seq1 = pF1KE2383.tfa, 1470 bp
seq2 = pF1KE2383/gi568815588f_11065505.tfa (gi568815588f:11065505_11429050), 363546 bp

>pF1KE2383 1470
>gi568815588f:11065505_11429050 (Chr10)

1-178  (100001-100178)   100% ->
179-261  (151921-152003)   100% ->
262-310  (183649-183697)   100% ->
311-445  (192234-192368)   100% ->
446-525  (201094-201173)   100% ->
526-684  (205162-205320)   100% ->
685-748  (209553-209616)   100% ->
749-883  (222914-223048)   100% ->
884-1003  (248635-248754)   100% ->
1004-1201  (255685-255882)   100% ->
1202-1345  (260332-260475)   100% ->
1346-1470  (263422-263546)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAACGGAGCTTTGGATCACTCAGACCAACCAGACCCAGATGCCATTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAACGGAGCTTTGGATCACTCAGACCAACCAGACCCAGATGCCATTAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GATGTTTGTCGGACAGATCCCCCGGTCATGGTCGGAAAAGGAGCTGAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GATGTTTGTCGGACAGATCCCCCGGTCATGGTCGGAAAAGGAGCTGAAAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AACTTTTTGAGCCTTACGGAGCCGTCTACCAGATCAACGTCCTCCGGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AACTTTTTGAGCCTTACGGAGCCGTCTACCAGATCAACGTCCTCCGGGAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CGGAGTCAGAACCCTCCGCAGAGTAAAG         GTTGTTGTTTCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 100151 CGGAGTCAGAACCCTCCGCAGAGTAAAGGTA...TAGGTTGTTGTTTCGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AACATTTTATACAAGAAAAGCTGCACTTGAGGCCCAGAATGCACTGCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151934 AACATTTTATACAAGAAAAGCTGCACTTGAGGCCCAGAATGCACTGCACA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 ATATTAAAACTTTACCTGGG         ATGCATCATCCCATTCAGATG
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 151984 ATATTAAAACTTTACCTGGGGTG...TAGATGCATCATCCCATTCAGATG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AAACCTGCAGATAGTGAAAAGTCCAACG         CTGTGGAAGACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 183670 AAACCTGCAGATAGTGAAAAGTCCAACGGTA...TAGCTGTGGAAGACAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 AAAATTGTTCATAGGAATGGTATCGAAGAAATGTAATGAGAACGACATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 192247 AAAATTGTTCATAGGAATGGTATCGAAGAAATGTAATGAGAACGACATCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 GGGTGATGTTCTCTCCATTTGGCCAGATAGAAGAATGCCGGATCCTCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 192297 GGGTGATGTTCTCTCCATTTGGCCAGATAGAAGAATGCCGGATCCTCCGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GGACCTGATGGGCTGAGTCGAG         GCTGTGCGTTTGTCACATT
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 192347 GGACCTGATGGGCTGAGTCGAGGTG...CAGGCTGTGCGTTTGTCACATT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 TTCTACAAGGGCAATGGCACAGAATGCAATCAAAGCCATGCATCAGTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 201113 TTCTACAAGGGCAATGGCACAGAATGCAATCAAAGCCATGCATCAGTCTC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 AGACCATGGAG         GGCTGCTCTTCACCTATCGTGGTGAAGTTT
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 201163 AGACCATGGAGGTA...CAGGGCTGCTCTTCACCTATCGTGGTGAAGTTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 GCTGACACTCAGAAGGACAAAGAGCAAAGGCGCCTCCAGCAGCAGCTCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 205192 GCTGACACTCAGAAGGACAAAGAGCAAAGGCGCCTCCAGCAGCAGCTCGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 TCAGCAGATGCAGCAGCTCAACACTGCCACCTGGGGGAACCTGACAGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 205242 TCAGCAGATGCAGCAGCTCAACACTGCCACCTGGGGGAACCTGACAGGGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 TGGGCGGACTGACCCCACAGTATCTGGCG         CTCCTGCAGCAG
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 205292 TGGGCGGACTGACCCCACAGTATCTGGCGGTA...CAGCTCCTGCAGCAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 GCCACCTCCTCCAGCAACCTGGGTGCGTTCAGCGGCATTCAACAAATGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 209565 GCCACCTCCTCCAGCAACCTGGGTGCGTTCAGCGGCATTCAACAAATGGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 AG         GCATGAATGCTTTACAGTTGCAGAACCTGGCGACGCTGG
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 209615 AGGTA...CAGGCATGAATGCTTTACAGTTGCAGAACCTGGCGACGCTGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 CTGCTGCTGCAGCTGCGGCCCAGACCTCAGCCACCAGCACCAATGCAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 222953 CTGCTGCTGCAGCTGCGGCCCAGACCTCAGCCACCAGCACCAATGCAAAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 CCTCTCTCTACCACGAGCAGCGCCCTGGGAGCCCTCACGAGTCCCG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 223003 CCTCTCTCTACCACGAGCAGCGCCCTGGGAGCCCTCACGAGTCCCGGTG.

