGAGCCCTGGAGACAGAAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 113133 ATTGAAAGCTGCAAGACTAGCAACCCTGGGAGCCCTGGAGACAGAAGGTT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    785       GGACTGATGGGCACACTTTCCGGAGTGCCTGTTTACCGAGATGG
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113183 ...CAGGGACTGATGGGCACACTTTCCGGAGTGCCTGTTTACCGAGATGG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    829 TTGGAAGCAGAGTGGATCTTTGGGGGTGTGAAATACCAGTATGGTGGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114169 TTGGAAGCAGAGTGGATCTTTGGGGGTGTGAAATACCAGTATGGTGGCAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 CCAAGAAG         GGGAGGTGGGCTTTGAGCCCTGCTATGCCGAAG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 114219 CCAAGAAGGCA...CAGGGGAGGTGGGCTTTGAGCCCTGCTATGCCGAAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    920 TGCTGAGGGTGGTACGAGGAAAACTTCACCAGCCAGAGGAGGTCCAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115112 TGCTGAGGGTGGTACGAGGAAAACTTCACCAGCCAGAGGAGGTCCAGAGA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    970 GGTTCCTTCTATGCTTTCTCTTACTATTATGACCGAGCTGTTGACACAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115162 GGTTCCTTCTATGCTTTCTCTTACTATTATGACCGAGCTGTTGACACAGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 CATGATTG         ATTATGAAAAGGGGGGTATTTTAAAAGTTGAAG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 115212 CATGATTGGTG...CAGATTATGAAAAGGGGGGTATTTTAAAAGTTGAAG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1061 ATTTTGAAAGAAAAGCCAGGGAAG         TGTGTGATAACTTGGAA
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 116228 ATTTTGAAAGAAAAGCCAGGGAAGGTA...CAGTGTGTGATAACTTGGAA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1102 AACTTCACCTCAGGCAGTCCTTTCCTGTGCATGGATCTCAGCTACATCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117995 AACTTCACCTCAGGCAGTCCTTTCCTGTGCATGGATCTCAGCTACATCAC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1152 AGCCCTGTTAAAGGATGGCTTTGGCTTTGCAGACAGCACAGTCTTACAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 118045 AGCCCTGTTAAAGGATGGCTTTGGCTTTGCAGACAGCACAGTCTTACAGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201         CTCACAAAGAAAGTGAACAACATAGAGACGGGCTGGGCCTTG
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118095 TA...CAGCTCACAAAGAAAGTGAACAACATAGAGACGGGCTGGGCCTTG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :
   1243 GGGGCCACCTTTCACCTGTTGCAGTCTCTGGGCATCTCCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121131 GGGGCCACCTTTCACCTGTTGCAGTCTCTGGGCATCTCCCAT