seq1 = pF1KE2487.tfa, 2052 bp
seq2 = pF1KE2487/gi568815588f_100888211.tfa (gi568815588f:100888211_101093507), 205297 bp

>pF1KE2487 2052
>gi568815588f:100888211_101093507 (Chr10)

1-1243  (100001-101243)   100% ->
1244-1484  (101434-101674)   100% ->
1485-1592  (102226-102333)   100% ->
1593-1734  (102659-102800)   100% ->
1735-2052  (104980-105297)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTGGGTCCTCCTCCGAAGTGGGTACCCCCTCCGTATCTTGTTACCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTGGGTCCTCCTCCGAAGTGGGTACCCCCTCCGTATCTTGTTACCCCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCGTGGGGAGTGGATGGGTCGGAGGGGCCTGCCCCGAAACTTGGCCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCGTGGGGAGTGGATGGGTCGGAGGGGCCTGCCCCGAAACTTGGCCCCAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCCCTCCTCGCAGACGTTACAGGAAGGAGACTCTCCAAGCCTTGGATATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCCCTCCTCGCAGACGTTACAGGAAGGAGACTCTCCAAGCCTTGGATATG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CCAGTGTTGCCTGTAACTGCAACTGAAATCCGCCAGTATTTGCGGGGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CCAGTGTTGCCTGTAACTGCAACTGAAATCCGCCAGTATTTGCGGGGGCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TGGGATCCCCTTCCAGGATGGTCACAGTTGCCTGCGGGCACTGAGCCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TGGGATCCCCTTCCAGGATGGTCACAGTTGCCTGCGGGCACTGAGCCCCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TTGCAGAGTCTTCACAGCTCAAAGGCCAGACTGGTGTTACCACTTCCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TTGCAGAGTCTTCACAGCTCAAAGGCCAGACTGGTGTTACCACTTCCTTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AGCCTCTTCATTGACAAGACCACAGGCCACTTTCTCTGCATGACCAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 AGCCTCTTCATTGACAAGACCACAGGCCACTTTCTCTGCATGACCAGCCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 AGCAGAAGGGAGCTGGGAAGACTTCCAGGCCAGCGTGGAGGGGCGAGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 AGCAGAAGGGAGCTGGGAAGACTTCCAGGCCAGCGTGGAGGGGCGAGGGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 ATGGGGCCAGGGAGGGGTTTCTGCTTAGCAAGGCACCAGAATTTGAGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 ATGGGGCCAGGGAGGGGTTTCTGCTTAGCAAGGCACCAGAATTTGAGGAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 AGCGAGGAGGTCCGGAGGATCTGGAACCGAGCAATACCTCTCTGGGAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 AGCGAGGAGGTCCGGAGGATCTGGAACCGAGCAATACCTCTCTGGGAGCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GCCTGATCAGGAGGAGGTTCAGCTGGCTGATACAATGTTTGGCCTTACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GCCTGATCAGGAGGAGGTTCAGCTGGCTGATACAATGTTTGGCCTTACCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 AGGTTACAGATGACACACTCAAGCGTTTCAGTGTGCGATATCTGCGACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 AGGTTACAGATGACACACTCAAGCGTTTCAGTGTGCGATATCTGCGACCT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GCTCGCAGTCTTGTCTTCCCTTGGTTCTCCCCTGGGGGCTCAGGATTACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GCTCGCAGTCTTGTCTTCCCTTGGTTCTCCCCTGGGGGCTCAGGATTACG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 AGGCCTGAAGCTCCTAGAGGCTAAATGCCAGGGGGATGGAGTGAGCTACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 AGGCCTGAAGCTCCTAGAGGCTAAATGCCAGGGGGATGGAGTGAGCTACG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 AGGAAACCACTATTCCCCGACCCAGCGCCTACCACAATCTGTTTGGATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 AGGAAACCACTATTCCCCGACCCAGCGCCTACCACAATCTGTTTGGATTA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CCACTGATTAGTCGTCGAGATGCTGAGGTGGTACTGACGAGTCGTGAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 CCACTGATTAGTCGTCGAGATGCTGAGGTGGTACTGACGAGTCGTGAGCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TGACAGCCTGGCCTTGAACCAGTCCACGGGGCTGCCTACCCTTACTCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TGACAGCCTGGCCTTGAACCAGTCCACGGGGCTGCCTACCCTTACTCTAC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 CCCGAGGAACGACCTGCTTACCCCCTGCCTTACTCCCTTACCTGGAACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 CCCGAGGAACGACCTGCTTACCCCCTGCCTTACTCCCTTACCTGGAACAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 TTCCGGCGGATTGTATTCTGGTTGGGGGATGACCTTCGGTCCTGGGAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 TTCCGGCGGATTGTATTCTGGTTGGGGGATGACCTTCGGTCCTGGGAAGC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 CGCCAAGTTGTTTGCACGAAAACTGAACCCCAAACGATGCTTCTTGGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 CGCCAAGTTGTTTGCACGAAAACTGAACCCCAAACGATGCTTCTTGGTGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 GACCAGGAGACCAGCAACCCCGTCCCCTGGAGGCCCTGAACGGAGGCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 GACCAGGAGACCAGCAACCCCGTCCCCTGGAGGCCCTGAACGGAGGCTTC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 AATCTTTCTCGTATTCTTCGTACCGCCCTGCCTGCCTGGCACAAGTCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 AATCTTTCTCGTATTCTTCGTACCGCCCTGCCTGCCTGGCACAAGTCCAT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 CGTATCTTTCCGGCAGCTTCGGGAGGAGGTGCTAGGAGAACTGTCAAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 CGTATCTTTCCGGCAGCTTCGGGAGGAGGTGCTAGGAGAACTGTCAAATG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 TGGAGCAAGCAGCTGGCCTCCGCTGGAGCCGCTTTCCAGACCTCAATCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 TGGAGCAAGCAGCTGGCCTCCGCTGGAGCCGCTTTCCAGACCTCAATCGT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 ATCTTGAAGGGACATCGAAAGGGCGAGCTGACGGTCTTCACAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 101201 ATCTTGAAGGGACATCGAAAGGGCGAGCTGACGGTCTTCACAGGTA...C

