seq1 = pF1KE2372.tfa, 1971 bp
seq2 = pF1KE2372/gi568815597r_99985331.tfa (gi568815597r:99985331_100232814), 247484 bp

>pF1KE2372 1971
>gi568815597r:99985331_100232814 (Chr1)

(complement)

1-65  (100001-100065)   100% ->
66-126  (106873-106933)   100% ->
127-206  (109526-109605)   100% ->
207-311  (110331-110435)   100% ->
312-483  (111266-111437)   100% ->
484-549  (112356-112421)   100% ->
550-669  (113678-113797)   100% ->
670-861  (122332-122523)   99% ->
862-1056  (124811-125005)   100% ->
1057-1146  (125098-125187)   100% ->
1147-1326  (125262-125441)   100% ->
1327-1408  (125822-125903)   100% ->
1409-1545  (126912-127048)   100% ->
1546-1674  (129732-129860)   100% ->
1675-1772  (144579-144676)   100% ->
1773-1867  (147185-147279)   100% ->
1868-1971  (147381-147484)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGCCAAGTGCTGTTCCACCAACTAGTCCCGTTGCAGGTGAAATGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGCCAAGTGCTGTTCCACCAACTAGTCCCGTTGCAGGTGAAATGCAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGACTGTGAGGAGAG         GAGAGTAAGTATAAGAATGAGCATTG
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 100051 AGACTGTGAGGAGAGGTA...CAGGAGAGTAAGTATAAGAATGAGCATTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AACTACAATCAGTTTCTAATCCAGTTCACAGAAAG         GACTTA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 106899 AACTACAATCAGTTTCTAATCCAGTTCACAGAAAGGTT...TAGGACTTA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 GTTATTCGTCTGACTGATGACACGGATCCATTTTTTTTATATAACCTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109532 GTTATTCGTCTGACTGATGACACGGATCCATTTTTTTTATATAACCTTGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TATATCTGAGGAAGATTTTCAAAG         TTTAAAATTCCAGCAAG
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 109582 TATATCTGAGGAAGATTTTCAAAGGTA...TAGTTTAAAATTCCAGCAAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 GTCTTCTGGTAGACTTCTTAGCTTTCCCACAAAAATTTATAGATCTCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110348 GTCTTCTGGTAGACTTCTTAGCTTTCCCACAAAAATTTATAGATCTCCTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 CAGCAATGTACTCAAGAACATGCCAAAGAAATTCCAAG         GTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 110398 CAGCAATGTACTCAAGAACATGCCAAAGAAATTCCAAGGTA...AAGGTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    315 TTTGCTACAGTTAGTTTCTCCAGCAGCTATTTTGGATAACTCACCTGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111269 TTTGCTACAGTTAGTTTCTCCAGCAGCTATTTTGGATAACTCACCTGCAT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 TTTTAAATGTGGTAGAGACAAATCCTTTTAAGCATCTTACACACCTCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111319 TTTTAAATGTGGTAGAGACAAATCCTTTTAAGCATCTTACACACCTCTCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 CTAAAACTTTTACCTGGAAATGATGTGGAGATAAAGAAATTTCTCGCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111369 CTAAAACTTTTACCTGGAAATGATGTGGAGATAAAGAAATTTCTCGCAGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 CTGTTTGAAATGTAGCAAG         GAAGAAAAATTATCATTGATGC
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 111419 CTGTTTGAAATGTAGCAAGGTA...TAGGAAGAAAAATTATCATTGATGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 AATCACTAGATGATGCTACTAAGCAACTGGACTTTACACGAAAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 112378 AATCACTAGATGATGCTACTAAGCAACTGGACTTTACACGAAAGGTA...

