seq1 = pF1KE2454.tfa, 2538 bp
seq2 = pF1KE2454/gi568815591f_77596470.tfa (gi568815591f:77596470_77879165), 282696 bp

>pF1KE2454 2538
>gi568815591f:77596470_77879165 (Chr7)

1-586  (100001-100586)   100% ->
587-703  (139941-140057)   100% ->
704-1344  (152955-153595)   100% ->
1345-1482  (169026-169163)   100% ->
1483-1625  (172192-172334)   100% ->
1626-1793  (176678-176845)   100% ->
1794-1902  (181869-181977)   100% ->
1903-2538  (182061-182696)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGAACCGCCGAGCCCCGTGCACTGTGTCGCTGCCGCGGCCCCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGAACCGCCGAGCCCCGTGCACTGTGTCGCTGCCGCGGCCCCCAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGCCACCGTCTCGGAGAAAGAACCGTTTGGCAAGCTGCAACTCTCCTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGCCACCGTCTCGGAGAAAGAACCGTTTGGCAAGCTGCAACTCTCCTCCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GGGACCCTCCGGGTTCTCTGTCCGCCAAGAAGGTCCGGACTGAGGAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GGGACCCTCCGGGTTCTCTGTCCGCCAAGAAGGTCCGGACTGAGGAGAAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AAGGCACCGCGGAGAGTGAACGGAGAAGGGGGCAGCGGCGGGAACAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AAGGCACCGCGGAGAGTGAACGGAGAAGGGGGCAGCGGCGGGAACAGCAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GCAGCTGCAGCCGCCGGCAGCACCTTCGCCTCAGAGCTATGGCAGCCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GCAGCTGCAGCCGCCGGCAGCACCTTCGCCTCAGAGCTATGGCAGCCCCG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CGTCTTGGAGCTTTGCCCCTCTGTCTGCTGCTCCCTCCCCGTCCTCTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CGTCTTGGAGCTTTGCCCCTCTGTCTGCTGCTCCCTCCCCGTCCTCTTCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CGGAGCAGTTTCTCTTTCTCCGCTGGCACGGCCGTTCCCTCCTCAGCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CGGAGCAGTTTCTCTTTCTCCGCTGGCACGGCCGTTCCCTCCTCAGCCTC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CGCTTCCTTGTCTCAGCCGGTGCCGCGCAAACTGCTGGTCCCTCCTACGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CGCTTCCTTGTCTCAGCCGGTGCCGCGCAAACTGCTGGTCCCTCCTACGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TGCTGCACGCTCAGCCTCACCATCTCCTCCTGCCCGCCGCCGCCGCCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TGCTGCACGCTCAGCCTCACCATCTCCTCCTGCCCGCCGCCGCCGCCGCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GCCTCGGCTAACGCCAAGTCGCGCAGACCTAAGGAGAAGCGGGAGAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GCCTCGGCTAACGCCAAGTCGCGCAGACCTAAGGAGAAGCGGGAGAAGGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GAGGAGGAGGCACGGTCTCGGTGGGGCCCGAGAGGCCGGCGGGGCCTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GAGGAGGAGGCACGGTCTCGGTGGGGCCCGAGAGGCCGGCGGGGCCTCCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GGGAGGAGAACGGGGAGGTGAAGCCGCTGCCCCGAG         ATAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 100551 GGGAGGAGAACGGGGAGGTGAAGCCGCTGCCCCGAGGTG...CAGATAAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 ATCAAAGACAAAATTAAAGAGAGAGACAAAGAAAAAGAAAGAGAAAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139946 ATCAAAGACAAAATTAAAGAGAGAGACAAAGAAAAAGAAAGAGAAAAAAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 GAAACATAAAGTAATGAATGAGATCAAGAAAGAGAATGGAGAAGTAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139996 GAAACATAAAGTAATGAATGAGATCAAGAAAGAGAATGGAGAAGTAAAGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 TTTTGCTGAAAA         GTGGGAAGGAGAAACCAAAAACAAATATA
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 140046 TTTTGCTGAAAAGTA...CAGGTGGGAAGGAGAAACCAAAAACAAATATA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 GAAGACTTACAAATTAAAAAGGTAAAGAAGAAAAAGAAAAAGAAACACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152984 GAAGACTTACAAATTAAAAAGGTAAAGAAGAAAAAGAAAAAGAAACACAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 AGAGAATGAAAAACGGAAGCGTCCGAAAATGTATAGCAAATCTATTCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153034 AGAGAATGAAAAACGGAAGCGTCCGAAAATGTATAGCAAATCTATTCAGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    833 CCATCTGCTCAGGATTGCTAACTGATGTTGAAGATCAAGCAGCCAAAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153084 CCATCTGCTCAGGATTGCTAACTGATGTTGAAGATCAAGCAGCCAAAGGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    883 