seq1 = pF1KE2389.tfa, 2073 bp
seq2 = pF1KE2389/gi568815586f_21041575.tfa (gi568815586f:21041575_21339186), 297612 bp

>pF1KE2389 2073
>gi568815586f:21041575_21339186 (Chr12)

1-84  (100001-100084)   100% ->
85-226  (131076-131217)   100% ->
227-359  (133003-133135)   100% ->
360-481  (135202-135323)   100% ->
482-628  (137002-137148)   100% ->
629-727  (137348-137446)   100% ->
728-970  (155372-155614)   100% ->
971-1135  (158934-159098)   100% ->
1136-1331  (160917-161112)   100% ->
1332-1497  (164294-164459)   100% ->
1498-1682  (175545-175729)   100% ->
1683-1747  (180726-180790)   100% ->
1748-1865  (183148-183265)   100% ->
1866-2073  (197405-197612)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGACCAAAATCAACATTTGAATAAAACAGCAGAGGCACAACCTTCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGACCAAAATCAACATTTGAATAAAACAGCAGAGGCACAACCTTCAGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GAATAAGAAAACAAGATACTGCAATGGATTGAAG         ATGTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 100051 GAATAAGAAAACAAGATACTGCAATGGATTGAAGGTA...TAGATGTTCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TGGCAGCTCTGTCACTCAGCTTTATTGCTAAGACACTAGGTGCAATTATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131083 TGGCAGCTCTGTCACTCAGCTTTATTGCTAAGACACTAGGTGCAATTATT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ATGAAAAGTTCCATCATTCATATAGAACGGAGATTTGAGATATCCTCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131133 ATGAAAAGTTCCATCATTCATATAGAACGGAGATTTGAGATATCCTCTTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TCTTGTTGGTTTTATTGACGGAAGCTTTGAAATTG         GAAATT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 131183 TCTTGTTGGTTTTATTGACGGAAGCTTTGAAATTGGTA...TAGGAAATT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TGCTTGTGATTGTATTTGTGAGTTACTTTGGATCCAAACTACATAGACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133009 TGCTTGTGATTGTATTTGTGAGTTACTTTGGATCCAAACTACATAGACCA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AAGTTAATTGGAATCGGTTGTTTCATTATGGGAATTGGAGGTGTTTTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133059 AAGTTAATTGGAATCGGTTGTTTCATTATGGGAATTGGAGGTGTTTTGAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TGCTTTGCCACATTTCTTCATGGGATA         TTACAGGTATTCTA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 133109 TGCTTTGCCACATTTCTTCATGGGATAGTA...CAGTTACAGGTATTCTA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AAGAAACTAATATCAATTCATCAGAAAATTCAACATCGACCTTATCCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135216 AAGAAACTAATATCAATTCATCAGAAAATTCAACATCGACCTTATCCACT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 TGTTTAATTAATCAAATTTTATCACTCAATAGAGCATCACCTGAGATAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135266 TGTTTAATTAATCAAATTTTATCACTCAATAGAGCATCACCTGAGATAGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GGGAAAAG         GTTGTTTAAAGGAATCTGGGTCATACATGTGGA
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 135316 GGGAAAAGGTA...TAGGTTGTTTAAAGGAATCTGGGTCATACATGTGGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TATATGTGTTCATGGGTAATATGCTTCGTGGAATAGGGGAGACTCCCATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137035 TATATGTGTTCATGGGTAATATGCTTCGTGGAATAGGGGAGACTCCCATA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GTACCATTGGGGCTTTCTTACATTGATGATTTCGCTAAAGAAGGACATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137085 GTACCATTGGGGCTTTCTTACATTGATGATTTCGCTAAAGAAGGACATTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 TTCTTTGTATTTAG         GTATATTGAATGCAATAGCAATGATTG
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 137135 TTCTTTGTATTTAGGTA...CAGGTATATTGAATGCAATAGCAATGATTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 GTCCAATCATTGGCTTTACCCTGGGATCTCTGTTTTCTAAAATGTACGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137375 GTCCAATCATTGGCTTTACCCTGGGATCTCTGTTTTCTAAAATGTACGTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 GATATTGGATATGTAGATCTAA         GCACTATCAGGATAACTCC
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 137425 GATATTGGATATGTAGATCTAAGTA...TAGGCACTATCAGGATAACTCC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 TACTGATTCTCGATGGGTTGGAGCTTGGTGGCTTAATTTCCTTGTGTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155391 TACTGATTCTCGATGGGTTGGAGCTTGGTGGCTTAATTTCCTTGTGTCTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 GACTATTCTCCATTATTTCTTCCATACCATTCTTTTTCTTGCCCCAAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155441 GACTATTCTCCATTATTTCTTCCATACCATTCTTTTTCTTGCCCCAAACT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 CCAAATAAACCACAAAAAGAAAGAAAAGCTTCACTGTCTTTGCATGTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155491 CCAAATAAACCACAAAAAGAAAGAAAAGCTTCACTGTCTTTGCATGTGCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 GGAAACAAATGATGAAAAGGATCAAACAGCTAATTTGACCAATCAAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155541 GGAAACAAATGATGAAAAGGATCAAACAGCTAATTTGACCAATCAAGGAA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 AAAATATTACCAAAAATGTGACTG         GTTTTTTCCAGTCTTTT
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 155591 AAAATATTACCAAAAATGTGACTGGTA...CAGGTTTTTTCCAGTCTTTT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 AAAAGCATCCTTACTAATCCCCTGTATGTTATGTTTGTGCTTTTGACGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158951 AAAAGCATCCTTACTAATCCCCTGTATGTTATGTTTGTGCTTTTGACGTT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 GTTACAAGTAAGCAGCTATATTGGTGCTTTTACTTATGTCTTCAAATACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159001 GTTACAAGTAAGCAGCTATATTGGTGCTTTTACTTATGTCTTCAAATACG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 TAGAGCAACAGTATGGTCAGCCTTCATCTAAGGCTAACATCTTATTGG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 159051 TAGAGCAACAGTATGGTCAGCCTTCATCTAAGGCTAACATCTTATTGGGT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1136        GAGTCATAACCATACCTATTTTTGCAAGTGGAATGTTTTTAGG
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159101 A...TAGGAGTCATAACCATACCTATTTTTGCAAGTGGAATGTTTTTAGG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 AGGATATATCATTAAAAAATTCAAACTGAACACCGTTGGAATTGCCAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160960 AGGATATATCATTAAAAAATTCAAACTGAACACCGTTGGAATTGCCAAAT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 TCTCATGTTTTACTGCTGTGATGTCATTGTCCTTTTACCTATTATATTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161010 TCTCATGTTTTACTGCTGTGATGTCATTGTCCTTTTACCTATTATATTTT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 TTCATACTCTGTGAAAACAAATCAGTTGCCGGACTAACCATGACCTATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161060 TTCATACTCTGTGAAAACAAATCAGTTGCCGGACTAACCATGACCTATGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1329 TGG         AAATAATCCAGTGACATCTCATAGAGATGTACCACTTT
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161110 TGGGTT...CAGAAATAATCCAGTGACATCTCATAGAGATGTACCACTTT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1370 CTTATTGCAACTCAGACTGCAATTGTGATGAAAGTCAATGGGAACCAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164332 CTTATTGCAACTCAGACTGCAATTGTGATGAAAGTCAATGGGAACCAGTC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1420 TGTGGAAACAATGGAATAACTTACATCTCACCCTGTCTAGCAGGTTGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164382 TGTGGAAACAATGGAATAACTTACATCTCACCCTGTCTAGCAGGTTGCAA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1470 ATCTTCAAGTGGCAATAAAAAGCCTATA         GTGTTTTACAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 164432 ATCTTCAAGTGGCAATAAAAAGCCTATAGTG...AAGGTGTTTTACAACT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1511 GCAGTTGTTTGGAAGTAACTGGTCTCCAGAACAGAAATTACTCAGCCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 175558 GCAGTTGTTTGGAAGTAACTGGTCTCCAGAACAGAAATTACTCAGCCCAT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1561 TTGGGTGAATGCCCAAGAGATGATGCTTGTACAAGGAAATTTTACTTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 175608 TTGGGTGAATGCCCAAGAGATGATGCTTGTACAAGGAAATTTTACTTTTT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1611 TGTTGCAATACAAGTCTTGAATTTATTTTTCTCTGCACTTGGAGGCACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 175658 TGTTGCAATACAAGTCTTGAATTTATTTTTCTCTGCACTTGGAGGCACCT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1661 CACATGTCATGCTGATTGTTAA         AATTGTTCAACCTGAATTG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 175708 CACATGTCATGCTGATTGTTAAGTA...CAGAATTGTTCAACCTGAATTG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1702 AAATCACTTGCACTGGGTTTCCACTCAATGGTTATACGAGCACTAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 180745 AAATCACTTGCACTGGGTTTCCACTCAATGGTTATACGAGCACTAGGTA.

