seq1 = pF1KE2395.tfa, 3387 bp
seq2 = pF1KE2395/gi568815584r_54841493.tfa (gi568815584r:54841493_55126787), 285295 bp

>pF1KE2395 3387
>gi568815584r:54841493_55126787 (Chr14)

(complement)

1-77  (100001-100077)   100% ->
78-189  (113192-113303)   100% ->
190-341  (116328-116479)   100% ->
342-453  (118069-118180)   100% ->
454-504  (118422-118472)   100% ->
505-600  (119413-119508)   100% ->
601-693  (124603-124695)   100% ->
694-800  (125796-125902)   100% ->
801-942  (126144-126285)   100% ->
943-1153  (130975-131185)   100% ->
1154-1341  (135388-135575)   100% ->
1342-1526  (137576-137760)   100% ->
1527-1768  (139401-139642)   100% ->
1769-1906  (141928-142065)   100% ->
1907-2063  (145092-145248)   100% ->
2064-2178  (159394-159508)   100% ->
2179-2310  (160182-160313)   100% ->
2311-2531  (163616-163836)   100% ->
2532-2647  (163935-164050)   100% ->
2648-2701  (164237-164290)   100% ->
2702-2745  (169153-169196)   100% ->
2746-2916  (169584-169754)   100% ->
2917-3050  (171094-171227)   100% ->
3051-3189  (182318-182456)   100% ->
3190-3387  (185098-185295)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCTGCCACACGGAAGCCAATGAGATATGGGCATACAGAGGGACACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCTGCCACACGGAAGCCAATGAGATATGGGCATACAGAGGGACACAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGAGGTCTGTTTTGATGATTCTGGGAG         TTTTATTGTGACTT
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 100051 GGAGGTCTGTTTTGATGATTCTGGGAGGTA...CAGTTTTATTGTGACTT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GTGGAAGTGATGGTGATGTGAGGATTTGGGAAGACTTGGATGATGATGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113206 GTGGAAGTGATGGTGATGTGAGGATTTGGGAAGACTTGGATGATGATGAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CCTAAGTTCATTAATGTTGGAGAAAAGGCATATTCATGTGCTTTGAAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 113256 CCTAAGTTCATTAATGTTGGAGAAAAGGCATATTCATGTGCTTTGAAGGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    190        AGTGGAAAACTGGTCACTGCAGTTTCTAATAATACTATTCAAG
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113306 A...TAGAGTGGAAAACTGGTCACTGCAGTTTCTAATAATACTATTCAAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TCCACACATTTCCTGAAGGAGTTCCAGATGGTATATTGACTCGCTTCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116371 TCCACACATTTCCTGAAGGAGTTCCAGATGGTATATTGACTCGCTTCACT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 ACAAATGCAAACCATGTGGTCTTTAATGGGGATGGTACTAAAATTGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116421 ACAAATGCAAACCATGTGGTCTTTAATGGGGATGGTACTAAAATTGCTGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TGGATCTAG         TGATTTTCTAGTCAAAATTGTGGATGTGATGG
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 116471 TGGATCTAGGTA...TAGTGATTTTCTAGTCAAAATTGTGGATGTGATGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 ATAGCAGCCAACAGAAAACATTTCGAGGACATGATGCCCCTGTTTTAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118101 ATAGCAGCCAACAGAAAACATTTCGAGGACATGATGCCCCTGTTTTAAGT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CTTTCCTTTGATCCTAAGGACATCTTTCTG         GCATCAGCTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 118151 CTTTCCTTTGATCCTAAGGACATCTTTCTGGTA...CAGGCATCAGCTAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 TTGTGATGGATCTGTCAGAGTGTGGCAAATTTCAGATCAG         A
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 118433 TTGTGATGGATCTGTCAGAGTGTGGCAAATTTCAGATCAGGTA...TAGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 CATGTGCTATTAGTTGGCCACTGCTACAAAAATGCAACGATGTGATAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119414 CATGTGCTATTAGTTGGCCACTGCTACAAAAATGCAACGATGTGATAAAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 GCAAAATCAATCTGCAGACTTGCTTGGCAGCCAAAAAGTGGGAAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 119464 GCAAAATCAATCTGCAGACTTGCTTGGCAGCCAAAAAGTGGGAAGGTA..

