seq1 = pF1KE2463.tfa, 639 bp
seq2 = pF1KE2463/gi568815577r_33803529.tfa (gi568815577r:33803529_34014502), 210974 bp

>pF1KE2463 639
>gi568815577r:33803529_34014502 (Chr21)

(complement)

1-36  (98740-98775)   97% ->
37-87  (100003-100053)   100% ->
88-198  (102104-102214)   100% ->
199-328  (105292-105421)   99% ->
329-441  (107050-107162)   100% ->
442-528  (110482-110568)   100% ->
529-639  (110864-110974)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCGCCCCAGCAGTGTCCGGGCTCTCCCGGCAG         GTGCG
        ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
  98740 ATGGCTGCCCCAGCAGTGTCCGGGCTCTCCCGGCAGGTG...AAGGTGCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 ATGCTTCAGTACCTCTGTGGTCAGACCATTTGCCAAGCTTGTGAGG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 100008 ATGCTTCAGTACCTCTGTGGTCAGACCATTTGCCAAGCTTGTGAGGGTA.

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     88      CCTCCTGTTCAGGTATACGGTATTGAAGGTCGCTATGCCACAGCT
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100058 ..AAGCCTCCTGTTCAGGTATACGGTATTGAAGGTCGCTATGCCACAGCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 CTTTATTCTGCTGCATCAAAACAGAATAAGCTGGAGCAAGTAGAAAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102149 CTTTATTCTGCTGCATCAAAACAGAATAAGCTGGAGCAAGTAGAAAAGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GTTGTTGAGAGTAGCA         CAAATCCTGAAGGAACCCAAAGTGG
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 102199 GTTGTTGAGAGTAGCAGTA...CAGCAAATCCTGAAGGAACCCAAAGTGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 CTGCTTCTGTTTTGAATCCCTATGTGAAGCGTTCCATTAAAGTGAAAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105317 CTGCTTCTGTTTTGAATCCCTATGTGAAGCGTTCCATTAAAGTGAAAAGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 CTAAATGACATCACAGCAAAAGAGAGGTTCTCTCCCCTCACTACCAACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
 105367 CTAAATGACATCACAGCAAAAGAGAGGTTCTCTCCCCTCACTACCAATCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GATCA         ATTTGCTTGCTGAAAATGGTCGATTAAGCAATACCC
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105417 GATCAGTG...CAGATTTGCTTGCTGAAAATGGTCGATTAAGCAATACCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 AAGGAGTCGTTTCTGCCTTTTCTACCATGATGAGTGTCCATCGCGGAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107086 AAGGAGTCGTTTCTGCCTTTTCTACCATGATGAGTGTCCATCGCGGAGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 GTACCTTGCACAGTGACCTCTGCATCT         CCTTTAGAAGAAGC
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 107136 GTACCTTGCACAGTGACCTCTGCATCTGTA...CAGCCTTTAGAAGAAGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 CACACTCTCTGAATTAAAAACTGTCCTCAAGAGCTTCCTAAGTCAAGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110496 CACACTCTCTGAATTAAAAACTGTCCTCAAGAGCTTCCTAAGTCAAGGCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 AAGTATTGAAATTGGAGGCTAAG         ACTGATCCGTCAATCTTG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 110546 AAGTATTGAAATTGGAGGCTAAGGTA...TAGACTGATCCGTCAATCTTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    547 GGTGGAATGATTGTGCGCATTGGCGAGAAATATGTTGACATGTCTGTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110882 GGTGGAATGATTGTGCGCATTGGCGAGAAATATGTTGACATGTCTGTCAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :
    597 GACCAAGATTCAGAAGCTGGGCAGGGCTATGCGGGAGATTGTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110932 GACCAAGATTCAGAAGCTGGGCAGGGCTATGCGGGAGATTGTC