seq1 = pF1KE2468.tfa, 1704 bp
seq2 = pF1KE2468/gi568815581r_6586210.tfa (gi568815581r:6586210_6813333), 227124 bp

>pF1KE2468 1704
>gi568815581r:6586210_6813333 (Chr17)

(complement)

1-102  (100001-100102)   100% ->
103-231  (106178-106306)   100% ->
232-368  (106556-106692)   100% ->
369-547  (109278-109456)   100% ->
548-716  (110196-110364)   100% ->
717-839  (112208-112330)   100% ->
840-1055  (117393-117608)   100% ->
1056-1156  (119137-119237)   100% ->
1157-1275  (120172-120290)   100% ->
1276-1437  (122394-122555)   100% ->
1438-1575  (125668-125805)   100% ->
1576-1704  (126996-127124)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCTCGGCGCTGAGCTATGTCTCCAAGTTCAAGTCCTTCGTGATCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCTCGGCGCTGAGCTATGTCTCCAAGTTCAAGTCCTTCGTGATCTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GTTCGTCACCCCGCTCCTGCTGCTGCCACTCGTCATTCTGATGCCCGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GTTCGTCACCCCGCTCCTGCTGCTGCCACTCGTCATTCTGATGCCCGCCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AG         TTTGTCAGGTGTGCCTACGTCATCATCCTCATGGCCATT
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGGTC...CAGTTTGTCAGGTGTGCCTACGTCATCATCCTCATGGCCATT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TACTGGTGCACAGAAGTCATCCCTCTGGCTGTCACCTCTCTCATGCCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106217 TACTGGTGCACAGAAGTCATCCCTCTGGCTGTCACCTCTCTCATGCCTGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CTTGCTTTTCCCACTCTTCCAGATTCTGGACTCCAGGCAG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 106267 CTTGCTTTTCCCACTCTTCCAGATTCTGGACTCCAGGCAGGTG...CAGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TGTGTGTCCAGTACATGAAGGACACCAACATGCTGTTCCTGGGCGGCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106557 TGTGTGTCCAGTACATGAAGGACACCAACATGCTGTTCCTGGGCGGCCTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 ATCGTGGCCGTGGCTGTGGAGCGCTGGAACCTGCACAAGAGGATCGCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106607 ATCGTGGCCGTGGCTGTGGAGCGCTGGAACCTGCACAAGAGGATCGCCCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GCGCACGCTCCTCTGGGTGGGGGCCAAGCCTGCACG         GCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 106657 GCGCACGCTCCTCTGGGTGGGGGCCAAGCCTGCACGGTA...CAGGCTGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TGCTGGGCTTCATGGGCGTCACAGCCCTCCTGTCCATGTGGATCAGTAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109283 TGCTGGGCTTCATGGGCGTCACAGCCCTCCTGTCCATGTGGATCAGTAAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 ACGGCAACCACGGCCATGATGGTGCCCATCGTGGAGGCCATATTGCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109333 ACGGCAACCACGGCCATGATGGTGCCCATCGTGGAGGCCATATTGCAGCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GATGGAAGCCACAAGCGCAGCCACCGAGGCCGGCCTGGAGCTGGTGGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109383 GATGGAAGCCACAAGCGCAGCCACCGAGGCCGGCCTGGAGCTGGTGGACA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 AGGGCAAGGCCAAGGAGCTGCCAG         GGAGTCAAGTGATTTTT
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 109433 AGGGCAAGGCCAAGGAGCTGCCAGGTG...CAGGGAGTCAAGTGATTTTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GAAGGCCCCACTCTGGGGCAGCAGGAAGACCAAGAGCGGAAGAGGTTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110213 GAAGGCCCCACTCTGGGGCAGCAGGAAGACCAAGAGCGGAAGAGGTTGTG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 TAAGGCCATGACCCTGTGCATCTGCTACGCGGCCAGCATCGGGGGCACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110263 TAAGGCCATGACCCTGTGCATCTGCTACGCGGCCAGCATCGGGGGCACCG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 CCACCCTGACCGGGACGGGACCCAACGTGGTGCTCCTGGGCCAGATGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110313 CCACCCTGACCGGGACGGGACCCAACGTGGTGCTCCTGGGCCAGATGAAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 GA         GTTGTTTCCTGACAGCAAGGACCTCGTGAACTTTGCTTC