ATCCTAAATGATAACATAAAAGATTACGTTGGGAAGAATTTGGATACCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153134 ATCCTAAATGATAACATAAAAGATTACGTTGGGAAGAATTTGGATACCAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    933 GAACTATGATTCCAAAATTCCAGAGAACAGTGAGTTTCCATTTGTCTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153184 GAACTATGATTCCAAAATTCCAGAGAACAGTGAGTTTCCATTTGTCTCAT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    983 TAAAGGAGCCACGAGTTCAGAATAACCTCAAAAGGTTGGACACTTTGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153234 TAAAGGAGCCACGAGTTCAGAATAACCTCAAAAGGTTGGACACTTTGGAA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1033 TTTAAACAACTCATTCATATAGAGCACCAGCCTAATGGAGGTGCATCGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153284 TTTAAACAACTCATTCATATAGAGCACCAGCCTAATGGAGGTGCATCGGT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1083 TATCCATGCCTACAGTAACGAACTCTCCCACCTGTCTCCTATGGAGATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153334 TATCCATGCCTACAGTAACGAACTCTCCCACCTGTCTCCTATGGAGATGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1133 AGAGGTTTGCAGAAGAGTTTGTGGGTCTAGTGTTCAGTGAAAATGAAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153384 AGAGGTTTGCAGAAGAGTTTGTGGGTCTAGTGTTCAGTGAAAATGAAAAC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1183 TCTGCAGCTTTCTACGTGATGGGTATTGTTCATGGGGCAGCTACTTATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153434 TCTGCAGCTTTCTACGTGATGGGTATTGTTCATGGGGCAGCTACTTATTT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1233 ACCTGACTTTTTAGACTATTTTTCATTTAATTTTCCCAATTCACCAGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153484 ACCTGACTTTTTAGACTATTTTTCATTTAATTTTCCCAATTCACCAGTGA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1283 AAATGGAGATATTGGGAAAGAAAGATATAGAGACAACGACTATGTCCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153534 AAATGGAGATATTGGGAAAGAAAGATATAGAGACAACGACTATGTCCAAT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1333 TTTCATGCTCAG         GTAAAAAGAACGTATTCTCATGGTACTTA
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 153584 TTTCATGCTCAGGTA...CAGGTAAAAAGAACGTATTCTCATGGTACTTA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1374 CAGAGCTGGCCCAATGAGACAAATAAGCTTGGTGGGAGCAGTTGATGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 169055 CAGAGCTGGCCCAATGAGACAAATAAGCTTGGTGGGAGCAGTTGATGAAG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1424 AAGTAGGAGATTATTTCCCTGAGTTCCTTGACATGTTGGAAGAGTCACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 169105 AAGTAGGAGATTATTTCCCTGAGTTCCTTGACATGTTGGAAGAGTCACCA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1474 TTTTTAAAA         TGTACACTGCCATGGGGGACGCTATCTAGTCT
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 169155 TTTTTAAAAGTA...CAGTGTACACTGCCATGGGGGACGCTATCTAGTCT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1515 AAAATTACAGAGTCGAAAAGATAGTGATGATGGTCCCATCATGTGGGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 172224 AAAATTACAGAGTCGAAAAGATAGTGATGATGGTCCCATCATGTGGGTTC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1565 GTCCAGGAGAACAAATGATCCCTGTGGCTGATATGCCAAAGTCACCTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 172274 GTCCAGGAGAACAAATGATCCCTGTGGCTGATATGCCAAAGTCACCTTTC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1615 AAAAGGAAAAG         AACTACCAATGAAATAAAAAATCTTCAGTA
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 172324 AAAAGGAAAAGGTA...CAGAACTACCAATGAAATAAAAAATCTTCAGTA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1656 CCTACCTCGAACAAGTGAGCCCCGTGAGATGCTCTTTGAAGACAGGACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 176708 CCTACCTCGAACAAGTGAGCCCCGTGAGATGCTCTTTGAAGACAGGACAA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1706 GAGCTCATGCAGATCATATAGGACAAGGTTTTGAACGACAGACTACAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 176758 GAGCTCATGCAGATCATATAGGACAAGGTTTTGAACGACAGACTACAGCT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1756 GCTGTTGGAGTGCTGAAGGCTGTGCACTGTGGAGAGTG         GCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 176808 GCTGTTGGAGTGCTGAAGGCTGTGCACTGTGGAGAGTGGTA...TAGGCC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1797 TGATCAACCCCGTATAACCAAAGATGTAATTTGTTTTCATGCTGAAGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 181872 TGATCAACCCCGTATAACCAAAGATGTAATTTGTTTTCATGCTGAAGATT

