seq1 = pF1KE2435.tfa, 999 bp
seq2 = pF1KE2435/gi568815591r_141872691.tfa (gi568815591r:141872691_142073689), 200999 bp

>pF1KE2435 999
>gi568815591r:141872691_142073689 (Chr7)

(complement)

1-999  (100001-100999)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTTGACTCTAACTCGCATCCGCACTGTGTCCTATGAAGTCAGGAGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTTGACTCTAACTCGCATCCGCACTGTGTCCTATGAAGTCAGGAGTAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ATTTCTGTTCATTTCAGTCCTGGAGTTTGCAGTGGGGTTTCTGACCAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 ATTTCTGTTCATTTCAGTCCTGGAGTTTGCAGTGGGGTTTCTGACCAATG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCTTCGTTTTCTTGGTGAATTTTTGGGATGTAGTGAAGAGGCAGGCACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCTTCGTTTTCTTGGTGAATTTTTGGGATGTAGTGAAGAGGCAGGCACTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AGCAACAGTGATTGTGTGCTGCTGTGTCTCAGCATCAGCCGGCTTTTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AGCAACAGTGATTGTGTGCTGCTGTGTCTCAGCATCAGCCGGCTTTTCCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GCATGGACTGCTGTTCCTGAGTGCTATCCAGCTTACCCACTTCCAGAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GCATGGACTGCTGTTCCTGAGTGCTATCCAGCTTACCCACTTCCAGAAGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGAGTGAACCACTGAACCACAGCTACCAAGCCATCATCATGCTATGGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGAGTGAACCACTGAACCACAGCTACCAAGCCATCATCATGCTATGGATG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ATTGCAAACCAAGCCAACCTCTGGCTTGCTGCCTGCCTCAGCCTGCTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ATTGCAAACCAAGCCAACCTCTGGCTTGCTGCCTGCCTCAGCCTGCTTTA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CTGCTCCAAGCTCATCCGTTTCTCTCACACCTTCCTGATCTGCTTGGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CTGCTCCAAGCTCATCCGTTTCTCTCACACCTTCCTGATCTGCTTGGCAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GCTGGGTCTCCAGGAAGATCTCCCAGATGCTCCTGGGTATTATTCTTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GCTGGGTCTCCAGGAAGATCTCCCAGATGCTCCTGGGTATTATTCTTTGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TCCTGCATCTGCACTGTCCTCTGTGTTTGGTGCTTTTTTAGCAGACCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TCCTGCATCTGCACTGTCCTCTGTGTTTGGTGCTTTTTTAGCAGACCTCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CTTCACAGTCACAACTGTGCTATTCATGAATAACAATACAAGGCTCAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CTTCACAGTCACAACTGTGCTATTCATGAATAACAATACAAGGCTCAACT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GGCAGATTAAAGATCTCAATTTATTTTATTCCTTTCTCTTCTGCTATCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 GGCAGATTAAAGATCTCAATTTATTTTATTCCTTTCTCTTCTGCTATCTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 TGGTCTGTGCCTCCTTTCCTATTGTTTCTGGTTTCTTCTGGGATGCTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 TGGTCTGTGCCTCCTTTCCTATTGTTTCTGGTTTCTTCTGGGATGCTGAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TGTCTCCCTGGGAAGGCACATGAGGACAATGAAGGTCTATACCAGAAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TGTCTCCCTGGGAAGGCACATGAGGACAATGAAGGTCTATACCAGAAACT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CTCGTGACCCCAGCCTGGAGGCCCACATTAAAGCCCTCAAGTCTCTTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 CTCGTGACCCCAGCCTGGAGGCCCACATTAAAGCCCTCAAGTCTCTTGTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TCCTTTTTCTGCTTCTTTGTGATATCATCCTGTGTTGCCTTCATCTCTGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
 100751 TCCTTTTTCTGCTTCTTTGTGATATCATCCTGTGCTGCCTTCATCTCTGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GCCCCTACTGATTCTGTGGCGCGACAAAATAGGGGTGATGGTTTGTGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GCCCCTACTGATTCTGTGGCGCGACAAAATAGGGGTGATGGTTTGTGTTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 GGATAATGGCAGCTTGTCCCTCTGGGCATGCAGCCATCCTGATCTCAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 GGATAATGGCAGCTTGTCCCTCTGGGCATGCAGCCATCCTGATCTCAGGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 AATGCCAAGTTGAGGAGAGCTGTGATGACCATTCTGCTCTGGGCTCAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 AATGCCAAGTTGAGGAGAGCTGTGATGACCATTCTGCTCTGGGCTCAGAG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    951 CAGCCTGAAGGTAAGAGCCGACCACAAGGCAGATTCCCGGACACTGTGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 CAGCCTGAAGGTAAGAGCCGACCACAAGGCAGATTCCCGGACACTGTGC