seq1 = pF1KE2443.tfa, 963 bp
seq2 = pF1KE2443/gi568815583r_34652481.tfa (gi568815583r:34652481_34854488), 202008 bp

>pF1KE2443 963
>gi568815583r:34652481_34854488 (Chr15)

(complement)

1-71  (100001-100071)   100% ->
72-963  (101117-102008)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGGGAATGGACCATCTTGGAGAGGCTGCTAGAAGCCGCGGTGCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGGGAATGGACCATCTTGGAGAGGCTGCTAGAAGCCGCGGTGCAGCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCACTCCACTATGATCGGGAG         GATCCTGTTGACTGTGGTGG
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 100051 GCACTCCACTATGATCGGGAGGTA...CAGGATCCTGTTGACTGTGGTGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TGATCTTCCGGATCCTCATTGTGGCCATTGTGGGGGAGACGGTGTACGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101137 TGATCTTCCGGATCCTCATTGTGGCCATTGTGGGGGAGACGGTGTACGAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GATGAGCAGACCATGTTTGTGTGCAACACCCTGCAGCCCGGCTGTAACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101187 GATGAGCAGACCATGTTTGTGTGCAACACCCTGCAGCCCGGCTGTAACCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GGCCTGCTATGACCGCGCCTTCCCCATCTCCCACATACGTTACTGGGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101237 GGCCTGCTATGACCGCGCCTTCCCCATCTCCCACATACGTTACTGGGTCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TCCAGATCATAATGGTGTGTACCCCCAGTCTTTGCTTCATCACCTACTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101287 TCCAGATCATAATGGTGTGTACCCCCAGTCTTTGCTTCATCACCTACTCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GTGCACCAGTCCGCCAAGCAGCGAGAACGCCGCTACTCTACTGTCTTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
 101337 GTGCACCAGTCCGCCAAGCAGCGAGAACGCCGCTACTCTACAGTCTTCCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 AGCCCTGGACAGAGACCCCCCTGAGTCCATAGGAGGTCCTGGAGGAACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101387 AGCCCTGGACAGAGACCCCCCTGAGTCCATAGGAGGTCCTGGAGGAACTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 GGGGTGGGGGCAGTGGTGGGGGCAAACGAGAAGATAAGAAGTTGCAAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101437 GGGGTGGGGGCAGTGGTGGGGGCAAACGAGAAGATAAGAAGTTGCAAAAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 GCTATTGTGAATGGGGTGCTGCAGAACACAGAGAACACCAGTAAGGAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101487 GCTATTGTGAATGGGGTGCTGCAGAACACAGAGAACACCAGTAAGGAGAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 AGAGCCAGATTGTTTAGAGGTTAAGGAGCTGACTCCACACCCATCAGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101537 AGAGCCAGATTGTTTAGAGGTTAAGGAGCTGACTCCACACCCATCAGGTC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 TACGCACTGCATCAAAATCCAAGCTCAGAAGGCAGGAAGGCATCTCTCGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
 101587 TACGCACTGCATCAAAATCCAAGCTCAGAAGGCAGGAAGGCATCTCCCGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 TTCTACATTATCCAAGTGGTGTTCCGAAATGCCCTGGAAATTGGGTTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101637 TTCTACATTATCCAAGTGGTGTTCCGAAATGCCCTGGAAATTGGGTTCCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 GGTTGGCCAATATTTTCTCTATGGCTTTAGTGTCCCAGGGTTGTATGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101687 GGTTGGCCAATATTTTCTCTATGGCTTTAGTGTCCCAGGGTTGTATGAGT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 GTAACCGCTACCCCTGCATCAAGGAGGTGGAATGTTATGTGTCCCGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101737 GTAACCGCTACCCCTGCATCAAGGAGGTGGAATGTTATGTGTCCCGGCCA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 ACTGAGAAGACTGTCTTTCTAGTGTTCATGTTTGCTGTAAGTGGCATCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101787 ACTGAGAAGACTGTCTTTCTAGTGTTCATGTTTGCTGTAAGTGGCATCTG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 TGTTGTACTCAACCTGGCTGAACTCAACCACCTGGGATGGCGCAAGATCA
        |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101837 TGTTGTGCTCAACCTGGCTGAACTCAACCACCTGGGATGGCGCAAGATCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 AGCTGGCTGTGCGAGGGGCTCAGGCCAAGAGAAAGTCAATCTATGAGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101887 AGCTGGCTGTGCGAGGGGCTCAGGCCAAGAGAAAGTCAATCTATGAGATT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 CGTAACAAGGACCTGCCAAGGGTCAGTGTTCCCAATTTTGGCAGGACTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101937 CGTAACAAGGACCTGCCAAGGGTCAGTGTTCCCAATTTTGGCAGGACTCA

    950     .    :    .    :
    942 GTCCAGTGACTCTGCCTATGTG
        ||||||||||||||||||||||
 101987 GTCCAGTGACTCTGCCTATGTG