seq1 = pF1KE2380.tfa, 1887 bp
seq2 = pF1KE2380/gi568815585r_29414483.tfa (gi568815585r:29414483_29636188), 221706 bp

>pF1KE2380 1887
>gi568815585r:29414483_29636188 (Chr13)

(complement)

1-370  (100001-100370)   100% ->
371-529  (103207-103365)   99% ->
530-704  (105477-105651)   100% ->
705-826  (111936-112057)   100% ->
827-1049  (112701-112923)   100% ->
1050-1189  (113733-113872)   100% ->
1190-1292  (116640-116742)   100% ->
1293-1510  (118399-118616)   99% ->
1511-1677  (118879-119045)   100% ->
1678-1786  (119943-120051)   100% ->
1787-1887  (121606-121706)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGGTGCAAAGTCCTGCTCAACATTGGGCAGCAGATGCTGCGGCGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGGTGCAAAGTCCTGCTCAACATTGGGCAGCAGATGCTGCGGCGGAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGTGGTGGACTGTAGCCGGGAGGAGACGCGGCTGTCTCGCTGCCTGAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGTGGTGGACTGTAGCCGGGAGGAGACGCGGCTGTCTCGCTGCCTGAACA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CTTTTGATCTGGTGGCCCTCGGGGTGGGCAGCACACTGGGTGCTGGTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CTTTTGATCTGGTGGCCCTCGGGGTGGGCAGCACACTGGGTGCTGGTGTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TACGTCCTGGCTGGAGCTGTGGCCCGTGAGAATGCAGGCCCTGCCATTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TACGTCCTGGCTGGAGCTGTGGCCCGTGAGAATGCAGGCCCTGCCATTGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CATCTCCTTCCTGATCGCTGCGCTGGCCTCAGTGCTGGCTGGCCTGTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CATCTCCTTCCTGATCGCTGCGCTGGCCTCAGTGCTGGCTGGCCTGTGCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ATGGCGAGTTTGGTGCTCGGGTCCCCAAGACGGGCTCAGCTTACCTCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ATGGCGAGTTTGGTGCTCGGGTCCCCAAGACGGGCTCAGCTTACCTCTAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AGCTATGTCACCGTTGGAGAGCTCTGGGCCTTCATCACCGGCTGGAACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 AGCTATGTCACCGTTGGAGAGCTCTGGGCCTTCATCACCGGCTGGAACTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 AATCCTCTCCTACATCATCG         GTACTTCAAGCGTAGCGAGGG
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 100351 AATCCTCTCCTACATCATCGGTA...CAGGTACTTCAAGCGTAGCGAGGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 CCTGGAGCGCCACCTTCGACGAGCTGATAGGGAGACCCATCGGGGAGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
 103228 CCTGGAGCGCCACCTTCGACGAGCTGATAGGCAGACCCATCGGGGAGTTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 TCACGGACACACATGACTCTGAACGCCCCCGGCGTGCTGGCTGAAAACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103278 TCACGGACACACATGACTCTGAACGCCCCCGGCGTGCTGGCTGAAAACCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 CGACATATTCGCAGTGATCATAATTCTCATCTTGACAG         GAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 103328 CGACATATTCGCAGTGATCATAATTCTCATCTTGACAGGTA...CAGGAC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 TTTTAACTCTTGGTGTGAAAGAGTCGGCCATGGTCAACAAAATATTCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105480 TTTTAACTCTTGGTGTGAAAGAGTCGGCCATGGTCAACAAAATATTCACT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 TGTATTAACGTCCTGGTCCTGGGCTTCATAATGGTGTCAGGATTTGTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105530 TGTATTAACGTCCTGGTCCTGGGCTTCATAATGGTGTCAGGATTTGTGAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 AGGATCGGTTAAAAACTGGCAGCTCACGGAGGAGGATTTTGGGAACACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105580 AGGATCGGTTAAAAACTGGCAGCTCACGGAGGAGGATTTTGGGAACACAT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 CAGGCCGTCTCTGTTTGAACAA         TGACACAAAAGAAGGGAAG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 105630 CAGGCCGTCTCTGTTTGAACAAGTG...TAGTGACACAAAAGAAGGGAAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 CCCGGTGTTGGTGGATTCATGCCCTTCGGGTTCTCTGGTGTCCTGTCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111955 CCCGGTGTTGGTGGATTCATGCCCTTCGGGTTCTCTGGTGTCCTGTCGGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 GGCAGCGACTTGCTTCTATGCCTTCGTGGGCTTTGACTGCATCGCCACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112005 GGCAGCGACTTGCTTCTATGCCTTCGTGGGCTTTGACTGCATCGCCACCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 CAG         GTGAAGAGGTGAAGAACCCACAGAAGGCCATCCCCGTG
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112055 CAGGTA...TAGGTGAAGAGGTGAAGAACCCACAGAAGGCCATCCCCGTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 GGGATCGTGGCGTCCCTCTTGATCTGCTTCATCGCCTACTTTGGGGTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112739 GGGATCGTGGCGTCCCTCTTGATCTGCTTCATCGCCTACTTTGGGGTGTC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 GGCTGCCCTCACGCTCATGATGCCCTACTTCTGCCTGGACAATAACAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112789 GGCTGCCCTCACGCTCATGATGCCCTACTTCTGCCTGGACAATAACAGCC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 CCCTGCCCGACGCCTTTAAGCACGTGGGCTGGGAAGGTGCCAAGTACGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112839 CCCTGCCCGACGCCTTTAAGCACGTGGGCTGGGAAGGTGCCAAGTACGCA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1015 GTGGCCGTGGGCTCCCTCTGCGCTCTTTCCGCCAG         TCTTCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 112889 GTGGCCGTGGGCTCCCTCTGCGCTCTTTCCGCCAGGTG...TAGTCTTCT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 AGGTTCCATGTTTCCCATGCCTCGGGTTATCTATGCCATGGCTGAGGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113739 AGGTTCCATGTTTCCCATGCCTCGGGTTATCTATGCCATGGCTGAGGATG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1106 GACTGCTATTTAAATTCTTAGCCAACGTCAATGATAGGACCAAAACACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113789 GACTGCTATTTAAATTCTTAGCCAACGTCAATGATAGGACCAAAACACCA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1156 ATAATCGCCACATTAGCCTCGGGTGCCGTTGCTG         CTGTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 113839 ATAATCGCCACATTAGCCTCGGGTGCCGTTGCTGGTG...CAGCTGTGAT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1197 GGCCTTCCTCTTTGACCTGAAGGACTTGGTGGACCTCATGTCCATTGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116647 GGCCTTCCTCTTTGACCTGAAGGACTTGGTGGACCTCATGTCCATTGGCA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1247 CTCTCCTGGCTTACTCGTTGGTGGCTGCCTGTGTGTTGGTCTTACG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 116697 CTCTCCTGGCTTACTCGTTGGTGGCTGCCTGTGTGTTGGTCTTACGGTA.

