seq1 = pF1KE2384.tfa, 948 bp
seq2 = pF1KE2384/gi568815591r_134342731.tfa (gi568815591r:134342731_134559062), 216332 bp

>pF1KE2384 948
>gi568815591r:134342731_134559062 (Chr7)

(complement)

1-66  (100001-100066)   100% ->
67-234  (107310-107477)   100% ->
235-351  (108161-108277)   100% ->
352-429  (109266-109343)   100% ->
430-552  (109944-110066)   100% ->
553-659  (110570-110676)   100% ->
660-741  (111002-111083)   98% ->
742-825  (111682-111765)   100% ->
826-908  (113743-113825)   100% ->
909-948  (116293-116332)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCAAGCCGTCTCCTGCTCAACAACGGCGCCAAGATGCCCATCCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCAAGCCGTCTCCTGCTCAACAACGGCGCCAAGATGCCCATCCTGGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GTTGGGTACCTGGAAG         TCCCCTCCAGGGCAGGTGACTGAGG
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 100051 GTTGGGTACCTGGAAGGTA...CAGTCCCCTCCAGGGCAGGTGACTGAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CCGTGAAGGTGGCCATTGACGTCGGGTACCGCCACATCGACTGTGCCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107335 CCGTGAAGGTGGCCATTGACGTCGGGTACCGCCACATCGACTGTGCCCAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GTGTACCAGAATGAGAATGAGGTGGGGGTGGCCATTCAGGAGAAGCTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107385 GTGTACCAGAATGAGAATGAGGTGGGGGTGGCCATTCAGGAGAAGCTCAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GGAGCAGGTGGTGAAGCGTGAGGAGCTCTTCATCGTCAGCAAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 107435 GGAGCAGGTGGTGAAGCGTGAGGAGCTCTTCATCGTCAGCAAGGTA...T

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    235   CTGTGGTGCACGTACCATGAGAAGGGCCTGGTGAAAGGAGCCTGCCAG
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108159 AGCTGTGGTGCACGTACCATGAGAAGGGCCTGGTGAAAGGAGCCTGCCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AAGACACTCAGCGACCTGAAGCTGGACTACCTGGACCTCTACCTTATTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108209 AAGACACTCAGCGACCTGAAGCTGGACTACCTGGACCTCTACCTTATTCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CTGGCCGACTGGCTTTAAG         CCTGGGAAGGAATTTTTCCCAT
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 108259 CTGGCCGACTGGCTTTAAGGTA...CAGCCTGGGAAGGAATTTTTCCCAT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TGGATGAGTCGGGCAATGTGGTTCCCAGTGACACCAACATTCTGGACACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109288 TGGATGAGTCGGGCAATGTGGTTCCCAGTGACACCAACATTCTGGACACG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 TGGGCG         GCCATGGAAGAGCTGGTGGATGAAGGGCTGGTGAA
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109338 TGGGCGGTA...TAGGCCATGGAAGAGCTGGTGGATGAAGGGCTGGTGAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 AGCTATTGGCATCTCCAACTTCAACCATCTCCAGGTGGAGATGATCTTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109979 AGCTATTGGCATCTCCAACTTCAACCATCTCCAGGTGGAGATGATCTTAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 ACAAACCTGGCTTGAAGTATAAGCCTGCAGTTAACCAG         ATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 110029 ACAAACCTGGCTTGAAGTATAAGCCTGCAGTTAACCAGGTA...CAGATT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 GAGTGCCACCCATATCTCACTCAGGAGAAGTTAATCCAGTACTGCCAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110573 GAGTGCCACCCATATCTCACTCAGGAGAAGTTAATCCAGTACTGCCAGTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 CAAAGGCATCGTGGTGACCGCCTACAGCCCCCTCGGCTCTCCTGACAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110623 CAAAGGCATCGTGGTGACCGCCTACAGCCCCCTCGGCTCTCCTGACAGGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 CCTG         GGCCAAGCCCGAGGACCCTTCTCTCCTGGAGGATCCC
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110673 CCTGGTG...CAGGGCCAAGCCCGAGGACCCTTCTCTCCTGGAGGATCCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 AGGATCAAGGCTATCGCAGCCAAGCACAATAAAACTACAGCCCAG     
        ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 111039 AGGATCAAGGCGATCGCAGCCAAGCACAATAAAACTACAGCCCAGGTA..

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742     GTCCTGATCCGGTTCCCCATGCAGAGGAACTTGGTGGTGATCCCCA
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111089 .CAGGTCCTGATCCGGTTCCCCATGCAGAGGAACTTGGTGGTGATCCCCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 AGTCTGTGACACCAGAACGCATTGCTGAGAACTTTAAG         GTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 111728 AGTCTGTGACACCAGAACGCATTGCTGAGAACTTTAAGGTA...TAGGTC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    829 TTTGACTTTGAACTGAGCAGCCAGGATATGACCACCTTACTCAGCTACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113746 TTTGACTTTGAACTGAGCAGCCAGGATATGACCACCTTACTCAGCTACAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 CAGGAACTGGAGGGTCTGTGCCTTGTTGAG         CTGTACCTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 113796 CAGGAACTGGAGGGTCTGTGCCTTGTTGAGGTG...CAGCTGTACCTCCC

   1000     .    :    .    :    .
    920 ACAAGGATTACCCCTTCCATGAAGAGTTT
        |||||||||||||||||||||||||||||
 116304 ACAAGGATTACCCCTTCCATGAAGAGTTT