seq1 = pF1KE2351.tfa, 1404 bp
seq2 = pF1KE2351/gi568815584r_52543573.tfa (gi568815584r:52543573_52795481), 251909 bp

>pF1KE2351 1404
>gi568815584r:52543573_52795481 (Chr14)

(complement)

1-114  (100001-100114)   100% ->
115-234  (111575-111694)   100% ->
235-318  (113074-113157)   100% ->
319-357  (117010-117048)   100% ->
358-434  (123611-123687)   100% ->
435-508  (123779-123852)   100% ->
509-629  (128987-129107)   100% ->
630-688  (131635-131694)   86% ->
689-715  (137332-137358)   100% ->
716-808  (137473-137565)   100% ->
809-1055  (142167-142413)   100% ->
1056-1125  (143174-143243)   100% ->
1126-1212  (149021-149107)   100% ->
1213-1346  (149195-149328)   100% ->
1347-1404  (151852-151909)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGCCGCGGCTGGGGATTCTTGTTTGGCCTCCTGGGCGCCGTGTGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGCCGCGGCTGGGGATTCTTGTTTGGCCTCCTGGGCGCCGTGTGGCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCTCAGCTCGGGCCACGGAGAGGAGCAGCCCCCGGAGACAGCGGCACAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCTCAGCTCGGGCCACGGAGAGGAGCAGCCCCCGGAGACAGCGGCACAGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GGTGCTTCTGCCAG         GTTAGTGGTTACTTGGATGATTGTACC
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 100101 GGTGCTTCTGCCAGGTG...CAGGTTAGTGGTTACTTGGATGATTGTACC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TGTGATGTTGAAACCATTGATAGATTTAATAACTACAGGCTTTTCCCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111602 TGTGATGTTGAAACCATTGATAGATTTAATAACTACAGGCTTTTCCCAAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 ACTACAAAAACTTCTTGAAAGTGACTACTTTAGGTATTACAAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 111652 ACTACAAAAACTTCTTGAAAGTGACTACTTTAGGTATTACAAGGTA...C

