seq1 = pF1KE2374.tfa, 852 bp
seq2 = pF1KE2374/gi568815576r_29455938.tfa (gi568815576r:29455938_29681082), 225145 bp

>pF1KE2374 852
>gi568815576r:29455938_29681082 (Chr22)

(complement)

1-98  (100001-100098)   100% ->
99-226  (110551-110678)   100% ->
227-272  (110876-110921)   100% ->
273-367  (111796-111890)   100% ->
368-438  (119221-119291)   100% ->
439-579  (119437-119577)   100% ->
580-611  (119881-119912)   100% ->
612-706  (120255-120349)   100% ->
707-790  (122130-122213)   100% ->
791-852  (125084-125145)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTCCGCGGCTGTGCAGCATCTCTGTGACGGCGCGGCGGCTGCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTCCGCGGCTGTGCAGCATCTCTGTGACGGCGCGGCGGCTGCTGGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGGCCCGGGGCCTCGCGCTGGGGACGTTGCGTCTGCAGCTGCGGCGCG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 100051 GGGCCCGGGGCCTCGCGCTGGGGACGTTGCGTCTGCAGCTGCGGCGCGGT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     99        TTTCTATTCCAAGGACAATGAAGGCAGCTGGTTCCGCTCCCTC
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 G...CAGTTTCTATTCCAAGGACAATGAAGGCAGCTGGTTCCGCTCCCTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TTTGTTCACAAAGTGGATCCCCGGAAGGATGCCCACTCCACCCTGCTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110594 TTTGTTCACAAAGTGGATCCCCGGAAGGATGCCCACTCCACCCTGCTGTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CAAGAAGGAAACCAGCAACCTCTATAAGATCCAGT         TTCACA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 110644 CAAGAAGGAAACCAGCAACCTCTATAAGATCCAGTGTG...CAGTTCACA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ATGTAAAGCCTGAATACCTGGATGCCTACAACAGCCTCAC         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 110882 ATGTAAAGCCTGAATACCTGGATGCCTACAACAGCCTCACGTG...CAGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 GAGGCTGTGCTGCCCAAGCTTCACCTGGATGAGGACTACCCATGCTCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111797 GAGGCTGTGCTGCCCAAGCTTCACCTGGATGAGGACTACCCATGCTCACT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CGTGGGCAACTGGAACACGTGGTATGGGGAGCAGGACCAGGCAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 111847 CGTGGGCAACTGGAACACGTGGTATGGGGAGCAGGACCAGGCAGGTA...

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    368    TGCACCTGTGGCGATTCTCAGGTGGCTACCCAGCCCTCATGGACTGC
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119218 CAGTGCACCTGTGGCGATTCTCAGGTGGCTACCCAGCCCTCATGGACTGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 ATGAACAAGCTCAAAAACAATAAG         GAGTACCTGGAGTTCCG
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 119268 ATGAACAAGCTCAAAAACAATAAGGTA...CAGGAGTACCTGGAGTTCCG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 AAGGGAGCGGAGCCAGATGCTGCTGTCCAGGAGAAACCAGCTGCTCCTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119454 AAGGGAGCGGAGCCAGATGCTGCTGTCCAGGAGAAACCAGCTGCTCCTCG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 AGTTCAGCTTCTGGAATGAGCCACAGCCCAGAATGGGTCCCAACATCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119504 AGTTCAGCTTCTGGAATGAGCCACAGCCCAGAATGGGTCCCAACATCTAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 GAGCTGAGGACATACAAGCTCAAG         CCAGGAACCATGATCGA
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 119554 GAGCTGAGGACATACAAGCTCAAGGTG...CAGCCAGGAACCATGATCGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 GTGGGGGAACAACTG         GGCTCGGGCCATCAAGTACCGGCAGG
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 119898 GTGGGGGAACAACTGGTA...CAGGGCTCGGGCCATCAAGTACCGGCAGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    638 AGAACCAGGAGGCAGTGGGCGGCTTCTTCTCACAGATAGGAGAGCTCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120281 AGAACCAGGAGGCAGTGGGCGGCTTCTTCTCACAGATAGGAGAGCTCTAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    688 GTGGTGCACCATCTCTGGG         CCTATAAAGACCTGCAGTCTCG
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 120331 GTGGTGCACCATCTCTGGGGTA...CAGCCTATAAAGACCTGCAGTCTCG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    729 GGAGGAGACTCGAAACGCTGCCTGGAGGAAGAGAGGCTGGGATGAAAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122152 GGAGGAGACTCGAAACGCTGCCTGGAGGAAGAGAGGCTGGGATGAAAATG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    779 TCTACTATACAG         TCCCCCTGGTGCGACACATGGAGTCTAGG
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 122202 TCTACTATACAGGTG...CAGTCCCCCTGGTGCGACACATGGAGTCTAGG

    900     .    :    .    :    .    :
    820 ATCATGATCCCCTTGAAGATCTCGCCTCTGCAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||
 125113 ATCATGATCCCCTTGAAGATCTCGCCTCTGCAG