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1748      GAGGAATTCTAGCTCCAATATATTTTGGGGCTCTGATTGATACAA
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 180795 ..CAGGAGGAATTCTAGCTCCAATATATTTTGGGGCTCTGATTGATACAA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1793 CGTGTATAAAGTGGTCCACCAACAACTGTGGCACACGTGGGTCATGTAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 183193 CGTGTATAAAGTGGTCCACCAACAACTGTGGCACACGTGGGTCATGTAGG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1843 ACATATAATTCCACATCATTTTC         AAGGGTCTACTTGGGCTT
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 183243 ACATATAATTCCACATCATTTTCGTA...CAGAAGGGTCTACTTGGGCTT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1884 GTCTTCAATGTTAAGAGTCTCATCACTTGTTTTATATATTATATTAATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 197423 GTCTTCAATGTTAAGAGTCTCATCACTTGTTTTATATATTATATTAATTT

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1934 ATGCCATGAAGAAAAAATATCAAGAGAAAGATATCAATGCATCAGAAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 197473 ATGCCATGAAGAAAAAATATCAAGAGAAAGATATCAATGCATCAGAAAAT

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1984 GGAAGTGTCATGGATGAAGCAAACTTAGAATCCTTAAATAAAAATAAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 197523 GGAAGTGTCATGGATGAAGCAAACTTAGAATCCTTAAATAAAAATAAACA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :
   2034 TTTTGTCCCTTCTGCTGGGGCAGATAGTGAAACACATTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 197573 TTTTGTCCCTTCTGCTGGGGCAGATAGTGAAACACATTGT