seq1 = pF1KE2410.tfa, 858 bp
seq2 = pF1KE2410/gi568815587f_43782653.tfa (gi568815587f:43782653_44020007), 237355 bp

>pF1KE2410 858
>gi568815587f:43782653_44020007 (Chr11)

1-79  (100001-100079)   100% ->
80-183  (100433-100536)   100% ->
184-218  (101331-101365)   100% ->
219-266  (103954-104001)   100% ->
267-370  (107073-107176)   99% ->
371-459  (109389-109477)   100% ->
460-669  (118864-119073)   100% ->
670-768  (136386-136484)   98% ->
769-858  (137266-137355)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGGAAAAAAGACGGCGAGCCCGAGTTCAGGGAGCCTGGGCTGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGGAAAAAAGACGGCGAGCCCGAGTTCAGGGAGCCTGGGCTGCCCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGTTAAAAGCCAGGCCATTGCTCAGCCAG         CTACCACTGCTA
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 100051 TGTTAAAAGCCAGGCCATTGCTCAGCCAGGCA...CAGCTACCACTGCTA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AGAGCCATCTCCACCAGAAGCCTGGCCAGACCTGGAAGAACAAAGAGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100445 AGAGCCATCTCCACCAGAAGCCTGGCCAGACCTGGAAGAACAAAGAGCAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CATCTCTCTGACAGAGAGTTTGTGTTCAAAGAACCTCAGCAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 100495 CATCTCTCTGACAGAGAGTTTGTGTTCAAAGAACCTCAGCAGGTA...CA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    184  GTAGTACGTAGAGCTCCTGAGCCACGAGTGATTGA         CAGAG
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 101330 GGTAGTACGTAGAGCTCCTGAGCCACGAGTGATTGAGTA...TAGCAGAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 AGGGTGTGTATGAAATCAGCCTGTCACCCACAGGTGTATCTAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 103959 AGGGTGTGTATGAAATCAGCCTGTCACCCACAGGTGTATCTAGGTA...C

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    267   GGTCTGTTTGTATCCTGGCTTTGTTGACGTGAAAGAAGCTGACTGGAT
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107071 AGGGTCTGTTTGTATCCTGGCTTTGTTGACGTGAAAGAAGCTGACTGGAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    315 ATTGGAACAGCTTTGTCAAGATGTTCCCTGGAAACAGAGGACCGGCATCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
 107121 ATTGGAACAGCTTTGTCAAGATGTTCCCTGGAAACAGAGGACTGGCATCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 GAGAGG         ATATAACTTATCAGCAACCAAGACTTACAGCATGG
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107171 GAGAGGGTA...TAGATATAACTTATCAGCAACCAAGACTTACAGCATGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    406 TATGGAGAACTTCCTTACACTTATTCAAGAATCACTATGGAACCAAATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109424 TATGGAGAACTTCCTTACACTTATTCAAGAATCACTATGGAACCAAATCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 TCAC         TGGCACCCTGTGCTGCGCACACTAAAGAACCGCATTG
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109474 TCACGTA...CAGTGGCACCCTGTGCTGCGCACACTAAAGAACCGCATTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    497 AAGAGAACACTGGCCACACCTTCAACTCCTTACTCTGCAATCTTTATCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118901 AAGAGAACACTGGCCACACCTTCAACTCCTTACTCTGCAATCTTTATCGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    547 AATGAGAAGGACAGCGTGGACTGGCACAGTGATGATGAACCCTCACTAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118951 AATGAGAAGGACAGCGTGGACTGGCACAGTGATGATGAACCCTCACTAGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 GAGGTGCCCCATTATTGCTTCACTAAGTTTTGGTGCCACACGCACATTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119001 GAGGTGCCCCATTATTGCTTCACTAAGTTTTGGTGCCACACGCACATTTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 AGATGAGAAAGAAGCCACCACCA         GAAGAGAATGGAGAGTAC
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||| |||
 119051 AGATGAGAAAGAAGCCACCACCAGTG...TAGGAAGAGAATGGAGACTAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    688 ACATATGTGGAAAGAGTGAAGATACCCTTGGATCATGGGACCTTGTTAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136404 ACATATGTGGAAAGAGTGAAGATACCCTTGGATCATGGGACCTTGTTAAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 CATGGAAGGAGCGACACAAGCTGACTGGCAG         CATCGAGTGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 136454 CATGGAAGGAGCGACACAAGCTGACTGGCAGGTG...TAGCATCGAGTGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    779 CCAAAGAATACCACTCTAGAGAACCGAGAGTGAACCTGACCTTTCGGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137276 CCAAAGAATACCACTCTAGAGAACCGAGAGTGAACCTGACCTTTCGGACA

    900     .    :    .    :    .    :
    829 GTCTATCCAGACCCTCGAGGGGCACCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||
 137326 GTCTATCCAGACCCTCGAGGGGCACCCTGG