seq1 = pF1KE2473.tfa, 2526 bp
seq2 = pF1KE2473/gi568815596r_219110230.tfa (gi568815596r:219110230_219318673), 208444 bp

>pF1KE2473 2526
>gi568815596r:219110230_219318673 (Chr2)

(complement)

1-549  (100001-100549)   99% ->
550-687  (100867-101004)   100% ->
688-868  (101842-102022)   100% ->
869-970  (102209-102310)   100% ->
971-1154  (102494-102677)   100% ->
1155-1276  (103592-103713)   100% ->
1277-1386  (104176-104285)   100% ->
1387-1452  (104488-104553)   100% ->
1453-1578  (104723-104848)   99% ->
1579-1655  (105008-105084)   100% ->
1656-1719  (105172-105235)   100% ->
1720-1805  (105348-105433)   100% ->
1806-1863  (105609-105666)   100% ->
1864-1968  (106183-106287)   100% ->
1969-2143  (107566-107740)   100% ->
2144-2256  (107851-107963)   100% ->
2257-2351  (108199-108293)   100% ->
2352-2420  (108376-108444)   100% ->
2421-2526  (108628-108733)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGTGACTGTGGGCAACTACTGCGAGGCCGAAGGGCCCGTGGGTCCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGTGACTGTGGGCAACTACTGCGAGGCCGAAGGGCCCGTGGGTCCGGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTGGATGCAGGATGGCCTGAGTCCCTGCTTCTTCTTCACGCTCGTGCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTGGATGCAGGATGGCCTGAGTCCCTGCTTCTTCTTCACGCTCGTGCCCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CGACGCGGATGGCTCTAGGGACTCTGGCCTTGGTGCTGGCTCTTCCCTGC
        |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CGACGCGGATGGCTCTGGGGACTCTGGCCTTGGTGCTGGCTCTTCCCTGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AGACGCCGGGAGCGGCCCGCTGGTGCTGATTCGCTGTCTTGGGGGGCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AGACGCCGGGAGCGGCCCGCTGGTGCTGATTCGCTGTCTTGGGGGGCCGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCCTCGCATCTCTCCCTACGTGCTGCAGCTGCTTCTGGCCACACTTCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCCTCGCATCTCTCCCTACGTGCTGCAGCTGCTTCTGGCCACACTTCAGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CGGCGCTGCCCCTGGCCGGCCTGGCTGGCCGGGTGGGCACTGCCCGGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CGGCGCTGCCCCTGGCCGGCCTGGCTGGCCGGGTGGGCACTGCCCGGGGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GCCCCACTGCCAAGCTATCTACTTCTGGCCTCCGTGCTGGAGAGTCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GCCCCACTGCCAAGCTATCTACTTCTGGCCTCCGTGCTGGAGAGTCTGGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CGGCGCCTGTGGCCTGTGGCTGCTTGTCGTGGAGCGGAGCCAGGCACGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CGGCGCCTGTGGCCTGTGGCTGCTTGTCGTGGAGCGGAGCCAGGCACGGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AGCGTCTGGCAATGGGCATCTGGATCAAGTTCAGGCACAGCCCTGGTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AGCGTCTGGCAATGGGCATCTGGATCAAGTTCAGGCACAGCCCTGGTCTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CTGCTCCTCTGGACTGTGGCGTTTGCAGCTGAGAACTTGGCCCTGGTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CTGCTCCTCTGGACTGTGGCGTTTGCAGCTGAGAACTTGGCCCTGGTGTC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TTGGAACAGCCCACAGTGGTGGTGGGCAAGGGCAGACTTGGGCCAGCAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 100501 TTGGAACAGCCCACAGTGGTGGTGGGCAAGGGCAGACTTGGGCCAGCAGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    550         GTTCAGTTTAGCCTGTGGGTGCTGCGGTATGTGGTCTCTGGA
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TG...TAGGTTCAGTTTAGCCTGTGGGTGCTGCGGTATGTGGTCTCTGGA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 GGGCTGTTTGTCCTGGGTCTCTGGGCCCCTGGACTTCGTCCCCAGTCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100909 GGGCTGTTTGTCCTGGGTCTCTGGGCCCCTGGACTTCGTCCCCAGTCCTA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 TACATTGCAGGTTCATGAAGAGGACCAAGATGTGGAAAGGAGCCAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 100959 TACATTGCAGGTTCATGAAGAGGACCAAGATGTGGAAAGGAGCCAGGTA.

