seq1 = pF1KE2451.tfa, 1134 bp
seq2 = pF1KE2451/gi568815593r_156819460.tfa (gi568815593r:156819460_157063198), 243739 bp

>pF1KE2451 1134
>gi568815593r:156819460_157063198 (Chr5)

(complement)

1-58  (100001-100058)   100% ->
59-400  (108443-108784)   100% ->
401-679  (111409-111687)   100% ->
680-760  (113468-113548)   98% ->
761-844  (114700-114783)   100% ->
845-894  (136887-136936)   100% ->
895-1012  (140983-141100)   100% ->
1013-1052  (142696-142735)   100% ->
1053-1134  (143658-143739)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCCAAAGAACCTCTCATTCTCTGGCTGATGATTGAGTTTTGGTGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCCAAAGAACCTCTCATTCTCTGGCTGATGATTGAGTTTTGGTGGCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TTACCTGA         CACCAGTCACTTCAGAGACTGTTGTGACGGAGG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TTACCTGAGTA...CAGCACCAGTCACTTCAGAGACTGTTGTGACGGAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TTTTGGGTCACCGGGTGACTTTGCCCTGTCTGTACTCATCCTGGTCTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108476 TTTTGGGTCACCGGGTGACTTTGCCCTGTCTGTACTCATCCTGGTCTCAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AACAGCAACAGCATGTGCTGGGGGAAAGACCAGTGCCCCTACTCCGGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108526 AACAGCAACAGCATGTGCTGGGGGAAAGACCAGTGCCCCTACTCCGGTTG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CAAGGAGGCGCTCATCCGCACTGATGGAATGAGGGTGACCTCAAGAAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108576 CAAGGAGGCGCTCATCCGCACTGATGGAATGAGGGTGACCTCAAGAAAGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CAGCAAAATATAGACTTCAGGGGACTATCCCGAGAGGTGATGTCTCCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108626 CAGCAAAATATAGACTTCAGGGGACTATCCCGAGAGGTGATGTCTCCTTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 ACCATCTTAAACCCCAGTGAAAGTGACAGCGGTGTGTACTGCTGCCGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108676 ACCATCTTAAACCCCAGTGAAAGTGACAGCGGTGTGTACTGCTGCCGCAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 AGAAGTGCCTGGCTGGTTCAACGATGTAAAGATAAACGTGCGCCTGAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108726 AGAAGTGCCTGGCTGGTTCAACGATGTAAAGATAAACGTGCGCCTGAATC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 TACAGAGAG         CCTCAACAACCACGCACAGAACAGCAACCACC
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 108776 TACAGAGAGGTA...CAGCCTCAACAACCACGCACAGAACAGCAACCACC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 ACCACACGCAGAACAACAACAACAAGCCCCACCACCACCCGACAAATGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111441 ACCACACGCAGAACAACAACAACAAGCCCCACCACCACCCGACAAATGAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 AACAACCCCAGCTGCACTTCCAACAACAGTCGTGACCACACCCGATCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111491 AACAACCCCAGCTGCACTTCCAACAACAGTCGTGACCACACCCGATCTCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 CAACCGGAACACCACTCCAGATGACAACCATTGCCGTCTTCACAACAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111541 CAACCGGAACACCACTCCAGATGACAACCATTGCCGTCTTCACAACAGCA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 AACACGTGCCTTTCACTAACCCCAAGCACCCTTCCGGAGGAAGCCACAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111591 AACACGTGCCTTTCACTAACCCCAAGCACCCTTCCGGAGGAAGCCACAGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 TCTTCTGACTCCCGAGCCTTCTAAGGAAGGGCCCATCCTCACTGCAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 111641 TCTTCTGACTCCCGAGCCTTCTAAGGAAGGGCCCATCCTCACTGCAGGTA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    680       AATCAGAAACTGTCCTCCCCAGTGATTCCTGGAGTAGTGCTGAG
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
 111691 ...CAGAATCAGAAACTGTCCTCCCCAGTGATTCCTGGAGTAGTGTTGAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 TCTACTTCTGCTGACACTGTCCTGCTGACATCCAAAG         AGTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 113512 TCTACTTCTGCTGACACTGTCCTGCTGACATCCAAAGGTG...AAGAGTC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 CAAAGTTTGGGATCTCCCATCAACATCCCACGTGTCAATGTGGAAAACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114704 CAAAGTTTGGGATCTCCCATCAACATCCCACGTGTCAATGTGGAAAACGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 GTGATTCTGTGTCTTCTCCTCAGCCTGGAG         CATCTGATACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 114754 GTGATTCTGTGTCTTCTCCTCAGCCTGGAGGTA...CAGCATCTGATACA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 GCAGTTCCTGAGCAGAACAAAACAACAAAAACAGGACAG         AT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 136898 GCAGTTCCTGAGCAGAACAAAACAACAAAAACAGGACAGGTA...CAGAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 GGATGGAATACCCATGTCAATGAAGAATGAAATGCCCATCTCCCAACTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140985 GGATGGAATACCCATGTCAATGAAGAATGAAATGCCCATCTCCCAACTAC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 TGATGATCATCGCCCCCTCCTTGGGATTTGTGCTCTTCGCATTGTTTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141035 TGATGATCATCGCCCCCTCCTTGGGATTTGTGCTCTTCGCATTGTTTGTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 GCGTTTCTCCTGAGAG         GGAAACTCATGGAAACCTATTGTTC
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 141085 GCGTTTCTCCTGAGAGGTA...CAGGGAAACTCATGGAAACCTATTGTTC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 GCAGAAACACACAAG         GCTAGACTACATTGGAGATAGTAAAA
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 142721 GCAGAAACACACAAGGTA...CAGGCTAGACTACATTGGAGATAGTAAAA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 ATGTCCTCAATGACGTGCAGCATGGAAGGGAAGACGAAGACGGCCTTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143684 ATGTCCTCAATGACGTGCAGCATGGAAGGGAAGACGAAGACGGCCTTTTT

   1200     .
   1129 ACCCTC
        ||||||
 143734 ACCCTC