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601     TTACTGGCAATTCCTGTGGAAAAATCTGTTAAGCTATATAGAAGAG
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119514 .TAGTTACTGGCAATTCCTGTGGAAAAATCTGTTAAGCTATATAGAAGAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 AATCTTGGAGTCATCAATTTGATCTTTCAGATAATTTCATCTCTCAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 124649 AATCTTGGAGTCATCAATTTGATCTTTCAGATAATTTCATCTCTCAGGTA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    694       ACCCTCAATATAGTAACCTGGTCTCCCTGTGGGCAATATTTAGC
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124699 ...CAGACCCTCAATATAGTAACCTGGTCTCCCTGTGGGCAATATTTAGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 TGCAGGTAGTATTAATGGTCTAATCATAGTTTGGAATGTGGAAACCAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125840 TGCAGGTAGTATTAATGGTCTAATCATAGTTTGGAATGTGGAAACCAAAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 ACTGCATGGAAAG         GGTGAAACATGAGAAAGGTTATGCAATT
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 125890 ACTGCATGGAAAGGTA...TAGGGTGAAACATGAGAAAGGTTATGCAATT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    829 TGTGGTCTGGCATGGCATCCTACTTGTGGTCGAATATCGTATACTGATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126172 TGTGGTCTGGCATGGCATCCTACTTGTGGTCGAATATCGTATACTGATGC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 GGAAGGAAATCTAGGGCTTCTAGAGAATGTTTGTGACCCCAGTGGAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126222 GGAAGGAAATCTAGGGCTTCTAGAGAATGTTTGTGACCCCAGTGGAAAGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 CATCAAGCAGTAAG         GTATCTAGCAGAGTGGAAAAGGATTAT
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 126272 CATCAAGCAGTAAGGTA...AAGGTATCTAGCAGAGTGGAAAAGGATTAT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    970 AATGATCTTTTTGATGGAGATGATATGAGTAATGCTGGTGATTTTCTAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131002 AATGATCTTTTTGATGGAGATGATATGAGTAATGCTGGTGATTTTCTAAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 TGACAATGCAGTTGAGATCCCTTCTTTTTCAAAAGGGATTATAAATGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131052 TGACAATGCAGTTGAGATCCCTTCTTTTTCAAAAGGGATTATAAATGATG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 ATGAGGATGATGAAGACCTCATGATGGCTTCAGGTCGTCCTAGACAGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131102 ATGAGGATGATGAAGACCTCATGATGGCTTCAGGTCGTCCTAGACAGCGA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 AGTCACATCCTAGAAGATGATGAAAACTCAGTTG         ATATTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 131152 AGTCACATCCTAGAAGATGATGAAAACTCAGTTGGTA...TAGATATTTC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1161 AATGCTAAAAACTGGTTCTAGTCTTCTCAAAGAGGAGGAGGAAGATGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135395 AATGCTAAAAACTGGTTCTAGTCTTCTCAAAGAGGAGGAGGAAGATGGTC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1211 AAGAAGGCAGCATTCACAATCTACCACTTGTAACATCCCAAAGGCCATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135445 AAGAAGGCAGCATTCACAATCTACCACTTGTAACATCCCAAAGGCCATTT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1261 TATGATGGACCCATGCCAACTCCCCGGCAAAAGCCATTTCAGTCAGGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135495 TATGATGGACCCATGCCAACTCCCCGGCAAAAGCCATTTCAGTCAGGTTC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 TACACCGTTGCATCTCACTCACAGATTCATG         GTGTGGAACT
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 135545 TACACCGTTGCATCTCACTCACAGATTCATGGTA...TAGGTGTGGAACT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1352 CTATTGGAATTATTCGCTGCTATAATGATGAGCAAGACAATGCCATAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137586 CTATTGGAATTATTCGCTGCTATAATGATGAGCAAGACAATGCCATAGAT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1402 GTGGAGTTCCATGATACCTCCATACACCATGCAACACACTTATCAAACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137636 GTGGAGTTCCATGATACCTCCATACACCATGCAACACACTTATCAAACAC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1452 TTTGAATTATACAATAGCAGATCTTTCCCACGAAGCTATTTTGTTGGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137686 TTTGAATTATACAATAGCAGATCTTTCCCACGAAGCTATTTTGTTGGCAT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1502 GTGAAAGCACTGATGAACTAGCAAG         CAAGCTTCACTGCCTG
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 137736 GTGAAAGCACTGATGAACTAGCAAGGTA...TAGCAAGCTTCACTGCCTG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1543 CACTTTAGTTCTTGGGATTCAAGCAAAGAGTGGATAATAGACTTGCCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139417 CACTTTAGTTCTTGGGATTCAAGCAAAGAGTGGATAATAGACTTGCCTCA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1593 GAATGAGGATATTGAAGCCATATGTCTCGGTCAAGGATGGGCTGCTGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139467 GAATGAGGATATTGAAGCCATATGTCTCGGTCAAGGATGGGCTGCTGCCG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1643 CTACTAGTGCCCTGCTTCTTCGATTGTTTACTATTGGAGGGGTTCAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139517 CTACTAGTGCCCTGCTTCTTCGATTGTTTACTATTGGAGGGGTTCAAAAA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1693 GAGGTATTCAGCCTTGCTGGACCTGTGGTGTCAATGGCAGGACATGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139567 GAGGTATTCAGCCTTGCTGGACCTGTGGTGTCAATGGCAGGACATGGAGA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1743 ACAGCTTTTCATTGTTTATCACAGAG         GTACAGGATTTGATG
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 139617 ACAGCTTTTCATTGTTTATCACAGAGGTA...TAGGTACAGGATTTGATG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1784 GGGATCAGTGCCTTGGAGTTCAACTGCTAGAGCTGGGGAAAAAGAAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141943 GGGATCAGTGCCTTGGAGTTCAACTGCTAGAGCTGGGGAAAAAGAAAAAA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1834 CAAATTTTGCATGGTGACCCTCTTCCTCTTACAAGGAAATCCTACCTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141993 CAAATTTTGCATGGTGACCCTCTTCCTCTTACAAGGAAATCCTACCTTGC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1884 ATGGATTGGGTTTTCAGCTGAAG         GTACCCCTTGTTACGTGG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 142043 ATGGATTGGGTTTTCAGCTGAAGGCA...TAGGTACCCCTTGTTACGTGG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1925 ATTCAGAAGGAATTGTTCGAATGCTTAACAGAGGACTTGGTAATACGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145110 ATTCAGAAGGAATTGTTCGAATGCTTAACAGAGGACTTGGTAATACGTGG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1975 ACTCCTATATGTAATACAAGAGAGCACTGCAAAGGAAAATCTGATCACTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145160 ACTCCTATATGTAATACAAGAGAGCACTGCAAAGGAAAATCTGATCACTA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2025 CTGGGTGGTTGGTATCCATGAAAATCCCCAGCAACTAAG         GT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 145210 CTGGGTGGTTGGTATCCATGAAAATCCCCAGCAACTAAGGTG...CAGGT