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1847 TCTTAGAAGTAGTTCAACGAATGCAGTTAGATTTACATGAACCTCCACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 181922 TCTTAGAAGTAGTTCAACGAATGCAGTTAGATTTACATGAACCTCCACTG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1897 TCCCAG         TGTGTCCAATGGGTTGATGATGCAAAACTGAATCA
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 181972 TCCCAGGTA...TAGTGTGTCCAATGGGTTGATGATGCAAAACTGAATCA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1938 ACTGAGGAGGGAAGGCATTCGCTATGCCAGGATTCAGCTATATGATAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182096 ACTGAGGAGGGAAGGCATTCGCTATGCCAGGATTCAGCTATATGATAATG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1988 ACATTTATTTTATTCCAAGGAATGTTGTTCATCAGTTCAAGACAGTTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182146 ACATTTATTTTATTCCAAGGAATGTTGTTCATCAGTTCAAGACAGTTTCA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2038 GCTGTATGCAGTTTAGCATGGCATATTCGGCTCAAATTATATCACTCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182196 GCTGTATGCAGTTTAGCATGGCATATTCGGCTCAAATTATATCACTCAGA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2088 GGAGGACACTTCTCAGAATACAGCTACTCATGAAACAGGCACATCATCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182246 GGAGGACACTTCTCAGAATACAGCTACTCATGAAACAGGCACATCATCAG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2138 ATTCCACATCATCTGTTCTTGGACCTCACACTGACAACATGATTTGTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182296 ATTCCACATCATCTGTTCTTGGACCTCACACTGACAACATGATTTGTGCT

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2188 GTAAGCAAAGCCTCCTTGGATTCTGTTTTTTCAGATAAACTTCATTCTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182346 GTAAGCAAAGCCTCCTTGGATTCTGTTTTTTCAGATAAACTTCATTCTAA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2238 ATATGAATTACAGCAGATTAAACATGAACCTATTGCATCTGTAAGAATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182396 ATATGAATTACAGCAGATTAAACATGAACCTATTGCATCTGTAAGAATCA

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2288 AGGAAGAACCTGTGAATGTTAATATTCCTGAAAAGACTACAGCACTGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182446 AGGAAGAACCTGTGAATGTTAATATTCCTGAAAAGACTACAGCACTGAAT

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2338 AATATGGATGGCAAGAATGTTAAAGCAAAATTGGATCATGTTCAATTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182496 AATATGGATGGCAAGAATGTTAAAGCAAAATTGGATCATGTTCAATTTGC

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2388 AGAATTTAAGATTGACATGGATTCTAAATTTGAAAATAGCAACAAAGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182546 AGAATTTAAGATTGACATGGATTCTAAATTTGAAAATAGCAACAAAGATT

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2438 TAAAGGAAGAATTGTGCCCTGGAAATCTAAGTCTAGTTGATACAAGGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182596 TAAAGGAAGAATTGTGCCCTGGAAATCTAAGTCTAGTTGATACAAGGCAA

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2488 CACAGTTCAGCACATTCAAATCAAGATAAAAAAGACGATGACATTTTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182646 CACAGTTCAGCACATTCAAATCAAGATAAAAAAGACGATGACATTTTGTG

   2600 
   2538 C
        |
 182696 C