seq1 = pF1KE2418.tfa, 2517 bp
seq2 = pF1KE2418/gi568815581r_3466818.tfa (gi568815581r:3466818_3692350), 225533 bp

>pF1KE2418 2517
>gi568815581r:3466818_3692350 (Chr17)

(complement)

1-284  (100001-100284)   100% ->
285-451  (100998-101164)   100% ->
452-604  (101235-101387)   99% ->
605-745  (101959-102099)   100% ->
746-1044  (102246-102544)   99% ->
1045-1224  (103984-104163)   100% ->
1225-1383  (106425-106583)   100% ->
1384-1476  (108921-109013)   98% ->
1477-1547  (111824-111894)   100% ->
1548-1713  (114588-114753)   100% ->
1714-1780  (115159-115225)   100% ->
1781-2103  (118396-118718)   100% ->
2104-2231  (120102-120229)   100% ->
2232-2347  (120712-120827)   100% ->
2348-2517  (125364-125533)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAGAAATGGAGCAGCACAGACTTGGGGGCAGCTGCGGACCCACTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAAGAAATGGAGCAGCACAGACTTGGGGGCAGCTGCGGACCCACTCCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AAAGGACACCTGCCCAGACCCCCTGGATGGAGACCCTAACTCCAGGCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AAAGGACACCTGCCCAGACCCCCTGGATGGAGACCCTAACTCCAGGCCAC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CTCCAGCCAAGCCCCAGCTCTCCACGGCCAAGAGCCGCACCCGGCTCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CTCCAGCCAAGCCCCAGCTCTCCACGGCCAAGAGCCGCACCCGGCTCTTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GGGAAGGGTGACTCGGAGGAGGCTTTCCCGGTGGATTGCCCTCACGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GGGAAGGGTGACTCGGAGGAGGCTTTCCCGGTGGATTGCCCTCACGAGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 AGGTGAGCTGGACTCCTGCCCGACCATCACAGTCAGCCCTGTTATCACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 AGGTGAGCTGGACTCCTGCCCGACCATCACAGTCAGCCCTGTTATCACCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TCCAGAGGCCAGGAGACGGCCCCACCGGTGCCAG         GCTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 100251 TCCAGAGGCCAGGAGACGGCCCCACCGGTGCCAGGTA...CAGGCTGCTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TCCCAGGACTCTGTCGCCGCCAGCACCGAGAAGACCCTCAGGCTCTATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101005 TCCCAGGACTCTGTCGCCGCCAGCACCGAGAAGACCCTCAGGCTCTATGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 TCGCAGGAGTATCTTTGAAGCCGTTGCTCAGAATAACTGCCAGGATCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101055 TCGCAGGAGTATCTTTGAAGCCGTTGCTCAGAATAACTGCCAGGATCTGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 AGAGCCTGCTGCTCTTCCTGCAGAAGAGCAAGAAGCACCTCACAGACAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101105 AGAGCCTGCTGCTCTTCCTGCAGAAGAGCAAGAAGCACCTCACAGACAAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 GAGTTCAAAG         ACCCTGAGACAGGGAAGACCTGTCTGCTGAA
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 101155 GAGTTCAAAGGTG...CAGACCCTGAGACAGGGAAGACCTGTCTGCTGAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 AGCCATGCTCAACCTGCATGACGGACAGAACACCACCATCCCCCTGCTCC
        |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
 101266 AGCCATGCTCAACCTGCACGACGGACAGAACACCACCATCCCCCTGCTCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 TGGAGATCGCGCGGCAAACGGACAGCCTGAAGGAGCTTGTCAACGCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101316 TGGAGATCGCGCGGCAAACGGACAGCCTGAAGGAGCTTGTCAACGCCAGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 TACACGGACAGCTACTACAAGG         GCCAGACAGCACTGCACAT
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 101366 TACACGGACAGCTACTACAAGGGTG...TAGGCCAGACAGCACTGCACAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 CGCCATCGAGAGACGCAACATGGCCCTGGTGACCCTCCTGGTGGAGAACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101978 CGCCATCGAGAGACGCAACATGGCCCTGGTGACCCTCCTGGTGGAGAACG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 GAGCAGACGTCCAGGCTGCGGCCCATGGGGACTTCTTTAAGAAAACCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102028 GAGCAGACGTCCAGGCTGCGGCCCATGGGGACTTCTTTAAGAAAACCAAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 GGGCGGCCTGGATTCTACTTCG         GTGAACTGCCCCTGTCCCT