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2066 GCATTCCTTGTAAAGGTTCTCGGTTTCCCCCAACCCTTCCACGCCCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159396 GCATTCCTTGTAAAGGTTCTCGGTTTCCCCCAACCCTTCCACGCCCTGCT

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2116 GTTGCTATATTATCCTTTAAGCTTCCTTACTGTCAGATTGCAACAGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159446 GTTGCTATATTATCCTTTAAGCTTCCTTACTGTCAGATTGCAACAGAGAA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2166 AGGACAAATGGAG         GAGCAATTTTGGCGTTCAGTTATATTTC
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 159496 AGGACAAATGGAGGTA...TAGGAGCAATTTTGGCGTTCAGTTATATTTC

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2207 ACAACCACCTTGATTATTTAGCTAAAAATGGTTATGAATATGAAGAGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160210 ACAACCACCTTGATTATTTAGCTAAAAATGGTTATGAATATGAAGAGAGC

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2257 ACTAAAAATCAAGCAACAAAAGAGCAACAGGAACTTTTAATGAAAATGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160260 ACTAAAAATCAAGCAACAAAAGAGCAACAGGAACTTTTAATGAAAATGCT

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2307 TGCG         CTTTCTTGTAAACTGGAGCGAGAATTCCGTTGTGTGG
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160310 TGCGGTG...TAGCTTTCTTGTAAACTGGAGCGAGAATTCCGTTGTGTGG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2348 AACTTGCTGATCTAATGACTCAAAATGCTGTGAATTTAGCCATTAAATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163653 AACTTGCTGATCTAATGACTCAAAATGCTGTGAATTTAGCCATTAAATAT

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2398 GCTTCTCGCTCTCGGAAATTAATACTGGCTCAAAAACTAAGTGAACTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163703 GCTTCTCGCTCTCGGAAATTAATACTGGCTCAAAAACTAAGTGAACTGGC

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2448 TGTAGAGAAGGCAGCCGAATTGACAGCAACCCAGGTGGAAGAGGAAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163753 TGTAGAGAAGGCAGCCGAATTGACAGCAACCCAGGTGGAAGAGGAAGAAG

