seq1 = pF1KE2467.tfa, 693 bp
seq2 = pF1KE2467/gi568815580f_63384429.tfa (gi568815580f:63384429_63593221), 208793 bp

>pF1KE2467 693
>gi568815580f:63384429_63593221 (Chr18)

1-168  (100001-100168)   100% ->
169-306  (102518-102655)   100% ->
307-424  (104919-105036)   99% ->
425-693  (108525-108793)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGATGCCCTGCAACTAGCAAATTCGGCTTTTGCCGTTGATCTGTTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGATGCCCTGCAACTAGCAAATTCGGCTTTTGCCGTTGATCTGTTCAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ACAACTATGTGAAAAGGAGCCACTGGGCAATGTCCTCTTCTCTCCAATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 ACAACTATGTGAAAAGGAGCCACTGGGCAATGTCCTCTTCTCTCCAATCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GTCTCTCCACCTCTCTGTCACTTGCTCAAGTGGGTGCTAAAGGTGACACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GTCTCTCCACCTCTCTGTCACTTGCTCAAGTGGGTGCTAAAGGTGACACT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCAAATGAAATTGGACAG         GTTCTTCATTTTGAAAATGTCAA
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 100151 GCAAATGAAATTGGACAGGTA...CAGGTTCTTCATTTTGAAAATGTCAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AGATGTACCCTTTGGATTTCAAACAGTAACATCGGATGTAAACAAACTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102541 AGATGTACCCTTTGGATTTCAAACAGTAACATCGGATGTAAACAAACTTA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GTTCCTTTTACTCACTGAAACTAATCAAGCGGCTCTACGTAGACAAATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102591 GTTCCTTTTACTCACTGAAACTAATCAAGCGGCTCTACGTAGACAAATCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CTGAATCTTTCTACA         GAGTTCATCAGCTCTACGAAGAGACC
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 102641 CTGAATCTTTCTACAGTA...CAGGAGTTCATCAGCTCTACGAAGAGACC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CTATGCAAAGGAATTGGAAACTGTTGACTTCAAAGATAAATTGGAAGAAA
         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104945 GTATGCAAAGGAATTGGAAACTGTTGACTTCAAAGATAAATTGGAAGAAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CGAAAGGTCAGATCAACAACTCAATTAAGGATCTCACAGATG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 104995 CGAAAGGTCAGATCAACAACTCAATTAAGGATCTCACAGATGGCA...CA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    425  GCCACTTTGAGAACATTTTAGCTGACAACAGTGTGAACGACCAGACCAA
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108524 GGCCACTTTGAGAACATTTTAGCTGACAACAGTGTGAACGACCAGACCAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 AATCCTTGTGGTTAATGCTGCCTACTTTGTTGGCAAGTGGATGAAGAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108574 AATCCTTGTGGTTAATGCTGCCTACTTTGTTGGCAAGTGGATGAAGAAAT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TTCCTGAATCAGAAACAAAAGAATGTCCTTTCAGAGTCAACAAGGTATGT
        || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108624 TTTCTGAATCAGAAACAAAAGAATGTCCTTTCAGAGTCAACAAGGTATGT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GGGGCAGCATGTAGCAGTAAAAGGAGCCCAATTATAGATGTGAAAAATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108674 GGGGCAGCATGTAGCAGTAAAAGGAGCCCAATTATAGATGTGAAAAATGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 CAGGGACAGAGTGGGGCATAAATCCATTCCAATGAGGAACCTGAGGGCAC
         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108724 TAGGGACAGAGTGGGGCATAAATCCATTCCAATGAGGAACCTGAGGGCAC

    700     .    :    .    :
    674 GGCCGGCAAAGTGCCTTTCC
        ||||||||||||||||||||
 108774 GGCCGGCAAAGTGCCTTTCC