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 102078 GGGCGGCCTGGATTCTACTTCGGTA...CAGGTGAACTGCCCCTGTCCCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 GGCCGCGTGCACCAACCAGCTGGGCATCGTGAAGTTCCTGCTGCAGAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102265 GGCCGCGTGCACCAACCAGCTGGGCATCGTGAAGTTCCTGCTGCAGAACT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 CCTGGCAGACGGCCGACATCAGCGCCAGGGACTCGGTGGGCAACACGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102315 CCTGGCAGACGGCCGACATCAGCGCCAGGGACTCGGTGGGCAACACGGTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 CTGCACGCCCTGGTGGAGGTGGCCGACAACACGGCCGACAACACGAAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102365 CTGCACGCCCTGGTGGAGGTGGCCGACAACACGGCCGACAACACGAAGTT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 TGTGACGAGCATGTACAATGAGATTCTGATCCTGGGGGCCAAACTGCACC
        |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
 102415 TGTGACGAGCATGTACAATGAGATTCTGATGCTGGGGGCCAAACTGCACC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 CGACGCTGAAGCTGGAGGAGCTCACCAACAAGAAGGGAATGACGCCGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102465 CGACGCTGAAGCTGGAGGAGCTCACCAACAAGAAGGGAATGACGCCGCTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1015 GCTCTGGCAGCTGGGACCGGGAAGATCGGG         GTCTTGGCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 102515 GCTCTGGCAGCTGGGACCGGGAAGATCGGGGTA...CAGGTCTTGGCCTA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 TATTCTCCAGCGGGAGATCCAGGAGCCCGAGTGCAGGCACCTGTCCAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103995 TATTCTCCAGCGGGAGATCCAGGAGCCCGAGTGCAGGCACCTGTCCAGGA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1106 AGTTCACCGAGTGGGCCTACGGGCCCGTGCACTCCTCGCTGTACGACCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104045 AGTTCACCGAGTGGGCCTACGGGCCCGTGCACTCCTCGCTGTACGACCTG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1156 TCCTGCATCGACACCTGCGAGAAGAACTCGGTGCTGGAGGTGATCGCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104095 TCCTGCATCGACACCTGCGAGAAGAACTCGGTGCTGGAGGTGATCGCCTA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1206 CAGCAGCAGCGAGACCCCT         AATCGCCACGACATGCTCTTGG
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 104145 CAGCAGCAGCGAGACCCCTGTG...TAGAATCGCCACGACATGCTCTTGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1247 TGGAGCCGCTGAACCGACTCCTGCAGGACAAGTGGGACAGATTCGTCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106447 TGGAGCCGCTGAACCGACTCCTGCAGGACAAGTGGGACAGATTCGTCAAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1297 CGCATCTTCTACTTCAACTTCCTGGTCTACTGCCTGTACATGATCATCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106497 CGCATCTTCTACTTCAACTTCCTGGTCTACTGCCTGTACATGATCATCTT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1347 CACCATGGCTGCCTACTACAGGCCCGTGGATGGCTTG         CCTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 106547 CACCATGGCTGCCTACTACAGGCCCGTGGATGGCTTGGTG...CAGCCTC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1388 CCTTTAAGATGGAAAAAATTGGAGACTATTTCCGAGTTACTGGAGAGATC
        |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
 108925 CCTTTAAGATGGAAAAAACTGGAGACTATTTCCGAGTTACTGGAGAGATC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1438 CTGTCTGTGTTAGGAGGAGTCTACTTCTTTTTCCGAGGG         AT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 108975 CTGTCTGTGTTAGGAGGAGTCTACTTCTTTTTCCGAGGGGTA...CAGAT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1479 TCAGTATTTCCTGCAGAGGCGGCCGTCGATGAAGACCCTGTTTGTGGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111826 TCAGTATTTCCTGCAGAGGCGGCCGTCGATGAAGACCCTGTTTGTGGACA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1529 GCTACAGTGAGATGCTTTT         CTTTCTGCAGTCACTGTTCATG
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 111876 GCTACAGTGAGATGCTTTTGTA...CAGCTTTCTGCAGTCACTGTTCATG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1570 CTGGCCACCGTGGTGCTGTACTTCAGCCACCTCAAGGAGTATGTGGCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114610 CTGGCCACCGTGGTGCTGTACTTCAGCCACCTCAAGGAGTATGTGGCTTC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1620 CATGGTATTCTCCCTGGCCTTGGGCTGGACCAACATGCTCTACTACACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114660 CATGGTATTCTCCCTGGCCTTGGGCTGGACCAACATGCTCTACTACACCC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1670 GCGGTTTCCAGCAGATGGGCATCTATGCCGTCATGATAGAGAAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 114710 GCGGTTTCCAGCAGATGGGCATCTATGCCGTCATGATAGAGAAGGTG...