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110363 GAGTG...TAGGTTGTTTCCTGACAGCAAGGACCTCGTGAACTTTGCTTC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 CTGGTTTGCATTTGCCTTTCCCAACATGCTGGTGATGCTGCTGTTCGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112247 CTGGTTTGCATTTGCCTTTCCCAACATGCTGGTGATGCTGCTGTTCGCCT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 GGCTGTGGCTCCAGTTTGTTTACATGAGATTCAA         TTTTAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 112297 GGCTGTGGCTCCAGTTTGTTTACATGAGATTCAAGTA...CAGTTTTAAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 AAGTCCTGGGGCTGCGGGCTAGAGAGCAAGAAAAACGAGAAGGCTGCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117400 AAGTCCTGGGGCTGCGGGCTAGAGAGCAAGAAAAACGAGAAGGCTGCCCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 CAAGGTGCTGCAGGAGGAGTACCGGAAGCTGGGGCCCTTGTCCTTCGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117450 CAAGGTGCTGCAGGAGGAGTACCGGAAGCTGGGGCCCTTGTCCTTCGCGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 AGATCAACGTGCTGATCTGCTTCTTCCTGCTGGTCATCCTGTGGTTCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117500 AGATCAACGTGCTGATCTGCTTCTTCCTGCTGGTCATCCTGTGGTTCTCC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 CGAGACCCCGGCTTCATGCCCGGCTGGCTGACTGTTGCCTGGGTGGAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117550 CGAGACCCCGGCTTCATGCCCGGCTGGCTGACTGTTGCCTGGGTGGAGGG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 TGAGACAAA         GTATGTCTCCGATGCCACTGTGGCCATCTTTG
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 117600 TGAGACAAAGTA...TAGGTATGTCTCCGATGCCACTGTGGCCATCTTTG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 TGGCCACCCTGCTATTCATTGTGCCTTCACAGAAGCCCAAGTTTAACTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119169 TGGCCACCCTGCTATTCATTGTGCCTTCACAGAAGCCCAAGTTTAACTTC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 CGCAGCCAGACTGAGGAAG         AAAGGAAAACTCCATTTTATCC
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 119219 CGCAGCCAGACTGAGGAAGGTA...CAGAAAGGAAAACTCCATTTTATCC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 CCCTCCCCTGCTGGATTGGAAGGTAACCCAGGAGAAAGTGCCCTGGGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120194 CCCTCCCCTGCTGGATTGGAAGGTAACCCAGGAGAAAGTGCCCTGGGGCA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 TCGTGCTGCTACTAGGGGGCGGATTTGCTCTGGCTAAAGGATCCGAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 120244 TCGTGCTGCTACTAGGGGGCGGATTTGCTCTGGCTAAAGGATCCGAGGTA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1276       GCCTCGGGGCTGTCCGTGTGGATGGGGAAGCAGATGGAGCCCTT
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120294 ...CAGGCCTCGGGGCTGTCCGTGTGGATGGGGAAGCAGATGGAGCCCTT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 GCACGCAGTGCCCCCGGCAGCCATCACCTTGATCTTGTCCTTGCTCGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122438 GCACGCAGTGCCCCCGGCAGCCATCACCTTGATCTTGTCCTTGCTCGTTG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1370 CCGTGTTCACTGAGTGCACAAGCAACGTGGCCACCACCACCTTGTTCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122488 CCGTGTTCACTGAGTGCACAAGCAACGTGGCCACCACCACCTTGTTCCTG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1420 CCCATCTTTGCCTCCATG         TCTCGCTCCATCGGCCTCAATCC
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 122538 CCCATCTTTGCCTCCATGGTA...CAGTCTCGCTCCATCGGCCTCAATCC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1461 GCTGTACATCATGCTGCCCTGTACCCTGAGTGCCTCCTTTGCCTTCATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125691 GCTGTACATCATGCTGCCCTGTACCCTGAGTGCCTCCTTTGCCTTCATGT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1511 TGCCTGTGGCCACCCCTCCAAATGCCATCGTGTTCACCTATGGGCACCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125741 TGCCTGTGGCCACCCCTCCAAATGCCATCGTGTTCACCTATGGGCACCTC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1561 AAGGTTGCTGACATG         GTGAAAACAGGAGTCATAATGAACAT
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 125791 AAGGTTGCTGACATGGTA...CAGGTGAAAACAGGAGTCATAATGAACAT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1602 AATTGGAGTCTTCTGTGTGTTTTTGGCTGTCAACACCTGGGGACGGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127022 AATTGGAGTCTTCTGTGTGTTTTTGGCTGTCAACACCTGGGGACGGGCCA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1652 TATTTGACTTGGATCATTTCCCTGACTGGGCTAATGTGACACATATTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127072 TATTTGACTTGGATCATTTCCCTGACTGGGCTAATGTGACACATATTGAG

   1800 
   1702 ACT
        |||
 127122 ACT