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2498 AAGAAGAAGATTTCAGAAAAAAGCTGAATGCTGG         TTACAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 163803 AAGAAGAAGATTTCAGAAAAAAGCTGAATGCTGGGTA...TAGTTACAGC

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2539 AATACTGCTACAGAGTGGAGCCAACCAAGGTTCAGAAATCAAGTTGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163942 AATACTGCTACAGAGTGGAGCCAACCAAGGTTCAGAAATCAAGTTGAAGA

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2589 AGATGCTGAGGACAGTGGAGAAGCTGATGATGAAGAAAAACCAGAAATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163992 AGATGCTGAGGACAGTGGAGAAGCTGATGATGAAGAAAAACCAGAAATAC

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2639 ATAAGCCTG         GACAGAACTCGTTTTCCAAAAGTACAAATTCC
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 164042 ATAAGCCTGGTG...TAGGACAGAACTCGTTTTCCAAAAGTACAAATTCC

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2680 TCTGATGTTTCAGCTAAGTCAG         GTGCAGTTACCTTTAGCAG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 164269 TCTGATGTTTCAGCTAAGTCAGGTG...AAGGTGCAGTTACCTTTAGCAG

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2721 CCAAGGACGAGTAAATCCCTTTAAG         GTATCAGCCAGTTCCA
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 169172 CCAAGGACGAGTAAATCCCTTTAAGGTA...TAGGTATCAGCCAGTTCCA

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2762 AAGAACCAGCCATGTCAATGAATTCAGCACGTTCAACTAATATTTTAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 169600 AAGAACCAGCCATGTCAATGAATTCAGCACGTTCAACTAATATTTTAGAC

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2812 AATATGGGCAAATCATCCAAGAAATCCACTGCACTTAGTCGAACTACAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 169650 AATATGGGCAAATCATCCAAGAAATCCACTGCACTTAGTCGAACTACAAA

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2862 TAATGAAAAGTCTCCCATTATAAAGCCTCTGATTCCAAAGCCGAAGCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 169700 TAATGAAAAGTCTCCCATTATAAAGCCTCTGATTCCAAAGCCGAAGCCTA

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2912 AGCAG         GCATCTGCAGCATCCTATTTCCAGAAAAGAAATTCT
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 169750 AGCAGGTA...TAGGCATCTGCAGCATCCTATTTCCAGAAAAGAAATTCT

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2953 CAAACTAATAAAACTGAGGAAGTGAAAGAAGAAAATCTTAAAAATGTATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171130 CAAACTAATAAAACTGAGGAAGTGAAAGAAGAAAATCTTAAAAATGTATT

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3003 ATCTGAAACCCCAGCTATATGTCCTCCTCAAAACACTGAAAACCAAAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 171180 ATCTGAAACCCCAGCTATATGTCCTCCTCAAAACACTGAAAACCAAAGGT

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3051        GCCAAAGACCGGGTTCCAGATGTGGTTAGAAGAAAATAGAAGT
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171230 C...TAGGCCAAAGACCGGGTTCCAGATGTGGTTAGAAGAAAATAGAAGT

   3300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3094 AATATTTTGTCTGACAATCCTGACTTTTCAGATGAAGCAGACATAATAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182361 AATATTTTGTCTGACAATCCTGACTTTTCAGATGAAGCAGACATAATAAA

   3350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3144 AGAAGGAATGATTCGATTTAGAGTATTGTCAACTGAAGAAAGAAAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 182411 AGAAGGAATGATTCGATTTAGAGTATTGTCAACTGAAGAAAGAAAGGTA.

   3400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3190      GTGTGGGCTAACAAAGCCAAAGGAGAAACGGCAAGTGAAGGAACT
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182461 ..AAGGTGTGGGCTAACAAAGCCAAAGGAGAAACGGCAAGTGAAGGAACT

   3450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3235 GAAGCAAAGAAGCGAAAACGTGTGGTTGATGAAAGTGATGAAACAGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 185143 GAAGCAAAGAAGCGAAAACGTGTGGTTGATGAAAGTGATGAAACAGAAAA

   3500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3285 CCAGGAAGAAAAAGCAAAAGAGAACCTGAATTTGTCTAAAAAGCAGAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 185193 CCAGGAAGAAAAAGCAAAAGAGAACCTGAATTTGTCTAAAAAGCAGAAAC

   3550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3335 CTTTAGATTTTTCTACAAATCAGAAACTATCAGCTTTTGCATTTAAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 185243 CTTTAGATTTTTCTACAAATCAGAAACTATCAGCTTTTGCATTTAAGCAG

   3600 
   3385 GAG
        |||
 185293 GAG