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1293      GTACCAGCCAGAGCAGCCTAACCTGGTATACCAGATGGCCAGTAC
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116747 ..CAGGTACCAGCCAGAGCAGCCTAACCTGGTATACCAGATGGCCAGTAC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1338 TTCCGACGAGTTAGATCCAGCAGACCAAAATGAATTGGCAAGCACCAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118444 TTCCGACGAGTTAGATCCAGCAGACCAAAATGAATTGGCAAGCACCAATG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1388 ATTCCCAGCTGGGGTTTTTACCAGAGGCAGAGATGTTCTCTTTGAAAACC
        ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118494 ATTCCCAGCTGGGCTTTTTACCAGAGGCAGAGATGTTCTCTTTGAAAACC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1438 ATACTCTCACCCAAAAACATGGAGCCTTCCAAAATCTCTGGGCTAATTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118544 ATACTCTCACCCAAAAACATGGAGCCTTCCAAAATCTCTGGGCTAATTGT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1488 GAACATTTCAACCAGCCTTATAG         CTGTTCTCATCATCACCT
        |||||||||||||||||| ||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 118594 GAACATTTCAACCAGCCTCATAGGTA...TAGCTGTTCTCATCATCACCT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1529 TCTGCATTGTGACCGTGCTTGGAAGGGAGGCTCTCACCAAAGGGGCGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118897 TCTGCATTGTGACCGTGCTTGGAAGGGAGGCTCTCACCAAAGGGGCGCTG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1579 TGGGCAGTCTTTCTGCTCGCAGGGTCTGCCCTCCTCTGTGCCGTGGTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118947 TGGGCAGTCTTTCTGCTCGCAGGGTCTGCCCTCCTCTGTGCCGTGGTCAC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1629 GGGCGTCATCTGGAGGCAGCCCGAGAGCAAGACCAAGCTCTCATTTAAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 118997 GGGCGTCATCTGGAGGCAGCCCGAGAGCAAGACCAAGCTCTCATTTAAGG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1678         GTTCCCTTCCTGCCAGTGCTCCCCATCCTGAGCATCTTCGTG
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119047 TG...CAGGTTCCCTTCCTGCCAGTGCTCCCCATCCTGAGCATCTTCGTG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1720 AACGTCTATCTCATGATGCAGCTGGACCAGGGCACCTGGGTCCGGTTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119985 AACGTCTATCTCATGATGCAGCTGGACCAGGGCACCTGGGTCCGGTTTGC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1770 TGTGTGGATGCTGATAG         GCTTCATCATCTACTTTGGCTATG
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 120035 TGTGTGGATGCTGATAGGTA...CAGGCTTCATCATCTACTTTGGCTATG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1811 GCCTGTGGCACAGCGAGGAGGCGTCCCTGGATGCCGACCAAGCAAGGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121630 GCCTGTGGCACAGCGAGGAGGCGTCCCTGGATGCCGACCAAGCAAGGACT

   1950     .    :    .    :    .
   1861 CCTGACGGCAACTTGGACCAGTGCAAG
        |||||||||||||||||||||||||||
 121680 CCTGACGGCAACTTGGACCAGTGCAAG