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1244   GGCCAACAGGCAGTGGAAAGACGACATTCATCAGTGAGTATGCCCTGG
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101432 AGGGCCAACAGGCAGTGGAAAGACGACATTCATCAGTGAGTATGCCCTGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1292 ATTTGTGTTCCCAGGGGGTGAACACACTGTGGGGTAGCTTCGAGATCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101482 ATTTGTGTTCCCAGGGGGTGAACACACTGTGGGGTAGCTTCGAGATCAGC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1342 AATGTGAGACTAGCCCGGGTCATGCTGACACAGTTTGCCGAGGGGCGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101532 AATGTGAGACTAGCCCGGGTCATGCTGACACAGTTTGCCGAGGGGCGGCT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1392 GGAAGATCAACTGGACAAATATGATCACTGGGCTGACCGCTTTGAGGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101582 GGAAGATCAACTGGACAAATATGATCACTGGGCTGACCGCTTTGAGGACC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1442 TGCCCCTCTATTTCATGACTTTCCATGGACAGCAAAGCATCAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 101632 TGCCCCTCTATTTCATGACTTTCCATGGACAGCAAAGCATCAGGTG...C

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1485   GACTGTAATAGATACAATGCAACATGCAGTCTACGTCTATGACATTTG
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102224 AGGACTGTAATAGATACAATGCAACATGCAGTCTACGTCTATGACATTTG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1533 TCATGTGATCATCGACAACCTGCAGTTCATGATGGGTCACGAGCAGCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102274 TCATGTGATCATCGACAACCTGCAGTTCATGATGGGTCACGAGCAGCTGT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1583 CCACAGACAG         GATCGCAGCTCAAGACTACATCATCGGGGTC
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 102324 CCACAGACAGGTG...TAGGATCGCAGCTCAAGACTACATCATCGGGGTC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1624 TTTCGGAAGTTTGCAACAGACAATAACTGCCATGTGACACTGGTCATTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102690 TTTCGGAAGTTTGCAACAGACAATAACTGCCATGTGACACTGGTCATTCA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1674 CCCCCGGAAAGAGGATGATGACAAGGAACTGCAGACAGCGTCCATTTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102740 CCCCCGGAAAGAGGATGATGACAAGGAACTGCAGACAGCGTCCATTTTTG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1724 GCTCAGCCAAA         GCAAGCCAGGAAGCAGACAATGTTCTGATC
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 102790 GCTCAGCCAAAGTG...CAGGCAAGCCAGGAAGCAGACAATGTTCTGATC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1765 CTGCAGGACAGGAAGCTGGTAACCGGGCCAGGGAAACGGTATCTGCAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105010 CTGCAGGACAGGAAGCTGGTAACCGGGCCAGGGAAACGGTATCTGCAGGT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1815 GTCCAAGAACCGCTTTGATGGAGATGTAGGTGTCTTCCCGCTTGAGTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105060 GTCCAAGAACCGCTTTGATGGAGATGTAGGTGTCTTCCCGCTTGAGTTCA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1865 ACAAGAACTCCCTCACCTTCTCCATTCCACCAAAGAACAAGGCCCGGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105110 ACAAGAACTCCCTCACCTTCTCCATTCCACCAAAGAACAAGGCCCGGCTC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1915 AAGAAGATCAAGGATGACACTGGACCAGTGGCCAAAAAGCCCTCTTCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105160 AAGAAGATCAAGGATGACACTGGACCAGTGGCCAAAAAGCCCTCTTCTGG

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1965 CAAAAAGGGGGCTACGACACAGAACTCTGAGATTTGCTCAGGCCAGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105210 CAAAAAGGGGGCTACGACACAGAACTCTGAGATTTGCTCAGGCCAGGCCC

   2050     .    :    .    :    .    :    .
   2015 CCACTCCCGACCAGCCAGACACCTCCAAGCGTTCAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105260 CCACTCCCGACCAGCCAGACACCTCCAAGCGTTCAAAG