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    235   GTAAACCTGAAGAGGCCGTGTCCTTTCTGGAATGACATCAGCCAGTGT
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113072 AGGTAAACCTGAAGAGGCCGTGTCCTTTCTGGAATGACATCAGCCAGTGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GGAAGAAGGGACTGTGCTGTCAAACCATGTCAATCT         GATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 113122 GGAAGAAGGGACTGTGCTGTCAAACCATGTCAATCTGTA...CAGGATGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 AGTTCCTGATGGAATTAAATCTGCGAGCTACAAG         TATTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 117015 AGTTCCTGATGGAATTAAATCTGCGAGCTACAAGGTG...TAGTATTCTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 AAGAAGCCAATAATCTCATTGAAGAATGTGAACAAGCTGAACGACTTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123618 AAGAAGCCAATAATCTCATTGAAGAATGTGAACAAGCTGAACGACTTGGA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 GCAGTGGATGAATCTCTGAG         TGAGGAAACACAGAAGGCTGT
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 123668 GCAGTGGATGAATCTCTGAGGTT...AAGTGAGGAAACACAGAAGGCTGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 TCTTCAGTGGACCAAGCATGATGATTCTTCAGATAACTTCTGTGAAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123800 TCTTCAGTGGACCAAGCATGATGATTCTTCAGATAACTTCTGTGAAGCTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 ATG         ACATTCAGTCCCCTGAAGCTGAATATGTAGATTTGCTT
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123850 ATGGTA...CAGACATTCAGTCCCCTGAAGCTGAATATGTAGATTTGCTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    547 CTTAATCCTGAGCGCTACACTGGTTACAAGGGACCAGATGCTTGGAAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129025 CTTAATCCTGAGCGCTACACTGGTTACAAGGGACCAGATGCTTGGAAAAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 ATGGAATGTCATCTACGAAGAAAACTGTTTTAA         GCCACAGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 129075 ATGGAATGTCATCTACGAAGAAAACTGTTTTAAGTA...TAGGCCACAGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    638 CAATTAAAAGACCTTTAAATCCTTTGGCTTCTGGTCAAGGGACA  AGTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |--| | 
 131643 CAATTAAAAGACCTTTAAATCCTTTGGCTTCTGGTCAAGGTAAATTACTT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    686 AAG         AGAACACTTTTTACAGTTGGCTAGAAG         GT
        | ->>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 131693 AT TTG...CAGAGAACACTTTTTACAGTTGGCTAGAAGGTA...TAGGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    718 CTCTGTGTAGAAAAAAGAGCATTCTACAGACTTATATCTGGCCTACATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137475 CTCTGTGTAGAAAAAAGAGCATTCTACAGACTTATATCTGGCCTACATGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    768 AAGCATTAATGTGCATTTGAGTGCAAGATATCTTTTACAAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 137525 AAGCATTAATGTGCATTTGAGTGCAAGATATCTTTTACAAGGTA...TAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    809 AGACCTGGTTAGAAAAGAAATGGGGACACAACATTACAGAATTTCAACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142167 AGACCTGGTTAGAAAAGAAATGGGGACACAACATTACAGAATTTCAACAG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    859 CGATTTGATGGAATTTTGACTGAAGGAGAAGGTCCAAGAAGGCTTAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142217 CGATTTGATGGAATTTTGACTGAAGGAGAAGGTCCAAGAAGGCTTAAGAA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    909 CTTGTATTTTCTCTACTTAATAGAACTAAGGGCTTTATCCAAAGTGTTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142267 CTTGTATTTTCTCTACTTAATAGAACTAAGGGCTTTATCCAAAGTGTTAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    959 CATTCTTCGAGCGCCCAGATTTTCAACTCTTTACTGGAAATAAAATTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142317 CATTCTTCGAGCGCCCAGATTTTCAACTCTTTACTGGAAATAAAATTCAG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1009 GATGAGGAAAACAAAATGTTACTTCTGGAAATACTTCATGAAATCAA   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 142367 GATGAGGAAAACAAAATGTTACTTCTGGAAATACTTCATGAAATCAAGTA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056       GTCATTTCCTTTGCATTTTGATGAGAATTCATTTTTTGCTGGGG
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142417 ...CAGGTCATTTCCTTTGCATTTTGATGAGAATTCATTTTTTGCTGGGG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1100 ATAAAAAAGAAGCACACAAACTAAAG         GAGGACTTTCGACTG
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 143218 ATAAAAAAGAAGCACACAAACTAAAGGTA...CAGGAGGACTTTCGACTG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1141 CATTTTAGAAATATTTCAAGAATTATGGATTGTGTTGGTTGTTTTAAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149036 CATTTTAGAAATATTTCAAGAATTATGGATTGTGTTGGTTGTTTTAAATG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1191 TCGTCTGTGGGGAAAGCTTCAG         ACTCAGGGTTTGGGCACTG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 149086 TCGTCTGTGGGGAAAGCTTCAGGTA...CAGACTCAGGGTTTGGGCACTG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1232 CTCTGAAGATCTTATTTTCTGAGAAATTGATAGCAAATATGCCAGAAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149214 CTCTGAAGATCTTATTTTCTGAGAAATTGATAGCAAATATGCCAGAAAGT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1282 GGACCTAGTTATGAATTCCATCTAACCAGACAAGAAATAGTATCATTATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149264 GGACCTAGTTATGAATTCCATCTAACCAGACAAGAAATAGTATCATTATT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1332 CAACGCATTTGGAAG         AATTTCTACAAGTGTGAAAGAATTAG
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 149314 CAACGCATTTGGAAGGTT...CAGAATTTCTACAAGTGTGAAAGAATTAG

   1500     .    :    .    :    .    :
   1373 AAAACTTCAGGAACTTGTTACAGAATATTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||
 151878 AAAACTTCAGGAACTTGTTACAGAATATTCAT