seq1 = pF1KE2378.tfa, 1464 bp
seq2 = pF1KE2378/gi568815592r_113841708.tfa (gi568815592r:113841708_114060019), 218312 bp

>pF1KE2378 1464
>gi568815592r:113841708_114060019 (Chr6)

(complement)

1-52  (89112-89163)   100% ->
53-165  (100002-100114)   100% ->
166-283  (101254-101371)   100% ->
284-358  (103327-103401)   100% ->
359-497  (103869-104007)   100% ->
498-639  (106602-106743)   100% ->
640-732  (110760-110852)   100% ->
733-841  (110933-111041)   100% ->
842-982  (113872-114012)   100% ->
983-1091  (114550-114658)   100% ->
1092-1222  (115610-115740)   100% ->
1223-1378  (116514-116669)   100% ->
1379-1436  (118255-118312)   100% ->
1437-1464  (118932-118959)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGTACAGTCAAGGAGGCGGCAAAAAAAAAGTCTGCTACTACTACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  89112 ATGGCGTACAGTCAAGGAGGCGGCAAAAAAAAAGTCTGCTACTACTACGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CG         GTGATATTGGAAATTATTATTATGGACAGGGTCATCCCA
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  89162 CGGTG...TAGGTGATATTGGAAATTATTATTATGGACAGGGTCATCCCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TGAAGCCTCATAGAATCCGCATGACCCATAACTTGCTGTTAAATTATGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100041 TGAAGCCTCATAGAATCCGCATGACCCATAACTTGCTGTTAAATTATGGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TTATACAGAAAAATGGAAATATAT         AGGCCCCATAAAGCCAC
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 100091 TTATACAGAAAAATGGAAATATATGTG...CAGAGGCCCCATAAAGCCAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TGCCGAAGAAATGACAAAATATCACAGTGATGAGTATATCAAATTTCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101271 TGCCGAAGAAATGACAAAATATCACAGTGATGAGTATATCAAATTTCTAC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GGTCAATAAGACCAGATAACATGTCTGAGTATAGTAAGCAGATGCAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101321 GGTCAATAAGACCAGATAACATGTCTGAGTATAGTAAGCAGATGCAGAGA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 T         TTAATGTTGGAGAAGATTGTCCAGTGTTTGATGGACTCTT
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101371 TGTA...CAGTTAATGTTGGAGAAGATTGTCCAGTGTTTGATGGACTCTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 TGAGTTTTGTCAGCTCTCAACTGGCGGTTCAGTTG         CTGGAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 103367 TGAGTTTTGTCAGCTCTCAACTGGCGGTTCAGTTGGTA...TAGCTGGAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 CTGTGAAGTTAAACCGACAACAGACTGATATGGCTGTTAATTGGGCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103875 CTGTGAAGTTAAACCGACAACAGACTGATATGGCTGTTAATTGGGCTGGA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 GGATTACATCATGCTAAGAAATCAGAAGCATCAGGATTCTGTTACGTTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103925 GGATTACATCATGCTAAGAAATCAGAAGCATCAGGATTCTGTTACGTTAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 TGATATTGTGCTTGCCATCCTTGAATTACTAAA         GTATCATC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 103975 TGATATTGTGCTTGCCATCCTTGAATTACTAAAGTA...CAGGTATCATC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 AGAGAGTCTTATATATTGATATAGATATTCATCATGGTGATGGTGTTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106610 AGAGAGTCTTATATATTGATATAGATATTCATCATGGTGATGGTGTTGAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 GAAGCTTTTTATACAACAGATCGTGTAATGACGGTATCATTCCATAAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106660 GAAGCTTTTTATACAACAGATCGTGTAATGACGGTATCATTCCATAAATA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 TGGGGAATACTTTCCTGGCACAGGAGACTTGAGG         GATATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 106710 TGGGGAATACTTTCCTGGCACAGGAGACTTGAGGGTA...TAGGATATTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 