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    688      GTTCGGTCAGCAGCCCAACAGTCTACCTGGCGAGATTTTGGCAGG
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101009 ..TAGGTTCGGTCAGCAGCCCAACAGTCTACCTGGCGAGATTTTGGCAGG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 AAGCTCCGCCTCCTGAGTGGCTACCTGTGGCCTCGAGGGAGTCCAGCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101887 AAGCTCCGCCTCCTGAGTGGCTACCTGTGGCCTCGAGGGAGTCCAGCTCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 GCAGCTGGTGGTGCTCATCTGCCTGGGGCTCATGGGTTTGGAACGGGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101937 GCAGCTGGTGGTGCTCATCTGCCTGGGGCTCATGGGTTTGGAACGGGCAC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    833 TCAATGTGTTGGTGCCTATATTCTATAGGAACATTG         TGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 101987 TCAATGTGTTGGTGCCTATATTCTATAGGAACATTGGTG...CAGTGAAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 TTGCTGACTGAGAAGGCACCTTGGAACTCTCTGGCCTGGACTGTTACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102214 TTGCTGACTGAGAAGGCACCTTGGAACTCTCTGGCCTGGACTGTTACCAG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    924 TTACGTCTTCCTCAAGTTCCTCCAGGGGGGTGGCACTGGCAGTACAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 102264 TTACGTCTTCCTCAAGTTCCTCCAGGGGGGTGGCACTGGCAGTACAGGTA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    971       GCTTCGTGAGCAACCTGCGCACCTTCCTGTGGATCCGGGTGCAG
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102314 ...CAGGCTTCGTGAGCAACCTGCGCACCTTCCTGTGGATCCGGGTGCAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1015 CAGTTCACGTCTCGGCGGGTGGAGCTGCTCATCTTCTCCCACCTGCACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102538 CAGTTCACGTCTCGGCGGGTGGAGCTGCTCATCTTCTCCCACCTGCACGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1065 GCTCTCACTGCGCTGGCACCTGGGGCGCCGCACAGGGGAGGTGCTGCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102588 GCTCTCACTGCGCTGGCACCTGGGGCGCCGCACAGGGGAGGTGCTGCGGA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1115 TCGCGGATCGGGGCACATCCAGTGTCACAGGGCTGCTCAG         C
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 102638 TCGCGGATCGGGGCACATCCAGTGTCACAGGGCTGCTCAGGTG...TAGC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1156 TACCTGGTGTTCAATGTCATCCCCACGCTGGCCGACATCATCATTGGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103593 TACCTGGTGTTCAATGTCATCCCCACGCTGGCCGACATCATCATTGGCAT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1206 CATCTACTTCAGCATGTTCTTCAACGCCTGGTTTGGCCTCATTGTGTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103643 CATCTACTTCAGCATGTTCTTCAACGCCTGGTTTGGCCTCATTGTGTTCC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1256 TGTGCATGAGTCTTTACCTCA         CCCTGACCATTGTGGTCACT
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 103693 TGTGCATGAGTCTTTACCTCAGTG...CAGCCCTGACCATTGTGGTCACT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1297 GAGTGGAGAACCAAGTTTCGTCGTGCTATGAACACACAGGAGAACGCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104196 GAGTGGAGAACCAAGTTTCGTCGTGCTATGAACACACAGGAGAACGCTAC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1347 CCGGGCACGAGCAGTGGACTCTCTGCTAAACTTCGAGACG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 104246 CCGGGCACGAGCAGTGGACTCTCTGCTAAACTTCGAGACGGTA...CAGG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1388 TGAAGTATTACAACGCCGAGAGTTACGAAGTGGAACGCTATCGAGAGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104489 TGAAGTATTACAACGCCGAGAGTTACGAAGTGGAACGCTATCGAGAGGCC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1438 ATCATCAAATATCAG         GGTTTGGAGTGGAAGTCGAGCGCTTC
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 104539 ATCATCAAATATCAGGTG...CAGGGTTTGGAGTGGAAGTCGAGCGCTTC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1479 ACTGGTTTTACTAAATCAGACCCAGAACCTGGTAATTGGGCTCGGGCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
 104749 ACTGGTTTTACTAAATCAGACCCAGAACCTGGTGATTGGGCTCGGGCTCC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1529 TCGCCGGCTCCCTGCTTTGCGCATACTTTGTCACTGAGCAGAAGCTACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104799 TCGCCGGCTCCCTGCTTTGCGCATACTTTGTCACTGAGCAGAAGCTACAG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1579          GTTGGGGACTATGTGCTCTTTGGCACCTACATTATCCAGCT
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104849 GTG...CAGGTTGGGGACTATGTGCTCTTTGGCACCTACATTATCCAGCT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1620 GTACATGCCCCTCAATTGGTTTGGCACCTACTACAG         GATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 105049 GTACATGCCCCTCAATTGGTTTGGCACCTACTACAGGTA...CAGGATGA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1661 TCCAGACCAACTTCATTGACATGGAGAACATGTTTGACTTGCTGAAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105177 TCCAGACCAACTTCATTGACATGGAGAACATGTTTGACTTGCTGAAAGAG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1711 GAGACAGAA         GTGAAGGACCTTCCTGGAGCAGGGCCCCTTCG
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 105227 GAGACAGAAGTG...CAGGTGAAGGACCTTCCTGGAGCAGGGCCCCTTCG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1752 CTTTCAGAAGGGCCGTATTGAGTTTGAGAACGTGCACTTCAGCTATGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105380 CTTTCAGAAGGGCCGTATTGAGTTTGAGAACGTGCACTTCAGCTATGCCG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1802 ATGG         GCGGGAGACTCTGCAGGACGTGTCTTTCACTGTGATG
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105430 ATGGGTG...CAGGCGGGAGACTCTGCAGGACGTGTCTTTCACTGTGATG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1843 CCTGGACAGACACTTGCCCTG         GTGGGCCCATCTGGGGCAGG
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 105646 CCTGGACAGACACTTGCCCTGGTG...CAGGTGGGCCCATCTGGGGCAGG