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1714    ATGATCCTGAGAGACCTGTGCCGTTTCATGTTTGTCTACATCGTCTT
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115156 CAGATGATCCTGAGAGACCTGTGCCGTTTCATGTTTGTCTACATCGTCTT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1761 CTTGTTCGGGTTTTCCACAG         CGGTGGTGACGCTGATTGAAG
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 115206 CTTGTTCGGGTTTTCCACAGGTA...TAGCGGTGGTGACGCTGATTGAAG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1802 ACGGGAAGAATGACTCCCTGCCGTCTGAGTCCACGTCGCACAGGTGGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118417 ACGGGAAGAATGACTCCCTGCCGTCTGAGTCCACGTCGCACAGGTGGCGG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1852 GGGCCTGCCTGCAGGCCCCCCGATAGCTCCTACAACAGCCTGTACTCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118467 GGGCCTGCCTGCAGGCCCCCCGATAGCTCCTACAACAGCCTGTACTCCAC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1902 CTGCCTGGAGCTGTTCAAGTTCACCATCGGCATGGGCGACCTGGAGTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118517 CTGCCTGGAGCTGTTCAAGTTCACCATCGGCATGGGCGACCTGGAGTTCA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1952 CTGAGAACTATGACTTCAAGGCTGTCTTCATCATCCTGCTGCTGGCCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118567 CTGAGAACTATGACTTCAAGGCTGTCTTCATCATCCTGCTGCTGGCCTAT

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2002 GTAATTCTCACCTACATCCTCCTGCTCAACATGCTCATCGCCCTCATGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118617 GTAATTCTCACCTACATCCTCCTGCTCAACATGCTCATCGCCCTCATGGG

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2052 TGAGACTGTCAACAAGATCGCACAGGAGAGCAAGAACATCTGGAAGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118667 TGAGACTGTCAACAAGATCGCACAGGAGAGCAAGAACATCTGGAAGCTGC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2102 AG         AGAGCCATCACCATCCTGGACACGGAGAAGAGCTTCCTT
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118717 AGGTG...CAGAGAGCCATCACCATCCTGGACACGGAGAAGAGCTTCCTT

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2143 AAGTGCATGAGGAAGGCCTTCCGCTCAGGCAAGCTGCTGCAGGTGGGGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120141 AAGTGCATGAGGAAGGCCTTCCGCTCAGGCAAGCTGCTGCAGGTGGGGTA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2193 CACACCTGATGGCAAGGACGACTACCGGTGGTGCTTCAG         GG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 120191 CACACCTGATGGCAAGGACGACTACCGGTGGTGCTTCAGGTA...CAGGG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2234 TGGACGAGGTGAACTGGACCACCTGGAACACCAACGTGGGCATCATCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120714 TGGACGAGGTGAACTGGACCACCTGGAACACCAACGTGGGCATCATCAAC

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2284 GAAGACCCGGGCAACTGTGAGGGCGTCAAGCGCACCCTGAGCTTCTCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120764 GAAGACCCGGGCAACTGTGAGGGCGTCAAGCGCACCCTGAGCTTCTCCCT

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2334 GCGGTCAAGCAGAG         TTTCAGGCAGACACTGGAAGAACTTTG
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 120814 GCGGTCAAGCAGAGGTG...CAGTTTCAGGCAGACACTGGAAGAACTTTG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2375 CCCTGGTCCCCCTTTTAAGAGAGGCAAGTGCTCGAGATAGGCAGTCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125391 CCCTGGTCCCCCTTTTAAGAGAGGCAAGTGCTCGAGATAGGCAGTCTGCT

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2425 CAGCCCGAGGAAGTTTATCTGCGACAGTTTTCAGGGTCTCTGAAGCCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125441 CAGCCCGAGGAAGTTTATCTGCGACAGTTTTCAGGGTCTCTGAAGCCAGA

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :
   2475 GGACGCTGAGGTCTTCAAGAGTCCTGCCGCTTCCGGGGAGAAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125491 GGACGCTGAGGTCTTCAAGAGTCCTGCCGCTTCCGGGGAGAAG