GTGCTGGAAAAGGCAAATACTATGCTGTCAATTTTCCAATGAGAGATGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110767 GTGCTGGAAAAGGCAAATACTATGCTGTCAATTTTCCAATGAGAGATGGT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 ATAGATGATGAGTCATATGGGCAGATATTTAAGCCT         ATTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 110817 ATAGATGATGAGTCATATGGGCAGATATTTAAGCCTGTA...TAGATTAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 CTCAAAGGTGATGGAGATGTATCAACCTAGTGCTGTGGTATTACAGTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110938 CTCAAAGGTGATGGAGATGTATCAACCTAGTGCTGTGGTATTACAGTGTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 GTGCAGACTCATTATCTGGTGATAGACTGGGTTGTTTCAATCTAACAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110988 GTGCAGACTCATTATCTGGTGATAGACTGGGTTGTTTCAATCTAACAGTC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 AAAG         GTCATGCTAAATGTGTAGAAGTTGTAAAAACTTTTAA
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111038 AAAGGTA...TAGGTCATGCTAAATGTGTAGAAGTTGTAAAAACTTTTAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 CTTACCATTACTGATGCTTGGAGGAGGTGGCTACACAATCCGTAATGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113909 CTTACCATTACTGATGCTTGGAGGAGGTGGCTACACAATCCGTAATGTTG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 CTCGATGTTGGACATATGAGACTGCAGTTGCCCTTGATTGTGAGATTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113959 CTCGATGTTGGACATATGAGACTGCAGTTGCCCTTGATTGTGAGATTCCC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 AATG         AGTTGCCATATAATGATTACTTTGAGTATTTTGGACC
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114009 AATGGTA...TAGAGTTGCCATATAATGATTACTTTGAGTATTTTGGACC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 AGACTTCAAACTGCATATTAGTCCTTCAAACATGACAAACCAGAACACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114587 AGACTTCAAACTGCATATTAGTCCTTCAAACATGACAAACCAGAACACTC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 CAGAATATATGGAAAAGATAAA         ACAGCGTTTGTTTGAAAAT
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 114637 CAGAATATATGGAAAAGATAAAGTA...TAGACAGCGTTTGTTTGAAAAT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1111 TTGCGCATGTTACCTCATGCACCTGGTGTCCAGATGCAAGCTATTCCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115629 TTGCGCATGTTACCTCATGCACCTGGTGTCCAGATGCAAGCTATTCCAGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1161 AGATGCTGTTCATGAAGACAGTGGAGATGAAGATGGAGAAGATCCAGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115679 AGATGCTGTTCATGAAGACAGTGGAGATGAAGATGGAGAAGATCCAGACA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1211 AGAGAATTTCTA         TTCGAGCATCAGACAAGCGGATAGCTTGT
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 115729 AGAGAATTTCTAGTA...CAGTTCGAGCATCAGACAAGCGGATAGCTTGT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1252 GATGAAGAATTCTCAGATTCTGAGGATGAAGGAGAAGGAGGTCGAAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116543 GATGAAGAATTCTCAGATTCTGAGGATGAAGGAGAAGGAGGTCGAAGAAA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1302 TGTGGCTGATCATAAGAAAGGAGCAAAGAAAGCTAGAATTGAAGAAGATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116593 TGTGGCTGATCATAAGAAAGGAGCAAAGAAAGCTAGAATTGAAGAAGATA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1352 AGAAAGAAACAGAGGACAAAAAAACAG         ACGTTAAGGAAGAA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 116643 AGAAAGAAACAGAGGACAAAAAAACAGGTC...TAGACGTTAAGGAAGAA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1393 GATAAATCCAAGGACAACAGTGGTGAAAAAACAGATACCAAAGG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 118269 GATAAATCCAAGGACAACAGTGGTGAAAAAACAGATACCAAAGGGTA...

   1550     .    :    .    :    .    :
   1437    AACCAAATCAGAACAGCTCAGCAACCCC
        >>>||||||||||||||||||||||||||||
 118929 CAGAACCAAATCAGAACAGCTCAGCAACCCC