seq1 = pF1KE2393.tfa, 1494 bp
seq2 = pF1KE2393/gi568815583r_78525136.tfa (gi568815583r:78525136_78741133), 215998 bp

>pF1KE2393 1494
>gi568815583r:78525136_78741133 (Chr15)

(complement)

1-55  (100001-100055)   100% ->
56-204  (105547-105695)   100% ->
205-249  (109802-109846)   100% ->
250-359  (109949-110058)   100% ->
360-1338  (111189-112167)   100% ->
1339-1494  (115843-115998)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGGCGCGCGCCTTCCCTGGTCCTTTTCTTCCTGGTCGCCCTTTGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGGCGCGCGCCTTCCCTGGTCCTTTTCTTCCTGGTCGCCCTTTGCGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCGCG         GGAACTGCCGCGTGGCCAATGCGGAGGAAAAGCTGA
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCGCGGTG...CAGGGAACTGCCGCGTGGCCAATGCGGAGGAAAAGCTGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TGGACGACCTTCTGAACAAAACCCGTTACAATAACCTGATCCGCCCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105583 TGGACGACCTTCTGAACAAAACCCGTTACAATAACCTGATCCGCCCAGCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ACCAGCTCCTCACAGCTCATCTCCATCAAGCTGCAGCTCTCCCTGGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105633 ACCAGCTCCTCACAGCTCATCTCCATCAAGCTGCAGCTCTCCCTGGCCCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GCTTATCAGCGTG         AATGAGCGAGAGCAGATCATGACCACCA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 105683 GCTTATCAGCGTGGTA...CAGAATGAGCGAGAGCAGATCATGACCACCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ATGTCTGGCTGAAACAG         GAATGGACTGATTACCGCCTGACC
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 109830 ATGTCTGGCTGAAACAGGTA...CAGGAATGGACTGATTACCGCCTGACC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 TGGAACAGCTCCCGCTACGAGGGTGTGAACATCCTGAGGATCCCTGCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109973 TGGAACAGCTCCCGCTACGAGGGTGTGAACATCCTGAGGATCCCTGCAAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GCGCATCTGGTTGCCTGACATCGTGCTTTACAACAA         CGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 110023 GCGCATCTGGTTGCCTGACATCGTGCTTTACAACAAGTG...CAGCGCCG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 ACGGGACCTATGAGGTGTCTGTCTACACCAACTTGATAGTCCGGTCCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111194 ACGGGACCTATGAGGTGTCTGTCTACACCAACTTGATAGTCCGGTCCAAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 GGCAGCGTCCTGTGGCTGCCCCCTGCCATCTACAAGAGCGCCTGCAAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111244 GGCAGCGTCCTGTGGCTGCCCCCTGCCATCTACAAGAGCGCCTGCAAGAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 TGAGGTGAAGTACTTTCCCTTCGACCAGCAGAACTGCACCCTCAAGTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111294 TGAGGTGAAGTACTTTCCCTTCGACCAGCAGAACTGCACCCTCAAGTTCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 GCTCCTGGACCTATGACCACACGGAGATAGACATGGTCCTCATGACGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111344 GCTCCTGGACCTATGACCACACGGAGATAGACATGGTCCTCATGACGCCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 ACAGCCAGCATGGATGACTTTACTCCCAGTGGTGAGTGGGACATAGTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111394 ACAGCCAGCATGGATGACTTTACTCCCAGTGGTGAGTGGGACATAGTGGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 CCTCCCAGGGAGAAGGACAGTGAACCCACAAGACCCCAGCTACGTGGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111444 CCTCCCAGGGAGAAGGACAGTGAACCCACAAGACCCCAGCTACGTGGACG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 TGACTTACGACTTCATCATCAAGCGCAAGCCTCTGTTCTACACCATCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111494 TGACTTACGACTTCATCATCAAGCGCAAGCCTCTGTTCTACACCATCAAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 CTCATCATCCCCTGCGTGCTCACCACCTTGCTGGCCATCCTCGTCTTCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111544 CTCATCATCCCCTGCGTGCTCACCACCTTGCTGGCCATCCTCGTCTTCTA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 CCTGCCATCCGACTGCGGCGAGAAGATGACACTGTGCATCTCAGTGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111594 CCTGCCATCCGACTGCGGCGAGAAGATGACACTGTGCATCTCAGTGCTGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 TGGCACTGACATTCTTCCTGCTGCTCATCTCCAAGATCGTGCCACCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111644 TGGCACTGACATTCTTCCTGCTGCTCATCTCCAAGATCGTGCCACCCACC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 TCCCTCGATGTGCCTCTCATCGGCAAGTACCTCATGTTCACCATGGTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111694 TCCCTCGATGTGCCTCTCATCGGCAAGTACCTCATGTTCACCATGGTGCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 GGTCACCTTCTCCATCGTCACCAGCGTCTGTGTGCTCAATGTGCACCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111744 GGTCACCTTCTCCATCGTCACCAGCGTCTGTGTGCTCAATGTGCACCACC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 GCTCGCCCAGCACCCACACCATGGCACCCTGGGTCAAGCGCTGCTTCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111794 GCTCGCCCAGCACCCACACCATGGCACCCTGGGTCAAGCGCTGCTTCCTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1015 CACAAGCTGCCTACCTTCCTCTTCATGAAGCGCCCTGGCCCCGACAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111844 CACAAGCTGCCTACCTTCCTCTTCATGAAGCGCCCTGGCCCCGACAGCAG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1065 CCCGGCCAGAGCCTTCCCGCCCAGCAAGTCATGCGTGACCAAGCCCGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111894 CCCGGCCAGAGCCTTCCCGCCCAGCAAGTCATGCGTGACCAAGCCCGAGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1115 CCACCGCCACCTCCACCAGCCCCTCCAACTTCTATGGGAACTCCATGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111944 CCACCGCCACCTCCACCAGCCCCTCCAACTTCTATGGGAACTCCATGTAC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1165 TTTGTGAACCCCGCCTCTGCAGCTTCCAAGTCTCCAGCCGGCTCTACCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111994 TTTGTGAACCCCGCCTCTGCAGCTTCCAAGTCTCCAGCCGGCTCTACCCC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1215 GGTGGCTATCCCCAGGGATTTCTGGCTGCGGTCCTCTGGGAGGTTCCGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112044 GGTGGCTATCCCCAGGGATTTCTGGCTGCGGTCCTCTGGGAGGTTCCGAC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1265 AGGATGTGCAGGAGGCATTAGAAGGTGTCAGCTTCATCGCCCAGCACATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112094 AGGATGTGCAGGAGGCATTAGAAGGTGTCAGCTTCATCGCCCAGCACATG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1315 AAGAATGACGATGAAGACCAGAGT         GTCGTTGAGGACTGGAA
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 112144 AAGAATGACGATGAAGACCAGAGTGTA...CAGGTCGTTGAGGACTGGAA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1356 GTACGTGGCTATGGTGGTGGACCGGCTGTTCCTGTGGGTGTTCATGTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115860 GTACGTGGCTATGGTGGTGGACCGGCTGTTCCTGTGGGTGTTCATGTTTG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1406 TGTGCGTCCTGGGCACTGTGGGGCTCTTCCTACCGCCCCTCTTCCAGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115910 TGTGCGTCCTGGGCACTGTGGGGCTCTTCCTACCGCCCCTCTTCCAGACC

   1500     .    :    .    :    .    :    .
   1456 CATGCAGCTTCTGAGGGGCCCTACGCTGCCCAGCGTGAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115960 CATGCAGCTTCTGAGGGGCCCTACGCTGCCCAGCGTGAC