seq1 = pF1KE2482.tfa, 1404 bp
seq2 = pF1KE2482/gi568815583r_60397458.tfa (gi568815583r:60397458_60631853), 234396 bp

>pF1KE2482 1404
>gi568815583r:60397458_60631853 (Chr15)

(complement)

1-31  (39437-39467)   100% ->
32-117  (100003-100088)   100% ->
118-259  (117097-117238)   100% ->
260-655  (120233-120628)   100% ->
656-777  (126225-126346)   100% ->
778-910  (128187-128319)   100% ->
911-1018  (128987-129094)   100% ->
1019-1129  (130785-130895)   100% ->
1130-1242  (131850-131962)   100% ->
1243-1404  (134235-134396)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGATGTATTTTGTGATCGCAGCGATGAAAG         CTCAAATTGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
  39437 ATGATGTATTTTGTGATCGCAGCGATGAAAGGTG...CAGCTCAAATTGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 AATTATTCCATGCAAGATCTGTGGAGACAAATCATCAGGAATCCATTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100013 AATTATTCCATGCAAGATCTGTGGAGACAAATCATCAGGAATCCATTATG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GTGTCATTACATGTGAAGGCTGCAAG         GGCTTTTTCAGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 100063 GTGTCATTACATGTGAAGGCTGCAAGGTA...CAGGGCTTTTTCAGGAGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 AGTCAGCAAAGCAATGCCACCTACTCCTGTCCTCGTCAGAAGAACTGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117112 AGTCAGCAAAGCAATGCCACCTACTCCTGTCCTCGTCAGAAGAACTGTTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GATTGATCGAACCAGTAGAAACCGCTGCCAACACTGTCGATTACAGAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117162 GATTGATCGAACCAGTAGAAACCGCTGCCAACACTGTCGATTACAGAAAT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GCCTTGCCGTAGGGATGTCTCGAGATG         CTGTAAAATTTGGC
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 117212 GCCTTGCCGTAGGGATGTCTCGAGATGGTG...CAGCTGTAAAATTTGGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 CGAATGTCAAAAAAGCAGAGAGACAGCTTGTATGCAGAAGTACAGAAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120247 CGAATGTCAAAAAAGCAGAGAGACAGCTTGTATGCAGAAGTACAGAAACA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CCGGATGCAGCAGCAGCAGCGCGACCACCAGCAGCAGCCTGGAGAGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120297 CCGGATGCAGCAGCAGCAGCGCGACCACCAGCAGCAGCCTGGAGAGGCTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AGCCGCTGACGCCCACCTACAACATCTCGGCCAACGGGCTGACGGAACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120347 AGCCGCTGACGCCCACCTACAACATCTCGGCCAACGGGCTGACGGAACTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CACGACGACCTCAGTAACTACATTGACGGGCACACCCCTGAGGGGAGTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120397 CACGACGACCTCAGTAACTACATTGACGGGCACACCCCTGAGGGGAGTAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GGCAGACTCCGCCGTCAGCAGCTTCTACCTGGACATACAGCCTTCCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120447 GGCAGACTCCGCCGTCAGCAGCTTCTACCTGGACATACAGCCTTCCCCAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 ACCAGTCAGGTCTTGATATCAATGGAATCAAACCAGAACCAATATGTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120497 ACCAGTCAGGTCTTGATATCAATGGAATCAAACCAGAACCAATATGTGAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 TACACACCAGCATCAGGCTTCTTTCCCTACTGTTCGTTCACCAACGGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120547 TACACACCAGCATCAGGCTTCTTTCCCTACTGTTCGTTCACCAACGGCGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 GACTTCCCCAACTGTGTCCATGGCAGAATTAG         AACACCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 120597 GACTTCCCCAACTGTGTCCATGGCAGAATTAGGTA...TAGAACACCTTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 CACAGAATATATCTAAATCGCATCTGGAAACCTGCCAATACTTGAGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126234 CACAGAATATATCTAAATCGCATCTGGAAACCTGCCAATACTTGAGAGAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 GAGCTCCAGCAGATAACGTGGCAGACCTTTTTACAGGAAGAAATTGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126284 GAGCTCCAGCAGATAACGTGGCAGACCTTTTTACAGGAAGAAATTGAGAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 CTATCAAAACAAG         CAGCGGGAGGTGATGTGGCAATTGTGTG
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 126334 CTATCAAAACAAGGTA...CAGCAGCGGGAGGTGATGTGGCAATTGTGTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 CCATCAAAATTACAGAAGCTATACAGTATGTGGTGGAGTTTGCCAAACGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128215 CCATCAAAATTACAGAAGCTATACAGTATGTGGTGGAGTTTGCCAAACGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 ATTGATGGATTTATGGAACTGTGTCAAAATGATCAAATTGTGCTTCTAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128265 ATTGATGGATTTATGGAACTGTGTCAAAATGATCAAATTGTGCTTCTAAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 AGCAG         GTTCTCTAGAGGTGGTGTTTATCAGAATGTGCCGTG
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128315 AGCAGGTA...TAGGTTCTCTAGAGGTGGTGTTTATCAGAATGTGCCGTG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 CCTTTGACTCTCAGAACAACACCGTGTACTTTGATGGGAAGTATGCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129023 CCTTTGACTCTCAGAACAACACCGTGTACTTTGATGGGAAGTATGCCAGC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 CCCGACGTCTTCAAATCCTTAG         GTTGTGAAGACTTTATTAG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 129073 CCCGACGTCTTCAAATCCTTAGGTA...CAGGTTGTGAAGACTTTATTAG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 CTTTGTGTTTGAATTTGGAAAGAGTTTATGTTCTATGCACCTGACTGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130804 CTTTGTGTTTGAATTTGGAAAGAGTTTATGTTCTATGCACCTGACTGAAG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 ATGAAATTGCATTATTTTCTGCATTTGTACTGATGTCAGCAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 130854 ATGAAATTGCATTATTTTCTGCATTTGTACTGATGTCAGCAGGTA...TA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1130  ATCGCTCATGGCTGCAAGAAAAGGTAAAAATTGAAAAACTGCAACAGAA
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131849 GATCGCTCATGGCTGCAAGAAAAGGTAAAAATTGAAAAACTGCAACAGAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 AATTCAGCTAGCTCTTCAACACGTCCTACAGAAGAATCACCGAGAAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131899 AATTCAGCTAGCTCTTCAACACGTCCTACAGAAGAATCACCGAGAAGATG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 GAATACTAACAAAG         TTAATATGCAAGGTGTCTACCTTAAGA
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 131949 GAATACTAACAAAGGTG...CAGTTAATATGCAAGGTGTCTACCTTAAGA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 GCCTTATGTGGACGACATACAGAAAAGCTAATGGCATTTAAAGCAATATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134262 GCCTTATGTGGACGACATACAGAAAAGCTAATGGCATTTAAAGCAATATA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 CCCAGACATTGTGCGACTTCATTTTCCTCCATTATACAAGGAGTTGTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134312 CCCAGACATTGTGCGACTTCATTTTCCTCCATTATACAAGGAGTTGTTCA

   1450     .    :    .    :    .    :    .
   1370 CTTCAGAATTTGAGCCAGCAATGCAAATTGATGGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134362 CTTCAGAATTTGAGCCAGCAATGCAAATTGATGGG