seq1 = pF1KE2363.tfa, 1551 bp
seq2 = pF1KE2363/gi568815589f_38295749.tfa (gi568815589f:38295749_38497299), 201551 bp

>pF1KE2363 1551
>gi568815589f:38295749_38497299 (Chr9)

1-1551  (100001-101551)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCTGCGCTTCCTGGCACCCCGGCTGCTTAGCCTCCAGGGCAGGACCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCTGCGCTTCCTGGCACCCCGGCTGCTTAGCCTCCAGGGCAGGACCGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCGCTACTCCTCGGCAGCAGCCCTCCCAAGCCCCATTCTGAACCCAGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCGCTACTCCTCGGCAGCAGCCCTCCCAAGCCCCATTCTGAACCCAGACA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCCCCTACAACCAGCTGTTCATCAACAATGAATGGCAAGATGCAGTCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCCCCTACAACCAGCTGTTCATCAACAATGAATGGCAAGATGCAGTCAGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AAGAAGACCTTCCCGACGGTCAACCCTACCACCGGGGAGGTCATCGGGCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
 100151 AAGAAGACCTTCCCGACGGTCAACCCTACCACCGGGGAGGTCATTGGGCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CGTGGCTGAAGGTGACCGGGCTGATGTGGATCGGGCCGTGAAAGCAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CGTGGCTGAAGGTGACCGGGCTGATGTGGATCGGGCCGTGAAAGCAGCCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GGGAAGCCTTCCGCCTGGGGTCCCCATGGCGCCGGATGGATGCCTCTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GGGAAGCCTTCCGCCTGGGGTCCCCATGGCGCCGGATGGATGCCTCTGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CGGGGCCGGCTGCTGAACCTCCTGGCAGACCTAGTGGAGCGGGATCGAGT
        ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CGGGGCCGGCTGCTGAACCGCCTGGCAGACCTAGTGGAGCGGGATCGAGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CTACTTGGCCTCACTCGAGACCTTGGACAATGGGAAGCCTTTCCAAGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CTACTTGGCCTCACTCGAGACCTTGGACAATGGGAAGCCTTTCCAAGAGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CTTACGCCTTGGACTTGGATGAGGTCATCAAGGTGTATCGGTACTTTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CTTACGCCTTGGACTTGGATGAGGTCATCAAGGTGTATCGGTACTTTGCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GGCTGGGCTGACAAGTGGCATGGCAAGACCATCCCCATGGATGGCCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GGCTGGGCTGACAAGTGGCATGGCAAGACCATCCCCATGGATGGCCAGCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TTTCTGCTTCACCCGGCATGAGCCCGTTGGTGTCTGTGGCCAGATCATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TTTCTGCTTCACCCGGCATGAGCCCGTTGGTGTCTGTGGCCAGATCATCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CGTGGAACTTCCCCTTGGTCATGCAGGGTTGGAAACTTGCCCCGGCACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CGTGGAACTTCCCCTTGGTCATGCAGGGTTGGAAACTTGCCCCGGCACTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GCCACAGGCAACACTGTGGTTATGAAGGTGGCAGAGCAGACCCCCCTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GCCACAGGCAACACTGTGGTTATGAAGGTGGCAGAGCAGACCCCCCTCTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TGCCCTGTATTTGGCCTCCCTCATCAAGGAGGCAGGCTTTCCCCCTGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TGCCCTGTATTTGGCCTCCCTCATCAAGGAGGCAGGCTTTCCCCCTGGGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TGGTGAACATCATCACGGGGTATGGCCCAACAGCAGGTGCGGCCATCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TGGTGAACATCATCACGGGGTATGGCCCAACAGCAGGTGCGGCCATCGCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CAGCACATGGATGTTGACAAAGTTGCCTTCACCGGTTCCACCGAGGTGGG
        |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 CAGCACGTGGATGTTGACAAAGTTGCCTTCACCGGTTCCACCGAGGTGGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CCACCTGATCCAGAAAGCAGCTGGCGATTCCAACCTCAAGAGAGTCACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CCACCTGATCCAGAAAGCAGCTGGCGATTCCAACCTCAAGAGAGTCACCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TGGAGCTGGGTGGTAAGAGCCCCAGCATCGTGCTGGCCGATGCTGACATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TGGAGCTGGGTGGTAAGAGCCCCAGCATCGTGCTGGCCGATGCTGACATG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 GAGCATGCCGTGGAGCAGTGCCACGAAGCCCTGTTCTTCAACATGGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 GAGCATGCCGTGGAGCAGTGCCACGAAGCCCTGTTCTTCAACATGGGCCA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 GTGCTGCTGTGCTGGCTCCCGGACCTTCGTGGAAGAATCCATCTACAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 GTGCTGCTGTGCTGGCTCCCGGACCTTCGTGGAAGAATCCATCTACAATG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 AGTTTCTCGAGAGAACCGTGGAGAAAGCAAAGCAGAGGAAAGTGGGGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 AGTTTCTCGAGAGAACCGTGGAGAAAGCAAAGCAGAGGAAAGTGGGGAAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 CCCTTTGAGCTGGACACCCAGCAGGGGCCTCAGGTGGACAAGGAGCAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 CCCTTTGAGCTGGACACCCAGCAGGGGCCTCAGGTGGACAAGGAGCAGTT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 TGAACGAGTCCTAGGCTACATCCAGCTTGGCCAGAAGGAGGGCGCAAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 TGAACGAGTCCTAGGCTACATCCAGCTTGGCCAGAAGGAGGGCGCAAAAC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 TCCTCTGTGGCGGAGAGCGTTTCGGGGAGCGTGGTTTCTTCATCAAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 TCCTCTGTGGCGGAGAGCGTTTCGGGGAGCGTGGTTTCTTCATCAAGCCT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 ACTGTCTTTGGTGGCGTGCAGGATGACATGAGAATTGCCAAAGAGGAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 ACTGTCTTTGGTGGCGTGCAGGATGACATGAGAATTGCCAAAGAGGAGAT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 CTTTGGGCCTGTGCAGCCCCTGTTCAAGTTCAAGAAGATTGAGGAGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 CTTTGGGCCTGTGCAGCCCCTGTTCAAGTTCAAGAAGATTGAGGAGGTGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 TTGAGAGGGCCAACAACACCAGGTATGGCCTGGCTGCGGCTGTGTTCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 TTGAGAGGGCCAACAACACCAGGTATGGCCTGGCTGCGGCTGTGTTCACC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 CGGGATCTGGACAAGGCCATGTACTTCACCCAGGCACTCCAGGCCGGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 CGGGATCTGGACAAGGCCATGTACTTCACCCAGGCACTCCAGGCCGGGAC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 CGTGTGGGTAAACACCTACAACATCGTCACCTGCCACACGCCATTTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101401 CGTGTGGGTAAACACCTACAACATCGTCACCTGCCACACGCCATTTGGAG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1451 GGTTTAAGGAATCTGGAAACGGGAGGGAGCTGGGTGAGGATGGGCTTAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101451 GGTTTAAGGAATCTGGAAACGGGAGGGAGCTGGGTGAGGATGGGCTTAAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1501 GCCTACACAGAGGTAAAGACGGTCACCATCAAGGTTCCTCAGAAGAACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101501 GCCTACACAGAGGTAAAGACGGTCACCATCAAGGTTCCTCAGAAGAACTC

   1550 
   1551 G
        |
 101551 G