seq1 = pF1KE2431.tfa, 927 bp
seq2 = pF1KE2431/gi568815586r_10991303.tfa (gi568815586r:10991303_11192229), 200927 bp

>pF1KE2431 927
>gi568815586r:10991303_11192229 (Chr12)

(complement)

1-927  (100001-100927)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGATAACTTTTCTACCCATCATTTTTTCCAGTCTGGTAGTGGTTACATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGATAACTTTTCTACCCATCATTTTTTCCAGTCTGGTAGTGGTTACATT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGTTATTGGAAATTTTGCTAATGGCTTCATAGCACTGGTAAATTCCATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGTTATTGGAAATTTTGCTAATGGCTTCATAGCACTGGTAAATTCCATTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGTCGTTCAAGAGACAAAAGATCTCCTTTGCTGACCAAATTCTCACTGCT
        ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGTGGTTCAAGAGACAAAAGATCTCCTTTGCTGACCAAATTCTCACTGCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTGGCGGTCTCCAGAGTTGGTTTGCTCTGGGTATTATTATTAAACTGGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CTGGCGGTCTCCAGAGTTGGTTTGCTCTGGGTATTATTATTAAACTGGTA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TTCAACTGTGTTGAATCCAGCTTTTAATAGTGTAGAAGTAAGAACTACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TTCAACTGTGTTGAATCCAGCTTTTAATAGTGTAGAAGTAAGAACTACTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CTTATAATATCTGGGCAGTGATCAACCATTTCAGCAACTGGCTTGCTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CTTATAATATCTGGGCAGTGATCAACCATTTCAGCAACTGGCTTGCTACT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ACCCTCAGCATATTTTATTTGCTCAAGATTGCCAATTTCTCCAACTTTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ACCCTCAGCATATTTTATTTGCTCAAGATTGCCAATTTCTCCAACTTTAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TTTTCTTCACTTAAAGAGGAGAGTTAAGAGTGTCATTCTGGTGATGTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TTTTCTTCACTTAAAGAGGAGAGTTAAGAGTGTCATTCTGGTGATGTTGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TGGGGCCTTTGCTATTTTTGGCTTGTCATCTTTTTGTGATAAACATGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TGGGGCCTTTGCTATTTTTGGCTTGTCATCTTTTTGTGATAAACATGAAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GAGATTGTGCGGACAAAAGAATTTGAAGGAAACATGACTTGGAAGATCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GAGATTGTGCGGACAAAAGAATTTGAAGGAAACATGACTTGGAAGATCAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 ATTGAAGAGTGCAATGTACTTTTCAAATATGACTGTAACCATGGTAGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 ATTGAAGAGTGCAATGTACTTTTCAAATATGACTGTAACCATGGTAGCAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 ACTTAGTACCCTTCACTCTGACCCTACTATCTTTTATGCTGTTAATCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 ACTTAGTACCCTTCACTCTGACCCTACTATCTTTTATGCTGTTAATCTGT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 TCTTTGTGTAAACATCTCAAGAAGATGCAGCTCCGTGGTAAAGGATCTCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
 100601 TCTTTGTGTAAACATCTCAAGAAGATGCAGCTCCATGGTAAAGGATCTCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 AGATCCCAGCACGAAGGTCCACATAAAAGCTTTGCAAACTGTGATCTCCT
        |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 AGATCCCAGCACCAAGGTCCACATAAAAGCTTTGCAAACTGTGATCTCCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TCCTCTTGTTATGTGCCATTTACTTTCTGTCCATAATGATATCAGTTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TCCTCTTGTTATGTGCCATTTACTTTCTGTCCATAATGATATCAGTTTGG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 AGTTTTGGAAGTCTGGAAAACAAACCTGTCTTCATGTTCTGCAAAGCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 AGTTTTGGAAGTCTGGAAAACAAACCTGTCTTCATGTTCTGCAAAGCTAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TAGATTCAGCTATCCTTCAATCCACCCATTCATCCTGATTTGGGGAAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TAGATTCAGCTATCCTTCAATCCACCCATTCATCCTGATTTGGGGAAACA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 AGAAGCTAAAGCAGACTTTTCTTTCAGTTTTTTGGCAAATGAGGTACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 AGAAGCTAAAGCAGACTTTTCTTTCAGTTTTTTGGCAAATGAGGTACTGG

    900     .    :    .    :    .
    901 GTGAAAGGAGAGAAGACTTCATCTCCA
        |||||||||||||||||||||||||||
 100901 GTGAAAGGAGAGAAGACTTCATCTCCA