seq1 = pF1KE2481.tfa, 1416 bp
seq2 = pF1KE2481/gi568815579r_45385711.tfa (gi568815579r:45385711_45595139), 209429 bp

>pF1KE2481 1416
>gi568815579r:45385711_45595139 (Chr19)

(complement)

1-34  (98315-98348)   100% ->
35-79  (100001-100045)   100% ->
80-559  (100135-100614)   100% ->
560-814  (100720-100974)   100% ->
815-1022  (105587-105794)   100% ->
1023-1161  (106154-106292)   100% ->
1162-1231  (106434-106503)   100% ->
1232-1278  (106623-106669)   100% ->
1279-1337  (109027-109085)   100% ->
1338-1416  (109351-109429)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGGCAGGTCCTGCCGGTCTTCGCCCACTGCA         AAGAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
  98315 ATGGGGCAGGTCCTGCCGGTCTTCGCCCACTGCAGTG...CAGAAGAAGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 TCCGTCTACAGCCTCCTCAACTCCTGATTCCACAGAAG         GAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 100008 TCCGTCTACAGCCTCCTCAACTCCTGATTCCACAGAAGGTA...CAGGAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     83 GGAACGACGACTCTGATTTTCGAGAGCTGCACACAGCCCGGGAATTCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100138 GGAACGACGACTCTGATTTTCGAGAGCTGCACACAGCCCGGGAATTCTCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 GAGGAGGACGAGGAGGAGACCACGTCGCAGGACTGGGGCACCCCCCGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100188 GAGGAGGACGAGGAGGAGACCACGTCGCAGGACTGGGGCACCCCCCGGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GCTGACCTTCTCCTACATCGCCTTTGATGGTGTAGTGGGCTCCGGGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100238 GCTGACCTTCTCCTACATCGCCTTTGATGGTGTAGTGGGCTCCGGGGGCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GCAGGGATTCAACTGCCCGCCGCCCCCGCCCCCAGGGCCGCTCAGTCTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100288 GCAGGGATTCAACTGCCCGCCGCCCCCGCCCCCAGGGCCGCTCAGTCTCG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GAACCACGAGACCAGCACCCTCAGCCCAGCCTGGGCGACAGCTTGGAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100338 GAACCACGAGACCAGCACCCTCAGCCCAGCCTGGGCGACAGCTTGGAGAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CATCCCCAGCCTGAGCCAATCCCCGGAGCCTGGACGACGGGGTGATCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100388 CATCCCCAGCCTGAGCCAATCCCCGGAGCCTGGACGACGGGGTGATCCTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ACACCGCGCCTCCATCCGAGCGCCCTCTGGAAGACCTGAGGCTTCGGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100438 ACACCGCGCCTCCATCCGAGCGCCCTCTGGAAGACCTGAGGCTTCGGTTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GACCATCTGGGCTGGGTGGCCCGGGGAACGGGATCCGGGGAGGACTCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100488 GACCATCTGGGCTGGGTGGCCCGGGGAACGGGATCCGGGGAGGACTCTTC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CACCAGCAGCTCCACCCCGCTGGAAGACGAAGAACCCCAAGAACCCAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100538 CACCAGCAGCTCCACCCCGCTGGAAGACGAAGAACCCCAAGAACCCAACA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 GATTGGAGACAGGAGAAGCTGGGGAAG         AACTGGACCTACGA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 100588 GATTGGAGACAGGAGAAGCTGGGGAAGGTG...CAGAACTGGACCTACGA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 CTCCGACTTGCTCAGCCCTCATCGCCCGAGGTCTTGACTCCCCAGCTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100734 CTCCGACTTGCTCAGCCCTCATCGCCCGAGGTCTTGACTCCCCAGCTCAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 TCCGGGCTCTGGGACACCCCAGGCCGGTACTCCGTCCCCATCCCGATCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100784 TCCGGGCTCTGGGACACCCCAGGCCGGTACTCCGTCCCCATCCCGATCGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 GAGATTCGAACTCTGGGCCCGAAGAGCCATTGCTGGAAGAGGAAGAAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100834 GAGATTCGAACTCTGGGCCCGAAGAGCCATTGCTGGAAGAGGAAGAAAAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 CAGTGGGGGCCACTGGAGCGAGAGCCAGTAAGGGGACAGTGCCTCGATAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100884 CAGTGGGGGCCACTGGAGCGAGAGCCAGTAAGGGGACAGTGCCTCGATAG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 CACGGACCAATTAGAATTCACGGTGGAGCCACGCCTTCTAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 100934 CACGGACCAATTAGAATTCACGGTGGAGCCACGCCTTCTAGGTA...CAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 TGGCGGACCTGCTGTACTGGAAGGACACGAGGACGTCAGGAGTGGTCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105587 TGGCGGACCTGCTGTACTGGAAGGACACGAGGACGTCAGGAGTGGTCTTC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 ACAGGCCTGATGGTCTCCCTCCTCTGCCTCCTGCACTTTAGCATCGTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105637 ACAGGCCTGATGGTCTCCCTCCTCTGCCTCCTGCACTTTAGCATCGTGTC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 CGTGGCCGCGCACTTGGCTCTGTTGCTGCTCTGCGGCACCATCTCTCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105687 CGTGGCCGCGCACTTGGCTCTGTTGCTGCTCTGCGGCACCATCTCTCTCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 GGGTTTACCGCAAAGTGCTGCAGGCCGTGCACCGGGGGGATGGAGCCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105737 GGGTTTACCGCAAAGTGCTGCAGGCCGTGCACCGGGGGGATGGAGCCAAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1015 CCTTTCCA         GGCCTACCTGGATGTGGACCTCACCCTGACTCG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 105787 CCTTTCCAGTG...CAGGGCCTACCTGGATGTGGACCTCACCCTGACTCG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 GGAGCAGACGGAACGTTTGTCCCACCAGATCACCTCCCGCGTGGTCTCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106187 GGAGCAGACGGAACGTTTGTCCCACCAGATCACCTCCCGCGTGGTCTCGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1106 CGGCCACGCAGCTGCGGCACTTCTTCCTGGTAGAAGACCTCGTGGATTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106237 CGGCCACGCAGCTGCGGCACTTCTTCCTGGTAGAAGACCTCGTGGATTCC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1156 CTCAAG         CTGGCCCTCCTCTTCTACATCTTGACCTTCGTGGG
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106287 CTCAAGGTG...CAGCTGGCCCTCCTCTTCTACATCTTGACCTTCGTGGG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1197 TGCCATCTTCAATGGTTTGACTCTTCTCATTCTGG         GAGTGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 106469 TGCCATCTTCAATGGTTTGACTCTTCTCATTCTGGGTG...CAGGAGTGA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1238 TTGGTCTATTCACCATCCCCCTGCTGTACCGGCAGCACCAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 106629 TTGGTCTATTCACCATCCCCCTGCTGTACCGGCAGCACCAGGTG...CAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 GCTCAGATCGACCAATATGTGGGGTTGGTGACCAATCAGTTGAGCCACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109027 GCTCAGATCGACCAATATGTGGGGTTGGTGACCAATCAGTTGAGCCACAT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1329 CAAAGCTAA         GATCCGAGCTAAAATCCCAGGGACCGGAGCCC
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 109077 CAAAGCTAAGTA...CAGGATCCGAGCTAAAATCCCAGGGACCGGAGCCC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1370 TGGCCTCTGCAGCAGCCGCAGTCTCCGGATCCAAAGCCAAAGCCGAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109383 TGGCCTCTGCAGCAGCCGCAGTCTCCGGATCCAAAGCCAAAGCCGAA