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    550    ACATTAGCAGAAAAAAAACAAGAATTAGATAAGTTACGGAATGAATG
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113675 TAGACATTAGCAGAAAAAAAACAAGAATTAGATAAGTTACGGAATGAATG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 GGCGTCACATACAGCAGCCTTGACAAACAAGCATTCTCAGGAACTGACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113725 GGCGTCACATACAGCAGCCTTGACAAACAAGCATTCTCAGGAACTGACAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 ATGAAAAGGAAAAAGCCTTGCAG         GCACAGGTTCAATATCAA
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 113775 ATGAAAAGGAAAAAGCCTTGCAGGTA...TAGGCACAGGTTCAATATCAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    688 CAGCAGCATGAACAACAGAAAAAAGATTTAGAAATCCTCCATCAACAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122350 CAGCAGCATGAACAACAGAAAAAAGATTTAGAAATCCTCCATCAACAAAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 CATCCACCAGCTACAAAACAGACTGTCTGAGTTAGAAGTGGCTAATAAAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
 122400 CATCCACCAGCTACAAAACAGACTGTCTGAGTTAGAAGCGGCTAATAAAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 ACTTAACCGAAAGAAAATATAAAGGAGACTCCACTATTAGAGAACTTAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122450 ACTTAACCGAAAGAAAATATAAAGGAGACTCCACTATTAGAGAACTTAAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 GCAAAACTTTCTGGTGTTGAAGAG         GAGCTACAGCGGACTAA
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 122500 GCAAAACTTTCTGGTGTTGAAGAGGTA...TAGGAGCTACAGCGGACTAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 GCAAGAAGTCCTCTCTTTGCGAAGAGAGAATTCTACACTAGATGTTGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124828 GCAAGAAGTCCTCTCTTTGCGAAGAGAGAATTCTACACTAGATGTTGAAT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 GCCACGAGAAAGAAAAGCACGTTAATCAGCTACAAACAAAAGTGGCAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124878 GCCACGAGAAAGAAAAGCACGTTAATCAGCTACAAACAAAAGTGGCAGTT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 TTAGAACAGGAAATCAAGGATAAGGACCAGCTTGTTTTAAGAACAAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124928 TTAGAACAGGAAATCAAGGATAAGGACCAGCTTGTTTTAAGAACAAAAGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 GGCATTTGATACAATCCAGGAACAAAAG         GTGGTTTTAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 124978 GGCATTTGATACAATCCAGGAACAAAAGGTC...CAGGTGGTTTTAGAAG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 AAAATGGTGAGAAAAATCAAGTACAACTAGGAAAGCTTGAAGCTACAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125111 AAAATGGTGAGAAAAATCAAGTACAACTAGGAAAGCTTGAAGCTACAATA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 AAATCATTATCTGCAGAACTTCTGAAG         GCAAATGAAATTAT
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 125161 AAATCATTATCTGCAGAACTTCTGAAGGTT...TAGGCAAATGAAATTAT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1161 CAAGAAGTTACAAGGGGATCTGAAAACTTTAATGGGTAAGTTGAAATTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125276 CAAGAAGTTACAAGGGGATCTGAAAACTTTAATGGGTAAGTTGAAATTGA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1211 AGAATACAGTTACTATTCAGCAAGAAAAACTCTTGGCTGAGAAGGAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125326 AGAATACAGTTACTATTCAGCAAGAAAAACTCTTGGCTGAGAAGGAGGAA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1261 AAATTACAAAAGGAACAAAAGGAATTACAAGATGTTGGACAGTCTCTTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125376 AAATTACAAAAGGAACAAAAGGAATTACAAGATGTTGGACAGTCTCTTCG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 AATTAAAGAGCAAGAG         GTATGCAAATTACAAGAACAATTAG
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 125426 AATTAAAGAGCAAGAGGTA...CAGGTATGCAAATTACAAGAACAATTAG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1352 AAGCTACAGTTAAAAAACTTGAAGAAAGCAAACAACTTCTAAAAAATAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125847 AAGCTACAGTTAAAAAACTTGAAGAAAGCAAACAACTTCTAAAAAATAAT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1402 GAAAAGT         TAATCACGTGGTTAAATAAAGAACTAAATGAAAA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125897 GAAAAGTGTA...AAGTAATCACGTGGTTAAATAAAGAACTAAATGAAAA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1443 TCAGCTAGTGAGAAAGCAAGATGTATTGGGACCTTCTACTACTCCGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126946 TCAGCTAGTGAGAAAGCAAGATGTATTGGGACCTTCTACTACTCCGCCTG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1493 CACATTCCAGCAGCAACACAATCAGAAGTGGAATTTCTCCTAACCTGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126996 CACATTCCAGCAGCAACACAATCAGAAGTGGAATTTCTCCTAACCTGAAT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1543 GTG         GTTGATGGTAGACTGACTTACCCAACCTGTGGGATTGG
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127046 GTGGTA...TAGGTTGATGGTAGACTGACTTACCCAACCTGTGGGATTGG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1584 TTATCCTGTCTCCTCTGCATTTGCATTCCAGAATACCTTCCCTCATTCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129770 TTATCCTGTCTCCTCTGCATTTGCATTCCAGAATACCTTCCCTCATTCGA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1634 TATCTGCCAAAAATACCAGCCACCCTGGTTCAGGAACAAAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 129820 TATCTGCCAAAAATACCAGCCACCCTGGTTCAGGAACAAAGGTA...CAG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1675 GTTCAGTTTAATTTGCAGTTTACAAAACCAAATGCATCACTAGGAGATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144579 GTTCAGTTTAATTTGCAGTTTACAAAACCAAATGCATCACTAGGAGATGT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1725 TCAGTCAGGAGCAACTATTAGTATGCCTTGCTCAACTGATAAGGAAAA  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 144629 TCAGTCAGGAGCAACTATTAGTATGCCTTGCTCAACTGATAAGGAAAAGT

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1773        TGGTGAAAATGTAGGGTTGGAATCCAAATACCTGAAGAAAAGG
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144679 A...AAGTGGTGAAAATGTAGGGTTGGAATCCAAATACCTGAAGAAAAGG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1816 GAAGATAGCATTCCTTTACGCGGACTCAGCCAGAACCTATTTAGTAATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147228 GAAGATAGCATTCCTTTACGCGGACTCAGCCAGAACCTATTTAGTAATTC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1866 AG         ACCATCAGAGAGATGGCACTTTAGGAGCATTACATACAT
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147278 AGGTA...CAGACCATCAGAGAGATGGCACTTTAGGAGCATTACATACAT

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1907 CTTCCAAACCCACAGCGCTCCCCTCTGCGTCTTCAGCCTATTTCCCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147420 CTTCCAAACCCACAGCGCTCCCCTCTGCGTCTTCAGCCTATTTCCCTGGG

   2100     .    :    .
   1957 CAGTTACCAAACAGT
        |||||||||||||||
 147470 CAGTTACCAAACAGT