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    884      TGGCTGCTTCAACCCCCAACTCCACTGCTGGTGCAGCCATGAACT
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 223053 ..CAGTGGCTGCTTCAACCCCCAACTCCACTGCTGGTGCAGCCATGAACT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 CCTTGACCTCTCTCGGGACTCTGCAAGGACTGGCTGGAGCCACTGTTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 248680 CCTTGACCTCTCTCGGGACTCTGCAAGGACTGGCTGGAGCCACTGTTGGA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 CTGAATAATATTAATGCACTAGCAG         TTGCTCAAATGCTCTC
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 248730 CTGAATAATATTAATGCACTAGCAGGTA...AAGTTGCTCAAATGCTCTC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 AGGTATGGCGGCTCTGAATGGAGGACTTGGCGCCACAGGCTTGACGAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 255701 AGGTATGGCGGCTCTGAATGGAGGACTTGGCGCCACAGGCTTGACGAATG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 GCACGGCTGGCACCATGGACGCCCTCACCCAGGCCTACTCAGGAATTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 255751 GCACGGCTGGCACCATGGACGCCCTCACCCAGGCCTACTCAGGAATTCAA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 CAGTACGCAGCCGCCGCGCTGCCCACTCTGTACAGCCAGAGCCTGCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 255801 CAGTACGCAGCCGCCGCGCTGCCCACTCTGTACAGCCAGAGCCTGCTGCA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 GCAGCAGAGCGCTGCAGGCAGCCAGAAGGAAG         GTCCAGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 255851 GCAGCAGAGCGCTGCAGGCAGCCAGAAGGAAGGTA...TAGGTCCAGAGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1211 GGGCAAACCTCTTTATTTACCACCTTCCACAGGAATTTGGAGACCAGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 260341 GGGCAAACCTCTTTATTTACCACCTTCCACAGGAATTTGGAGACCAGGAC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1261 ATTCTGCAGATGTTCATGCCTTTTGGAAATGTTATCTCTGCTAAAGTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 260391 ATTCTGCAGATGTTCATGCCTTTTGGAAATGTTATCTCTGCTAAAGTCTT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 CATTGACAAACAGACCAATCTGAGCAAGTGCTTTG         GTTTTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 260441 CATTGACAAACAGACCAATCTGAGCAAGTGCTTTGGTA...CAGGTTTTG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1352 TTAGCTACGACAATCCAGTCTCTGCACAAGCTGCTATCCAAGCTATGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 263428 TTAGCTACGACAATCCAGTCTCTGCACAAGCTGCTATCCAAGCTATGAAT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1402 GGCTTTCAGATCGGCATGAAACGCTTGAAGGTGCAGCTGAAGCGTTCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 263478 GGCTTTCAGATCGGCATGAAACGCTTGAAGGTGCAGCTGAAGCGTTCCAA

   1550     .    :    .
   1452 AAACGACAGCAAACCTTAC
        |||||||||||||||||||
 263528 AAACGACAGCAAACCTTAC