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1884 GAAGAGCACAATTTTGCGCCTGCTGTTTCGCTTCTACGACATCAGCTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106203 GAAGAGCACAATTTTGCGCCTGCTGTTTCGCTTCTACGACATCAGCTCTG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1934 GCTGCATCCGAATAGATGGGCAGGACATTTCACAG         GTGACC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 106253 GCTGCATCCGAATAGATGGGCAGGACATTTCACAGGTA...TAGGTGACC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1975 CAGGCCTCTCTCCGGTCTCACATTGGAGTTGTGCCCCAAGACACTGTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107572 CAGGCCTCTCTCCGGTCTCACATTGGAGTTGTGCCCCAAGACACTGTCCT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2025 CTTTAATGACACCATCGCCGACAATATCCGTTACGGCCGTGTCACAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107622 CTTTAATGACACCATCGCCGACAATATCCGTTACGGCCGTGTCACAGCTG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2075 GGAATGATGAGGTGGAGGCTGCTGCTCAGGCTGCAGGCATCCATGATGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107672 GGAATGATGAGGTGGAGGCTGCTGCTCAGGCTGCAGGCATCCATGATGCC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2125 ATTATGGCTTTCCCTGAAG         GGTACAGGACACAGGTGGGCGA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 107722 ATTATGGCTTTCCCTGAAGGTG...CAGGGTACAGGACACAGGTGGGCGA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2166 GCGGGGACTGAAGCTGAGCGGCGGGGAGAAGCAGCGCGTCGCCATTGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107873 GCGGGGACTGAAGCTGAGCGGCGGGGAGAAGCAGCGCGTCGCCATTGCCC

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2216 GCACCATCCTCAAGGCTCCGGGCATCATTCTGCTGGATGAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 107923 GCACCATCCTCAAGGCTCCGGGCATCATTCTGCTGGATGAGGTG...TAG

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2257 GCAACGTCAGCGCTGGATACATCTAATGAGAGGGCCATCCAGGCTTCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108199 GCAACGTCAGCGCTGGATACATCTAATGAGAGGGCCATCCAGGCTTCTCT

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2307 GGCCAAAGTCTGTGCCAACCGCACCACCATCGTAGTGGCACACAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 108249 GGCCAAAGTCTGTGCCAACCGCACCACCATCGTAGTGGCACACAGGTA..

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2352     GCTCTCAACTGTGGTCAATGCTGACCAGATCCTCGTCATCAAGGAT
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108299 .CAGGCTCTCAACTGTGGTCAATGCTGACCAGATCCTCGTCATCAAGGAT

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2398 GGCTGCATCGTGGAGAGGGGACG         ACACGAGGCTCTGTTGTC
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 108422 GGCTGCATCGTGGAGAGGGGACGGTA...CAGACACGAGGCTCTGTTGTC

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2439 CCGAGGTGGGGTGTATGCTGACATGTGGCAGCTGCAGCAGGGACAGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108646 CCGAGGTGGGGTGTATGCTGACATGTGGCAGCTGCAGCAGGGACAGGAAG

   2650     .    :    .    :    .    :    .
   2489 AAACCTCTGAAGACACTAAGCCTCAGACCATGGAACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108696 AAACCTCTGAAGACACTAAGCCTCAGACCATGGAACGG